Ищем администратора баз данных СУБД Clickhouse и Postgresql для команды научных сотрудников и разработчиков.
Один из текущих проектов — создание, развитие и наполнение высокопроизводительной платформы GWAS-MAP для сбора, хранения, анализа, визуализации и доступа к базе данных суммарных статистик полногеномных исследований ассоциаций.
http://amp.gs/jnvDq
Основные задачи администратора:
— поддержание в актуальном рабочем состоянии полного объема оперативной и накапливаемой информации;
— защита информации от несанкционированного доступа;
— реализация репликации и шардирования БД по кластеру;
— настройка мониторинга и контроль производительности запросов;
— повышение отказоустойчивости (бекапы, балансировка);
— сохранение консистентности (настройка ролей, ограничения ресурсов).
Важен опыт работы в СУБД Clickhouse и Postgresql и оптимизации SQL запросов. Также приветствуются навыки в Python.
P.S. На эту вакансию можно порекомендовать друга/знакомого и получить вознаграждение в случае его трудоустройства!
#бластим_вакансии
Один из текущих проектов — создание, развитие и наполнение высокопроизводительной платформы GWAS-MAP для сбора, хранения, анализа, визуализации и доступа к базе данных суммарных статистик полногеномных исследований ассоциаций.
http://amp.gs/jnvDq
Основные задачи администратора:
— поддержание в актуальном рабочем состоянии полного объема оперативной и накапливаемой информации;
— защита информации от несанкционированного доступа;
— реализация репликации и шардирования БД по кластеру;
— настройка мониторинга и контроль производительности запросов;
— повышение отказоустойчивости (бекапы, балансировка);
— сохранение консистентности (настройка ролей, ограничения ресурсов).
Важен опыт работы в СУБД Clickhouse и Postgresql и оптимизации SQL запросов. Также приветствуются навыки в Python.
P.S. На эту вакансию можно порекомендовать друга/знакомого и получить вознаграждение в случае его трудоустройства!
#бластим_вакансии
👍1
Поиск работы — это непросто. В нынешних условиях неопределенности еще сложнее, особенно, если у вас редкая специальность. Команда Бластима специально подготовила раздел «Где работать в биотехе», который содержит список биотехнологических компаний в России. Он регулярно обновляется и расширяется, так что, по ссылке вы найдете актуальную информацию из разных сфер.
Мы постарались собрать организации популярных направлений — фармы,биоинформатики, агротеха, биомеда и не забыли о редких. Например, компании в сферах патоморфологии и робототехники тоже есть на сайте.
Мы понимаем, что многие ученые хотят развиваться и в других странах, поэтому в разделе еще можно найти ссылки на ресурсы для поиска иностранных вакансий.
Конечно, это не исчерпывающий список компаний. Он пополняется нашими силами и по запросу от представителей компаний/организаций. Но вы также можете поучаствовать в этой инициативе: отправить донат Blastim или прислать название вашей организации/ссылку на сайт на mail@blastim.ru.
Мы постарались собрать организации популярных направлений — фармы,биоинформатики, агротеха, биомеда и не забыли о редких. Например, компании в сферах патоморфологии и робототехники тоже есть на сайте.
Мы понимаем, что многие ученые хотят развиваться и в других странах, поэтому в разделе еще можно найти ссылки на ресурсы для поиска иностранных вакансий.
Конечно, это не исчерпывающий список компаний. Он пополняется нашими силами и по запросу от представителей компаний/организаций. Но вы также можете поучаствовать в этой инициативе: отправить донат Blastim или прислать название вашей организации/ссылку на сайт на mail@blastim.ru.
👍14❤5
У кого-то в Бластиме выходные затянулись, но хорошие новости хуже не стали!
Вышла статья «Как кишечные бактерии могут помочь в лечении рака». Микробиом кишечника оказывает как положительное, так и отрицательное влияние на прогрессирование отдаленных опухолей, побочные эффекты лечения и способность иммунной системы уничтожать раковые клетки.
Читать здесь: http://amp.gs/jnUcO
С помощью назальных вакцин учёные собираются разорвать цепь передачи вируса SARS-CoV-2. При проверке вакцины на мышиной модели возник сильный защитный мукозальный иммунитет, что значительно снизило вирусную нагрузку в верхних и нижних дыхательных путях и предотвратило заболевание.
Подробнее: http://amp.gs/jnUcN
Подборку составила Мария Киреева.
#выходные_у_бластим
Вышла статья «Как кишечные бактерии могут помочь в лечении рака». Микробиом кишечника оказывает как положительное, так и отрицательное влияние на прогрессирование отдаленных опухолей, побочные эффекты лечения и способность иммунной системы уничтожать раковые клетки.
Читать здесь: http://amp.gs/jnUcO
С помощью назальных вакцин учёные собираются разорвать цепь передачи вируса SARS-CoV-2. При проверке вакцины на мышиной модели возник сильный защитный мукозальный иммунитет, что значительно снизило вирусную нагрузку в верхних и нижних дыхательных путях и предотвратило заболевание.
Подробнее: http://amp.gs/jnUcN
Подборку составила Мария Киреева.
#выходные_у_бластим
👍8
Напоминаем про наш новый сервис BlastimCloud!
С 15 августа по 15 сентября будет работать готовое рабочее пространство для анализа данных секвенирования. В услугу входят пакет необходимых для обработки данных программ, техподдержка и доступ на сервер 24/7 из любой точки мира.
Если вам кажутся недостаточными ваши теоретические знания о процессе обработки данных секвенирования, выбирайте пакет, включающий доступ к серверу и записи текущего потока курса «Анализ NGS-данных».
Окружение настроено для решения следующих задач:
— Контроль качества входных данных (FastQC, QUAST, Trimmomatic, Cutadapt).
— Сборка генома (Spades) и картирования прочтений (BWA, Bowtie2, Hisat2).
— Поиск и аннотация структурных вариаций (BCFtools, GATK, Annovar, vep).
— Анализ метагеномных данных (QIIME2, DADA2, Deblur) и дифференциальной экспрессии (DESeq2).
— Построение филогенетических деревьев (IQTree).
— Обработка и визуализация результатов (Jupyter Notebook, RStudio).
#бластим_курсы
С 15 августа по 15 сентября будет работать готовое рабочее пространство для анализа данных секвенирования. В услугу входят пакет необходимых для обработки данных программ, техподдержка и доступ на сервер 24/7 из любой точки мира.
Если вам кажутся недостаточными ваши теоретические знания о процессе обработки данных секвенирования, выбирайте пакет, включающий доступ к серверу и записи текущего потока курса «Анализ NGS-данных».
Окружение настроено для решения следующих задач:
— Контроль качества входных данных (FastQC, QUAST, Trimmomatic, Cutadapt).
— Сборка генома (Spades) и картирования прочтений (BWA, Bowtie2, Hisat2).
— Поиск и аннотация структурных вариаций (BCFtools, GATK, Annovar, vep).
— Анализ метагеномных данных (QIIME2, DADA2, Deblur) и дифференциальной экспрессии (DESeq2).
— Построение филогенетических деревьев (IQTree).
— Обработка и визуализация результатов (Jupyter Notebook, RStudio).
#бластим_курсы
👍12❤1
Осталось всего три недели до начала и три дня до повышения цены на 10% на курс «Python и Linux для биоинформатики и биологии»!
Уже по традиции:
1) Приглашаем вас на вебинар «Обработка таблиц с биологическими данными на Python». Спикер — Зинкевич Арсений, преподаватель ФББ МГУ им. М.В. Ломоносова, системный аналитик в компании Insilico Medicine, сотрудник лаборатории в ИОГен РАН.
Встреча состоится 3 августа в 19:00 по московскому времени.
В программе:
— Работа с таблицами в Python с помощью библиотеки Pandas.
— Объединение таблиц, картирование идентификаторов из различных БД.
— Базовые очистка и фильтрация данных.
— Построение графиков в Python.
— Простые статистические тесты.
Регистрация на вебинар по ссылке!
2) Вы можете принять участие в розыгрыше 5 (!) скидок на курс «Python и Linux для биоинформатики и биологии».
Для этого вам нужно:
— быть подписчиком минимум одной из групп Бластим в соцсетях;
— сделать репост записи о конкурсе у себя на странице или сторис/пост с отметкой аккаунта;
— в публикации написать для чего вам нужен курс по питону от Бластим;
— зарегистрироваться и прийти на вебинар!
Всего будет 5 победителей, и каждый из них получит одну из 5 скидок: 90%, 70%, 50%, 35% и 20%. Итоги мы подведем 3 августа во время вебинара.
#бластим_курсы
Уже по традиции:
1) Приглашаем вас на вебинар «Обработка таблиц с биологическими данными на Python». Спикер — Зинкевич Арсений, преподаватель ФББ МГУ им. М.В. Ломоносова, системный аналитик в компании Insilico Medicine, сотрудник лаборатории в ИОГен РАН.
Встреча состоится 3 августа в 19:00 по московскому времени.
В программе:
— Работа с таблицами в Python с помощью библиотеки Pandas.
— Объединение таблиц, картирование идентификаторов из различных БД.
— Базовые очистка и фильтрация данных.
— Построение графиков в Python.
— Простые статистические тесты.
Регистрация на вебинар по ссылке!
2) Вы можете принять участие в розыгрыше 5 (!) скидок на курс «Python и Linux для биоинформатики и биологии».
Для этого вам нужно:
— быть подписчиком минимум одной из групп Бластим в соцсетях;
— сделать репост записи о конкурсе у себя на странице или сторис/пост с отметкой аккаунта;
— в публикации написать для чего вам нужен курс по питону от Бластим;
— зарегистрироваться и прийти на вебинар!
Всего будет 5 победителей, и каждый из них получит одну из 5 скидок: 90%, 70%, 50%, 35% и 20%. Итоги мы подведем 3 августа во время вебинара.
#бластим_курсы
👍8
#бластим_рекомендации
Успейте подать документы на магистерскую программу «Создание и разработка лекарственных препаратов» РУДН. Прием документов дистанционно до 24 августа.
Программа охватывает все этапы разработки — от поиска мишени до выведения препарата на рынок, и предусматривает три трека специализации:
— ранняя разработка и доклинические исследования;
— клинические исследования, регуляторика и фармаконадзор;
— фармацевтическая разработка и контроль качества.
✔️ Среди лекторов и спикеров — эксперты отрасли с опытом разработки препаратов и управления этим процессом.
✔️ Практики и стажировки в ведущих фармацевтических компаниях в России и национальных исследовательских центрах.
Абитуриентам, имеющим средний балл при обучении в бакалавриате 4,9, и сдавшим вступительное тестирование на 95%, будет предоставлен грант на обучение из фонда РУДН.
Сайт программы: www.innovativedrugs.ru
Информация для желающих поступить: http://amp.gs/jnsww
Открытый вебинар 6 августа в 16:00: http://amp.gs/jnswX
Успейте подать документы на магистерскую программу «Создание и разработка лекарственных препаратов» РУДН. Прием документов дистанционно до 24 августа.
Программа охватывает все этапы разработки — от поиска мишени до выведения препарата на рынок, и предусматривает три трека специализации:
— ранняя разработка и доклинические исследования;
— клинические исследования, регуляторика и фармаконадзор;
— фармацевтическая разработка и контроль качества.
✔️ Среди лекторов и спикеров — эксперты отрасли с опытом разработки препаратов и управления этим процессом.
✔️ Практики и стажировки в ведущих фармацевтических компаниях в России и национальных исследовательских центрах.
Абитуриентам, имеющим средний балл при обучении в бакалавриате 4,9, и сдавшим вступительное тестирование на 95%, будет предоставлен грант на обучение из фонда РУДН.
Сайт программы: www.innovativedrugs.ru
Информация для желающих поступить: http://amp.gs/jnsww
Открытый вебинар 6 августа в 16:00: http://amp.gs/jnswX
👍5
Хорошие новости из отпуска!
Статья об AlphаFold, инструменте, который определил структуры белков почти всех организмов с данными о последовательности белков. Разработчики считают, что доступная база данных окажет долгосрочное влияние на науки о жизни и потребует значительных изменений в мышлении.
Читать здесь: http://amp.gs/jniXL
Красная водоросль Gracilaria gracilis использует изопод рачка Idotea balthica для переноса своих мужских гамет. Это занимательно тем, что существенно расширяет филогенетические рамки видов, использующих животных в качестве опылителей.
Подробнее здесь: http://amp.gs/jniXa
Недалеко от Страуда, на месте раскопок юрского периода, была найдена ископаемая хищная рыба Pachycormus. Отдельно отмечена исключительная сохранность: у одного экземпляра можно увидеть даже содержимое желудка.
Интересное: http://amp.gs/jniXo
Подборку составила Мария Киреева.
#выходные_у_бластим
Статья об AlphаFold, инструменте, который определил структуры белков почти всех организмов с данными о последовательности белков. Разработчики считают, что доступная база данных окажет долгосрочное влияние на науки о жизни и потребует значительных изменений в мышлении.
Читать здесь: http://amp.gs/jniXL
Красная водоросль Gracilaria gracilis использует изопод рачка Idotea balthica для переноса своих мужских гамет. Это занимательно тем, что существенно расширяет филогенетические рамки видов, использующих животных в качестве опылителей.
Подробнее здесь: http://amp.gs/jniXa
Недалеко от Страуда, на месте раскопок юрского периода, была найдена ископаемая хищная рыба Pachycormus. Отдельно отмечена исключительная сохранность: у одного экземпляра можно увидеть даже содержимое желудка.
Интересное: http://amp.gs/jniXo
Подборку составила Мария Киреева.
#выходные_у_бластим
Nature
‘The entire protein universe’: AI predicts shape of nearly every known protein
Nature - DeepMind’s AlphaFold tool has determined the structures of around 200 million proteins.
👍16❤5
Что получится, если объединить классных преподавателей английского языка и многолетний опыт в найме сотрудников в биотехе?
Мы запускаем набор на курс «Английский язык для ученых», где поможем вам прокачать свои навыки коммуникации для международной карьеры! Эта программа для тех, кто хочет подтянуть английский и разобраться, как рассказывать о себе в западной концепции unique value proposition.
В программе:
— Research pitch: учимся грамотно рассказывать о своем исследовании иностранным коллегам;
— LinkedIn and CV: составляем резюме на английском языке и разбираемся в полезных для трудоустройства инструментах LinkedIn;
— Motivation letter: пишем мотивационное письмо, да ещё и по правилам сторителлинга.
Даты: 23 сентября — 26 октября. Основные занятия будут проходить по понедельникам и средам в 19:00, а дополнительные встречи — по субботам в 11:00 (их наличие зависит от тарифа).
Узнать больше о курсе и записаться: http://amp.gs/jn0p5
#бластим_курсы
Мы запускаем набор на курс «Английский язык для ученых», где поможем вам прокачать свои навыки коммуникации для международной карьеры! Эта программа для тех, кто хочет подтянуть английский и разобраться, как рассказывать о себе в западной концепции unique value proposition.
В программе:
— Research pitch: учимся грамотно рассказывать о своем исследовании иностранным коллегам;
— LinkedIn and CV: составляем резюме на английском языке и разбираемся в полезных для трудоустройства инструментах LinkedIn;
— Motivation letter: пишем мотивационное письмо, да ещё и по правилам сторителлинга.
Даты: 23 сентября — 26 октября. Основные занятия будут проходить по понедельникам и средам в 19:00, а дополнительные встречи — по субботам в 11:00 (их наличие зависит от тарифа).
Узнать больше о курсе и записаться: http://amp.gs/jn0p5
#бластим_курсы
❤10🔥2
Это напоминание про вебинар!
Тема: «Обработка таблиц с биологическими данными на Python».
Спикер: Зинкевич Арсений, преподаватель ФББ МГУ им. М.В. Ломоносова, системный аналитик в компании Insilico Medicine, сотрудник лаборатории в ИОГен РАН.
Встреча пройдет сегодня в 19:00 по московскому времени. Ссылку мы вышлем за час до начала в чат вебинара и на почту, которую можно оставить в анкете регистрации.
Тема: «Обработка таблиц с биологическими данными на Python».
Спикер: Зинкевич Арсений, преподаватель ФББ МГУ им. М.В. Ломоносова, системный аналитик в компании Insilico Medicine, сотрудник лаборатории в ИОГен РАН.
Встреча пройдет сегодня в 19:00 по московскому времени. Ссылку мы вышлем за час до начала в чат вебинара и на почту, которую можно оставить в анкете регистрации.
👍7
#бластим_рекомендации
Увлечены химией? А, может, вы топите за экологию и хотите сделать этот мир немного (или много) лучше? Или обожаете все, что связано с биологией?
Если хотя бы на один вопрос вы ответили утвердительно, то этот пост для вас.
Магистратура ИТМО поможет вам стать профи в сфере химии, биологии или экотехнологий. Не важно какой у вас бэкграунд и сколько вам лет, главное — это ваше желание сделать мир лучше.
3042 бюджетных мест уже ждут вас на программах:
Рециклинг и промышленный симбиоз
Химия и искусственный интеллект
Индустриальная биотехнология
Индустриальная экология
Биоинженерия и биотехнические системы
Роботизация химических технологий
Инфохимия
Экологическая и техносферная безопасность
ФудТех
А еще на эти программы можно поступить на бюджет без экзаменов. Скажем по-секрету, это очень просто. Подробнее о магистратуре в ИТМО можно узнать здесь.
Увлечены химией? А, может, вы топите за экологию и хотите сделать этот мир немного (или много) лучше? Или обожаете все, что связано с биологией?
Если хотя бы на один вопрос вы ответили утвердительно, то этот пост для вас.
Магистратура ИТМО поможет вам стать профи в сфере химии, биологии или экотехнологий. Не важно какой у вас бэкграунд и сколько вам лет, главное — это ваше желание сделать мир лучше.
3042 бюджетных мест уже ждут вас на программах:
Рециклинг и промышленный симбиоз
Химия и искусственный интеллект
Индустриальная биотехнология
Индустриальная экология
Биоинженерия и биотехнические системы
Роботизация химических технологий
Инфохимия
Экологическая и техносферная безопасность
ФудТех
А еще на эти программы можно поступить на бюджет без экзаменов. Скажем по-секрету, это очень просто. Подробнее о магистратуре в ИТМО можно узнать здесь.
👍5
Давно не было вакансий, исправляем!
Врач-генетик в РЖД-Медицина.
Компания в поисках генетика с опытом в медицине и большим списком «мокрых» навыков для поддержки развития генетического направления всей сети.
Специалист в отдел олигонуклеотидного синтеза в Евроген.
Ищут специалиста с профильным высшим образованием и опытом работы в научной или производственной лаборатории от 1 года. Возможно обучение.
Лаборант/молекулярный биолог в ИФМиБ КФУ НИЛ.
Ищут сотрудника со знанием основ молекулярной биологии и биоинформатики и способностью читать научную литературу и протоколы на английском языке. Наличие сертификата КЛД будет плюсом.
#бластим_вакансии
Врач-генетик в РЖД-Медицина.
Компания в поисках генетика с опытом в медицине и большим списком «мокрых» навыков для поддержки развития генетического направления всей сети.
Специалист в отдел олигонуклеотидного синтеза в Евроген.
Ищут специалиста с профильным высшим образованием и опытом работы в научной или производственной лаборатории от 1 года. Возможно обучение.
Лаборант/молекулярный биолог в ИФМиБ КФУ НИЛ.
Ищут сотрудника со знанием основ молекулярной биологии и биоинформатики и способностью читать научную литературу и протоколы на английском языке. Наличие сертификата КЛД будет плюсом.
#бластим_вакансии
👍7
Возможно вы забыли, но у Бластима есть курс о генетических тестах!
С момента записи прошло довольно много времени, но программа остается не менее, а с развитием и доступностью гентестов даже более, полезной.
Получить запись курса можно по ссылке.
Из лекций вы узнаете:
— Как выбрать оптимальный вариант теста по своим запросам и кошельку, не переплачивая?
— Как интерпретировать результатами и какие дополнительные анализы будут полезны?
— За чем следить, чтобы поддержать здоровье в зависимости от результатов и когда стоит обращаться к врачу?
Рекомендации из курса помогут выжать максимум информации из пройденного генетического теста, а также разобраться со многочисленными сервисами анализа результатов.
#бластим_курсы
С момента записи прошло довольно много времени, но программа остается не менее, а с развитием и доступностью гентестов даже более, полезной.
Получить запись курса можно по ссылке.
Из лекций вы узнаете:
— Как выбрать оптимальный вариант теста по своим запросам и кошельку, не переплачивая?
— Как интерпретировать результатами и какие дополнительные анализы будут полезны?
— За чем следить, чтобы поддержать здоровье в зависимости от результатов и когда стоит обращаться к врачу?
Рекомендации из курса помогут выжать максимум информации из пройденного генетического теста, а также разобраться со многочисленными сервисами анализа результатов.
#бластим_курсы
👍5👎1
Хорошие новости!
В Nature вышел материал с чудесным названием «Углеродный вызов, экономика дружбы — неделя в инфографике». Усложнилось радиоуглеродное датирование, но не все так плохо, как может показаться. Источник: http://amp.gs/jnFQo
Вторая экспедиция за 2022 год Арктического плавучего университета (АПУ) вышла в среду с острова Диксона на архипелаг Землю Франца-Иосифа. Исследователи будут искать породы, в которых потенциально может быть нефть и газ. Читать здесь: http://amp.gs/jnFQM
Подборку составила Мария Киреева.
#выходные_у_бластим
В Nature вышел материал с чудесным названием «Углеродный вызов, экономика дружбы — неделя в инфографике». Усложнилось радиоуглеродное датирование, но не все так плохо, как может показаться. Источник: http://amp.gs/jnFQo
Вторая экспедиция за 2022 год Арктического плавучего университета (АПУ) вышла в среду с острова Диксона на архипелаг Землю Франца-Иосифа. Исследователи будут искать породы, в которых потенциально может быть нефть и газ. Читать здесь: http://amp.gs/jnFQM
Подборку составила Мария Киреева.
#выходные_у_бластим
Nature
Carbon dating challenge, friendship economics — the week in infographics
Nature - Discover the world’s best science and medicine | Nature.com
👍5