Состоялась третья лекция по курсу "Введение в биофотонику". Она - об опсинах: это белки, благодаря которым мы видим. И не только мы - они встречаются почти у всех животных и у некоторых бактерий.
Удивительно, что во всех опсинах используется один и тот же светочувствительный элемент - это ретиналь. Эта маленькая молекула при взаимодействии со светом изомеризуется (меняет свою форму), чем вызывает изменение пространственной структуры всего белка, а это уже запускает сигнальный каскад.
Также немного рассказал об оптических системах зрения разных организмов. Оказывается, даже у одноклеточной хламидомонады есть подобие "глаза" - фоторецептор, который с одной стороны защищён от света слоем пигментов. Точнее, несколькими слоями толщиной около 1/4 длины волны видимого света - получается почти идеальное диэлектрическое зеркало.
В конце лекции - об основах оптогенетики. В этом методе тоже используются опсины.
#лекции
Удивительно, что во всех опсинах используется один и тот же светочувствительный элемент - это ретиналь. Эта маленькая молекула при взаимодействии со светом изомеризуется (меняет свою форму), чем вызывает изменение пространственной структуры всего белка, а это уже запускает сигнальный каскад.
Также немного рассказал об оптических системах зрения разных организмов. Оказывается, даже у одноклеточной хламидомонады есть подобие "глаза" - фоторецептор, который с одной стороны защищён от света слоем пигментов. Точнее, несколькими слоями толщиной около 1/4 длины волны видимого света - получается почти идеальное диэлектрическое зеркало.
В конце лекции - об основах оптогенетики. В этом методе тоже используются опсины.
#лекции
Ещё немного о наших разработках - в новости, которую недавно опубликовал НГУ и которая разошлась по Новосибирским каналам (вот, например, пост в канале Академпарка).
https://www.nsu.ru/n/media/news/nauka/novye-pribory-i-drugie-razrabotki-uchenogo-ngu-v-oblasti-biofotoniki-otmecheny-premiey-pravitelstva-/
https://www.nsu.ru/n/media/news/nauka/novye-pribory-i-drugie-razrabotki-uchenogo-ngu-v-oblasti-biofotoniki-otmecheny-premiey-pravitelstva-/
Telegram
АКАДЕМПАРК | channel
Разработки резидента Академпарка в области биофотоники отметили премией правительства Новосибирской области
Результаты исследований заведующего лабораторией оптики и динамики биологических систем Физического факультета НГУ, Александра Москаленского (ООО…
Результаты исследований заведующего лабораторией оптики и динамики биологических систем Физического факультета НГУ, Александра Москаленского (ООО…
Научный журнал Journal of Biophotonics опубликовал нашу статью!
В статье описаны научные принципы работы нашего прибора и приведены результаты экспериментов с биологическими клетками.
Несмотря на то, что подготовка и публикация статей - часть работы учёного, каждый раз это вызывает бурю эмоций. Начиная от "видеть больше не могу этот текст" до фрустрации от замечаний рецензентов и бурной радости от письма редактора "Your paper has been accepted for publication".
В этот раз было три рецензента, два из которых сначала не рекомендовали публикацию. К счастью, редактор дал возможность ответить на их комментарии, так что в итоге удалось нам убедить по крайней мере одного из них. Интересный факт: сама статья занимает 9 страниц, а ответы на рецензии - 10 страниц (за две ревизии). Если кому-нибудь интересно, могу выложить переписку с рецензентами - пишите в комментариях.
#публикации
В статье описаны научные принципы работы нашего прибора и приведены результаты экспериментов с биологическими клетками.
Несмотря на то, что подготовка и публикация статей - часть работы учёного, каждый раз это вызывает бурю эмоций. Начиная от "видеть больше не могу этот текст" до фрустрации от замечаний рецензентов и бурной радости от письма редактора "Your paper has been accepted for publication".
В этот раз было три рецензента, два из которых сначала не рекомендовали публикацию. К счастью, редактор дал возможность ответить на их комментарии, так что в итоге удалось нам убедить по крайней мере одного из них. Интересный факт: сама статья занимает 9 страниц, а ответы на рецензии - 10 страниц (за две ревизии). Если кому-нибудь интересно, могу выложить переписку с рецензентами - пишите в комментариях.
#публикации
Wiley Online Library
Wireless monitoring of cell cultures based on light scattering: A novel optical scheme and portable prototype
Journal of Biophotonics, a Wiley physics journal, publishes research at the interface of photonics & life science, medicine, environmental science, nutrition & biology.
На картинке - различные случаи распространения света в рассеивающей среде (взята отсюда).
Множество неоднородностей в биологических тканях приводит к сложному теоретическому описанию распространения света. Особенно в случае красной и ближней инфракрасной области, когда поглощение мало и фотоны путешествуют между неоднородностями, испытывая многократное рассеяние.
Но начать обсуждение можно с задачи рассеяния электромагнитной волны одной изолированной частицей. Её проще понять и ввести теоретические концепции (например, сечение рассеяния, экстинкции и поглощения, параметр ассимметрии рассеяния).
Именно про это говорили сегодня на лекции. Но пока дошли только до определения рассеянного поля 😊
А ещё в качестве "живого эксперимента" наблюдали флуоресценцию порфирина.
#лекции
Множество неоднородностей в биологических тканях приводит к сложному теоретическому описанию распространения света. Особенно в случае красной и ближней инфракрасной области, когда поглощение мало и фотоны путешествуют между неоднородностями, испытывая многократное рассеяние.
Но начать обсуждение можно с задачи рассеяния электромагнитной волны одной изолированной частицей. Её проще понять и ввести теоретические концепции (например, сечение рассеяния, экстинкции и поглощения, параметр ассимметрии рассеяния).
Именно про это говорили сегодня на лекции. Но пока дошли только до определения рассеянного поля 😊
А ещё в качестве "живого эксперимента" наблюдали флуоресценцию порфирина.
#лекции
🎉 В пятницу состоялась защита кандидатской диссертации члена нашей команды, талантливого химика Михаила!
🎓 Тема диссертации - «Синтез флуоресцентных индикаторов и фотоактивируемых доноров оксида азота (II)», специальность 1.4.3 Органическая химия.
🧙♂️ На фото Михаил со своим научным руководителем - Алексеем Воробьевым. Алексей - заведующий лабораторией фотоактивируемых процессов, один из лучших химиков-синтетиков Академгородка и гениальный преподаватель.
🏰 Михаил и Алексей работают в Новосибирском институте органической химии СО РАН, а также вовлечены в проекты нашей лаборатории. Ведь фотоактивируемые доноры оксида азота для нас - одно из главных направлений.
👨🔬 Желаем Михаилу не останавливаться на достигнутом, развивать науку и однажды получить Нобелевскую премию!
#люди #события
🎓 Тема диссертации - «Синтез флуоресцентных индикаторов и фотоактивируемых доноров оксида азота (II)», специальность 1.4.3 Органическая химия.
🧙♂️ На фото Михаил со своим научным руководителем - Алексеем Воробьевым. Алексей - заведующий лабораторией фотоактивируемых процессов, один из лучших химиков-синтетиков Академгородка и гениальный преподаватель.
🏰 Михаил и Алексей работают в Новосибирском институте органической химии СО РАН, а также вовлечены в проекты нашей лаборатории. Ведь фотоактивируемые доноры оксида азота для нас - одно из главных направлений.
👨🔬 Желаем Михаилу не останавливаться на достигнутом, развивать науку и однажды получить Нобелевскую премию!
#люди #события
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Плавающие в образце крупинки означают, что вещество не растворяется в данном растворителе. Из-за этого количественные измерения люминесценции провести невозможно. Зато красиво!
#эксперименты
#эксперименты
Интересные оптические эффекты встречаются в самых простых организмах. Хламидомонада — род одноклеточных зелёных водорослей, способных к фотосинтезу. Они имеют жгутики, которые нужны для перемещения - в том числе по направлению к свету или от него.
Чтобы определить, в каком направлении нужно двигаться, хламидомонада имеет специальный глазок. Его схема показана на картинке (взята отсюда). Помимо светочувствительных элементов - рецепторов родопсина - клетке необходим "экран", который блокирует свет с одной стороны. Без "экрана" рецепторы реагировали бы на свет, приходящий со всех сторон, ведь клетка сама по себе прозрачная.
В качестве экрана хламидомонада использует слой гранул с каротиноидами. Но это не просто поглотители света. Гранулы аккуратно расположены слоями, между которыми расположены слои без пигментов. Все эти слои имеют толщину около 70 нм и образуют структуру, очень похожую на Брэгговское зеркало.
Брэгговское зеркало - структура, часто применяющаяся в фотонике, которая состоит из чередующихся слоев двух различных оптических материалов. Наиболее часто используется конструкция в виде четвертьволнового зеркала, где толщина каждого оптического слоя соответствует четверти длины волны, для которой разработано зеркало.
В случае хламидомонады максимальное отражение получается в диапазоне длин волн около 420-510 нм (видимый свет). Аналогия между глазком хламидомонады и четвертьволновым зеркалом была впервые описана в статье Forster & Smith, "Light Antennas in phototactic algae", Microbiological reviews, 1980 год. В этой статье авторы показывают, что глазок хламидомонады - это "multilayer quarter-wave stack antenna", и именно направленность этой антенны помогает клетке двигаться к свету.
#образовательное
Чтобы определить, в каком направлении нужно двигаться, хламидомонада имеет специальный глазок. Его схема показана на картинке (взята отсюда). Помимо светочувствительных элементов - рецепторов родопсина - клетке необходим "экран", который блокирует свет с одной стороны. Без "экрана" рецепторы реагировали бы на свет, приходящий со всех сторон, ведь клетка сама по себе прозрачная.
В качестве экрана хламидомонада использует слой гранул с каротиноидами. Но это не просто поглотители света. Гранулы аккуратно расположены слоями, между которыми расположены слои без пигментов. Все эти слои имеют толщину около 70 нм и образуют структуру, очень похожую на Брэгговское зеркало.
Брэгговское зеркало - структура, часто применяющаяся в фотонике, которая состоит из чередующихся слоев двух различных оптических материалов. Наиболее часто используется конструкция в виде четвертьволнового зеркала, где толщина каждого оптического слоя соответствует четверти длины волны, для которой разработано зеркало.
В случае хламидомонады максимальное отражение получается в диапазоне длин волн около 420-510 нм (видимый свет). Аналогия между глазком хламидомонады и четвертьволновым зеркалом была впервые описана в статье Forster & Smith, "Light Antennas in phototactic algae", Microbiological reviews, 1980 год. В этой статье авторы показывают, что глазок хламидомонады - это "multilayer quarter-wave stack antenna", и именно направленность этой антенны помогает клетке двигаться к свету.
#образовательное
Сегодня на лекции по биофотонике рассматривали явление интерференции, которое приводит к таким красивым зависимостям, как на первой картинке (взята отсюда). Прелесть этого явления в том, что его просто описать математическим языком и понять физически: есть рассеивающие центры, есть разность хода лучей, которая зависит от положения детектора, поэтому и возникает осциллирующая зависимость от углов рассеяния.
Если рассеивающие центры стабильны, то и интерференционная картина не будет меняться. А если они движутся, то максимумы и минимумы смещаются. На этом основан метод визуализации сосудов Laser Speckle Contrast Imaging. Ткань освещается монохроматическим светом, камера регистрирует интерференционную картину, потом всё это усредняется по времени. Так как в сосудах движутся эритроциты (которые хорошо рассеивают свет), интерференционная картина замывается и при усреднении по времени даёт почти нулевой результат. Можно получить чёткие изображения сосудов - например, как на второй картинке (взята из этой статьи).
Мы решили на следующей лекции воспроизвести этот метод "вживую". Кто-нибудь из подписчиков пробовал такое сделать?
#лекции
Если рассеивающие центры стабильны, то и интерференционная картина не будет меняться. А если они движутся, то максимумы и минимумы смещаются. На этом основан метод визуализации сосудов Laser Speckle Contrast Imaging. Ткань освещается монохроматическим светом, камера регистрирует интерференционную картину, потом всё это усредняется по времени. Так как в сосудах движутся эритроциты (которые хорошо рассеивают свет), интерференционная картина замывается и при усреднении по времени даёт почти нулевой результат. Можно получить чёткие изображения сосудов - например, как на второй картинке (взята из этой статьи).
Мы решили на следующей лекции воспроизвести этот метод "вживую". Кто-нибудь из подписчиков пробовал такое сделать?
#лекции
Уже завтра в НГУ начинает свою работу форум "Золотая долина".
Это одно из немногих мероприятий, где вместе собираются представители науки и индустрии. Например, тематика пленарного заседания - «Запросы реального сектора экономики на создание новых технологий». Звучит просто отлично!
А ещё на Форуме будет проходить выставка научных и прикладных разработок. Мы участвуем с проектом OptiCounter! Будем делиться с вами происходящим.
#события
Это одно из немногих мероприятий, где вместе собираются представители науки и индустрии. Например, тематика пленарного заседания - «Запросы реального сектора экономики на создание новых технологий». Звучит просто отлично!
А ещё на Форуме будет проходить выставка научных и прикладных разработок. Мы участвуем с проектом OptiCounter! Будем делиться с вами происходящим.
#события
В этом голосовании можно выбрать лучший проект на выставке! Вы знаете, что делать 😊
https://t.me/zolotayadolina2023/59
https://t.me/zolotayadolina2023/59
Telegram
«Золотая Долина-2023»
В рамках форума в холле 2 этажа до 18:00 работает выставка проектов, технологий, новейших передовых индустриальных достижений!
Она будет открыта оба дня, 1 и 2 ноября.
👉🏼 Голосуйте за стенды с самыми перспективными, на ваш взгляд, проектами: https://do…
Она будет открыта оба дня, 1 и 2 ноября.
👉🏼 Голосуйте за стенды с самыми перспективными, на ваш взгляд, проектами: https://do…
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Маленький клип о выставке (+ вставили кадры разработки прибора).
Заряжайтесь позитивом! Хороших выходных!
Заряжайтесь позитивом! Хороших выходных!
Привет, друзья!
🎧 Слушаете ли вы подкасты? Если нет - попробуйте, это отличный способ узнать множество нового и интересного. А ещё - прокачать свой английский. Сейчас выбор подкастов огромен, в том числе и научных. Сделали для вас подборку выпусков по биофотонике!
🇬🇧 на английском языке
🎧 Подкаст Futureproof Extra, серия "Pigments in the fossil record & the medical applications of Biophotonics"
В этом выпуске вы узнаете о пигментах динозавров (и заодно - почему ваш кот рыжий или чёрный), а ещё - почему венозная и артериальная кровь разного цвета и как это можно использовать. Интересный разговор с палеобиологом (Dr Tiffany Slater) и биофизиком (Professor Stefan Andersson-Engles).
🎧 Подкаст All Things Photonics, серия "BIOMEDICAL OPTICS — THE BIOPHOTONICS CONFERENCE EPISODE"
Это разговор об отношениях между наукой, индустрией и медициной, а также методах лечения и диагностики рака, производстве биомедицинских устройств. Гость - prof. Brian Pogue, глава отдела медицинской физики университета Висконсина и главный редактор журнала Journal of Biomedical Optics.
🎧 Подкаст Podcast or Perish, серия "Episode 037: Ozzy Mermut"
Один из лучших научных подскастов. Ozzy Mermut - исследователь в области диагностики и лечения возрастных заболеваний глаз с помощью лазеров. В этом выпуске - интереснейшее интервью с Оззи. На сайте есть текстовая расшифровка.
🇷🇺 на русском языке
🎧 подкаст "Мы все умрем. Но это не точно", серия "Сделать кислород убийцей раковой клетки: что такое биофотоника?"
Разговор с Дмитрием Гориным, профессором Сколтеха. Возможно ли услышать свет, и как это помогает находить опухоли на ранних стадиях? В каких случаях введёное пациенту вещество должно поглощать свет, а в каких излучать его?
🎧 подкаст Нижегродского НОЦ, выпуск "Биофотоника. Новый взгляд на известные проблемы".
Разговор с экспертами и партнерами Нижегородского НОЦ о взаимодействии света с биологическими объектами и о практической значимости биофотоники в настоящее время.
Знаете ещё подкасты о биофотонике? Пишите в комментариях. С удовольствием добавим в подборку!
🇬🇧 на английском языке
🎧 Подкаст Futureproof Extra, серия "Pigments in the fossil record & the medical applications of Biophotonics"
В этом выпуске вы узнаете о пигментах динозавров (и заодно - почему ваш кот рыжий или чёрный), а ещё - почему венозная и артериальная кровь разного цвета и как это можно использовать. Интересный разговор с палеобиологом (Dr Tiffany Slater) и биофизиком (Professor Stefan Andersson-Engles).
🎧 Подкаст All Things Photonics, серия "BIOMEDICAL OPTICS — THE BIOPHOTONICS CONFERENCE EPISODE"
Это разговор об отношениях между наукой, индустрией и медициной, а также методах лечения и диагностики рака, производстве биомедицинских устройств. Гость - prof. Brian Pogue, глава отдела медицинской физики университета Висконсина и главный редактор журнала Journal of Biomedical Optics.
🎧 Подкаст Podcast or Perish, серия "Episode 037: Ozzy Mermut"
Один из лучших научных подскастов. Ozzy Mermut - исследователь в области диагностики и лечения возрастных заболеваний глаз с помощью лазеров. В этом выпуске - интереснейшее интервью с Оззи. На сайте есть текстовая расшифровка.
🇷🇺 на русском языке
🎧 подкаст "Мы все умрем. Но это не точно", серия "Сделать кислород убийцей раковой клетки: что такое биофотоника?"
Разговор с Дмитрием Гориным, профессором Сколтеха. Возможно ли услышать свет, и как это помогает находить опухоли на ранних стадиях? В каких случаях введёное пациенту вещество должно поглощать свет, а в каких излучать его?
🎧 подкаст Нижегродского НОЦ, выпуск "Биофотоника. Новый взгляд на известные проблемы".
Разговор с экспертами и партнерами Нижегородского НОЦ о взаимодействии света с биологическими объектами и о практической значимости биофотоники в настоящее время.
Знаете ещё подкасты о биофотонике? Пишите в комментариях. С удовольствием добавим в подборку!
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Apple Podcasts
Futureproof with Jonathan McCrea: Futureproof Extra: Pigments in the fossil record & the medical applications of Biophotonics…
Show Futureproof with Jonathan McCrea, Ep Futureproof Extra: Pigments in the fossil record & the medical applications of Biophotonics - 23 Oct 2023