Biophotonics NSU
996 subscribers
444 photos
40 videos
14 files
158 links
Канал научной лаборатории НГУ о биофотонике.

Пишите @sunmosk
Download Telegram
Состоялась третья лекция по курсу "Введение в биофотонику". Она - об опсинах: это белки, благодаря которым мы видим. И не только мы - они встречаются почти у всех животных и у некоторых бактерий.

Удивительно, что во всех опсинах используется один и тот же светочувствительный элемент - это ретиналь. Эта маленькая молекула при взаимодействии со светом изомеризуется (меняет свою форму), чем вызывает изменение пространственной структуры всего белка, а это уже запускает сигнальный каскад.

Также немного рассказал об оптических системах зрения разных организмов. Оказывается, даже у одноклеточной хламидомонады есть подобие "глаза" - фоторецептор, который с одной стороны защищён от света слоем пигментов. Точнее, несколькими слоями толщиной около 1/4 длины волны видимого света - получается почти идеальное диэлектрическое зеркало.

В конце лекции - об основах оптогенетики. В этом методе тоже используются опсины.

#лекции
Научный журнал Journal of Biophotonics опубликовал нашу статью!

В статье описаны научные принципы работы нашего прибора и приведены результаты экспериментов с биологическими клетками.

Несмотря на то, что подготовка и публикация статей - часть работы учёного, каждый раз это вызывает бурю эмоций. Начиная от "видеть больше не могу этот текст" до фрустрации от замечаний рецензентов и бурной радости от письма редактора "Your paper has been accepted for publication".

В этот раз было три рецензента, два из которых сначала не рекомендовали публикацию. К счастью, редактор дал возможность ответить на их комментарии, так что в итоге удалось нам убедить по крайней мере одного из них. Интересный факт: сама статья занимает 9 страниц, а ответы на рецензии - 10 страниц (за две ревизии). Если кому-нибудь интересно, могу выложить переписку с рецензентами - пишите в комментариях.

#публикации
На картинке - различные случаи распространения света в рассеивающей среде (взята отсюда).

Множество неоднородностей в биологических тканях приводит к сложному теоретическому описанию распространения света. Особенно в случае красной и ближней инфракрасной области, когда поглощение мало и фотоны путешествуют между неоднородностями, испытывая многократное рассеяние.

Но начать обсуждение можно с задачи рассеяния электромагнитной волны одной изолированной частицей. Её проще понять и ввести теоретические концепции (например, сечение рассеяния, экстинкции и поглощения, параметр ассимметрии рассеяния).

Именно про это говорили сегодня на лекции. Но пока дошли только до определения рассеянного поля 😊

А ещё в качестве "живого эксперимента" наблюдали флуоресценцию порфирина.

#лекции
🎉 В пятницу состоялась защита кандидатской диссертации члена нашей команды, талантливого химика Михаила!

🎓 Тема диссертации - «Синтез флуоресцентных индикаторов и фотоактивируемых доноров оксида азота (II)», специальность 1.4.3 Органическая химия.

🧙‍♂️ На фото Михаил со своим научным руководителем - Алексеем Воробьевым. Алексей - заведующий лабораторией фотоактивируемых процессов, один из лучших химиков-синтетиков Академгородка и гениальный преподаватель.

🏰 Михаил и Алексей работают в Новосибирском институте органической химии СО РАН, а также вовлечены в проекты нашей лаборатории. Ведь фотоактивируемые доноры оксида азота для нас - одно из главных направлений.

👨‍🔬 Желаем Михаилу не останавливаться на достигнутом, развивать науку и однажды получить Нобелевскую премию!

#люди #события
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Плавающие в образце крупинки означают, что вещество не растворяется в данном растворителе. Из-за этого количественные измерения люминесценции провести невозможно. Зато красиво!

#эксперименты
Интересные оптические эффекты встречаются в самых простых организмах. Хламидомонада — род одноклеточных зелёных водорослей, способных к фотосинтезу. Они имеют жгутики, которые нужны для перемещения - в том числе по направлению к свету или от него.

Чтобы определить, в каком направлении нужно двигаться, хламидомонада имеет специальный глазок. Его схема показана на картинке (взята отсюда). Помимо светочувствительных элементов - рецепторов родопсина - клетке необходим "экран", который блокирует свет с одной стороны. Без "экрана" рецепторы реагировали бы на свет, приходящий со всех сторон, ведь клетка сама по себе прозрачная.

В качестве экрана хламидомонада использует слой гранул с каротиноидами. Но это не просто поглотители света. Гранулы аккуратно расположены слоями, между которыми расположены слои без пигментов. Все эти слои имеют толщину около 70 нм и образуют структуру, очень похожую на Брэгговское зеркало.

Брэгговское зеркало - структура, часто применяющаяся в фотонике, которая состоит из чередующихся слоев двух различных оптических материалов. Наиболее часто используется конструкция в виде четвертьволнового зеркала, где толщина каждого оптического слоя соответствует четверти длины волны, для которой разработано зеркало.

В случае хламидомонады максимальное отражение получается в диапазоне длин волн около 420-510 нм (видимый свет). Аналогия между глазком хламидомонады и четвертьволновым зеркалом была впервые описана в статье Forster & Smith, "Light Antennas in phototactic algae", Microbiological reviews, 1980 год. В этой статье авторы показывают, что глазок хламидомонады - это "multilayer quarter-wave stack antenna", и именно направленность этой антенны помогает клетке двигаться к свету.

#образовательное
Сегодня на лекции по биофотонике рассматривали явление интерференции, которое приводит к таким красивым зависимостям, как на первой картинке (взята отсюда). Прелесть этого явления в том, что его просто описать математическим языком и понять физически: есть рассеивающие центры, есть разность хода лучей, которая зависит от положения детектора, поэтому и возникает осциллирующая зависимость от углов рассеяния.

Если рассеивающие центры стабильны, то и интерференционная картина не будет меняться. А если они движутся, то максимумы и минимумы смещаются. На этом основан метод визуализации сосудов Laser Speckle Contrast Imaging. Ткань освещается монохроматическим светом, камера регистрирует интерференционную картину, потом всё это усредняется по времени. Так как в сосудах движутся эритроциты (которые хорошо рассеивают свет), интерференционная картина замывается и при усреднении по времени даёт почти нулевой результат. Можно получить чёткие изображения сосудов - например, как на второй картинке (взята из этой статьи).

Мы решили на следующей лекции воспроизвести этот метод "вживую". Кто-нибудь из подписчиков пробовал такое сделать?

#лекции
Уже завтра в НГУ начинает свою работу форум "Золотая долина".

Это одно из немногих мероприятий, где вместе собираются представители науки и индустрии. Например, тематика пленарного заседания - «Запросы реального сектора экономики на создание новых технологий». Звучит просто отлично!

А ещё на Форуме будет проходить выставка научных и прикладных разработок. Мы участвуем с проектом OptiCounter! Будем делиться с вами происходящим.

#события
Наш стенд на форуме «Золотая Долина» !

#события
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Маленький клип о выставке (+ вставили кадры разработки прибора).
Заряжайтесь позитивом! Хороших выходных!
Привет, друзья!

🎧 Слушаете ли вы подкасты? Если нет - попробуйте, это отличный способ узнать множество нового и интересного. А ещё - прокачать свой английский. Сейчас выбор подкастов огромен, в том числе и научных. Сделали для вас подборку выпусков по биофотонике!

🇬🇧 на английском языке

🎧 Подкаст Futureproof Extra, серия "Pigments in the fossil record & the medical applications of Biophotonics"
В этом выпуске вы узнаете о пигментах динозавров (и заодно - почему ваш кот рыжий или чёрный), а ещё - почему венозная и артериальная кровь разного цвета и как это можно использовать. Интересный разговор с палеобиологом (Dr Tiffany Slater) и биофизиком (Professor Stefan Andersson-Engles).

🎧 Подкаст All Things Photonics, серия "BIOMEDICAL OPTICS — THE BIOPHOTONICS CONFERENCE EPISODE"
Это разговор об отношениях между наукой, индустрией и медициной, а также методах лечения и диагностики рака, производстве биомедицинских устройств. Гость - prof. Brian Pogue, глава отдела медицинской физики университета Висконсина и главный редактор журнала Journal of Biomedical Optics.

🎧 Подкаст Podcast or Perish, серия "Episode 037: Ozzy Mermut"
Один из лучших научных подскастов. Ozzy Mermut - исследователь в области диагностики и лечения возрастных заболеваний глаз с помощью лазеров. В этом выпуске - интереснейшее интервью с Оззи. На сайте есть текстовая расшифровка.

🇷🇺 на русском языке

🎧 подкаст "Мы все умрем. Но это не точно", серия "Сделать кислород убийцей раковой клетки: что такое биофотоника?"
Разговор с Дмитрием Гориным, профессором Сколтеха. Возможно ли услышать свет, и как это помогает находить опухоли на ранних стадиях? В каких случаях введёное пациенту вещество должно поглощать свет, а в каких излучать его?

🎧 подкаст Нижегродского НОЦ, выпуск "Биофотоника. Новый взгляд на известные проблемы".
Разговор с экспертами и партнерами Нижегородского НОЦ о взаимодействии света с биологическими объектами и о практической значимости биофотоники в настоящее время.

Знаете ещё подкасты о биофотонике? Пишите в комментариях. С удовольствием добавим в подборку!
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM