​Чем больше исследователи накапливают знаний об изменчивости последовательностей различных генов животных и растений, и чем больше появляется методов биоинформатической обработки генетических данных, тем менее возможным становится экспертное, умозрительное выделение того или иного вида. Все чаще этот процесс отдается на откуп формальным математическим методам. При этом у исследователей возникает соблазн выделить те или иные популяции или региональные группы в отдельные таксоны. Каким способом проводить делимитацию видов на основе генетических данных? В этой работе мы сравниваем разные методы автоматического разделения видов на примере ДНК-идентификации рыб из Плещеева озера, расположенного в Ярославской области России.

Читайте на сайте.

Авторы: Дмитрий Карабанов, Алексей Котов

#Биомолекула_новость

​​В этой статье, подготовленной совместно с Институтом биоинформатики, мы расскажем о том, как отдельные эксперименты и начинания в области биостатистики выросли в комплексную дисциплину; что значит быть биостатистиком сегодня; а также о программах Института биоинформатики, которые позволили многим выпускникам стать успешными специалистами в этой области.

Читайте на сайте.

Авторы: Алиса Моршнева, Алиса Селезнева, Павел Дерябин, Наталья Зорина

На программу биостатистики открыт набор до 21 июля.

#Биомолекула_новость

Рубрика — #Месяц_на_Биомолекуле! Все статьи нашего сайта за месяц.

☺️Следите за нашими постами и будьте в курсе всех событий вместе с БМ.
Итак, что нового появилось на Биомолекуле в июле?👀👀👀

🧬Спецпроект Гемофильная палочка: колесо Фортуны.
🧬Спецпроект Унесенные корью: корь у взрослых — это опасно?

🔬Новости:
— Разграничение видов при помощи генетических данных: пример ДНК-идентификации рыб из озера Плещеево Рубрика #Биомолекула_новость
— Чем докажешь? Заметка о современной (и не очень) биостатистике Рубрика #Биомолекула_новость
— Розалиндагейт 
Рубрика #Биомолекула_дата

🦠 Дайджест SciNat:
#1: новый конкурент CRISPR/​Cas9, секреты клеточной гибели и полет клеща 
#2: микроскопы, микроядра и нанотела
#3: пластик в коралловых рифах, неостановимые энхансеры и одомашненные тополя 
#4: выбор еды за иммунной системой, генетические предпосылки бессимптомного течения COVID-19 и становления человечества на ноги 
#5: this is molecular SPARTA!, секреты регенерации и молекулы-маммокины 
Рубрика #Биомолекула_дайджест

📚А также читайте наши рецензии и выбирайте книгу по душе.
▪️Металлы: Физика, химия, история 
▪️Главное в истории медицины
▪️Не один дома: Естественная история нашего жилища от бактерий до многоножек, тараканов и пауков 
▪️Метамышление. Как нейронауки помогают нам понять себя 
▪️Метазоа: Зарождение разума в животном мире  
▪️Это просто я: как наука объясняет наши странности и привычки 
▪️Наука в комиксах. Том 1. 
▪️Кто мы такие? Гены, наше тело, общество
▪️Лекарства от... Фармацевт о препаратах первой необходимости и о том, чему не место в вашей аптечке 
Рубрика #Биомолекула_рецензия

🧪Рубрика #Биомолекула_chromatin
1) Изменение трехмерной организации генома в районе участков генома человека с ускоренной эволюцией
2) Стопки петель организуют сворачивание генома в пространстве: от ТАДов к хромосомам
3) Надзор за геномом во время транскрипции, осуществляемый комплексом HUSH, связан с белками терминации

Переходите на наш сайт и читайте статьи из мира науки 🧬
Оставайтесь с нами в августе!

​В 2023 году лауреатами Нобелевской премии по физиологии и медицине стали Каталин Карико и Дрю Вайсман. Эти исследователи десятилетиями изучали перспективы использования вакцин на основе мРНК и изобрели способ модификации РНК, благодаря которому создание таких вакцин стало возможно. Их работы легли в основу самых современных прививок против «прославившегося» COVID-19 — знаменитых Comirnaty от Pfizer/BioNTech и Moderna. (В скобках отметим, что, хотя последняя пандемия и принесла нам целый букет действенных вакцин — тот же «Спутник V», — но именно мРНК-вакцины по праву считаются самыми инновационными.)

Читайте на нашем сайте.

Автор: Алексей Дукат

#Биомолекула_новость

​Нобелевский комитет вручил премию по химии за создание уникальных наночастиц — квантовых точек. В отличие от других материалов, их электрические, оптические и иные физические свойства меняются при увеличении размеров частиц. Для сравнения, вода в кристаллике льда любого размера не меняет цвет и температуру плавления. Это открытие важно с разных сторон. Оно фундаментально изменило химию, потому что ввело в использование новый класс материалов. Эти частицы расширили возможности для развития технологий, к примеру, цветных экранов QLED. Наконец, квантовые точки помогают биологам окрашивать нужные молекулы в живых клетках, а хирургам — находить опухоль во время операций.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Александр Хазанов

#Биомолекула_новость

​​Бактериофаги для отделения интенсивной терапии: российские исследователи проверили новый подход

Интерес врачей и ученых к применению бактериофагов в лечении бактериальных инфекций продолжает расти во всем мире. Во многом это продиктовано нарастающей проблемой антибиотикорезистентности. У фагопрепаратов есть преимущества, но с их внедрением в клиническую практику возникает немало сложностей. Например, трудно совместить современные требования к клиническим исследованиям и регистрации лекарственных препаратов с необходимостью создавать для пациентов с инфекциями, вызванными разными видами и штаммами микроорганизмов, персонализированные коктейли из фагов. Эксперты ищут пути решения этой проблемы. Перспективный подход продемонстрировали исследователи из Федерального научно-клинического центра реаниматологии и реабилитологии (ФНКЦ РР) и НПЦ «Микромир». В своей работе, опубликованной 14 декабря 2023 года в журнале Antibiotics, они подбирали комбинации бактериофагов не индивидуально для каждого пациента, а с учетом бактерий, циркулирующих в отделении интенсивной терапии.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Артем Кабанов

#Биомолекула_новость

​Как первые российские CAR-T-клетки с опухолью боролись

В феврале 2024 года в Москве прошел Форум будущих технологий, на котором среди биотехнологических и биомедицинских достижений российских ученых была представлена работа по созданию первого российского CAR-T-клеточного препарата для лечения онкологических заболеваний, направленного против CD19+ В-лимфоцитов. Мы поговорили с руководителем проекта, заведующей лабораторией трансплантационной иммунологии ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России Аполлинарией Боголюбовой-Кузнецовой о том, как вообще возникла эта идея, что позволило команде с по сути космической скоростью создать работающий препарат в условиях постоянных ограничений и ухода с рынка многих компаний, а также о мечтах и реальных планах на ближайшее будущее.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Ирина Линге

#Биомолекула_новость

​Разнообразие исследований в онкологии отражает многоликость этой группы заболеваний — ежемесячно выходят десятки работ, в которых злокачественные опухоли исследуются на всех уровнях, от молекулярного до популяционного. Мы предлагаем вашему вниманию дайджест наиболее интересных исследований из самых уважаемых научных журналов мира, чтобы ориентироваться в море новой информации.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Камиль Айсин

#Биомолекула_новость

​В нужное время и в нужном месте — чем не максима онкотерапии? Новые исследования показывают, что нужное время может быть даже специфическим временем суток, когда организм лучше готов бороться со злокачественными клетками. А нужного места можно достигнуть разными способами, даже если лекарство в твоих руках имеет более чем полувековую историю.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Камиль Айсин

#Биомолекула_новость

​Одна из стратегий борьбы с онкологическими заболеваниями — сломать в раковых клетках всё так, чтобы они уже точно не смогли дальше расти и размножаться. И тут начинается гонка вооружений. Ученые находят белок, который надо ингибировать — раковые клетки находят способ не реагировать на ингибитор. Теперь для одного из ингибиторов ученые поняли, что именно позволяет игнорировать терапию. Это уже шах или просто ход конем?

Читайте на нашем сайте.

Автор: Камиль Айсин

#Биомолекула_новость

​Геном человека кодирует около 20 тысяч белков, количество же активных молекул РНК, судя по всему, еще в несколько раз больше. О большинстве этих молекул не известно почти ничего. Роль других в норме и при онкологических заболеваниях постепенно проясняется. Но и в «старых» и, казалось бы, хорошо изученных биомолекулах порой открываются новые важные черты.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Камиль Айсин

#Биомолекула_новость

​Злокачественную опухоль и ее микроокружение можно сравнить с итальянской мафией периода ее расцвета — преступность множится, процветает, захватывает новые территории, а все вокруг либо закрывают на это глаза, либо оказываются вовлечены в эту порочную деятельность. В этой метафоре клетки иммунитета — коррумпированная полиция. Что же заставляет природных защитников организма обратиться против него?

Читайте на нашем сайте.

Автор: Камиль Айсин

#Биомолекула_новость

🔥 #Месяц_на_Биомолекуле! Все статьи нашего сайта за месяц 👀

🧬Статья "Аутоиммунные заболевания нервной системы: как сдержать нечаянное зло?" в рамках спецпроекта Нейрофармакология.
🧬Статья "Современное свиноводство: от профилактики инфекций до модификации генома" в рамках спецпроекта Ветеринария.

🔬Новости:
— Клеточная мафия и коррумпированные комиссары
Рубрика #Биомолекула_новость

🦠Дайджест SciNat:
#1: далеко ли до чтения мыслей, новые теории о мигрени, новые причины «длительного COVID»
#2: антиплазмидная защита, эритроциты насекомых и лягушачья сауна
#3: почему мелкие хромосомы часто не расходятся при мейозе, как ускорить разложение пластика
#4: удивительный морской червь, очередной пациент спасен от ВИЧ, хроматин и память

📖 Рецензии:
▪️Что едят сурикаты и другие голодные животные
▪️Морские животные в комиксах
▪️Билли и его гены. Книга о тебе и ДНК
▪️Космос
▪️Огарок во тьме
▪️Как умирали динозавры. Убийственный астероид и рождение нового мира
▪️Атомы науки
▪️Хроники испанки
▪️Невероятные носы
▪️Машина творения
Рубрика #Биомолекула_рецензия

🧪 Рубрика #Биомолекула_chromatin
– p53 быстро реорганизует геном в пространстве для транскрипционного ответа на стимул
– Репрессия генов комплексом Polycomb осуществляется по механизму обратной связи в пространстве, а не компактизации хроматина или разделения фаз
– Много дальних взаимодействий участков Polycomb и слабые компартменты – основные признаки организации человеческого генома в нейронах
– Организация гетерохроматина в пространстве направляется механизмами, зависимыми и независимыми от взаимодействия HP1 с H3K9me3

Переходите на наш сайт и читайте статьи из мира науки 🧬
Оставайтесь с нами в августе!

Бактериофагам давно прочат роль главной альтернативы антибиотикам. Но с их применением в медицине есть немало сложностей. Например, фаготерапию нужно подбирать индивидуально для каждого пациента, но не существует простого и быстрого способа проверить чувствительность бактерий к вирусам. К тому же коллекции фагов разбросаны по разным организациям и нет единой централизованной системы. Поэтому учёным сложно быстро обмениваться образцами тех или иных фагов. Решение этих проблем предложили канадские исследователи из Макмастерского университета и университета Лаваля. Они «упаковали» фаги вместе с некоторыми реагентами в таблетки и поместили в планшеты размером с книгу. Эти «карманные хранилища» не сильно требовательны к условиям хранения и транспортировки и позволяют проанализировать чувствительность патогенных бактерий к фагам за 30–120 минут. О своей разработке ученые рассказали в июльском выпуске Nature Communications.

Читайте на сайте.

Автор: Артем Кабанов

#Биомолекула_новость

🔥 #Месяц_на_Биомолекуле! Все статьи нашего сайта за месяц 👀

🔬Новости:
— Биофарма в первом полугодии 2024: неслыханные генные новости, новые показания GLP-1, непокорный Альцгеймер
— Галопом по обзорам: летний марафон 2024
Рубрика #Биомолекула_дайджест
— Светящиеся таблетки: предложен новый способ хранить и идентифицировать бактериофаги, а также делиться ими
Рубрика #Биомолекула_новость

🦠Дайджест SciNat:
#1: мини-кишечники и мега-геномные проекты
#2: нейроны выбора между едой и спортом, микробиом микроволновки и рекордно большие ферменты водорослей
#3: ИИ-крыса, доставка белков в мозг при помощи токсоплазмы и «анти-рипплы» в гиппокампе
#4: одинокие растения, долгоживущие ископаемые зверьки и «темная сторона» голодания

📖 Рецензии:
▪️Почему жирафы не стали людьми и другие вопросы эволюции
▪️Сорные травы
▪️Желанный ребенок
▪️Грибы
▪️Куда скачет температура?
▪️Клюворыл и другие киты

Рубрика #Биомолекула_рецензия

🧪 Рубрика #Биомолекула_chromatin
– Транскрипционные фабрики регулируют экспрессию генов, привлекая CDK9
– Динамический поиск в одном измерении и процессивное перемещение нуклеосом ремоделерами RSC и ISW2
– Модель глубокого обучения на архитектуре раковой клетки показала подробности ответа и резистентности к ингибиторам CDK4/6
– Диацетилирование гистона H2A вызывает разделение фаз, подавляя формирование синапса с концами ДНК

Переходите на наш сайт и читайте статьи из мира науки 🧬
Оставайтесь с нами в сентябре!