Из нового дайджеста вы узнаете о том, для чего нужны мини-органы человека, как клетки глии помогают восстанавливать функции мозга во сне, о новых оптогенетических способах контроля воспалительных процессов и о многом другом.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Андрей Бахтюков

#Биомолекула_дайджест

Если вам хочется понять, как нейросетевые языковые модели справляются с биомолекулами, для начала нужно узнать, как они работают со словами — ведь белки, ДНК и РНК точно так же состоят из букв и символов!

#Биомолекула_инстант

Как и зачем сегодня используют мультиомиксные данные в биомедицине? Как интеграция различных типов данных помогает лучше понять молекулярные и клеточные процессы? Какие есть новые способы выявить заболевания на ранних стадиях? Мы рассказываем об этом в спецпроектной статье “Медицинская мультивселенная: получится ли у омиксов людей лечить?”.

Одна из главных задач медицины — найти биомаркеры, которые позволят определить болезнь в тот момент, когда ее лечение еще требует минимальных усилий со стороны врачей и затрат жизненных ресурсов пациентов. Для этого алгоритмы обработки биомедицинских данных постоянно обучаются на основе новых потоков информации. Таким образом, индивидуальные (мульти)омиксные данные о конкретном пациенте будут одновременно объединяться и сравниваться с существующей информацией, как мы это видим на инфографике. А алгоритмы искусственного интеллекта будут направлены на извлечение полезных сведений, пополнение выборки и собственно обучение на ней. Извлеченные сведения будут предоставлять важную информацию для мультифакторного анализа, пополняют базу данных и служат источником помощи для других пациентов.
Внесут ли мультиомики весомый практический вклад в терапию — читайте в нашей статье.

#Биомолекула_инфографика

​Пятьдесят историй о тех, кто был нашими предками и тоже любил вкусно покушать. О том, где еда водилась и легко ли добывалась, и о том, насколько жизнь человека зависит от его рациона.

Оценка «Биомолекулы»: 7,3/10

Кому подойдет: тем, кто хотел бы познакомиться с антропологией и палеозоологией без вырвиглазных схем и мозговыносных названий.

Читайте на сайте.

Автор: Антон Бабурин

#Биомолекула_рецензия

В одном из прошлых инстантов мы говорили о one-hot кодировании и объясняли, как можно кодировать слова для машинного обучения. В новом инстанте мы расскажем, как современные модели улавливают смысл слов и их контекст в предложении.

#Биомолекула_инстант

​«История жизни» легко и без занудства расскажет юным читателям о том, как на Земле зародились и развивались живые организмы, почему они вымирали, как выживали и с какими вызовами сталкиваются современные виды животных (спойлер — животные продолжают вымирать из-за разрушительной деятельности человека).

Оценка «Биомолекулы»: 8/10

Кому подойдет: детям школьного возраста от 6–7 лет и всем интересующимся естественной историей.

Читайте на сайте.

Автор: Анастасия Волчок

#Биомолекула_рецензия

Когда мы говорим о языковых моделях в применении к биологии или химии, сразу возникает закономерный вопрос — «А разве биомолекулы умеют разговаривать?». Конечно же, нет! Но как же тогда применять языковые модели для биомолекул? Чтобы дать ответ, нужно вспомнить, какие биомолекулы вообще бывают и как они устроены.

#Биомолекула_инстант

Протиснуться через преграду клеток гематоэнцефалического барьера ужасающе и невыразимо сложно, но можно. Главное – найти подход!

О том, как физические и химические методы воздействия помогают решать биологические проблемы, читайте в нашем инстанте.

Больше о способах доставки лекарственных препаратов в головной мозг, вы можете узнать на нашем сайте!

#Биомолекула_инстант

Из нового дайджеста вы узнаете о том, какие нейроны контролируют наш иммунитет и как можно бороться с устойчивыми мочеполовыми инфекциями. Новые исследования расскажут о важности изучения и использования B-клеток против рака, а также о различиях разных штаммов малярии. Кроме того, теперь мы стали ближе к пониманию развития мозговой ассиметрии на примере рыбок Данио и гораздо лучше понимаем важность циркадных ритмов для старения организмов млекопитающих.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Сергей Козловский

#Биомолекула_дайджест

Подходит ли язык белков, РНК и ДНК для обучения языковых моделей?

Дело в том, что моделям нужны численные представления текстов. По сути, в качестве «текста» может выступать любая последовательность — музыка как набор звуков, фильм как лента из кадров, белок как последовательность аминокислот.

Единственное важное предположение — это наличие связи между контекстом и текущим элементом. В биологии эта связь есть: например, структуры коротких аминокислотных последовательностей определяют структуру всего белка — принцип, лежащий в основе алгоритма моделирования белков Rosetta. А раз главное условие выполнено, значит, LLM можно применить к белкам, РНК и ДНК и даже малым молекулам. И такие модели действительно работают!

Выше мы визуализировали аналогию между естественным языком и биологическими языками. Разные последовательности и разные послания всё равно можно прогонять через похожие по сути LLM.

Подробнее о том, как языковые модели покорили мир белков, можно узнать в статье.

#Биомолекула_инфографика