Из нового дайджеста вы узнаете о том, какие нейроны контролируют наш иммунитет и как можно бороться с устойчивыми мочеполовыми инфекциями. Новые исследования расскажут о важности изучения и использования B-клеток против рака, а также о различиях разных штаммов малярии. Кроме того, теперь мы стали ближе к пониманию развития мозговой ассиметрии на примере рыбок Данио и гораздо лучше понимаем важность циркадных ритмов для старения организмов млекопитающих.
Читайте на нашем сайте.
Автор: Сергей Козловский
#Биомолекула_дайджест
Читайте на нашем сайте.
Автор: Сергей Козловский
#Биомолекула_дайджест
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Подходит ли язык белков, РНК и ДНК для обучения языковых моделей?
Дело в том, что моделям нужны численные представления текстов. По сути, в качестве «текста» может выступать любая последовательность — музыка как набор звуков, фильм как лента из кадров, белок как последовательность аминокислот.
Единственное важное предположение — это наличие связи между контекстом и текущим элементом. В биологии эта связь есть: например, структуры коротких аминокислотных последовательностей определяют структуру всего белка — принцип, лежащий в основе алгоритма моделирования белков Rosetta. А раз главное условие выполнено, значит, LLM можно применить к белкам, РНК и ДНК и даже малым молекулам. И такие модели действительно работают!
Выше мы визуализировали аналогию между естественным языком и биологическими языками. Разные последовательности и разные послания всё равно можно прогонять через похожие по сути LLM.
Подробнее о том, как языковые модели покорили мир белков, можно узнать в статье.
#Биомолекула_инфографика
Дело в том, что моделям нужны численные представления текстов. По сути, в качестве «текста» может выступать любая последовательность — музыка как набор звуков, фильм как лента из кадров, белок как последовательность аминокислот.
Единственное важное предположение — это наличие связи между контекстом и текущим элементом. В биологии эта связь есть: например, структуры коротких аминокислотных последовательностей определяют структуру всего белка — принцип, лежащий в основе алгоритма моделирования белков Rosetta. А раз главное условие выполнено, значит, LLM можно применить к белкам, РНК и ДНК и даже малым молекулам. И такие модели действительно работают!
Выше мы визуализировали аналогию между естественным языком и биологическими языками. Разные последовательности и разные послания всё равно можно прогонять через похожие по сути LLM.
Подробнее о том, как языковые модели покорили мир белков, можно узнать в статье.
#Биомолекула_инфографика
#Биомолекула_биоFAQ
В рамках нашего спецпроекта мы продолжаем освещать важные аспекты онкологии, поэтому сегодняшняя публикация будет посвящена одному из наиболее изучаемых генов-супрессоров опухолей — TP53.
Подробнее тут
Страница спецпроекта на сайте
В рамках нашего спецпроекта мы продолжаем освещать важные аспекты онкологии, поэтому сегодняшняя публикация будет посвящена одному из наиболее изучаемых генов-супрессоров опухолей — TP53.
Подробнее тут
Страница спецпроекта на сайте
Мультиомиксные технологии играют ключевую роль в нейробиологических исследованиях, предоставляя возможность анализировать широкий спектр данных о генах, мРНК, белках и метаболитах, локализованных в различных отделах головного мозга. Это позволяет учёным создавать атласы мозга и отслеживать динамику изменений на клеточном уровне. Анализ мультиомиксных данных открывает новые горизонты для углубленного изучения клинических фенотипов, неврологических особенностей, причин развития заболеваний и механизмов, лежащих в основе этих процессов.
#Биомолекула_инстант
#Биомолекула_инстант
Telegraph
Мультиомиксные технологии в нейробиологии
Начнем с такого расстройства нервной системы, как шизофрения. У пациентов с ней наблюдаются галлюцинации, нарушение когнитивных функций, психоз. Первые симптомы обычно появляются во взрослом возрасте. Известно более 100 геномных локусов, связанных с шизофренией.…
🎓 Программа магистратуры РУДН "Генная и тканевая инженерия" приглашает на открытый вебинар.
🗓 Дата: 14 мая (вторник)
🕒 Время: 11:00 по мск
На вебинаре вы узнаете:
- О содержании магистерской программы
- Какие навыки и знания вы можете приобрести
- Возможности для исследований и практических занятий
- Процесс поступления и дополнительная информация о программе
Вы сможете задать вопросы прямо во время вебинара и получить подробные ответы от наших экспертов!
✍️ Регистрация обязательна: https://taplanding.com/genetic-and-tissue-engineering
Присоединяйтесь к нам и узнайте, как программа магистратуры по генной и тканевой инженерии может стать ключом к вашему успешному будущему!
Реклама. Вишнякова Полина Александровна
ИНН:665805816765 erid:2VfnxxwaQor
🗓 Дата: 14 мая (вторник)
🕒 Время: 11:00 по мск
На вебинаре вы узнаете:
- О содержании магистерской программы
- Какие навыки и знания вы можете приобрести
- Возможности для исследований и практических занятий
- Процесс поступления и дополнительная информация о программе
Вы сможете задать вопросы прямо во время вебинара и получить подробные ответы от наших экспертов!
✍️ Регистрация обязательна: https://taplanding.com/genetic-and-tissue-engineering
Присоединяйтесь к нам и узнайте, как программа магистратуры по генной и тканевой инженерии может стать ключом к вашему успешному будущему!
Реклама. Вишнякова Полина Александровна
ИНН:665805816765 erid:2VfnxxwaQor
В одном из предыдущих постов мы описывали строение трех основных биополимеров. Если вы его прочли, у вас мог возникнуть вопрос: а если ДНК, РНК и белки так тесно связаны, то зачем нужны отдельные ДНК, РНК или белковые модели? Не проще ли обучать все модели на языке ДНК?
Дело в том, что для разных задач нам нужны разные данные. Чтобы предсказать структуру белка, мы могли бы использовать последовательность ДНК, но в ней находится слишком много не относящейся к данному белку информации. Выкинув всё лишнее, мы получим только кодирующую наш белок последовательность мРНК. Переведя ее на язык аминокислот, мы уменьшим размер входных данных втрое, а значит, и обучение пойдет быстрее. В этом случае работать с текстом из аминокислот кажется разумнее. Однако кое-какую информацию мы всё же потеряем.
А подробнее о том, как работают большие языковые модели с биологическими молекулами вы узнаете в статье!
#Биомолекула_биоFaq
Дело в том, что для разных задач нам нужны разные данные. Чтобы предсказать структуру белка, мы могли бы использовать последовательность ДНК, но в ней находится слишком много не относящейся к данному белку информации. Выкинув всё лишнее, мы получим только кодирующую наш белок последовательность мРНК. Переведя ее на язык аминокислот, мы уменьшим размер входных данных втрое, а значит, и обучение пойдет быстрее. В этом случае работать с текстом из аминокислот кажется разумнее. Однако кое-какую информацию мы всё же потеряем.
А подробнее о том, как работают большие языковые модели с биологическими молекулами вы узнаете в статье!
#Биомолекула_биоFaq
Рак – это настоящий вызов современности: уникальный в своем разнообразии и сложности, он продолжает оставаться одной из ведущих причин смертности. Число случаев заболевания раком растет, в том числе и из-за общего старения населения мира. С возрастом наши клетки накапливают генетические ошибки, что приводит к геномной нестабильности – прямой дороге к раку.
Но не всё так пессимистично: увеличение заболеваемости частично связано с улучшением его диагностики – мы стали чаще и точнее выявлять рак на ранних стадиях. Это открывает новые перспективы для лечения и дает надежду на победу над этим коварным недугом. Борьба продолжается, и каждое открытие ученых приближает нас к моменту, когда рак перестанет быть приговором.
О том, какие существуют методы генной и клеточной терапии рака, читайте на нашем сайте!
#Биомолекула_инфографика
Но не всё так пессимистично: увеличение заболеваемости частично связано с улучшением его диагностики – мы стали чаще и точнее выявлять рак на ранних стадиях. Это открывает новые перспективы для лечения и дает надежду на победу над этим коварным недугом. Борьба продолжается, и каждое открытие ученых приближает нас к моменту, когда рак перестанет быть приговором.
О том, какие существуют методы генной и клеточной терапии рака, читайте на нашем сайте!
#Биомолекула_инфографика
Вот уже два миллиона лет человечество идет по своему эволюционному пути, и одно из предопределяющих свершений на нем — сравнительно недавнее (всего-то десять–пятнадцать тысяч лет назад) одомашнивание первых животных. Чем отличается одомашнивание от приручения и животноводства, какое животное считается первым одомашненным и об истории ранней доместикации рассказываем в инстанте!
#Биомолекула_инстант
#Биомолекула_инстант
Telegraph
От охотника и живодера до ветеринара
В древности люди еще не умели выращивать урожаи и разводить скот, но уже занимались охотой, рыболовством и собирательством. Охотники как главные добытчики белковой пищи со временем приобретали ценный опыт и подмечали повадки своих жертв, особенности их образа…
Три века тому назад рост численности городского населения существенно изменил требования к сельскому хозяйству. Животноводство в этот период становится объектом научных исследований, цель которых — повышение скороспелости и продуктивности животных за счет выбора породы, улучшения кормления, содержания. Так появился инбридинг, о возникновении которого читайте в инстанте.
#Биомолекула_инстант
#Биомолекула_инстант
Telegraph
Как возник инбридинг
Основоположник племенного животноводства — Роберт Бейкуэлл (1725–1795): разработчик метода чистого разведения и метода родственного скрещивания (инбридинга). Инбридинг не был его единственным достижением. Бейкуэлл вывел несколько новых пород копытных (лестерских…
В одном из предыдущих постов мы уже рассказывали о том, как скормить языковым моделям большие молекулы — ДНК, РНК и белки. Малые молекулы несколько отличаются от биополимеров, но и с ними машины могут работать. Надо только правильно эти молекулы закодировать.
#Биомолекула_инстант
#Биомолекула_инстант
Telegraph
А как кодировать малые молекулы?
Главное отличие малых молекул от белков, РНК и ДНК — отсутствие регулярной структуры (ибо это, в отличие от упомянутой троицы, не биополимеры). Они не состоят из повторяющихся блоков, соединенных в длинную последовательность: структура малых молекул более…
Вначале было слово.
Потом лучевая и химиотерапия. И хирургическое удаление опухолей, конечно.
Потом таргетные лекарства.
И звезды нынешней эпохи – генные и клеточные технологии.
Почему мы не остановились на таргентных препаратах, прицельно воздействующих на звенья молекулярного онкогенеза? Потому что не такие они и таргетные, как оказалось. Больше ни слова не скажем, подробности ищите в нашей статье!
А пока вы можете посмотреть на признаки раковых клеток (необходимые для их роста и развития) и таргетные лекарства, противодействующие каждому из них. И представить (и ужаснуться) сколько работы потребовалось, чтобы все это узнать!Узнать, что общее есть у биологов и маркетологов :)
#Биомолекула_инфографика
Потом лучевая и химиотерапия. И хирургическое удаление опухолей, конечно.
Потом таргетные лекарства.
И звезды нынешней эпохи – генные и клеточные технологии.
Почему мы не остановились на таргентных препаратах, прицельно воздействующих на звенья молекулярного онкогенеза? Потому что не такие они и таргетные, как оказалось. Больше ни слова не скажем, подробности ищите в нашей статье!
А пока вы можете посмотреть на признаки раковых клеток (необходимые для их роста и развития) и таргетные лекарства, противодействующие каждому из них. И представить (и ужаснуться) сколько работы потребовалось, чтобы все это узнать!
#Биомолекула_инфографика
Если вам при упоминании царства растений приходит на ум фотосинтез, неподвижность, постоянный рост и т.д. — заинтересовать школьника вам вряд ли удастся. Поэтому вы просто обязаны прочитать эту книгу-комикс. Ведь растения чрезвычайно многообразны и необычны: некоторые из них передвигаются, питаются, вступают в отношения, оставляют свой след в истории и еще много чего интересного...
Оценка «Биомолекулы»: 8,7/10
Кому подойдет: любителям комиксов и растений всех возрастов.
Читайте на сайте.
Автор: Мария Лойко
#Биомолекула_рецензия
Оценка «Биомолекулы»: 8,7/10
Кому подойдет: любителям комиксов и растений всех возрастов.
Читайте на сайте.
Автор: Мария Лойко
#Биомолекула_рецензия
Из нового дайджеста вы узнаете о том, для чего нужны мини-органы человека, как клетки глии помогают восстанавливать функции мозга во сне, о новых оптогенетических способах контроля воспалительных процессов и о многом другом.
Читайте на нашем сайте.
Автор: Елизавета Минина
#Биомолекула_дайджест
Читайте на нашем сайте.
Автор: Елизавета Минина
#Биомолекула_дайджест
Исследование мультиомиксных данных открывает удивительные перспективы в понимании клинических фенотипов и причин прогрессирования заболеваний головного мозга. Сфера науки обращает свое внимание на ключевые патологии, такие как болезни Альцгеймера, Паркинсона, рассеянный склероз, расстройства аутистического спектра и шизофрения. Особое значение придается изучению процессов нейровоспаления, нейродегенерации и нейроиммунной дисрегуляции.
На картинке можно увидеть, как интеграция омиксных данных с клиническими характеристиками позволяет получить уникальный патологический профиль заболевания и выявить различия в состоянии головного мозга при различных комбинациях мультиомиксных слоев. Подробнее в статье.
#Биомолекула_инфографика
На картинке можно увидеть, как интеграция омиксных данных с клиническими характеристиками позволяет получить уникальный патологический профиль заболевания и выявить различия в состоянии головного мозга при различных комбинациях мультиомиксных слоев. Подробнее в статье.
#Биомолекула_инфографика
Обсуждая передовые методы борьбы с раковыми опухолями следует, конечно, узнать подробнее этапы опухолевого перерождения. И тут мы обращаем внимание на довольно очевидную вещь ─ чем больше мутаций, тем выше его риск.
Эти мутации могут наследоваться или приобретаться вследствие ошибок копирования ДНК или под действием мутагенов. Возрастающая нестабильность генома в какой-то момент просто обрушивает защитные системы клетки.
Мутации в некоторых генах — протоонкогенах — запускают канцерогенез напрямую, инициируя неконтролируемое деление; практически тот же эффект могут дать мутации в генах — супрессорах опухолей (в норме подавляющих чрезмерный рост клеток).
В итоге в клетках появляются мутантные белки, запускающие аномально активированные молекулярные каскады, которые дают старт взрывному росту клеток. Если совсем просто — клетки «теряют тормоза»: делятся бесконтрольно, продолжая злокачественно перерождаться и образуя тем самым опухоль.
О том, какие существуют методы генной и клеточной терапии рака, читайте на нашем сайте!
#Биомолекула_инфографика
Эти мутации могут наследоваться или приобретаться вследствие ошибок копирования ДНК или под действием мутагенов. Возрастающая нестабильность генома в какой-то момент просто обрушивает защитные системы клетки.
Мутации в некоторых генах — протоонкогенах — запускают канцерогенез напрямую, инициируя неконтролируемое деление; практически тот же эффект могут дать мутации в генах — супрессорах опухолей (в норме подавляющих чрезмерный рост клеток).
В итоге в клетках появляются мутантные белки, запускающие аномально активированные молекулярные каскады, которые дают старт взрывному росту клеток. Если совсем просто — клетки «теряют тормоза»: делятся бесконтрольно, продолжая злокачественно перерождаться и образуя тем самым опухоль.
О том, какие существуют методы генной и клеточной терапии рака, читайте на нашем сайте!
#Биомолекула_инфографика
Разнообразие исследований в онкологии отражает многоликость этой группы заболеваний — ежемесячно выходят десятки работ, в которых злокачественные опухоли исследуются на всех уровнях, от молекулярного до популяционного. Мы предлагаем вашему вниманию дайджест наиболее интересных исследований из самых уважаемых научных журналов мира, чтобы ориентироваться в море новой информации.
Читайте на нашем сайте.
Автор: Камиль Айсин
#Биомолекула_новость
Читайте на нашем сайте.
Автор: Камиль Айсин
#Биомолекула_новость
