В одном из прошлых инстантов мы говорили о one-hot кодировании и объясняли, как можно кодировать слова для машинного обучения. В новом инстанте мы расскажем, как современные модели улавливают смысл слов и их контекст в предложении.

#Биомолекула_инстант

​«История жизни» легко и без занудства расскажет юным читателям о том, как на Земле зародились и развивались живые организмы, почему они вымирали, как выживали и с какими вызовами сталкиваются современные виды животных (спойлер — животные продолжают вымирать из-за разрушительной деятельности человека).

Оценка «Биомолекулы»: 8/10

Кому подойдет: детям школьного возраста от 6–7 лет и всем интересующимся естественной историей.

Читайте на сайте.

Автор: Анастасия Волчок

#Биомолекула_рецензия

Когда мы говорим о языковых моделях в применении к биологии или химии, сразу возникает закономерный вопрос — «А разве биомолекулы умеют разговаривать?». Конечно же, нет! Но как же тогда применять языковые модели для биомолекул? Чтобы дать ответ, нужно вспомнить, какие биомолекулы вообще бывают и как они устроены.

#Биомолекула_инстант

Протиснуться через преграду клеток гематоэнцефалического барьера ужасающе и невыразимо сложно, но можно. Главное – найти подход!

О том, как физические и химические методы воздействия помогают решать биологические проблемы, читайте в нашем инстанте.

Больше о способах доставки лекарственных препаратов в головной мозг, вы можете узнать на нашем сайте!

#Биомолекула_инстант

Из нового дайджеста вы узнаете о том, какие нейроны контролируют наш иммунитет и как можно бороться с устойчивыми мочеполовыми инфекциями. Новые исследования расскажут о важности изучения и использования B-клеток против рака, а также о различиях разных штаммов малярии. Кроме того, теперь мы стали ближе к пониманию развития мозговой ассиметрии на примере рыбок Данио и гораздо лучше понимаем важность циркадных ритмов для старения организмов млекопитающих.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Сергей Козловский

#Биомолекула_дайджест

Подходит ли язык белков, РНК и ДНК для обучения языковых моделей?

Дело в том, что моделям нужны численные представления текстов. По сути, в качестве «текста» может выступать любая последовательность — музыка как набор звуков, фильм как лента из кадров, белок как последовательность аминокислот.

Единственное важное предположение — это наличие связи между контекстом и текущим элементом. В биологии эта связь есть: например, структуры коротких аминокислотных последовательностей определяют структуру всего белка — принцип, лежащий в основе алгоритма моделирования белков Rosetta. А раз главное условие выполнено, значит, LLM можно применить к белкам, РНК и ДНК и даже малым молекулам. И такие модели действительно работают!

Выше мы визуализировали аналогию между естественным языком и биологическими языками. Разные последовательности и разные послания всё равно можно прогонять через похожие по сути LLM.

Подробнее о том, как языковые модели покорили мир белков, можно узнать в статье.

#Биомолекула_инфографика

Мультиомиксные технологии играют ключевую роль в нейробиологических исследованиях, предоставляя возможность анализировать широкий спектр данных о генах, мРНК, белках и метаболитах, локализованных в различных отделах головного мозга. Это позволяет учёным создавать атласы мозга и отслеживать динамику изменений на клеточном уровне. Анализ мультиомиксных данных открывает новые горизонты для углубленного изучения клинических фенотипов, неврологических особенностей, причин развития заболеваний и механизмов, лежащих в основе этих процессов.

#Биомолекула_инстант

🎓 Программа магистратуры РУДН "Генная и тканевая инженерия" приглашает на открытый вебинар.

🗓 Дата: 14 мая (вторник)
🕒 Время: 11:00 по мск

На вебинаре вы узнаете:
- О содержании магистерской программы
- Какие навыки и знания вы можете приобрести
- Возможности для исследований и практических занятий
- Процесс поступления и дополнительная информация о программе

Вы сможете задать вопросы прямо во время вебинара и получить подробные ответы от наших экспертов!

✍️ Регистрация обязательна: https://taplanding.com/genetic-and-tissue-engineering

Присоединяйтесь к нам и узнайте, как программа магистратуры по генной и тканевой инженерии может стать ключом к вашему успешному будущему!

Реклама. Вишнякова Полина Александровна
ИНН:665805816765 erid:2VfnxxwaQor

В одном из предыдущих постов мы описывали строение трех основных биополимеров. Если вы его прочли, у вас мог возникнуть вопрос: а если ДНК, РНК и белки так тесно связаны, то зачем нужны отдельные ДНК, РНК или белковые модели? Не проще ли обучать все модели на языке ДНК?

Дело в том, что для разных задач нам нужны разные данные. Чтобы предсказать структуру белка, мы могли бы использовать последовательность ДНК, но в ней находится слишком много не относящейся к данному белку информации. Выкинув всё лишнее, мы получим только кодирующую наш белок последовательность мРНК. Переведя ее на язык аминокислот, мы уменьшим размер входных данных втрое, а значит, и обучение пойдет быстрее. В этом случае работать с текстом из аминокислот кажется разумнее. Однако кое-какую информацию мы всё же потеряем.

А подробнее о том, как работают большие языковые модели с биологическими молекулами вы узнаете в статье!

#Биомолекула_биоFaq

Вот уже два миллиона лет человечество идет по своему эволюционному пути, и одно из предопределяющих свершений на нем — сравнительно недавнее (всего-то десять–пятнадцать тысяч лет назад) одомашнивание первых животных. Чем отличается одомашнивание от приручения и животноводства, какое животное считается первым одомашненным и об истории ранней доместикации рассказываем в инстанте!

#Биомолекула_инстант

Три века тому назад рост численности городского населения существенно изменил требования к сельскому хозяйству. Животноводство в этот период становится объектом научных исследований, цель которых — повышение скороспелости и продуктивности животных за счет выбора породы, улучшения кормления, содержания. Так появился инбридинг, о возникновении которого читайте в инстанте.

#Биомолекула_инстант

В одном из предыдущих постов мы уже рассказывали о том, как скормить языковым моделям большие молекулы — ДНК, РНК и белки. Малые молекулы несколько отличаются от биополимеров, но и с ними машины могут работать. Надо только правильно эти молекулы закодировать.

#Биомолекула_инстант

​Если вам при упоминании царства растений приходит на ум фотосинтез, неподвижность, постоянный рост и т.д. — заинтересовать школьника вам вряд ли удастся. Поэтому вы просто обязаны прочитать эту книгу-комикс. Ведь растения чрезвычайно многообразны и необычны: некоторые из них передвигаются, питаются, вступают в отношения, оставляют свой след в истории и еще много чего интересного...

Оценка «Биомолекулы»: 8,7/10

Кому подойдет: любителям комиксов и растений всех возрастов.

Читайте на сайте.

Автор: Мария Лойко

#Биомолекула_рецензия

Из нового дайджеста вы узнаете о том, для чего нужны мини-органы человека, как клетки глии помогают восстанавливать функции мозга во сне, о новых оптогенетических способах контроля воспалительных процессов и о многом другом.

Читайте на нашем сайте.

Автор: Елизавета Минина

#Биомолекула_дайджест