А вы знали, что у рака есть свой собственный «паспорт», по которому мы можем безошибочно определить, что перед нами злокачественная опухоль?
«Ключевые признаки рака» («The hallmarks of cancer») — концепция, состоящая из 14 характерных для рака особенностей. Ее первая версия была сформулирована выдающимися учеными Дугласом Ханахэном и Робертом Вайнбергом еще в 2000 году, но с тех пор уже не раз обновлялась (в 2011 году и в 2022 году).
Эволюция концепции «ключевых признаков» наглядно отражает прогресс молекулярной онкологии за последние 30 лет, так что на инфографике мы рассмотрим ее именно в исторической перспективе, двигаясь от «старых» признаков к «новым».
Подробнее тут
Страница спецпроекта на сайте
«Ключевые признаки рака» («The hallmarks of cancer») — концепция, состоящая из 14 характерных для рака особенностей. Ее первая версия была сформулирована выдающимися учеными Дугласом Ханахэном и Робертом Вайнбергом еще в 2000 году, но с тех пор уже не раз обновлялась (в 2011 году и в 2022 году).
Эволюция концепции «ключевых признаков» наглядно отражает прогресс молекулярной онкологии за последние 30 лет, так что на инфографике мы рассмотрим ее именно в исторической перспективе, двигаясь от «старых» признаков к «новым».
Подробнее тут
Страница спецпроекта на сайте
Пятьдесят историй о тех, кто был нашими предками и тоже любил вкусно покушать. О том, где еда водилась и легко ли добывалась, и о том, насколько жизнь человека зависит от его рациона.
Оценка «Биомолекулы»: 7,3/10
Кому подойдет: тем, кто хотел бы познакомиться с антропологией и палеозоологией без вырвиглазных схем и мозговыносных названий.
Читайте на сайте.
Автор: Антон Бабурин
#Биомолекула_рецензия
Оценка «Биомолекулы»: 7,3/10
Кому подойдет: тем, кто хотел бы познакомиться с антропологией и палеозоологией без вырвиглазных схем и мозговыносных названий.
Читайте на сайте.
Автор: Антон Бабурин
#Биомолекула_рецензия
🔥 #Месяц_на_Биомолекуле! Все статьи нашего сайта за месяц 👀
🧬Статья «Клещевой энцефалит: как не заразиться болезнью строителей коммунизма и нужны ли прививки» в рамках спецпроекта История одной эпидемии.
🧬Статья «Ветеринария: эволюция, революции, инновации» в рамках спецпроекта Ветеринария.
🧬Статья «Можно ли вылечить рак генной терапией?» в рамках спецпроекта Генная и клеточная терапии.
🧬Статья «Онкодиагностика — вызовы и решения» в рамках спецпроекта Онкология.
🦠Дайджест SciNat:
#1: укус молекулярного скорпиона, РНК-долгожители и усовершенствование геномного редактирования
#2: первая азотфиксирующая органелла, новые способности CAR-T-клеток, неповторимый фМРТ и нюансы работы гиразы E. coli
#3: эволюция бабочек, дендритные клетки и бактерии комаров
#4: рыбы-исследователи, мини-органы и еще один повод больше спать
📖 Рецензии:
▪️«Тело: мой друг и враг»
▪️«Вернуть энергию»
▪️«Атлас иммунологии»
▪️«Закат и падение крошечных империй»
Рубрика #Биомолекула_рецензия
🧫Рубрика #Биомолтекст2023_24
– Сказ о том, как протеинкиназа память создавала
– Молекулярная коммутация — новый механизм регуляции генов и не только
– Что было раньше — курица или первичный бульон? Коацерваты
– Игра в «поймай промотор»
– Нутрии внутри!
– Использование водных растений для создания искусственной атмосферы
– Белок альфа-синуклеин — важный участник проявления болезни Паркинсона?
🧪 Рубрика #Биомолекула_chromatin
– Минимальные требования к эпигенетическому наследованию синтетических репрессивных хроматиновых доменов
– Очистки с денатурацией показали, что PRC2 и некоторые другие хроматиновые белки/комплексы не связываются с РНК прямо
– Соединение сестринских хроматид осуществляется индивидуальными комплексами когезина
Переходите на наш сайт и читайте статьи из мира науки🧬 Оставайтесь с нами в мае!
🧬Статья «Клещевой энцефалит: как не заразиться болезнью строителей коммунизма и нужны ли прививки» в рамках спецпроекта История одной эпидемии.
🧬Статья «Ветеринария: эволюция, революции, инновации» в рамках спецпроекта Ветеринария.
🧬Статья «Можно ли вылечить рак генной терапией?» в рамках спецпроекта Генная и клеточная терапии.
🧬Статья «Онкодиагностика — вызовы и решения» в рамках спецпроекта Онкология.
🦠Дайджест SciNat:
#1: укус молекулярного скорпиона, РНК-долгожители и усовершенствование геномного редактирования
#2: первая азотфиксирующая органелла, новые способности CAR-T-клеток, неповторимый фМРТ и нюансы работы гиразы E. coli
#3: эволюция бабочек, дендритные клетки и бактерии комаров
#4: рыбы-исследователи, мини-органы и еще один повод больше спать
▪️«Тело: мой друг и враг»
▪️«Вернуть энергию»
▪️«Атлас иммунологии»
▪️«Закат и падение крошечных империй»
Рубрика #Биомолекула_рецензия
🧫Рубрика #Биомолтекст2023_24
– Сказ о том, как протеинкиназа память создавала
– Молекулярная коммутация — новый механизм регуляции генов и не только
– Что было раньше — курица или первичный бульон? Коацерваты
– Игра в «поймай промотор»
– Нутрии внутри!
– Использование водных растений для создания искусственной атмосферы
– Белок альфа-синуклеин — важный участник проявления болезни Паркинсона?
🧪 Рубрика #Биомолекула_chromatin
– Минимальные требования к эпигенетическому наследованию синтетических репрессивных хроматиновых доменов
– Очистки с денатурацией показали, что PRC2 и некоторые другие хроматиновые белки/комплексы не связываются с РНК прямо
– Соединение сестринских хроматид осуществляется индивидуальными комплексами когезина
Переходите на наш сайт и читайте статьи из мира науки
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
В одном из прошлых инстантов мы говорили о one-hot кодировании и объясняли, как можно кодировать слова для машинного обучения. В новом инстанте мы расскажем, как современные модели улавливают смысл слов и их контекст в предложении.
#Биомолекула_инстант
#Биомолекула_инстант
Telegraph
Слова как векторы
Вместо one-hot кодирования современные модели используют технологию векторизации (представления слова в виде набора чисел), которую называют эмбеддинг. Здесь важно сделать оговорку, что эмбеддинг — это одновременно и процесс превращения слова в вектор, и…
«История жизни» легко и без занудства расскажет юным читателям о том, как на Земле зародились и развивались живые организмы, почему они вымирали, как выживали и с какими вызовами сталкиваются современные виды животных (спойлер — животные продолжают вымирать из-за разрушительной деятельности человека).
Оценка «Биомолекулы»: 8/10
Кому подойдет: детям школьного возраста от 6–7 лет и всем интересующимся естественной историей.
Читайте на сайте.
Автор: Анастасия Волчок
#Биомолекула_рецензия
Оценка «Биомолекулы»: 8/10
Кому подойдет: детям школьного возраста от 6–7 лет и всем интересующимся естественной историей.
Читайте на сайте.
Автор: Анастасия Волчок
#Биомолекула_рецензия
Когда мы говорим о языковых моделях в применении к биологии или химии, сразу возникает закономерный вопрос — «А разве биомолекулы умеют разговаривать?». Конечно же, нет! Но как же тогда применять языковые модели для биомолекул? Чтобы дать ответ, нужно вспомнить, какие биомолекулы вообще бывают и как они устроены.
#Биомолекула_инстант
#Биомолекула_инстант
Telegraph
Биологические процессы: их герои и языки
В главных молекулярных процессах внутри клетки есть три основных участника: белки, РНК и ДНК. Bсё это линейные молекулы (биополимеры), состоящие из повторяющихся блоков: белки — из 20 аминокислот; а РНК и ДНК — из 4 нуклеотидов. Ученые договорились называть…
Протиснуться через преграду клеток гематоэнцефалического барьера ужасающе и невыразимо сложно, но можно. Главное – найти подход!
О том, как физические и химические методы воздействия помогают решать биологические проблемы, читайте в нашем инстанте.
Больше о способах доставки лекарственных препаратов в головной мозг, вы можете узнать на нашем сайте!
#Биомолекула_инстант
О том, как физические и химические методы воздействия помогают решать биологические проблемы, читайте в нашем инстанте.
Больше о способах доставки лекарственных препаратов в головной мозг, вы можете узнать на нашем сайте!
#Биомолекула_инстант
Telegraph
Создавая бреши
Теперь рассмотрим большую группу методик, связанных с доставкой препаратов непосредственно через ГЭБ. Условно их можно разделить на две группы: 1) подразумевающие временное повреждение ГЭБ 2) использующие физико-химические подходы и свойства мембран эндотелиальных…
Из нового дайджеста вы узнаете о том, какие нейроны контролируют наш иммунитет и как можно бороться с устойчивыми мочеполовыми инфекциями. Новые исследования расскажут о важности изучения и использования B-клеток против рака, а также о различиях разных штаммов малярии. Кроме того, теперь мы стали ближе к пониманию развития мозговой ассиметрии на примере рыбок Данио и гораздо лучше понимаем важность циркадных ритмов для старения организмов млекопитающих.
Читайте на нашем сайте.
Автор: Сергей Козловский
#Биомолекула_дайджест
Читайте на нашем сайте.
Автор: Сергей Козловский
#Биомолекула_дайджест
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Подходит ли язык белков, РНК и ДНК для обучения языковых моделей?
Дело в том, что моделям нужны численные представления текстов. По сути, в качестве «текста» может выступать любая последовательность — музыка как набор звуков, фильм как лента из кадров, белок как последовательность аминокислот.
Единственное важное предположение — это наличие связи между контекстом и текущим элементом. В биологии эта связь есть: например, структуры коротких аминокислотных последовательностей определяют структуру всего белка — принцип, лежащий в основе алгоритма моделирования белков Rosetta. А раз главное условие выполнено, значит, LLM можно применить к белкам, РНК и ДНК и даже малым молекулам. И такие модели действительно работают!
Выше мы визуализировали аналогию между естественным языком и биологическими языками. Разные последовательности и разные послания всё равно можно прогонять через похожие по сути LLM.
Подробнее о том, как языковые модели покорили мир белков, можно узнать в статье.
#Биомолекула_инфографика
Дело в том, что моделям нужны численные представления текстов. По сути, в качестве «текста» может выступать любая последовательность — музыка как набор звуков, фильм как лента из кадров, белок как последовательность аминокислот.
Единственное важное предположение — это наличие связи между контекстом и текущим элементом. В биологии эта связь есть: например, структуры коротких аминокислотных последовательностей определяют структуру всего белка — принцип, лежащий в основе алгоритма моделирования белков Rosetta. А раз главное условие выполнено, значит, LLM можно применить к белкам, РНК и ДНК и даже малым молекулам. И такие модели действительно работают!
Выше мы визуализировали аналогию между естественным языком и биологическими языками. Разные последовательности и разные послания всё равно можно прогонять через похожие по сути LLM.
Подробнее о том, как языковые модели покорили мир белков, можно узнать в статье.
#Биомолекула_инфографика
#Биомолекула_биоFAQ
В рамках нашего спецпроекта мы продолжаем освещать важные аспекты онкологии, поэтому сегодняшняя публикация будет посвящена одному из наиболее изучаемых генов-супрессоров опухолей — TP53.
Подробнее тут
Страница спецпроекта на сайте
В рамках нашего спецпроекта мы продолжаем освещать важные аспекты онкологии, поэтому сегодняшняя публикация будет посвящена одному из наиболее изучаемых генов-супрессоров опухолей — TP53.
Подробнее тут
Страница спецпроекта на сайте
Мультиомиксные технологии играют ключевую роль в нейробиологических исследованиях, предоставляя возможность анализировать широкий спектр данных о генах, мРНК, белках и метаболитах, локализованных в различных отделах головного мозга. Это позволяет учёным создавать атласы мозга и отслеживать динамику изменений на клеточном уровне. Анализ мультиомиксных данных открывает новые горизонты для углубленного изучения клинических фенотипов, неврологических особенностей, причин развития заболеваний и механизмов, лежащих в основе этих процессов.
#Биомолекула_инстант
#Биомолекула_инстант
Telegraph
Мультиомиксные технологии в нейробиологии
Начнем с такого расстройства нервной системы, как шизофрения. У пациентов с ней наблюдаются галлюцинации, нарушение когнитивных функций, психоз. Первые симптомы обычно появляются во взрослом возрасте. Известно более 100 геномных локусов, связанных с шизофренией.…
🎓 Программа магистратуры РУДН "Генная и тканевая инженерия" приглашает на открытый вебинар.
🗓 Дата: 14 мая (вторник)
🕒 Время: 11:00 по мск
На вебинаре вы узнаете:
- О содержании магистерской программы
- Какие навыки и знания вы можете приобрести
- Возможности для исследований и практических занятий
- Процесс поступления и дополнительная информация о программе
Вы сможете задать вопросы прямо во время вебинара и получить подробные ответы от наших экспертов!
✍️ Регистрация обязательна: https://taplanding.com/genetic-and-tissue-engineering
Присоединяйтесь к нам и узнайте, как программа магистратуры по генной и тканевой инженерии может стать ключом к вашему успешному будущему!
Реклама. Вишнякова Полина Александровна
ИНН:665805816765 erid:2VfnxxwaQor
🗓 Дата: 14 мая (вторник)
🕒 Время: 11:00 по мск
На вебинаре вы узнаете:
- О содержании магистерской программы
- Какие навыки и знания вы можете приобрести
- Возможности для исследований и практических занятий
- Процесс поступления и дополнительная информация о программе
Вы сможете задать вопросы прямо во время вебинара и получить подробные ответы от наших экспертов!
✍️ Регистрация обязательна: https://taplanding.com/genetic-and-tissue-engineering
Присоединяйтесь к нам и узнайте, как программа магистратуры по генной и тканевой инженерии может стать ключом к вашему успешному будущему!
Реклама. Вишнякова Полина Александровна
ИНН:665805816765 erid:2VfnxxwaQor
В одном из предыдущих постов мы описывали строение трех основных биополимеров. Если вы его прочли, у вас мог возникнуть вопрос: а если ДНК, РНК и белки так тесно связаны, то зачем нужны отдельные ДНК, РНК или белковые модели? Не проще ли обучать все модели на языке ДНК?
Дело в том, что для разных задач нам нужны разные данные. Чтобы предсказать структуру белка, мы могли бы использовать последовательность ДНК, но в ней находится слишком много не относящейся к данному белку информации. Выкинув всё лишнее, мы получим только кодирующую наш белок последовательность мРНК. Переведя ее на язык аминокислот, мы уменьшим размер входных данных втрое, а значит, и обучение пойдет быстрее. В этом случае работать с текстом из аминокислот кажется разумнее. Однако кое-какую информацию мы всё же потеряем.
А подробнее о том, как работают большие языковые модели с биологическими молекулами вы узнаете в статье!
#Биомолекула_биоFaq
Дело в том, что для разных задач нам нужны разные данные. Чтобы предсказать структуру белка, мы могли бы использовать последовательность ДНК, но в ней находится слишком много не относящейся к данному белку информации. Выкинув всё лишнее, мы получим только кодирующую наш белок последовательность мРНК. Переведя ее на язык аминокислот, мы уменьшим размер входных данных втрое, а значит, и обучение пойдет быстрее. В этом случае работать с текстом из аминокислот кажется разумнее. Однако кое-какую информацию мы всё же потеряем.
А подробнее о том, как работают большие языковые модели с биологическими молекулами вы узнаете в статье!
#Биомолекула_биоFaq
Рак – это настоящий вызов современности: уникальный в своем разнообразии и сложности, он продолжает оставаться одной из ведущих причин смертности. Число случаев заболевания раком растет, в том числе и из-за общего старения населения мира. С возрастом наши клетки накапливают генетические ошибки, что приводит к геномной нестабильности – прямой дороге к раку.
Но не всё так пессимистично: увеличение заболеваемости частично связано с улучшением его диагностики – мы стали чаще и точнее выявлять рак на ранних стадиях. Это открывает новые перспективы для лечения и дает надежду на победу над этим коварным недугом. Борьба продолжается, и каждое открытие ученых приближает нас к моменту, когда рак перестанет быть приговором.
О том, какие существуют методы генной и клеточной терапии рака, читайте на нашем сайте!
#Биомолекула_инфографика
Но не всё так пессимистично: увеличение заболеваемости частично связано с улучшением его диагностики – мы стали чаще и точнее выявлять рак на ранних стадиях. Это открывает новые перспективы для лечения и дает надежду на победу над этим коварным недугом. Борьба продолжается, и каждое открытие ученых приближает нас к моменту, когда рак перестанет быть приговором.
О том, какие существуют методы генной и клеточной терапии рака, читайте на нашем сайте!
#Биомолекула_инфографика
Вот уже два миллиона лет человечество идет по своему эволюционному пути, и одно из предопределяющих свершений на нем — сравнительно недавнее (всего-то десять–пятнадцать тысяч лет назад) одомашнивание первых животных. Чем отличается одомашнивание от приручения и животноводства, какое животное считается первым одомашненным и об истории ранней доместикации рассказываем в инстанте!
#Биомолекула_инстант
#Биомолекула_инстант
Telegraph
От охотника и живодера до ветеринара
В древности люди еще не умели выращивать урожаи и разводить скот, но уже занимались охотой, рыболовством и собирательством. Охотники как главные добытчики белковой пищи со временем приобретали ценный опыт и подмечали повадки своих жертв, особенности их образа…
Три века тому назад рост численности городского населения существенно изменил требования к сельскому хозяйству. Животноводство в этот период становится объектом научных исследований, цель которых — повышение скороспелости и продуктивности животных за счет выбора породы, улучшения кормления, содержания. Так появился инбридинг, о возникновении которого читайте в инстанте.
#Биомолекула_инстант
#Биомолекула_инстант
Telegraph
Как возник инбридинг
Основоположник племенного животноводства — Роберт Бейкуэлл (1725–1795): разработчик метода чистого разведения и метода родственного скрещивания (инбридинга). Инбридинг не был его единственным достижением. Бейкуэлл вывел несколько новых пород копытных (лестерских…