❗️Replication of viruses

All of the dynamic events
associated with the virus (transcription & replication of genomes) occurs within the living host cell.
All DNA viruses multiply inside the host cell nucleus (except poxvirus) All RNA viruses multiply in the cytoplasm.

مختصر الحجي بالتضاعف دايكول كل عمليات التضاعف تصير داخل الخليه الحيه . و ڪُل DNA يتضاعف داخل النواة.
وكل RNA التضاعف مالته يكون بالسايتوبلازم ڪُلش مهم .....

❗️Stages of viral replication:
مراحل تضاعف الفيروس

1. Attachmentالالتصاق
2. Penetrationالاختراق
3. Uncoatingازالة الغلاف
4. Gene expression and biosynthesisالتعبير الجيني والتخليق
5. Assemblyالتجميع
6. Releaseالاطلاق
طبعاً الاطلاق يصير خارج الخليه .

شرح النقاط ذولي عليكم .

السلام عليكم
ان شاءالله اليوم ابلش اشرح بـسہ ادعولي بالثبات 🙂💔

المحاضره رقم 5
❗️innate immune
الاستجابه المناعيه طبعاً تكون (non-specific) يعني غير محدده

عدنه مصطلح اسمه
❗️Interferon :Alpha and beta interferon are group of proteins produced by human cells after
viral infection (have antiviral effects).
بالانترفيرون عباره عن مجموعه من البروتينات اللي تنتجها الخلايا البشريه بـ؏ـد الاصابه بالفيروس ( والها تأثير مضاد للفيروس)⬇️⬇️

 Inhibit the growth of viruses by blocking the synthesis of viral proteins
يمنع نمو الفيروسات عن طريق منع تخليق البروتينات الفيروسيه


 Prevents further spread of viruses
يمنع من انتشار الفيروسات

 Prevents uninfected cells from kill by Natural killer cells )NK(
يمنع الخلايا غير المصابه من القتل بواسطة الخلايا القاتله


❗️ Interferon have two main mechanisms
الانتروفيرون اله اليتان رئيسيتان


A. Ribonuclease that degrades Messenger RNA (mRNA)

ريبونوكلياز راح يتحلل وينطي mRNA

B. Protein kinase that inhibits protein synthesis
بروتين ڪيناز الدي يثبط تخليق البروتين

2. Natural killer cells (NK): important part of the innate immunity against virus infected cells, called natural killer cells because they are active without the necessity of being exposed to the virus previously and they are not specific for any virus.

طبعاً الخلايا الطبيعيه جزء مهم من المناعه الفطريه صد الخلايا المصابه للفيروسات . سميت بالخلايا القاتله الطبيعيه لانها نشطه دون الحاجه الى التعرض للفيروس سابقاً وليست خاصه بأي فيروس

3. Macrophages / phagocytosis virus and virus infected cells , production of antiviral molecules such as interferons (INF)


البلاعم / او الفيروسات البلعميه والخلايا المصابه بالفيروس . وانتاج الجزيئات المضاده للفيروسات مثل الانترفيرون .


4. Fever / elevated body temperature may play a role in host defenses , but it is important is uncertain
الحمى / ارتفاع درجة حرارة الجسم دوار في دفاعات المضيف . ولكن من المهم ان يكون غير مؤكد .

B-Adaptive immune response (Specific response )
الاستجابه التكيفيه ( تكون محدده)

1- Antiviral antibodies / such as IgA confers protection against viruses that enter through the respiratory and gastrointestinal mucosa, IgM and IgG protect against viruses that enter or are spread through the blood.

الاجسام المضاده : عدكم بروتين A يشتغل للحمايه ضد الفيروسات الي تدخل عبر الغشاء المخاطي للجهاز التنفسي والجهاز الهضمي .
بروتين IgM وIgG يحمي من الفيروسات الي تدخل للدم وتنشتر عبر الدم .


2- Cytotoxic T- lymphocytes / CD8 – positive T-cells recognize viral antigen in association with class I MHC proteins
الخلايا اللمفاويه التائيه السامه الخلايا - تعرف الخلايا الايجابيه على المستضد الفيروسي بالاشتراك مع بروتينات معقد التوافق الرئيسي في الفئه الاولى


 They kill virus infected cells by two methods

يقتلون الخلايت المصابه بالفيروس بطريقتين :

A. By releasing prteolytic enzymes called granzymes into the infected cell, which degrade the
cell contents
عن طريق اطلاق انزيم تحلل يسمى granzymes في الخليه المصابه . هذا يؤدي الى تحلل محتويات الخليه


B. Activating programmed cell death (apoptosis)

تنشيط موت الخلايا المبرمج

 Diagnosis of Viral Infections
Sampling:
راح نستخدم انواع مختلفه من العينات للتشخيص في انابيب معينه حتى نحافظ ؏ سلامة العينه وتخزينها بدرجة حراره 4Cْ

بعض انواع العينات اللي نحتاجها

 Types of samples include:
• Blood
• Skin
• Sputum, gargles and bronchial washings
• Urine
• Semen
• Faeces
• Cerebrospinal fluid (CSF)
• Tissues (biopsies or post-mortem)
• Dried blood spots Virus isolation

وغالباً ما يتم عزل الفيروس من العينه الاولى للمريض .
وهذا الشيء مهم حتى نكدر نزرع اكثر من عينة للفيروس وبكميات كبيره واجراء عدد اكبر من الاختبارات

يمكن زراعة العديد من الفيروسات في الخلايا في المختبر .
وقد تتطلب تلقيح بديل مثل بيض الدجاج embryonated chickenطبعاً هذا نستخدمه حتى انمي بيه (فيروس انفلاونزا الطيور ) . او تلقيح الفيروس داخل الجمجمه باستخدام الفئران حديثي الولاده newborn mice مثل فيروس lyssa viruses

 Virus diagnosis methods
طرق تشخيص الفيروسات

A-Nucleic acid based methods
الطرق المعتمده على الحمض النووي

يستخدم للاختبارات التشخيصيه الاكثر تحديداً وحساسيه . قادره ؏ اكتشاف الجينوم او اجزاء الجينوم الفيروسي في الماضي .
واستخدم هذا الاختبار كاختبار ثانوي لتأكيد النتائج المصليه الايجابيه

1-Polymerase chain reaction
(PCR)

يستخدم للكشف عن DNA و RNA
من خلال هاي الطريقه راح نسوي نسخ عديده من جينوم الفيروس بأستخدام مجسات خاصه .

2- Sequencing
Sequencing is the only diagnostic method that will provide the full sequence of a virus genome.

التسلسل / هاي الطريقه الوحيده الس توفر تسلسل كامل للجينوم الفيروسي the full sequence
يكون هذا التسلسل مفيد عند اختبار طفرات معينه في المريض من اجل تحديد العلاج المضاد للفيروسات والقابليه للاصابه بالعدوى . وهذا ارخص شيء ممكن بالمستقبل يكون هو أداة تشخيص اساسيه


B-Microscopy based methods
الطرق القائمه ؏ المجهر
Immunofluorescence or
immunoperoxidase
نستخدم فحوصات التألق المناعي او البيروكسيداز المناعي بشكل شائع
هاي الطريقه نستخدمها اذا جان الفيروس موجود في عينة الانسجه.
فـ شنو الجسم المضاد الخاص بهذا الفيروس سيكون قادر على الارتباط به.


Electron microscopy is a method that can take a picture of a whole virus and can reveal its shape and structure.

المجهر الالكتروني هو طريقه استخدم لتصوير الفيروس كامل ويمكن من خلاله الكشف عن شكل الفيروس وبنيته . ولا يستخدم كتشخيص روتيني لان يتطلب نوعاً عالي من التخصص .

C-Antibody detection
يستخدم للشكف عن الاجسام المضاده سينتج الشخص الذي اصيب مؤخراً بفيروس اجساما مضاده في مجرى الدم تتعرف على وجه التحديد على ان الفيروس يسمى بالمناعه الخلطيه .

 Two types of antibodies are important.
هناك نوعان الاجسام المضاده المهمه.

A. The first called IgM هذا يستخدم في تحييد الفيروسات وتنتجه خلايا الجهاز المناعي لبضعة اسابيع .

B. The second, called, IgG
النوع الثاني يشير الى وجود عدوى في وقت ماضي
IgM يوجد في دم المضيف . ويستخدم لاختبارات العدوى الحاده

هاي النوعين من الاجسام المضاده نقيسهم عند اجراء اختبارات المناعه


Antibody detection by
1-ELISA assay
احد استخدامات الاجسام المضاده يمكن اجراءه للفيروسات الفرديه
لكن automated panels يمكنها فحص العديد من الفيروسات في وقت واحد واصبحت شائعه .

2-Hemagglutination assay
مقياس التضخم
هذا يرتبط ببعض الفيروسات الموجوده ؏ سطح كريات الدم الحمراء present on the surface of red blood cells,

مثل فيروس الانفلاونزه for example, influenza virus.

إحدى عواقب ذلك هي أنه عند تركيزات معينة قد يرتبط المعلق الفيروسي معًا (agglutinate)خلايا الدم الحمراء وبالتالي يمنعها من الاستقرار خارج المعلق.

شرح المحاضره السادسه

---

أول شي: شرح عام عن الـ Herpes Viruses

Introduction: كل واحد من عدنا تقريباً راح يتعرض لفيروس من عائلة الـ Herpes خلال حياته.
الـ Herpes simplex virus (أو اختصاراً HSV) ينتمي لعائلة اسمها Herpesviridae، وهاي العائلة بيها أكثر من 80 نوع من الفيروسات، تلقاها بكل أنواع الحيوانات تقريبا: من الأسماك إلى الإنسان.

Classification – التصنيف⭕️

العائلة Herpesviridae تتقسم إلى 3 مجاميع رئيسية (subfamilies):

1. Alphaherpesvirinae

2. Betaherpesvirinae

3. Gammaherpesvirinae


وكل مجموعة بيها أنواع (genera).
رغم هذا التنوع، كل فيروسات الهربس تشترك بصفات معينة:

الـ DNA مالها double-stranded وlinear

كلها عدها نفس الشكل العام (morphology)

Virion Properties – خصائص الفايروس

الفايروس enveloped يعني مغلف بغلاف دهني lipoprotein envelope.

بيه 3 أجزاء:

Core (النواة): بيها المادة الوراثية، وهي عبارة عن خط مستقيم من الـ dsDNA.

Capsid (الكابسيد): يحمي الـ DNA.

Tegument: طبقة بروتينية تحيط بالكابسيد.

الحجم يختلف، من 120 إلى 250 نانومتر.

الكابسيد يكون icosahedral spherical، يعني شكل هندسي محدد -

⭕️أنواع الـ Human Herpes Viruses – وعددهم 8 أنواع رئيسية:

1. HSV-1 (Herpes simplex virus type 1)

يسبب oral herpes (القرحات بالفم والشفايف).

⭕️الأعراض: cold sores, fever blisters، ممكن يسبب أمراض بالعين والدماغ (مثل encephalitis).

ينتقل عن طريق contact with saliva or mucous.

ممكن يتحفز بسبب عوامل داخلية (مثل التعب، الحمى، الدورة الشهرية) أو خارجية (الشمس، التوتر...).

2. HSV-2 (Herpes simplex virus type 2)

يسبب genital herpes (قروح مؤلمة بالأعضاء التناسلية).

ينتقل بشكل رئيسي عن طريق الجنس.

ممكن ينتقل من الأم للطفل بالولادة.

يزيد خطر الإصابة بالإيدز (HIV).

3. VZV / HHV-3 (Varicella zoster virus)

يسبب chickenpox (جدري الماء) أول مرة، وإذا رجع يسبب shingles (الحزام الناري).

ممكن يسبب مضاعفات بالجهاز العصبي.

4. EBV / HHV-4 (Epstein-Barr virus)

يسبب infectious mononucleosis (مرض التقبيل).

يرتبط بأمراض مثل السرطان والذئبة الحمراء والتعب المزمن.

5. CMV / HHV-5 (Cytomegalovirus)

ينتقل جنسياً أو عن طريق الدم.

خطير خاصة بالحمل لأن يسبب مشاكل للجنين (مثل التخلف العقلي، الصمم...).

6. HHV-6 & HHV-7

يسببون roseola (طفح جلدي للأطفال).
مرتبطين بضعف المناعة.

7. HHV-8

يسبب Kaposi’s sarcoma، سرطان نادر يصيب مرضى الإيدز.

Viral Replication – خطوات تكاثر فيروس الهربس
العملية تصير بسرعة، خلال 8 – 16 ساعة:
1. الفايروس يدخل الخلية.
2. يتفكك الغلاف – Uncoating.

3. يدخل الـ DNA إلى نواة الخلية.

4. يصير Transcription – نسخ المعلومة إلى mRNA باستخدام إنزيم الخلية (RNA polymerase).

5. يتكون early proteins – تساعد في نسخ الـ DNA.

6. يتوقف إنتاج البروتينات المبكرة وتبدأ صنع late proteins – تدخل بتركيب الفايروس الجديد.

7. تتجمع الأجزاء بالنواة – Assembly.
8. الفايروس يطلع من الخلية عن طريق budding وياخذ الغلاف مالته.

يگدر يعيش كاملاً ساكت (latency) بالعصبونات ويفعل نفسه بعدين.



Diagnosis – تشخيص الهربس

1. الفحص السريري – إذا أكو قرحات أو تقرحات.
2. PCR – يكشف الحمض النووي للفايروس.

3. Electron microscopy – يفحص السائل من القرحات.

4. Immunofluorescence – صبغات تكشف الفايروس بالنسيج.

5. Serology (ELISA) – فحص الأجسام المضادة.

Immunity, Prevention and Control – الوقاية والمناعة

ماكو علاج يشفي الهربس تماماً، بس antiviral drugs تقلل الأعراض والتكرار.

الوقاية تشمل:

تجنب التقبيل أثناء وجود القرحات.

ما تستخدم أدوات الشخص المصاب.

تجنب الجنس غير المحمي.-

Poxviruses (عائلة الجدري): شرح ⭕️كامل

1. General Features (الخصائص العامة)

الفايروسات من عائلة Poxviridae هي من أكبر الفايروسات المعروفة، حجمها تقريبًا 300 × 200 نانومتر (بحجم بكتريا صغيرة).

شكلها طابوگي أو مستطيل (brick-shaped).

تحتوي على DNA مزدوج السلسلة (double-stranded DNA)، موجود داخل هيكل يسمّى core ومحاط من الجانبين بـ lateral bodies.

السطح الخارجي للفايروس مغطّى ببروتينات خيطية (filamentous proteins)، تعطيه شكل يشبه كرة الصوف.

الجزيئة كلها محاطة بـ envelope (غلاف خارجي) مشتق من غشاء الخلية المصابة (host membrane).

2. Host Specificity (تخصص المضيف)

أغلب فايروسات الـ Poxvirus تكون متخصصة لنوع واحد من الكائنات (host-species specific).

لكن فايروس Vaccinia هو استثناء نادر ويكدر يصيب أكثر من نوع.

3. Antigenic Similarity (تشابه المستضدات)

فايروسات الجدري الحقيقية (True poxviruses) تشترك بتركيب مستضدي متقارب، فالإصابة بفايروس واحد تعطي مناعة متقاطعة (cross-protection) ضد البقية.

⭕️أكو أربعة فايروسات من نوع Orthopoxvirus تصيب البشر:

1. Variola virus – يسبب Smallpox ويصيب البشر فقط طبيعيًا.

2. Vaccinia virus – يستخدم في اللقاح، ويصيب البشر وحيوانات.

3. Cowpox virus
4. Monkeypox virus

⭕️ملاحظة مهمة: Chickenpox (جدري الماء) مو من نفس العائلة، يسببّه فايروس من عائلة Herpesviruses، اسمه Varicella-zoster virus.

4. Replication (التكاثر)⭕️

عدهم دورة حياة معقدة، تحتوي أكثر من شكل معدي (infectious forms) كل واحد يدخل الخلية بطريقة مختلفة.

هم الوحيدين من بين الـ DNA viruses الي يتكاثرون داخل السايتوبلازم، مو داخل النواة مثل باقي الفايروسات.

حتى يتكاثر، الفايروس يصنع بروتينات خاصة، أهمها:

DNA-dependent RNA polymerase (إنزيم فايروسي يساعده على نسخ RNA داخل السايتوبلازم).


كل من الأنواع المغلفة (enveloped) و غير المغلفة (unenveloped) من الجزيئات الفيروسية تكون معدية.

الغلاف يحتوي على بروتينات خاصة مثل Hemagglutinin، ويتكوّن من غشاء Golgi المعدل.

⭕️5. Immunity (المناعة)

الإصابة بأي من النوعين:

Variola major

أو Variola minor

تعطي مناعة تامة ضد النوع الآخر.

⭕️Laboratory Diagnosis (التشخيص المختبري)

1. Guarnieri Bodies (الأجسام الشاملة):

تحت المجهر، فايروسات الجدري تنتج inclusion bodies داخل السايتوبلازم اسمها Guarnieri bodies.

هاي تكون مواقع تكاثر الفايروس.

نشوفها بصبغة H&E في خزعة جلدية، تظهر على شكل بقع وردية (pink blobs).

نكدر نعتمد عليها كعلامة مميزة للـ Poxviruses، بس غيابها ما ينفي المرض.

2. Electron Microscopy (المجهر الإلكتروني):

واحد من أسرع الطرق لتشخيص Orthopoxviruses هو فحص السائل من البثور أو القشرة بالمجهر الإلكتروني.

كل الـ Orthopoxviruses تظهر بشكل brick-shaped.

إذا شفنا شكل فايروس الهيربس، نكدر نستبعد Smallpox.

3. Chorioallantoic Membrane Test:

يُستخدم غشاء مشيمي داخل بيضة الدجاج (Chorioallantoic membrane) لتربية فايروس الـ Variola.

نشوف علامات خاصة (pock lesions) حسب درجة الحرارة المحددة.

4. PCR and ELISA:

فحص الـ PCR: يكشف جينات فايروس الـ Variola بدقة.

فحص ELISA و serology: يقيس وجود الأجسام المضادة (Ig) أو مستضدات خاصة بالفايروس.

5. Chickenpox Differentiation:

بعد القضاء على الجدري، كان أحيانًا يتم الخلط بينه وبين Chickenpox.

لهذا تم تطوير فحوصات خاصة للتفريق، مثل:

PCR خاص للـ Varicella-zoster.

Serology.

فحص الفقاعات.

6. Cell Culture (زراعة الخلايا):

بعض فايروسات Poxvirus نكدر نعزلها باستخدام زراعة خلايا (cell culture)، بس مو دائمًا تُستخدم سريريًا.

Smallpox Virus (فيروس الجدري)⭕️

1. Classification (التصنيف)

فيروس الجدري ينتمي إلى جنس Orthopoxvirus.

هو المرض البشري الوحيد الي تم استئصاله بالكامل من العالم.

آخر إصابة طبيعية سُجلت كانت بشهر تشرين الأول سنة 1977.

منظمة الصحة العالمية (WHO) أعلنت القضاء التام عليه سنة 1980.

2. Types of Smallpox (أنواع الجدري)

أكو نوعين رئيسيين من الجدري:

a. Variola major

النوع الشديد والأكثر شيوعًا.

يسبب طفح جلدي واسع و حرارة عالية.

نسبة الوفيات به أعلى، توصل 30% بالتأريخ.


b. Variola minor

نوع أخف، نادر الحدوث.

يسبب أعراض أخف، ونسميه أحيانًا discrete smallpox.

نسبة الوفاة به أقل من 1%.

3. Subclinical Forms (الأشكال غير العرضية)

أكو حالات نادرة من الإصابة تكون بدون أعراض واضحة، نسميها Subclinical infections.

أكو شكل يسمّى Variola sine eruption (جدري بدون طفح جلدي) – غالبًا يظهر عند الناس الي ماخذين اللقاح.

يسبب حرارة فقط بدون طفح.

يتأكد التشخيص عن طريق فحص الأجسام المضادة (antibody studies) أو زراعة الفايروس (rare).

4. Rare Forms (الأشكال النادرة جدًا)

a. Malignant (Flat) smallpox

شكل خطير ونادر.

الطفح يكون مسطّح وغير بارز.

عادةً يكون قاتل.


b. Hemorrhagic smallpox

شكل نادر جدًا.

يسبب نزيف داخلي وطفح دموي.

أيضًا يكون قاتل غالبًا.

Transmission of Smallpox (طرق انتقال الجدري)

1. Respiratory Route (عن طريق التنفس)

الفايروس ينتقل أساسًا عن طريق الاستنشاق (inhalation) للـ قطرات الهوائية (droplets) من فم أو أنف أو بلعوم الشخص المصاب.

2. Close Contact (الاتصال المباشر)

ينتقل خلال الملامسة المباشرة والوثيقة وجهًا لوجه لمسافة أقل من 1.8 متر (6 أقدام).

3. Fomites (الأغراض الملوّثة)

ممكن ينتقل عن طريق ملامسة سوائل جسم المصاب أو أشياء ملوثة مثل الملابس، الفرش، وغيرها.

4. Enclosed Spaces (الأماكن المغلقة)

بحالات نادرة، الفايروس ينتقل بالهواء داخل أماكن مغلقة مثل الباصات أو البنايات.
5. Vertical Transmission (من الأم إلى الجنين)

الفايروس يكدر يعبر المشيمة، بس الإصابة الخلقية (congenital smallpox) كانت نادرة.

6. Prodromal Period (الفترة قبل الطفح)

الفايروس غير معدي غالبًا خلال الفترة الأولى قبل الطفح (prodromal phase).

يبدأ نشر الفايروس عادةً مع ظهور الطفح والآفات داخل الفم والحلق.

7. Rash Stage (مرحلة الطفح الجلدي)

أعلى فترة للنقل تكون خلال أول أسبوع من ظهور الطفح، خاصةً لما تكون الآفات مليانة (intact lesions)

8. Scab Stage (مرحلة التقشر)

العدوى تبقى مستمرة لحد ما يسقط آخر قشرة (scab).

من اليوم 7 إلى 10، العدوى تبدأ تقل لأن الآفات تنشف وتتقشر.

9. Contagiousness (قابلية العدوى)

المرض كان شديد العدوى (highly contagious) بس ينتشر بشكل أبطأ من بعض الفايروسات الأخرى مثل الحصبة.

لأن نقل العدوى يحتاج اتصال مباشر ووقت أطول .
10. Duration of Infectiousness (مدة العدوى)

العدوى قصيرة نسبيًا، لأن فترة نقل الفايروس تكون محدودة بزمن ظهور الطفح وتقشر الجلد.

11. Seasonality (الموسمية)

بالمناطق الباردة (temperate): الإصابات أكثر خلال الشتاء والربيع.

بالمناطق الحارة (tropical): المرض ينتشر طول السنة، ماكو فرق موسمي واضح .

12. Age and Immunity (العمر والمناعة)

توزيع الحالات حسب العمر كان يعتمد على وجود المناعة المكتسبة (acquired immunity).

الناس الكبار ممكن تكون عدهم مناعة بسبب التلقيح السابق أو إصابة سابقة.

13. Vaccine Immunity Duration (مدة مناعة اللقاح)

مناعة التلقيح تتناقص بمرور الزمن، وغالبًا تختفي بعد 30 سنة.

14. No Animal/Insect Transmission (ما تنتقل بالحيوانات أو الحشرات)

ما كانت أكو حالة عدوى من الحيوانات أو الحشرات.

وماكو حاملين بدون أعراض (no asymptomatic carriers).

Vaccinia Virus (فايروس الفاكسينيا)⭕️

1. Classification and Structure (التصنيف والتركيب)

الفاكسينيا فايروس كبير ومعقد ومغلف (Large, complex, enveloped virus).

ينتمي إلى عائلة Poxviridae (عائلة الفايروسات الجدرية).

يحتوي على genome من نوع DNA مزدوج السلسلة وخطي (linear, double-stranded DNA).

2. Role in Smallpox Vaccine (دوره بلقاح الجدري)

هو الفايروس المستخدم بصنع لقاح الجدري (Smallpox vaccine).

منظمة الصحة العالمية (WHO) استخدمته بحملة التلقيح العالمية من سنة 1958 إلى 1977.

بفضل هذا الفايروس، تم استئصال مرض الجدري بالكامل سنة 1980.

3. Current Use in Research (استخدامه حاليًا في البحوث)

رغم أن الجدري انتهى، بس فايروس الفاكسينيا بعده يُستخدم علميًا:

في العلاج الجيني (Gene therapy).

وفي الهندسة الوراثية (Genetic engineering).

4. Multiplicity Reactivation (إعادة التفعيل المتعدد - MR)

من الخصائص المميزة للفاكسينيا هي قابليته على Multiplicity Reactivation (MR):

يعني إذا دخل أكثر من فايروس تالف (damaged) إلى نفس الخلية، يقدرون يصلّحون نفسهم عن طريق التبادل الجيني.

هذا الشي يفيد الفايروس بإصلاح الـ DNA التالف، ويعتبر نوع من recombinational repair.

5. Genetic Relationship (العلاقات الجينية)

تحليل تسلسل الجينوم (Whole-genome sequencing) كشف أن:

الفاكسينيا أكثر شي قريب وراثيًا من فايروس الحصان (Horsepox).

بينما Cowpox strains الموجودة ببريطانيا هي الأبعد جينيًا عن الفاكسينيا.

6. Immune Evasion (مقاومة المناعة)

الفاكسينيا يحتوي على جينات داخل جينومه تنتج بروتينات خاصة:

هذه البروتينات تساعد الفايروس يقاوم الـ Interferons (وهي مواد مناعية بالجسم تحارب الفايروسات).
7. Clinical Infection (الإصابة السريرية)

الإصابة بفايروس الفاكسينيا تكون خفيفة جدًا بالعادة عند الأشخاص الأصحاء.

ممكن يسبب حرارة خفيفة وطفح جلدي بسيط، أو أحيانًا ما يسبب أي أعراض.
8. Immunity Against Smallpox (الحماية من الجدري)

العدوى بفاكسينيا تحفّز الجسم على تكوين مناعة قوية.

هذي المناعة تحمي الشخص من الإصابة القاتلة بفايروس الجدري (Variola virus).

لذلك، تم استخدامه وما زال يُستخدم كلقاح حي ضد الجدري (Live-virus vaccine).

السلام عليكم طلاب خلصت المحاضره رقم 6
اللي اريده منكم تنشرون القناة او ادزون الشرح لأي طالب مرحله ثالثه
"الدال ؏ الخير ڪفاعله " لذلك لا تبخلون بيها اذا تستفادون منها وزعوها
وان شاءالله العصر اذا ماعندي شيء اكمل المحاضره السابعه واحاول هل الايام اختم الماده حتى ابلش وياكم اسئله وزاريه ؏ ڪُل محاضره
نسألكم الدعاء وموفقين ان شاءالله ♥️✨

شرح المحاضره رقم 7

Hepatitis Viruses – الفايروسات المسببة لالتهاب الكبد

أولاً: تعريف عام عن Hepatitis

الـ Hepatitis هو متلازمة سريرية (Clinical syndrome)، يعني مو مرض واحد، وإنما مجموعة أعراض تظهر نتيجة التهاب بالكبد (Liver inflammation).

ممكن يسببها فايروس، بكتريا، طفيلي، أدوية، كحول، أو مواد سامة. بس هنا نركز على الفايروسات.

ثانيًا: الفايروسات الكبدية (Hepatitis Viruses)

عدنا ستة فايروسات رئيسية نسميها "hepatitis viruses" لأن الهدف الرئيسي مالتها هو الكبد (Liver)، بالأخص خلايا الكبد (Hepatocytes).

هاي الفايروسات هي:

1. HAV (Hepatitis A Virus) – النوع المسبب لالتهاب الكبد A أو يسمى Infectious Hepatitis.


2. HBV (Hepatitis B Virus) – يسبب التهاب الكبد B أو Serum Hepatitis.


3. HCV (Hepatitis C Virus) – مسبب رئيسي لالتهاب الكبد C، ويكثر بعد عمليات نقل الدم.


4. HDV (Hepatitis D Virus) – فايروس ناقص (Defective virus)، يحتاج HBV حتى يتكاثر.


5. HEV (Hepatitis E Virus) – يسبب التهاب كبد ينقل عن طريق الأكل والماء، مثل HAV.


6. HGV (Hepatitis G Virus) – فايروس جديد، ودوره المرضي بعده غير واضح تمامًا.

ثالثًا: الاختلافات بين الفايروسات

رغم أن كلهم يصيبون الكبد، لكن يختلفون من حيث:

التركيب (Morphology): بعضها RNA مثل HAV، HEV، HCV، وبعضها DNA مثل HBV.

طريقة التكاثر (Replication pattern): كل فايروس عنده طريقة خاصة للتكاثر داخل الخلية.

طبيعة المرض (Course of infection): بعضها يسبب مرض حاد فقط مثل HAV، HEV، وبعضها ممكن يصير مزمن مثل HBV، HCV.

رابعًا: أعراض المرض الكلينيكية

كل هاي الفايروسات تسبب التهاب حاد بالكبد (Acute hepatitis)، والأعراض تشمل:

Fever (حمى)

Nausea (غثيان)

Vomiting (تقيؤ)

Jaundice (يرقان) – اصفرار الجلد والعينين نتيجة تراكم البيليروبين.

Elevated Liver Enzymes (ارتفاع أنزيمات الكبد) – خاصة ALT وAST بالدم.

خامسًا: العدوى والانتقال

واحدة من أسباب انتشار هاي الفايروسات بشكل سريع هو إنو الشخص المصاب يكون ناقل للعدوى (Contagious) حتى قبل ما تظهر عليه الأعراض، يعني خلال فترة الحضانة (Incubation period).

عدنا نوعين رئيسيين من طرق الانتقال:

Feco-oral transmission (عن طريق الأكل الملوث): مثل HAV وHEV.

Parenteral and sexual transmission (عن طريق الدم أو الجنس): مثل HBV، HCV، HDV.

سادسًا: أكثر المسببات شيوعًا لـ Acute Hepatitis

معظم حالات التهاب الكبد الحاد (Acute viral hepatitis) عند الأطفال والبالغين تكون بسبب واحد من هاي الفايروسات الخمسة:

1. HAV
2. HBV
3. HCV
4. HDV
5. HEV

Hepatitis A and E (التهاب الكبد نوع A و E)

أولًا: التصنيف الفايروسي (Viral Classification)

Hepatitis A Virus – HAV

ينتمي إلى عائلة Picornaviridae، وجنسه Hepatovirus.

هو فايروس RNA غير مغلف (Non-enveloped RNA virus).

الـ capsid ماله شكله عشروني (Icosahedral capsid)، يعني مكوَّن من 20 وجه.

جينومه يكون Single-stranded, positive-sense RNA، يعني RNA موجب الاتجاه، يشتغل مثل mRNA داخل الخلية.

رغم إنه مو مغلف، لكنه عنده طريقة مميزة للخروج من الخلية؛ يطلع وهو مغطى بغشاء دهني (Lipid membrane)، وكأنما مغلف، حتى يختفي من جهاز المناعة.


Hepatitis E Virus – HEV

ينتمي إلى عائلة Hepeviridae، وجنسه Hepevirus.

هو أيضًا RNA virus غير مغلف (Non-enveloped).

شكله عشروني (Icosahedral) مثل HAV.

جينومه Single-stranded, positive-sense RNA.

ثانيًا: طريقة الانتقال (Transmission)

كل من HAV و HEV ينتقلون بطريقة Feco-oral transmission (عن طريق الفم-البراز).

الانتقال يصير غالبًا من خلال الأكل أو الماء الملوث بفضلات الإنسان.

يعني أكثر شيوعًا بالمناطق اللي بيها سوء صرف صحي، أو خلال السفر لمناطق ملوثة.

ثالثًا: الأهمية السريرية (Clinical Significance)

HAV (Hepatitis A Virus)

فترة الحضانة (Incubation period): تتراوح بين 2 إلى 6 أسابيع.

يسبب مرض حاد ومؤقت (Acute illness) يتضمن:

يرقان (Jaundice).

ارتفاع إنزيمات الكبد (Elevated aminotransferases).

أعراض عامة مثل:

تعب (Fatigue)

ضعف عام (Malaise)

فقدان الشهية (Anorexia)

حرارة (Fever)

استفراغ وألم بالبطن (Vomiting & Abdominal pain)


المرض غالبًا ما يسبب مضاعفات خطيرة، ونادرًا ما يصير مزمن.

أهم شي: يتوفر له لقاح فعال (Vaccine) يقي من الإصابة.


HEV (Hepatitis E Virus)

فترة الحضانة: تتراوح من 15 إلى 40 يوم.

أيضًا يسبب مرض حاد (Acute hepatitis) يتضمن:

يرقان

ارتفاع إنزيمات الكبد

أعراض هضمية واضحة أكثر من HAV:

إسهال (Diarrhea)

غثيان واستفراغ (Nausea & Vomiting)

تضخم الكبد (Hepatomegaly)

تضخم الطحال (Splenomegaly)

الفايروس ممكن يكون خطير جدًا على الحوامل، خصوصًا بالثلث الثالث من الحمل، وقد يسبب فشل كبدي حاد (Fulminant Hepatitis).

رابعًا: الفروقات الرئيسية بين HAV و HEV

Hepatitis B Virus – HBV (فايروس التهاب الكبد B)

أولًا: التصنيف الفايروسي (Viral Classification)

ينتمي إلى عائلة Hepadnaviridae.

ضمن جنس Hepadnavirus.

الفايروس يتميز بأنه يقدر يسبب عدوى مزمنة (Chronic infection)، خصوصًا إذا الإصابة صارت بعمر صغير (الرضّع).

العدوى المزمنة ممكن تؤدي إلى تشمع كبد (Cirrhosis) أو سرطان الكبد (Hepatocellular carcinoma) بعد سنوات من الإصابة.

ثانيًا: الشكل والتركيب (Structure)

الفايروس معروف باسم Dane Particle.

يتكون من:

Nucleocapsid عشروني الشكل (Icosahedral).

محاط بـ envelope (غلاف).


ثالثًا: الجينوم (Genome)

DNA جزئيًا مزدوج السلسلة (Partially double-stranded circular DNA):

سلسلة "minus" طويلة وكاملة.

سلسلة "plus" أقصر منها، تغطي من 50–80% من طول السلسلة الثانية.

الجينوم دائري (Circular).

رابعًا: البروتينات الفيروسية (Viral Proteins)

الـ HBV يشفر أربعة بروتينات رئيسية:

1. HBcAg – Core antigen:

هو بروتين النواة (nucleocapsid).

يمثل الجزء الداخلي من الفايروس.



2. HBsAg – Surface antigen:

بروتين سطحي موجود على الغلاف.

مهم جدًا بالتشخيص والمناعة، وهو اللي نكشفه بفحوصات الدم.



3. Reverse transcriptase/DNA polymerase:

هذا انزيم يعمل نسخ عكسي (Reverse transcription) من RNA إلى DNA.

موجود داخل الكابسيد ومع الجينوم الفايروسي.

4. X protein:

بروتين غير هيكلي (Non-structural).

يلعب دور تنظيمي وممكن يساعد الفايروس على تطور السرطان.

خامسًا: دورة الحياة والتكاثر (Replication Cycle)

HBV فريد من نوعه بين فايروسات DNA لأنه يستخدم Reverse transcription مثل الريتروفايروسات (Retroviruses).

يدخل إلى الخلية ويتحول الجينوم إلى cccDNA (covalently closed circular DNA) داخل النواة.

يتم نسخ RNA، ومنه يتم تصنيع DNA جديد باستخدام إنزيم الـ reverse transcriptase.

سادسًا: الكشف (Detection)

HAV و HEV:

يحتاجون إلى Serologic tests (فحوصات مصلية) للكشف عن الأجسام المضادة.

وأيضًا ممكن الكشف عنهم بـ PCR.


HBV:

يتم الكشف عنه عن طريق:

HBsAg: وجوده يعني إصابة نشطة.

Anti-HBc: يبين إذا كانت الإصابة حديثة أو قديمة.

HBV DNA (by PCR): لقياس كمية الفايروس بدقة.

HBeAg: يبين إذا كان الفايروس يتكاثر داخل الجسم.

سابعًا: الانتقال والعدوى (Transmission & Infectiousness)

فيروس HBV موجود بجميع سوائل جسم الإنسان المصاب، ومنها:

الدم (Blood)

السائل المنوي (Semen)

اللعاب (Saliva)

حليب الأم (Breastmilk)


لهذا السبب، هاي السوائل كلها تعتبر مصدر عدوى إذا انتقلت لشخص سليم.

طرق الانتقال الشائعة:

1. الاتصال الجنسي (Sexual contact):

واحد من أكثر الطرق شيوعًا، خصوصًا بالعلاقات غير المحمية.

2. استخدام الإبر المشتركة (Shared needles):

شائع بين متعاطي المخدرات.

3. نقل الدم أو الأدوات الطبية الملوثة:

مثل عمليات نقل الدم بدون فحص، أو أدوات الجراحة والوشم.

4. من الأم إلى الجنين (Perinatal transmission):

خاصة وقت الولادة، إذا كانت الأم مصابة.

ملاحظة مهمة:

الأشخاص اللي ينصابون بالـ HBV بعمر صغير (خاصة الرضّع) عدهم خطر أعلى لتطوير سرطان الكبد (Hepatocellular carcinoma) لاحقًا.

في الدول النامية، HBV غالبًا يكون مرض يصيب الأطفال.

أما في الدول الغربية، الإصابة تكون غالبًا في البالغين، وخصوصًا عن طريق الاتصال الجنسي أو تعاطي المخدرات بإبر مشتركة.

ثامنًا: الأهمية السريرية (Clinical Significance)

1. المرض الحاد (Acute Disease):

هواي من الناس يصابون بالـ HBV وما يبين عليهم أي أعراض (asymptomatic)، خصوصًا الأطفال.

رغم هيچي، الجسم يكوّن استجابة مناعية خلوية (Cell-mediated immune response) تقدر تتغلب على الفايروس وتخليه يختفي.


مراحل العدوى الحادة بـ HBV:

1. فترة الحضانة (Incubation period):

تستمر تقريبًا من 45 إلى 120 يوم بعد الإصابة.

2. المرحلة قبل اليرقان (Pre-jaundice phase):

أعراض غير محددة مثل التعب، فقدان الشهية، وغثيان.


3. المرحلة اليرقانية (Icteric phase):

تبدأ أعراض أكثر وضوحًا مثل:

اليرقان (Jaundice): تلون الجلد وبياض العين باللون الأصفر.

بول غامق (Dark urine): بسبب وجود البيليروبين في البول (Bilirubinuria).

آلام بالبطن، وتضخم بالكبد أحيانًا.

2. الأشخاص المصابون المزمنين (Chronically Infected Individuals):

مو كل المصابين يشفون. بعضهم يتطور عندهم المرض إلى حالة مزمنة (Chronic HBV).

الناس المصابين بشكل مزمن يعتبرون خزان (Reservoir) للفايروس بالمجتمع، لأنهم يقدرون يعدون غيرهم حتى بدون أعراض واضحة.

تاسعًا: التشخيص المختبري (Laboratory Identification)

الهدف من الفحوصات المختبرية:

التحاليل تنعمل لهدفين رئيسيين:

1. تحديد نوع الفايروس المسبب للمرض: يعني هل هو HAV أو HBV أو HCV أو غيره.


2. بالنسبة لفيروس B (HBV): نريد نعرف إذا كانت الإصابة حادّة (acute) لو مزمنة (chronic).

التحاليل البيوكيميائية (Biochemical Tests):

هاي الفحوصات تساعدنا نعرف إذا أكو ضرر بالكبد:

ارتفاع إنزيمات الكبد (Aminotransferases):

مثل ALT و AST، ويدلون على التهاب بالكبد.


ارتفاع مستوى البيليروبين (Bilirubin):

يسبب اليرقان ويبين إن الكبد متأثر.


إطالة زمن البروثرومبين (Prothrombin Time):

يدل على تأثر قدرة الكبد على صنع عوامل التجلط


التحاليل المناعية (Immunologic Tests):

أهم وسيلة لتشخيص فيروسات الكبد.

من ضمنها:

ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay):

تبحث عن الأجسام المضادة (Antibodies) أو المستضدات (Antigens) الخاصة بالفايروس.


فحوصات متقدمة ممكن تشمل:

PCR لتحديد وجود DNA أو RNA الفايروس (خاصة HBV و HCV).

Western blot أو Immunoblot للتأكيد.

عاشرًا: فيروس التهاب الكبد نوع C (Hepatitis C Virus – HCV)


1. التصنيف الفايروسي (Viral Classification):

HCV هو فايروس RNA موجب الشحنة (Positive-stranded RNA).

ينتمي إلى:

Family: Flaviviridae

Genus: Hepacivirus

2. الاكتشاف والتاريخ (Discovery):

تم اكتشاف الفايروس سنة 1988 خلال البحث عن سبب حالات التهاب الكبد اللي كانت تصير بعد نقل الدم، وكانت لا نوع A ولا نوع B، فسموها “Non-A, Non-B Hepatitis”.

بعدها، ثبت إن HCV هو المسؤول عن حوالي 90% من هاي الحالات.

3. طرق الانتقال (Transmission):

HCV ينتقل عن طريق الدم بصورة رئيسية، وهاي أهم طرق الانتقال:

1. نقل الدم (Posttransfusion) – خاصة قبل ما تتوفر فحوصات HCV في بنوك الدم.


2. متعاطي المخدرات الوريدية (Intravenous drug users).


3. مرضى الغسل الكلوي (Hemodialysis) – بسبب تكرار التعرض للإبر والدم.


4. الوشم (Tattooing) – إذا استُخدمت أدوات غير معقمة.


5. الاتصال الجنسي (Sexual transmission) – نادر نسبيًا مقارنة بفيروس B.


6. من الأم إلى الطفل (Mother-to-infant transmission) – ممكن يصير أثناء الولادة.


7. استخدام أدوات حادة ملوثة (مثل الحلاقة أو أدوات الأسنان).

4. التضاعف والمرضية (Replication & Pathogenesis):

الفايروس يتضاعف بصورة أساسية داخل خلايا الكبد (Hepatocytes)، وممكن همين يشتغل داخل:

Mononuclear cells مثل Lymphocytes و Macrophages.


الأذية الكبدية تجي من سببين:

1. تأثير مباشر من بروتينات الفايروس على الخلية.


2. استجابة مناعية قوية، خاصة من Cytotoxic T cells، اللي تهاجم الخلايا المصابة وتسبب الالتهاب.


5. المضاعفات (Complications):

HCV معروف إنه ممكن يتحول إلى التهاب كبد مزمن (Chronic Hepatitis C).

بمرور الوقت، المزمن ممكن يسبب:

تليف الكبد (Cirrhosis)

سرطان الكبد (Hepatocellular carcinoma – HCC)

التهاب الكبد المزمن نوع C (Chronic Hepatitis C)

1. نسبة التحول إلى المزمن (Risk of Chronicity):

فايروس HCV معروف بارتفاع احتمالية التحول إلى التهاب كبد مزمن.

تقريبًا 70-85% من الحالات تتحول إلى مزمنة إذا ما تم علاجها.

2. الأعراض السريرية (Clinical Features):

أغلب المرضى يكونون بلا أعراض (Asymptomatic) أو عندهم أعراض خفيفة وغير نوعية (Mild, Nonspecific Symptoms)، خاصة لأن تليف الكبد (Cirrhosis) ما يكون بعد موجود.

أكثر عرض شائع هو:

Fatigue (تعب عام)


أعراض أقل شيوعًا:

Nausea (غثيان)

Weakness (ضعف عام)

Myalgia (ألم في العضلات)

Arthralgia (ألم المفاصل)

Weight loss (نقص وزن)

3. العدوى المشتركة بالفايروسات الأخرى (Viral Coinfection):

مرضى الإيدز (HIV-infected patients): تطور المرض عندهم أسرع وأكثر شدة.

العدوى المزدوجة بـ HBV/HCV:

تلف الكبد يكون أخطر وأسرع تطورًا.

التهاب كبد حاد بـ HBV على خلفية التهاب مزمن بـ HCV ممكن يكون أشد من الطبيعي

4. التشخيص المختبري (Laboratory Identification):

يتم تشخيص HCV عن طريق:

1. الكشف عن الأجسام المضادة (Antibodies Detection):

باستخدام بروتينات فايروسية مُعاد تركيبها (Recombinant viral proteins).

أشهر فحص: ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay).


2. الكشف عن الحامض النووي الفايروسي (Viral Nucleic Acid Detection):

باستخدام تقنية RT-PCR (Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction).

هذا الفحص حساس جدًا ويكشف عن RNA الفايروس في الدم.

اذا شاءالله باجر انزل الثامنه والتاسعه حتى اخلص بسرعه ونبدي بالاسئله
موفقين ان شاءالله

المحاضره رقم 8

HIV (Human Immunodeficiency Virus) – فايروس العوز المناعي البشري

التصنيف الفايروسي (Viral Classification):

العائلة (Family): Retroviridae

الجنس (Genus): Lentivirus

النوع (Species): Human Immunodeficiency Virus (HIV)

ضمن هذا الجنس يوجد:

HIV-1: النوع الأكثر شيوعًا بالعالم، مسؤول عن أغلب حالات الإيدز.

HIV-2: أقل شيوعًا، ينتشر غالبًا بغرب أفريقيا، أقل فتكًا من HIV-1.

الخلايا المُستهدفة (Target Cells):

الفايروس يصيب خلايا معينة بالجهاز المناعي وهي:

CD4+ T helper cells

Macrophages

Dendritic cells

هاي الخلايا تحتوي على مستقبلات CD4، والفايروس يرتبط بيها حتى يدخل الخلية.

آلية التأثير (Pathogenesis):

1. يدخل الفايروس إلى الخلية عبر مستقبل CD4، ويحتاج أيضًا إلى co-receptors (مثل CCR5 أو CXCR4).

2. بعد الدخول، يتم تحويل الـRNA إلى DNA بواسطة إنزيم reverse transcriptase.

3. يتم إدخال الـDNA الفايروسي داخل نواة الخلية ويدمج مع الـDNA البشري، وهذا الشي يخلي الفايروس مزمن ويصعب التخلص منه.

4. يبدأ الفايروس يتكاثر ويدمر الخلايا CD4+ تدريجيًا.

الفرق بين HIV و AIDS:

HIV (الفايروس) هو المسبب.

AIDS (Acquired Immunodeficiency Syndrome) هو المرحلة النهائية من الإصابة بالـHIV.

يتم تشخيص الإيدز عندما:

عدد خلايا CD4 ينزل أقل من 200 cell/mm³

أو ظهور عدوى انتهازية (Opportunistic infections) مثل: Pneumocystis pneumonia أو Kaposi sarcoma (نوع من السرطان).

أهمية CD4 T cells:

هاي الخلايا مهمة لتحفيز باقي الجهاز المناعي (B cells، CD8 cells، macrophages...).

نقصانها يؤدي إلى:
ضعف المناعة
قابلية عالية للإصابات الانتهازية
تطور الأورام غير المعتادة

أنواع فيروس HIV (Types of HIV):

الـHIV ينقسم إلى نوعين رئيسيين:

A. HIV-1

هو الأكثر شيوعًا عالميًا.

يحتوي على 9 أنماط فرعية (Subtypes).

يعتبر المسبب الرئيسي لمرض الإيدز (AIDS).


الخصائص:

يسبب العدوى في كل أنحاء العالم.

شديد الضراوة (Highly virulent) يعني يسبب أعراض ومضاعفات بسرعة وشدة أكبر.

سريع الطفرات (Highly susceptible to mutations)، وهذا يخلي مناعته صعبة ويصعب تطوير لقاح فعال ضده.

B. HIV-2

يحتوي على 5 أنماط فرعية (Subtypes).

أقل شيوعًا وينتشر غالبًا في مناطق معينة مثل:

غرب أفريقيا (West Africa)

موزمبيق (Mozambique)

الخصائص:

أقل ضراوة (Less virulent)، يعني الأعراض تتطور ببطء، وممكن يبقى الشخص سنين بدون ما يوصل لمرحلة الإيدز.

أقل طفرة (Less susceptible to mutations)، يعني ثباته الجيني أعلى، وسهل تتبعه مخبريًا.

يعتبر أقل تسببًا بالإيدز مقارنة بـHIV-1.