#лабжурнал

Проверим материал на абьюзивность токсичность

Привет, коллега!

При разработке новых препаратов для лечения человека, будь то лекарственные препараты или медицинские изделия, часто встаёт вопрос токсического воздействия на организм. Раньше всё тестировали на животных (а ещё раньше сразу на людях 😈), но с развитием принципов биоэтики и методов культивирования клеток эукариот, способность препаратов влиять на метаболизм или вообще убивать оценивается на клетках. И сегодня кратко перечислю самые популярные методы оценки. Кто хочет подробнее посмотреть протоколы, то они доступны здесь, здесь и здесь. Пойдём по очерёдности исходов: клетке стало плохо и она замедлила метаболизм (тесты на жизнеспособность), клетка встала на путь запрограммированной гибели (апоптоза) и клетка так или иначе умерла.

Получилось много, но я помню, что читатели не боятся длинных текстов, так что продолжение читай в телеграфе.

TW: рисунок содержит сцену насилия

#дед_инсайд

Мы с коллегами преподавателями достаточно много дискутируем на тему всех образовательных фишек и иногда я пишу про них и тут в рамках рубрики #педсовет. Но знаете, со многими из них я сталкивалась в своём обучении, просто тогда не было трансформации университетов и они не назывались какими-то модными словами. Собственно сегодняшний пост - это такой ретроспективный анализ моего собственного образовательного опыта с позиции разработчика программ.

❤️ Начнём с того, что я заканчивала биологический факультет МГУ и у меня был прекрасный пятилетний специалитет, ещё до введения всех этих бакалавров и магистров. Я кстати настаиваю, что 5 лет обучения биологии достаточно, но нынешние образовательные стандарты почему-то против. В конце первого курса нас распределяли по трём отделениям (условно мокрая лаба, полевики и сухая биология), в середине второго курса мы выбирали кафедру, где на третьем делали теоретическую курсовую, на четвёртом экспериментальную и на пятом собственно диплом. Естественно, программа для каждого отделения и каждой кафедры отличалась и сейчас такой формат называют групповыми образовательными траекториями.

✨ В самом начале нам давали знания по огромному количеству предметов, углубление в специальность пошло где-то после 3 курса. Большая часть этих знаний благополучно забылась, но какой-то их след остался. Так что по крайней мере я теперь могу понимать мемы из разных областей наук. Ещё могу общаться с очень разными специалистами, но конечно же главное мемы. Это конечно не новое для МГУ, но вот она: широкая фундаментальная подготовка.

🦯 Во время обучения на биофаке практика занимала огромное количество времени, для меня больше половины, поскольку лекции я почти всегда прогуливала. Мы делали всё: хроматографию, ПЦР, нервно-мышечные препараты, нас учили паять, копать нереисов и даже свежевать тушу кролика. Я приобрела просто огромное количество навыков, а правильно оформленные лабжурналы позволяют вспомнить самое главное много лет спустя. Нынче это зовётся практико-ориентированное обучение.

🏃‍♂️ Ещё пока мы учились, в МГУ ввели классную штуку - межфакультетские учебные курсы. Тогда они зашли не всем, возможно сейчас тоже не пользуются большой популярностью, но на мой взгляд это отличная возможность узнать то, что интересно лично тебе. Некоторые мои однокурсники ходили на занятия по литературе, экономике или даже брали новые иностранные языки, то есть то, что не могли получить в основной программе по биологии. Лично я ходила на язык R, астрофизику и методологию науки. И это между прочим индивидуализация образования.

⌨️ Ну и конечно же диплом. Факультет и наша кафедра устанавливала достаточно высокие требования к уровню дипломных, так что все так или иначе освоили и прочувствовали на своей шкуре полный цикл выполнения научных работ. Некоторые выбирали элективы под диплом, ходили на кафедры вольными слушателями или доучивались самостоятельно. Многие уже догадались, что это то самое проектно-ориентированное обучение.


Может сложиться впечатление, что я считаю образование на биофаке образца 10-15летней давности супер крутым и прогрессивным, но это не так. Очень много преподаваемой информации устарело ещё тогда (зачастую вместе с преподавателями), не хватало современных методов и работы на современном оборудовании. Также не было сбора обратной связи и какой-то работы над улучшением курсов, а если что-то и проскакивало - то это была полностью инициатива преподавателей, за что им огромное спасибо. Но в общем и целом, я считаю программу скорее хорошей, чем плохой и то, как были сделаны многие вещи, я таки забрала в копилочку, чтобы реализовать в собственных проектах ✨

#статистика_для_котиков

Согласно статистике, я в норме

Привет, коллега!

Когда я писала о мерах центральной тенденции и мерах разброса, я говорила также про симметричное и ассиметричное распределение данных. И вот сегодня обсудим одно из самых известных симметричных распределений — нормальное распределение или распределение Гаусса. Подавляющее большинство статистических методов и моделей основано на этом распределении, так что э т о б а з а.

Для чуть лучшего понимания решила снабдить пост картинками, так что публикую его в телеграф. Третий раз за неделю, что-то я разошлась ⌨️

Привет, коллега!

Сегодня пятница, а значит настало время расчехлить свои пальчики для участия в интерактивах. В комментариях мне предложили рассказать о лабораторных факапах, но я подумала, что мой опыт может быть достаточно однобоким, так что реквестирую помощь зала.

Мы все так или иначе допускаем ошибки и мне кажется важно показывать начинающим и не очень исследователям, что это нормально и это часть пути. Да иногда и нам самим стоит вспомнить с чего мы начинали и не обвинять своих подопечных в том, что у них руки из жопы.

Итак, представляю вам подборку своих лабораторных лайффаков:

🫠 Не стоит оставлять без присмотра пластиковые изделия в сушильных шкафах, разогревающихся до 100 градусов. Не знаю сколько раз я отвлекалась и забывала то убрать пластик из термостата, то опустить температуру, то проследить, что прибор работает корректно. Отдирать гистологические коробки или коробки с носами от сухожара - то ещё удовольствие.

🫠 Не забывай доливать воду в клеточный инкубатор. В нём всегда поддерживается температура 37С и 100% влажность, которая нужна для того, чтобы среда, в которой растут клетки, не испарялась. Как-то раз я забыла проследить за уровнем воды, а после выходных обнаружила сухие лунки с мёртвыми клетками.

🏌️Проверяй, что именно ты сбрасываешь в слив. Какое-то неприлично огромное количество раз сбрасывала в слив супернтант, содержащий что-то нужное. Например, забыла отцентрифугировать клетки и слила всю пробирку. В Каролинском институте подсмотрела, что для особо важных клеточных экспериментов они используют для слива не общую банку, а стерильные пробирки (какое расточительство!). И если случайно вылил что-то - то можно отцентрифугировать и вернуть всё взад.

👀 Читай внимательно как разводятся реактивы и обязательно переспрашивай, если что-то непонятно. В какой-то момент я впервые столкнулась с фиксацией тканей в формалине и для его разведения мне понадобилось приготовить фосфатно солевой буфер. Мне дали таблетки для буфера в какой-то неподписанной банке и я с чего-то решила, что одной таблетки мне хватит на литр буфера. Потом я узнала, что они были рассчитаны на 100 мл. Буфер получился неправильный, образцы нормально не зафиксировались и потом не прокрасились. Если что, кстати, дофиксировать можно прям на стекле, но это поможет, если сама ткань не развалилась.

😵 Соблюдай технику безопасности: иногда она написала кровью. У меня в анамнезе несколько испорченных вещей из-за пролитых реактивов и химический ожог от соляной кислоты. А ещё я как-то не аккуратно работала со скальпелем, срезая хрящ с человеческих суставов, и порезалась. Потом бегала сдавала анализы на гепатиты и ВИЧ.

➖➖
Ну что, коллеги, делитесь своими факапами в комментариях, а мы попробуем научиться на чужих ошибках 😈

#методичка

Кто не рискует, тот не публикует статьи в вестнике мухосранского федерального университета

Привет, коллега!

Как-то я писала про то, почему в этом году мне понравилось делать отчёт по гранту РНФ. Спойлер: в основном из-за хорошо спланированных работ. А всё потому что я душила и при написании заявки начала использовать такую вещь как риск-менеджмент для более системного подхода к дизайну исследования.

Риск-менеджмент — это процесс выявления, оценки и контроля рисков, которые могут повлиять на достижение цели исследования. 

Обычно он применяется везде, где есть какие-то большие инвестиции. В научных исследованиях это не так актуально, но какие-то приёмчики я регулярно применяю при планировании своей работы. Расскажу по шагам как именно.

1️⃣Первым делом нужно выявить все возможные риски. Кстати они бывают как отрицательные, так и положительные. Пример положительного риска: ты знаешь, что в институт может приехать новый прибор, но пока ничего не ясно. Но если он придёт и ты сможешь проанализировать на нём свои образцы - то это улучшит качество исследования. Ну а отрицательные риски мы все хорошо знаем: срыв закупок, поломка прибора, увольнение сотрудников, негативные результаты и так далее.

2️⃣ Далее надо определить вероятность возникновения каждого риска, самая простая схема это низкая, средняя и высокая вероятность. Каждой вероятности можно присвоить свой вес, например 1, 2 и 3, соответственно. Например, если отдел закупок института славится откладыванием документов в долгий ящик - то риск не купить реагенты вовремя будет высоким. А вот поломка надёжного спектрофотометра почти невозможна, так что риск будет считаться низким.

3️⃣ Теперь нужно примерно прикинуть, насколько сильно этот риск повлияет на выполнение твоего проекта. Можно также использовать шкалу низкое, среднее и высокое влияние. Срыв закупок очевидно будет иметь страшные последствия, а вот то, что какая-то отдельная методика не получится - не беда, получится другая.

4️⃣ Далее для каждого риска перемножается вероятность возникновения и степень влияния и таким образом они ранжируются. И далее выбирается стратегия для работы с каждым риском.

🟡Уклониться - вообще не делать то, что может вызвать риск. Есть опасность, что сотрудница уйдёт в декрет? Не вовлекай её в проект.

🟡Делегировать - передать риск кому-то ещё. Например, нанять людей, которые сделают эту часть работы за денежку. Правда тогда риск не исчезает, поэтому лучше не использовать данную стратегию для самых вероятных и влиятельных ситуаций.

🟡Снизить - сделать что-то, чтобы уменьшить вероятность возникновения риска или степень его воздействия. Например, самостоятельно подготовить все документы для отдела закупок, придумать пару подстаховочных методик для оценивания одного параметра. Это стратегия как раз для рисков с самыми высокими баллами.

🟡Принять - ничего не делать и позволить риску случиться или нет. Например, так можно сделать для риска, что в эксперименте не получатся данные, которые ты ожидаешь. Это можно только принять и придумать, что с этим делать дальше.

🟡Увеличить - сделать всё, чтобы риск случился. Очевидно, это делается только для положительных рисков. Помнишь ситуацию с прибором? Можно пойти к завлабу и капать ему на мозг, чтобы он продвигал его покупку у руководства.

5️⃣ И теперь нужно четко следовать намеченному плану и периодически обновлять оценку.

〰️〰️
Есть ещё другие схемы, например "галстук-бабочка", или более сложные шкалы, которые позволяет анализировать причины и последствия рисков и работать с ними, но на мой взгляд это уже перебор для научных проектов. Надеюсь, этот материал поможет тебе в планировании своих исследований и тебе никогда не придётся бегать с попой в мыле из-за риска невыполнения проекта 🤬