#淺談基因組分析

🔘無病毒論者的觀念
Stefan Lanka 等無病毒者根據他們對「基因組學」 (Genomics) 的理解聲稱：所有 SARS-CoV-2 的基因組都可以從任何一組病毒 RNA 片段 (鹼基的讀值 Read ) 組裝而成。他們駁斥了「基因組學」作為病毒存在的證據，轉向數位化之前的舊觀點，即「病毒應該首先被分離出來，然後才能測序」。這種觀念被蘭卡 (Stefan Lanka)、埃克特 (Samuel Eckert) 和考夫曼 (Andrew Kaufman) 等無病毒論者大力宣揚。

🔘基因組分析的基本概念
這就好比說：任何一本內容不同的書都可以用字母表中的任何字母或字典中的任何單詞來拼湊組合而成。但只有當用來組合的單元 (單詞) 的字母數量非常少的情況下它才有效。當用字母數量較多的完整句子或一串句子甚至段落章節作為單元進行組合，且文意必須連貫時，排列組合而成的內容種類數量就只能收斂成一本獨一無二的書。

用於基因組組合的單位不是像 A、T、C 或 G 這樣單獨的核苷酸/鹼基 (字母)，也不是像 CGG 或 ATC 這樣的密碼子 (單詞)，而是像CTTAGCCAGGTCCAA 這樣的長字符串 (一個或多個句子) 。目前技術上最短的單元大約有 100 個字母/鹼基 (第 3, 4 代定序一次讀取可達 100K 個以上)。這是高度集成的，對於特定病毒來說是獨一無二的 ( COVID-19 冠狀病毒的 RNA 基因組長度約為 30,000 個字母/鹼基;  流感病毒的基因組更短，約為 13,500 個 RNA 字母/鹼基)。這些基因組不是在電腦上隨機組裝或生成的，而是基於實際量測後的結果數位化 (保留其排列訊息) 和 (幾十萬~幾千萬個) 真實 RNA 片段的關聯性組裝結果。

如何知道這些組合完的基因組確實是我們正在尋找的病原體或生物體的基因組？答案是因為不同病毒會有組裝序列中獨特的一串核苷酸/鹼基 (一串字母)，可以從這些獨特的整串核苷酸/鹼基與世界累積共享的基因庫進行比對。如今，技術上已經可以直接對一些無法分離與培養的生物體進行基因測序。

因此，聲稱「病毒應該首先被分離出來，然後才能測序」與「任何病毒基因組都可以從任何一串鹼基讀數或其他物種的 RNA 片段任意組成」的說法 #都是無稽之談。

#組裝RNA片段不是按照隨便的基因模板去湊而是經關聯性演算法組成後再比對基因庫


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#病毒不是外泌體1

由 2020/8/18 刊登在 Science 期刊上的一篇德國團隊的 SARS-COV-2 研究論文的附件公佈的冷凍電子顯微鏡(Cryo-Electron Microscopy)影像顯示新冠病毒的斷層掃描動畫，病毒很明顯具有粗壯的刺突蛋白結構。

刺突蛋白並非人體DNA裡面可以生產出來的蛋白，所以不可能是人類細胞的外泌體。


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#一個生物學家的基因組學誤解

Stefan Lanka，1989年畢業於Konstanz大學，取得生物學碩士。1994年取得自然科學博士。在學期間的研究為「褐藻病毒感染的分子生物學研究」，嚴格說來並非病毒學家，更不是基因組學的專家。

在他最近「否認病毒的7個要點」的論述中，對於病毒的基因組學認知有很大的偏差。他認為：任何病毒的基因測序都可以用任何物種的RNA小片段去套用既有造假的病毒基因組模板而拼湊出來。

❎他的這個方法只可能在RNA碎片含量少於6個鹼基的狀況下才有很小的機會能成功，現實面取得的物種RNA片段基本上都遠大於6個鹼基的組合。(參考說明)

現今基因測序已經發展了確認基因組合唯一性的三種測序方法：
1⃣借助參考模板
事先比對不同病毒特有的一串核苷酸排列來選擇參考模板，確保唯一性。(譬如已經由RT-PCR確認是哪一種病毒) 再將所有RNA片段與參考模板進行逐個比對定位，然後再分析變異性。
2⃣重疊關聯串接
在未知的情況下，可以用打散了的拼圖的還原過程來想像，每一片拼圖都和周圍的拼圖有關聯性。基因組組合的時候，每個RNA片段的頭尾也會與位置相鄰的片段的頭或尾產生鹼基重疊的關聯性，進而組合成一條完整的 RNA，再以數十萬個不同長度與不同斷點的RNA片段去重複驗證組合的方式是否正確，程式的演算法會進行基因排列偵錯除錯來得到最正確且唯一的組合。就像拼圖只能被拼出一種結果一樣。
3⃣超長鏈的讀取
最新的基因測序如第三代測序的奈米孔技術，一次就可以讀取10Kb (Kilobase)以上的鹼基數目。冠狀病毒一共約有30Kb的鹼基，可想而知，有可能一次的鹼基讀取就涵蓋了整條病毒的RNA。第四代基因測序技術的讀取量更大，最大可達1000Kb。而這種技術觀念是無病毒論者腦袋中所沒有的觀念。都已經可以讀取整條RNA了，他們大腦還停留在NGS、一切都是碎片拼湊造假的階段。(2020年中國CDC、澳洲莫爾本大學、香港大學就是用這種第三代奈米孔的新技術測序SARS-COV-2)

❎以上三種基因測序的唯一性，也否定了Lanka提出的測序須要對照實驗組的想法。因為，同一來源的RNA片段針對不同的病毒基因組模板比對，絕對不會出現基因的排序組合也適用於兩種以上病毒的可能性。

❎現在的技術已經可以在測序樣本中，區分出不同物種的基因片段，因此也不會有把人或細菌的DNA/RNA碎片誤認成病毒RNA。


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#病毒RNA片段的唯一性

CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG

大家可以將以上這串SARS-COV-2病毒的RNA片段 (28個鹼基) 輸入到美國國家醫學圖書館的BLAST搜尋引擎進行搜尋，就會發現只能找到 SARS-COV-2 類的病毒，而無法搜尋到 Measles, HIV, Ebola, Zika 或其他病毒。目前世界上短片段RNA序列讀取的技術為 NGS (次世代定序)，處理最短的RNA片段也有50個鹼基。這就是為什麼虛線以下的對話稱作是無稽之談了。

(BLAST, Basic Local Alignment Search Tool 基本的局部比對搜索工具：
發現生物序列之間的相似區域。該程序將核苷酸或蛋白質序列與序列數據庫進行比較併計算統計顯著性。)
SARS-Cov-2 基因組的完整測序資料網頁

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Stefan Lanka 和 Thomas Cowan的對談

Lanka：
為了構建病毒基因組，佛地魔出現了。「哦！我發現了新的武漢病毒，或是我重複了實驗。」他們總是需要已給定的基因組，來作為他們在哪裡添加較小片段和在哪裡嵌合已給定基因組的方向點。所以，它就像一個句子。聖經的全部內容來自三萬個字母，對吧？以及我們使用一個小字母數的組合 ，一、二、三、五個字母以及嘗試將它們安裝到適合的位置，對吧？並且又再次沒有對照實驗。🙅對照實驗就像是去嘗試比對另一種RNA病毒，它可能是麻疹病毒。這就像是以相同的數據集合讓我們嘗試一下是否可以組成另一個病毒的對照實驗。而我可以告訴你 “是的”，就像這樣。我已經在錯誤的病毒程序中展示了它，並且這裡(我)在冠狀病毒(計劃)中將會很有希望地快速展示出這一點，對吧?
Cowan：
換句話說，你可以拿同樣的原始數據集合、🙅‍♂在混合物裡面拿相同的RNA短片段，然後你可以創建、你可以找到模板：對於冠狀病毒的模板，或是對於愛滋病毒的模板，或是對於麻疹病毒的模板。然後你告訴計算機去定向或對齊那個模板，以及在每一個的案例中，好，就是我們正在做的，就說：是的，我發現這個人得了麻疹、他們得了愛滋病、他們得了伊波拉、他們得了茲卡。順便說一下，他們感染了冠狀病毒。
Lanka：
就是這樣！

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#俄羅斯登月艇撞擊月球

Luna-25 是俄羅斯 47 年來的首次月球任務，是計劃中的一系列月球探測器的先鋒。Luna-25 於 8月10日 發射升空，並於 8月13日 將其第一張太空照片傳回地球，其中包括以月球和地球為背景的照片。

IKI (俄羅斯科學院 太空研究所) 原本希望最早於 8月21日 在月球南極著陸的 Luna-25 登陸艇在 8月19日 軌道調控器出現問題後墜入月球。莫斯科時間 8月19日 14:57 發生與  Luna-25 登陸艇的通信中斷。故障的軌道調控器使 Luna-25 進入了意想不到的軌道，因而使登陸艇與月球表面碰撞。

NASA LROC (LRO Camera) 團隊和 LRO Mission Operations 團隊於 8月22日 設計並向 LRO 軌道探測器送命令以捕獲該撞擊位置的圖像。LROC 團隊將撞擊前拍攝的圖像與撞擊後拍攝的圖像進行了比較，發現了一個新的小隕石坑。

#俄羅斯IKI會與美國NASA串通撒謊嗎？


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#一個不知道在對照什麼的對照實驗

Stefan Lanka為了否認病毒，認為所有新冠病毒分離的實驗中出現的細胞病變效應(CPE)不是由病毒造成的，而是培養細胞被餓死或被添加的抗生素毒死的。所以他設計執行了一項「劑量異常」的CPE對照實驗。(影片)

#CPE對照實驗的硬傷
這項實驗就好像是要證明「世上沒疾病、沒有人因病而死。」所以讓人挨餓並且喝酒過量致死，然後宣佈說：「餓死、中毒死跟病死都一樣是死的，所以講病死的都是誤判。」如此滑稽、荒謬與怪異。

#Lanka的CPE實驗
規劃了4組人類上皮細胞的培養：(傳代3代後的細胞再用實驗傳第4~6代，在第6代萃取培養基上清液和細胞中的RNA，作為後續否認基因定序的實驗用)

第1⃣組：原細胞培養液+1單位的抗生素
第2⃣組：新培養液+10%的胎牛血清+1單位的抗生素
第3⃣組：新培養液+1%的胎牛血清+3單位的抗生素+傳代時一起轉移部份培養基上清液
第4⃣組：新培養液+1%的胎牛血清+3單位的抗生素+傳代前用酵母RNA處理10分鐘+傳代時一起轉移部份培養基上清液

傳代後隔1天和5天，用顯微鏡拍攝細胞差異。發現：全部組別細胞都出現差異，第1⃣組無CPE，第2⃣組CPE不明顯，但第3⃣組和第4⃣組的CPE噬菌斑非常明顯。因而宣稱沒有添加新冠病毒、甚至添加酵母的培養細胞也出現CPE。因此，所有新冠病毒實驗觀察到的CPE都是原本就有或是細胞被餓死或抗生素毒死產生的，所以沒病毒。

#CPE實驗的問題點
1⃣實驗缺乏陽性對照。Lanka強調要證明病毒存在必須要有陰性對照組，那麼要證明病毒產生的CPE與細胞被餓死毒死的CPE一樣，就缺少「假的」的患者檢體感染的陽性對照組。邏輯無法自洽。
2⃣刻意設置的嚴苛條件。常規病毒分離培養會供給10%胎牛血清作為細胞營養，1單位(1X)的抗生素作為殺菌用途。一般多使用無毒青黴素+低毒性鏈黴素(二抗)，而Lanka卻採用毒性較高的青黴素+鏈黴素+兩性黴素(三抗)混合物，且劑量增至3倍(3X)，然後細胞營養供給降為1/10。讓人餓死或酒精中毒死無法否認病死存在。
3⃣正常劑量沒問題。如圖右，韓國、中國、澳洲團隊所做的新冠病毒分離實驗，實驗組與對照組使用的培養基+胎牛血清+抗生素的條件都一樣，差別只在有無病人樣本的感染。他們的陰性對照組的結果，細胞都很正常。而且Lanka已經自證，正常劑量胎牛血清+抗生素組別的CPE不明顯。


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#連Skywriting都不知道

可憐吶！

📖Skywriting維基百科
😊Skywriting笑臉影片1
😊Skywriting笑臉影片2
😊Skywriting笑臉影片3
😊Skywriting笑臉影片4
😊Skywriting笑臉影片5
😊Skywriting笑臉影片6
😊Skywriting笑臉影片7
😊Skywriting笑臉影片8


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#只要你不臉紅·臉紅的就是別人

你付600買盤子了嗎？


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#普丁的P圖替身

俄羅斯總統的兩張P圖照片 (左) 被用來說明他有很多「複製人替身」，但照片是假的。

第1張照片的來源是2012/12/28在克林姆林宮的將軍晉升儀式。

第2張照片的來源是烏克蘭車諾比人Yurly Pyvovar臉書製作的惡搞圖片。(已遭刪除，但有落款。其臉書上有很多惡搞普丁圖片。)

#真要斬首就一鍋端就好了(都在一起)


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#911事件的18個角度

911屆滿22週年(東亞應該是明天晚上)。如果是電腦動畫，造假18個角度的目擊還真累。由這些畫面來看，似乎不可能是造假的。但飛機真的可以完全撞進鋼筋混凝土而機翼不會脫落嗎？

有沒有飛機不影響發動戰爭與緊縮監控，事件的本身就是人為的陰謀。

#大家自由心證


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#一年後戳破叫囂者的謊言

王群光醫生車禍去世一年以來，王大師夥同愛將踹共(@Zorro)不斷持續叫囂持有行車記錄器影片的群友是網軍，什麼「王案交出影片就會水落石出」，「王案因群友不交影片而罪行加重」。眾多群眾被唬得一愣一愣的，還真的以為有誰隱匿了什麼重大事證，罪無可赦。現在讓他們表現一年的跳樑後，揭開他們偽善邪惡、羅織人入罪、箝制自由言論的假面具。

2022/9/16中時網路新聞的王群光醫生車禍報導照片的右下角，有行車記錄器的品牌與時間戳記。這代表第一時間警方與記者已經持有行車記錄器的影片。兩個跳樑小丑借勢借端誣陷他人，一年了，大家看清楚了沒？

王大師與踹共精彩表演頻道

王群光車禍事故始末


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#原始人又恐慌了

今天台北天空佈滿卷層雲，是飛機凝結尾好發的天氣。沒錯！一堆原始人又恐慌了。🤣

原因說明

註：
卷層雲出現的意義，就是與凝結尾會發生的重疊空域中的水氣含量過飽和，才會有多餘的冰晶形成卷層雲滯空。重疊空域的水氣不足時，則不會有卷雲。


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#今日台北凝結尾密集原因

2023/9/11 8:00由中央氣象局探空斜溫圖可看出氣壓200hPa的高空(約當36,000ft高度)的氣溫為-53°C, 濕度為80%~85%RH。而到11:00左右，氣壓200hPa處的濕度增加至100%，高空風力為西風7級陣風。

經過1小時觀測，幾乎九成的飛機飛過大台北上空都會產生凝結尾，在天空飄移與擴散非常快。這麼多的凝結尾同時出現相當罕見，也必須要高空100%RH的濕度條件配合才行。


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