DEAD-box последовательности – высококонсервативные мотивы, присущие для хеликаз. Например MDA5 рецептор, который участвует в антивирусном ответе системы врожденного иммунитета, содержит последовательность аспарагиновая кислота-глутаминовая кислота-аланин-аспарагиновая кислота, характерную для РНК-хеликаз.
Белки с такими мотивами участвуют в метаболизме РНК, включая ядерную транскрипцию, пре-сплайсинг мРНК, биогенез рибосом, нуклеоцитоплазматический транспорт, трансляцию, распад РНК и экспрессию органоидных генов.
#молекулярная_биология
Белки с такими мотивами участвуют в метаболизме РНК, включая ядерную транскрипцию, пре-сплайсинг мРНК, биогенез рибосом, нуклеоцитоплазматический транспорт, трансляцию, распад РНК и экспрессию органоидных генов.
#молекулярная_биология
CD36 — мембранный белок, экспрессированный на поверхности клеток нескольких типов, особенно макрофагах; относится к классу B скэвенджер-рецепторов («мусорных рецепторов»), компонент системы врожденного иммунитета. Связывает эритроциты, заражённые паразитическим Plasmodium falciparum, окисленные липопротеины низкой плотности, фосфолипиды и ЖК. Кроме этого, CD36, экспрессированный на поверхности эпителия вкусовых сосочков языка, является рецептором, связывающим жирные кислоты пищи и участвующим в формировании «вкуса жира».
#иммунология
#иммунология
Синдром Рея (Рейе) – редкое состояние при лечении детей препаратами ацетилсалициоловой кислоты (при лечении гриппа, кори, ветрянки, например, аспирином), сопровождающееся энцефалопатией, жировой инфильтрацией печени, гипераммониемией.
#микробиология
#микробиология
В результате использования вакцин против гриппа, как и при вирусных инфекциях, может развиваться такое аутоиммунное состояние, как синдром Гийена-Баррэ
#микробиология
#иммунология
#микробиология
#иммунология
Основными причинами асептического менингита являются вирусы Коксаки, паротита и эховирус.
#микробиология
#микробиология
В 2019 году вирус краснухи был окончательно перенесен в собственное семейство Matonaviridae, названное в честь Жоржа де Матона [1], который в 1814 году впервые отличил краснуху от кори и скарлатины.
[1] – https://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/animal-ssrna-viruses/8087
#микробиология
[1] – https://talk.ictvonline.org/files/ictv_official_taxonomy_updates_since_the_8th_report/m/animal-ssrna-viruses/8087
#микробиология
Записки
Синдром Рея (Рейе) – редкое состояние при лечении детей препаратами ацетилсалициоловой кислоты (при лечении гриппа, кори, ветрянки, например, аспирином), сопровождающееся энцефалопатией, жировой инфильтрацией печени, гипераммониемией. #микробиология
Также аспирин является ингибитором проколлаген-глюкозилтрансферазы => при длительном приеме нарушает структуру внеклеточного матрикса.
#биохимия
#биохимия
Симпатическая офтальмия — это редкий вид увеита*, при котором формируются небольшие аномальные скопления клеток(гранулемы**). Фактически это тяжёлая форма гранулематозного увеита.
Такое заболевание возникает на неповрежденном глазу после проникающей травмы(например, прокол глаза карандашом, ручкой или палочкой) или хирургического вмешательства на другом(травмированном) глазу(частота: 0,2-2% среди проникающих ранений глаза).
По этиологии это аутоиммунное симпатическое воспаление с участием антигенов увеальной ткани и сетчатки травмированного глаза. Возникает аутоиммунитет по теории секвестрированных антигенов***. В конце концов, ведёт к частичной или полной потере зрения.
Если хирург не уверен в том что травмированный глаз приживется, то он должен удалить его для сохранения зрения здорового глаза.
Увеит появляется в течение 2–12 недель после травмы или операции у 80 % перенесших их людей. В очень редких случаях симпатическая офтальмия появляется всего через 1 неделю или спустя целых 30 лет после первоначальной травмы или операции.
*Увеит — воспаление сосудистой оболочки глаза, так называемого увеального тракта.
**Гранулематозное воспаление(гранулёма) — воспаление, которое характеризуется образованием гранулём(узелков), возникающих в результате пролиферации и трансформации способных к фагоцитозу клеток.
***Теория секвестрированных антигенов. При нарушении гистогематического барьера в тканях и попадании антигенов в кровоток иммунные клетки воспринимают их как чужих и начинают иммунную реакцию.
#Иммунология
#Патан
Такое заболевание возникает на неповрежденном глазу после проникающей травмы(например, прокол глаза карандашом, ручкой или палочкой) или хирургического вмешательства на другом(травмированном) глазу(частота: 0,2-2% среди проникающих ранений глаза).
По этиологии это аутоиммунное симпатическое воспаление с участием антигенов увеальной ткани и сетчатки травмированного глаза. Возникает аутоиммунитет по теории секвестрированных антигенов***. В конце концов, ведёт к частичной или полной потере зрения.
Если хирург не уверен в том что травмированный глаз приживется, то он должен удалить его для сохранения зрения здорового глаза.
Увеит появляется в течение 2–12 недель после травмы или операции у 80 % перенесших их людей. В очень редких случаях симпатическая офтальмия появляется всего через 1 неделю или спустя целых 30 лет после первоначальной травмы или операции.
*Увеит — воспаление сосудистой оболочки глаза, так называемого увеального тракта.
**Гранулематозное воспаление(гранулёма) — воспаление, которое характеризуется образованием гранулём(узелков), возникающих в результате пролиферации и трансформации способных к фагоцитозу клеток.
***Теория секвестрированных антигенов. При нарушении гистогематического барьера в тканях и попадании антигенов в кровоток иммунные клетки воспринимают их как чужих и начинают иммунную реакцию.
#Иммунология
#Патан
Сероконверсия – период заболевания, когда антитела можно обнаружить при анализе крови. Он не соответствует периоду начала выделения антител, так как уровень антител должен превысить уровень субстрата, который они связывают. Период между попаданием в кровь антигена и сероконверсией называют «окном», и вязтый в период окна тест покажет ложноотрицательный результат.
На рисунке представлен график титров антигенов вируса гепатита B и антител к ним от месяца после экспозиции вируса.
#иммунология
#микробиология
На рисунке представлен график титров антигенов вируса гепатита B и антител к ним от месяца после экспозиции вируса.
#иммунология
#микробиология
Forwarded from Безвольные каменщики
Ну что, историю с БЦЖ можно считать закрытой. То есть, с самого начала было понятно, что вряд ли прививка от одной инфекции может неспецифическим образом защитить от другой, но, так как был предложен возможный механизм (стимуляция Т-клеточного иммунитет «сидящими» под кожей микобактериями из прививки), слабая надежда сохранялась – хотя исследование, где это было, якобы, показано, отличалось крайне низким качеством. Я его подробно тут разбирала [1]. Но теперь всё.
Израильские ученые сравнили [2] несколько тысяч людей, у которых была прививка, и несколько тысяч тех, у кого ее не было. Вероятность заболеть ковидом в обеих группах не отличалась. Оставь, так сказать, надежду всяк сюда входящий, все там будем.
Ссылки:
[1] - https://www.facebook.com/irina.yakutenko/posts/10158061141514800
[2] -
https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2766182?guestAccessKey=f4e2edc9-04e6-4e8f-bf29-568bf96b762d&utm_source=twitter&utm_medium=social_jama&utm_term=3340597823&utm_campaign=article_alert&linkId=88553160
Израильские ученые сравнили [2] несколько тысяч людей, у которых была прививка, и несколько тысяч тех, у кого ее не было. Вероятность заболеть ковидом в обеих группах не отличалась. Оставь, так сказать, надежду всяк сюда входящий, все там будем.
Ссылки:
[1] - https://www.facebook.com/irina.yakutenko/posts/10158061141514800
[2] -
https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2766182?guestAccessKey=f4e2edc9-04e6-4e8f-bf29-568bf96b762d&utm_source=twitter&utm_medium=social_jama&utm_term=3340597823&utm_campaign=article_alert&linkId=88553160
Интерферон гамма блокирует рост Toxoplasma gondii в фибробластах человека, индуцируя деградации триптофана в клетке с помощью фермента индоламин-2,3-диоксигеназа 1 (IDO1).
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/6422465
#микробиология
#биохимия
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/6422465
#микробиология
#биохимия
Ванкомицин-устойчивый золотистый стафилококк (Vancomycin-resistant Staphylococcus aureus - VRSA) приобрёл ген резистентности от ванкомицин-резистентных энтерококков (vancomycin-resistant enterococcus - VRE)
#Микробиология
#Микробиология
Мимивирус (лат. Mimivirus) — род вирусов, включающий в себя единственный вид Acanthamoeba polyphaga mimivirus (APMV), хозяевами которого являются амёбы рода Acanthamoeba.
Интересен он тем, что это один из самых больших в мире вирусов. Его и ещё несколько похожих вирусов, например Мегавирус и Пандоравирус(кстати они тоже вирусы амёб) можно увидеть даже в оптический микроскоп.
На последней фотографии изображён выход Мимивируса из клетки. Фотография через оптический микроскоп.
Интересен он тем, что это один из самых больших в мире вирусов. Его и ещё несколько похожих вирусов, например Мегавирус и Пандоравирус(кстати они тоже вирусы амёб) можно увидеть даже в оптический микроскоп.
На последней фотографии изображён выход Мимивируса из клетки. Фотография через оптический микроскоп.
Forwarded from Безвольные каменщики
Итак, обещанные хорошие новости про коронавирус. Ниже много букв, но они не страшные. Итак. Помимо базового репродуктивного числа (R0) в распространении эпидемий крайне важен еще один параметр – так называемая дисперсия (k). Она отражает, насколько равномерно носители вируса заражают друг друга. Если каждый, кто подхватил некую заразу с R0, скажем, три, заражает ровно трех человек, дисперсия оценивается в единицу. Если же из десяти заразившихся девять не заражают никого (в предельном случае) или почти никого, а один – сразу тридцать человек, то k = 0,1. И хотя R0 при этом остается тем же, вероятность развития эпидемии в конкретной популяции и меры, которые необходимо применить, чтобы эпидемию загасить, в этих двух ситуациях будут совершенно различными. Например, патогенам с низкой дисперсией для обеспечения эволюционного успеха (то есть эпидемии) необходимо много носителей, причем распределенных по территории равномерно [1]. Если восприимчивых особей мало или они кучкуются маленькими группками, всерьез распространиться такому паразиту будет не очень просто.
Представьте: патоген с маленькой k – пусть для простоты это будет вирус – заразил одного человека, скажем, перепрыгнув на него от летучей мыши. Но этот человек – например, китайский фермер – живет с семьей в собственном доме, от которого до другого ближайшего дома нужно полдня ехать на тракторе. Даже если конкретно этот фермер окажется тем самым распространителем, который один заражает десятерых, никого, кроме жены, тещи и детей он заразить не сможет. Они, в свою очередь, тоже вряд ли кого-то заразят, так как редко выезжают за пределы фермы. А если кто-то из них поедет в город за продуктами, он с вероятностью 9 к 10 окажется «нераспространителем». Другое дело, если первый зараженный живет в густонаселенном городе вроде Шанхая и каждый день ездит на работу на метро. В этом случае, даже если «вторичные» заразившиеся будут плохо распространять патоген, он все равно будет потихоньку перескакивать на новых хозяев – и однажды ему повезет встретить своего суперраспространителя (да, разумеется, мы говорим именно о них).
Теперь рассмотрим болезнь с большой дисперсией. Такому патогену нужно гораздо меньше народу, чтобы хорошенько распространится – ведь каждый носитель исправно заражает столько людей, сколько «предписывает» R0 (инфицированный родственник фермера едет в город и заражает положенных трех человек, которые передают вирус дальше). Если вирус контагиозный, то множество непрерывающихся цепочек заражения быстро дадут знакомую нам экспоненту.
Меры задавливания эпидемии для болезней с большой и маленькой дисперсией отличаются. С патогенами, у которых k близка к 1, бороться сложно: чтобы эффективно пресечь распространение, необходим всеобщий карантин, так как цепочек распространения много и они равномерно распределены в популяции. Маленькая дисперсия дает шанс удушить эпидемию, используя только локальные меры, так как «ловить» цепочки нужно не по всему обществу, а только в кластерах, берущих начало от суперраспространителей. Разумеется, угадать, кто из вновь заразившихся окажется «тем самым» невозможно – но возможно не допустить ситуаций, в которых вирус может легко перепрыгнуть от сверхинфекционных носителей на остальных.
Ограничение количества людей в магазинах, офисах и общественном транспорте, маски в местах, где скапливается много народу – и, конечно, дистанция. Вспомним истории с карнавалом в немецком Хайнсберге, церковным хором в Маунт-Верноне под Вашингтоном, корейской религиозной сектой и так далее [2]. Виновником каждой из этих мощных вспышек был один-единственный распространитель, который долгое время был в тесном контакте с большим количеством неиммунных людей. Сиди он дома – или просто на большом расстоянии от других – вирус не смог бы заразить так много народу. Часто именно такие события «запускают» эпидемии, и исключив их, можно в принципе не дать массовому распространению болезни начаться – если дисперсия мала.
Представьте: патоген с маленькой k – пусть для простоты это будет вирус – заразил одного человека, скажем, перепрыгнув на него от летучей мыши. Но этот человек – например, китайский фермер – живет с семьей в собственном доме, от которого до другого ближайшего дома нужно полдня ехать на тракторе. Даже если конкретно этот фермер окажется тем самым распространителем, который один заражает десятерых, никого, кроме жены, тещи и детей он заразить не сможет. Они, в свою очередь, тоже вряд ли кого-то заразят, так как редко выезжают за пределы фермы. А если кто-то из них поедет в город за продуктами, он с вероятностью 9 к 10 окажется «нераспространителем». Другое дело, если первый зараженный живет в густонаселенном городе вроде Шанхая и каждый день ездит на работу на метро. В этом случае, даже если «вторичные» заразившиеся будут плохо распространять патоген, он все равно будет потихоньку перескакивать на новых хозяев – и однажды ему повезет встретить своего суперраспространителя (да, разумеется, мы говорим именно о них).
Теперь рассмотрим болезнь с большой дисперсией. Такому патогену нужно гораздо меньше народу, чтобы хорошенько распространится – ведь каждый носитель исправно заражает столько людей, сколько «предписывает» R0 (инфицированный родственник фермера едет в город и заражает положенных трех человек, которые передают вирус дальше). Если вирус контагиозный, то множество непрерывающихся цепочек заражения быстро дадут знакомую нам экспоненту.
Меры задавливания эпидемии для болезней с большой и маленькой дисперсией отличаются. С патогенами, у которых k близка к 1, бороться сложно: чтобы эффективно пресечь распространение, необходим всеобщий карантин, так как цепочек распространения много и они равномерно распределены в популяции. Маленькая дисперсия дает шанс удушить эпидемию, используя только локальные меры, так как «ловить» цепочки нужно не по всему обществу, а только в кластерах, берущих начало от суперраспространителей. Разумеется, угадать, кто из вновь заразившихся окажется «тем самым» невозможно – но возможно не допустить ситуаций, в которых вирус может легко перепрыгнуть от сверхинфекционных носителей на остальных.
Ограничение количества людей в магазинах, офисах и общественном транспорте, маски в местах, где скапливается много народу – и, конечно, дистанция. Вспомним истории с карнавалом в немецком Хайнсберге, церковным хором в Маунт-Верноне под Вашингтоном, корейской религиозной сектой и так далее [2]. Виновником каждой из этих мощных вспышек был один-единственный распространитель, который долгое время был в тесном контакте с большим количеством неиммунных людей. Сиди он дома – или просто на большом расстоянии от других – вирус не смог бы заразить так много народу. Часто именно такие события «запускают» эпидемии, и исключив их, можно в принципе не дать массовому распространению болезни начаться – если дисперсия мала.