RSG - Iran
3.85K subscribers
335 photos
41 videos
5 files
383 links
Regional Student Group of ISCB.

ارتباط با ادمین:
@RSG_Iran

Contact Us:
http://yek.link/ISCB-RSGIran

گروه تلگرام انجمن:
https://t.me/RSGIrancommunity
Download Telegram
یکی دیگر از پادکست‌های بسیار مفید در زمینهٔ بیوانفورماتیک، The Bioinformatics and Beyond می‌باشد.
این پادکست از سال 2021 فعالیت خود را شروع کرد و همچنان محتواهای خود را در اسپاتیفای پادکست و اپل موزیک قرار می‌دهد.

📎 Dr. Afshin Beheshti: The Hazards and Molecular Features of Spaceflight

در این قسمت، دکتر افشین بهشتی، دانشمند ناسا، در مورد زیست‌ شناسی فضایی، خطرات مهم در سفرهای فضایی و ویژگی‌های مولکولی مربوط به آن صحبت می‌کند.

📎 Dr. Afshin Beheshti: MicroRNAs and COVID-19

در این قسمت، بار دیگر دکتر افشین بهشتی در مورد microRNA ها و دلیل مهم بودن آن‌ها در پژوهش‌های زیستی صحبت خود را آغاز کرده و در ادامه توضیح می‌دهد که چگونه microRNA ها می‌توانند محرک عفونت COVID-19 یا همان کرونا باشند.

📎 Dr. Justin Siegel: Lab Automation, Cloud Labs, and the Future of the Wet Lab

در این قسمت، دکتر جاستین سیگل دربارهٔ گذشته و حال و آیندهٔ wet lab و چگونگی خودکارسازی کار در آن را توضیح داده و می‌گوید چگونه زمانی کار خود را برای عمل‌های تکراری در آزمایشگاه هدر ندهیم.

✍️ مهیار ابارقی

🔗Telegram
🔗LinkedIn
🔗Instagram
❤‍🔥4🔥21😍1
🟡 همانگونه که اطلاع دارید،
انتخابات مدیر و دبیر شاخه دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران در روز جمعه ۱۴ آذر (۵ دسامبر) برگزار خواهد شد.

📌 در ادامه کاندیداهای هر سمت به ترتیب حروف الفبا معرفی می‌گردند:
🔴سرکار خانم یاسمین رضائی آشتیانی

کاندیدای سمت مدیر
لینکدین
مشخصات و برنامه‌های اعلامی
16
🔴جناب آقای محمد ساجدی‌ نسب

کاندیدای سمت مدیر
لینکدین
مشخصات و برنامه‌های اعلامی
10
🟠سرکار خانم زهرا چیذری

کاندیدای سمت دبیر
لینکدین
مشخصات و برنامه‌های اعلامی
18
🟠جناب آقای امیرمهدی محمودی

کاندیدای سمت دبیر
لینکدین
مشخصات و برنامه‌های اعلامی
21
🔥اعضای محترم! انتخابات سومین دوره‌‌ی انجمن ISCB RSG-Iran برگزار می‌شود.

🗳برای رای دادن از این 《لینک》 استفاده کنید.

⭐️توجه بفرمایید که:

1️⃣ ابتدا باید لاگین کنید.

2️⃣انتخابات مدیر و دبیر جداگانه است؛ در هر دو انتخابات شرکت کنید.

3️⃣ روز جمعه ۱۴ آذر ساعت ۱۲ شب، انتخابات به پایان میرسد.

منتظر حضور گرم شما در انتخابات هستیم.

-کمیته‌ی برگزاری انتخابات
8
صحنه و پشت‌ صحنه‌ی انتخابات🌟

مهلت ثبت رای تا ساعت ۲۴
لینک انتخابات
😍4
🔴 اعلام نتایج انتخابات انجمن زیست شناسی محاسباتی ایران (RSG IRAN)

با افتخار، نتایج انتخابات برای تعیین مدیر و دبیر انجمن اعلام می‌شود:

🟢 پست مدیر:
سرکار خانم یاسمین رضائی آشتیانی: 94.1 درصد از آرا
جناب آقای محمد ساجدی نسب: 5.9 درصد از آرا
مدیر منتخب: سرکار خانم یاسمین رضائی آشتیانی

🟢 پست دبیر:
سرکار خانم زهرا چیذری: 42.1 درصد از آرا
جناب آقای امیرمهدی محمودی: 57.9 درصد از آرا
دبیر منتخب: جناب آقای امیرمهدی محمودی

🌸از همه اعضای محترم که در این انتخابات شرکت کردند، صمیمانه سپاسگزاریم.

برای همکاری و همفکری در پیشبرد اهداف انجمن، منتظر پیشنهادات شما هستیم!

- کمیته برگزاری انتخابات
12❤‍🔥2
♦️سومین رویداد آموزشی CB Insight
انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران با همکاری آزمایشگاه نورالب دانشگاه صنعتی شریف برگزار می‌کند.

موضوع:
"GNNs For Chemists: Implementations of Graph Neural Networks from Scratch for Chemical Applications"

👨🏻‍💻 مدرس جناب آقای حسین فولادی

آقای فولادی پژوهشگر دکتری شیمی‌محاسباتی (Cheminformatics) و یادگیری ماشین در گروه تحقیقاتی COMP3D Lab دانشگاه وین هستند. ایشان کارشناسی ارشد مهندسی پزشکی را از دانشگاه صنعتی شریف و کارشناسی مهندسی مکانیک را از دانشگاه صنعتی امیرکبیر دریافت کرده‌اند.

❗️ جهت کسب اطلاعات بیش‌تر می‌توانید به صفحه‌ی LinkedIn و Google Scholar آقای فولادی مراجعه نمایید.

🗓 تاریخ: سه‌شنبه ۹ دسامبر ۲۰۲۵ (۱۸ آذر)
ساعت: ۲۰ الی ۲۲ به وقت ایران

🔗 لینک ثبت‌نام
🌐 برگزاری به صورت آنلاین

🔖 علاقه‌مندان می‌توانند برای ایجاد پیش‌زمینه‌ی ذهنی بهتر، مقالات زیر را مطالعه کنند:
📌 گیتهاب
📌 مقاله اول
📌 مقاله دوم
📌مقاله سوم

🔗Telegram
🔗LinkedIn
🔗Instagram
8😍1
🔥برای رقم زدن عصر ماشین‌های اندیشمند، برای هم‌زمان شگفت‌زده و نگران کردن بشر و برای دگرگون کردن اکنون و عبور از مرزهای ممکن، «معماران هوش مصنوعی» به‌عنوان «شخصیت سال ۲۰۲۵» مجلهٔ تایم برگزیده شده‌اند.

🎆معماران هوش مصنوعی در تابلویی از جیسن سایلر به تصویر کشیده شده‌اند؛ تابلویی که با ارجاع به عکس نمادین سال ۱۹۳۲، «ناهار بر فراز آسمان‌خراش»، چهرهٔ رهبران جهان فناوری یعنی مارک زاکربرگ، لیزا سو، ایلان ماسک، جنسن هوانگ، سم آلتمان، دِمیس هسابیس، داریو آمودی و فی‌فی لی را نشان می‌دهد.


🔗Telegram
🔗LinkedIn
🔗Instagram
🔥51
استنتاج نوع سلول در بیوپسی مایع

در سال‌های اخیر شاهد پیشرفت استفاده از داده رونویسی تک‌سلولی (single-cell transcriptomic) برای تشخیص بیماری یا نظارت بر آن بودیم. یک پیش‌نیازی که این دسته از داده برای جمع‌آوری دارد، بیوپسی (biopsy) است که با استفاده از وسیله‌ای شبیه سوزن، بخش کوچکی از بافت مورد نظر از بدن خارج می‌شود. یک جایگزین برای این داده می‌تواند استفاده از نوکلئیک اسیدهای آزاد (cfNA) موجود در خون یا هر مایع دیگر بدن باشد که تهیه آن به نسبت کمتر تهاجمی است و liquid biopsy نام دارد.

منشا cfNA می‌تواند از نقاط مختلف بدن باشد که معمولا یا متعلق به سلول‌های مرده است یا با انتقال فعال از سلول خارج شده است. با پیشرفت تشخیص cfNA در کنار تحلیل نوع سلول در سطح مولکولی، می‌توان انواع سلول در این داده را پیدا کرد. بطور کلی دو دسته تحلیل وجود دارد.

در دسته اول میخواهیم مقدار نسبی هر نوع سلول را نسبت به هم پیدا کنیم. با استفاده از داده رونویسی تک‌سلولی می‌دانیم هر نوع سلول چه مثلا ژن‌هایی دارد. از آن به عنوان مرجع استفاده می‌کنیم. یک متود آن الگوریتم رگرسیون کمترین مربعات نامنفی (Nonnegative Least Squares) است که به کمک آن مقدار نسبی هر نوع سلول حساب می‌شود. در دسته دوم به جای همه انواع سلول، تاثیر یک دسته خاصی از آنها بررسی می‌شود. این تحلیل برای بررسی نوع سلول بیماری مفید است. یک متود محاسبه آن تست آماری است که چک کند آیا ویژگی‌های یک نوع سلول خاص از حالت عادی بیشتر مشاهده می‌شود.

سه کاربرد تحلیل نوع سلول از cfNA در شکل می‌بینید. در بیماری‌هایی که در چند عضو علائم دارند یا در یک بافت حساس مثل مغز قرار دارند، استفاده از بیوپسی سخت یا غیر ممکن است. از دیدگاه نویسندگان این مقاله، یکپارچه‌سازی این نوع داده با انواع داده (omics) دیگر از مسیرهای آینده می‌تواند باشد.

✍️محمد شفیع‌زاده

لینک مقاله
🔗Telegram
🔗Instagram
🔗LinkedIn
4
یکی دیگر از پادکست‌های مفید در بیوانفورماتیک، پادکست micro binfie است.
این پادکست در هر قسمت به موضوع‌های مختلفی در زمینه بیوتکنولوژی و بیوانفورماتیک می‌پردازد.
در این متن به سه قسمت مفید در این پادکست می‌پردازیم.

📎 Chatgpt the bioinformatic calculator

در این قسمت درباره موضوعی بسیار جالب صحبت می‌شود.
((استفاده از چت جی‌پی‌تی در محاسبات بیوانفورماتیک))
مواردی مانند نحوه کار و انواع مختلف ابزارها.

📎 What language should I learn ?

یکی از مواردی که در بحث بیوانفورماتیک از اهمیت زیادی برخوردار هست، برنامه‌نویسی هست.
هر دانشجو یا محقق در این زمینه باید با برنامه‌نویسی و ابزارها آشنایی کافی داشته باشند.
در این قسمت در مورد اینکه کدام زبان برنامه‌نویسی مناسب هست صحبت می‌شود.

📎 13 question not to ask

این قسمت با قسمت‌های دیگر این پادکست کاملاً متفاوت هست.
هر فردی در بعضی مواقع به‌جای انجام کار خود، را در سوالاتی درباره موضوعی که پیش رو دارد غرق می‌کند.
در این قسمت از 13 سوالی که نباید در اولین مسیر از خودتون بپرسید صحبت می‌شود.

✍️ مهیار ابارقی

🔗Telegram
🔗LinkedIn
🔗Instagram
6😍2
پنجمین کنفرانس بین‌المللی و چهاردهمین کنفرانس ملی بیوانفورماتیک ایران (ICB14)

💫 برای اولین بار، پنجمین کنفرانس بین‌المللی و چهاردهمین کنفرانس ملی بیوانفورماتیک ایران (ICB14)، با همکاری مشترک دو قطب علمی برتر کشور، دانشگاه تهران و دانشگاه علوم پزشکی تهران، برگزار خواهد شد.

📃محورهای اصلی کنفرانس:
1️⃣هوش مصنوعی و یادگیری ماشین در علوم زیستی
2️⃣پزشکی دقیق و مدل‌سازی بیماری‌های پیچیده
3️⃣طراحی و کشف دارویی محاسباتی
4️⃣تحلیل داده‌های اُمیکس و تصویر و سایر زمینه‌های پیشرو

✔️ مزایای شرکت:
1️⃣ارائه آخرین دستاوردهای پژوهشی ملی و بین‌المللی
2️⃣برگزاری کارگاه‌های آموزشی تخصصی پیش از همایش
3️⃣دارای امتیاز بازآموزی برای متخصصان زیرمجموعه وزارت بهداشت
4️⃣شبکه‌سازی با اساتید و پژوهشگران برجسته

🌐 وبسایت انجمن:
ibis.org.ir

🔗 ثبت‌نام و اطلاعات تکمیلی:
conf.ibis.org.ir/icb14

مهلت ارسال چکیده: ۱ بهمن ۱۴۰۴ (۲۱ ژانویه ۲۰۲۶)

LinkedIn | Instagram | Telegram
6❤‍🔥1
📣 به تیم‌ ما بپیوندید! 📣

🔴 چنان‌چه علاقه‌مند به همکاری داوطلبانه با تیم اجرایی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی، شاخه‌ی دانشجویی ایران هستید، ما در مواردی خاص به افرادی با توانایی‌های مرتبط نیازمندیم.

🔗 می‌توانید از طریق فرم زیر، مهارت‌های موردنیاز را چک نمائید و اگر آن توانایی‌ها را در خود می‌بینید، فرم را تکمیل کنید تا به‌زودی باهم گفت‌وگو کنیم و فرصت‌های همکاری را بررسی‌ نمائیم.

⭐️ فرم ارسال درخواست

🤝 این همکاری داوطلبانه‌ است؛ همچنین این فراخوان مربوط به امور اجرایی، برنامه‌ریزی‌ها و مدیریت انجمن می‌باشد. دقت نمائید که این فراخوان، ارتباطی با فعالیت‌های پژوهشی انجمن نداشته و اختصاصاً مربوط به فعالیت‌های اجرایی خواهد بود!

🖥 جهت کسب اطلاعات بیشتر می‌توانید به وبسایت RSG-Iran و صفحات ما در شبکه های اجتماعی مراجعه کنید.

🔗 Telegram
🔗 LinkedIn
🔗 Instagram
8👎2
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
🧠روش سال ۲۰۲۵ در Nature Methods:
«کانکتومیکس مبتنی بر میکروسکوپ الکترونی (EM-based connectomics)»


⚡️مغز از شبکه‌ای بزرگ از نورون‌ها تشکیل شده که با سیناپس‌ها به هم وصل‌اند. کانکتومیکس تلاش می‌کند این شبکه را تا سطح اتصال‌های سیناپسی کامل و قابل جست‌وجو، بازسازی کند. اما، حتی در جانورانی مثل مگس هم تعداد نورون‌ها و سیناپس‌ها آن‌قدر زیاد است که کار را دشوار می‌کند.

🔬برای دیدن سیناپس‌ها به تفکیک‌پذیری نانومتری نیاز است؛ به همین دلیل، کانکتومیکس سال‌ها به EM تکیه داشته است. چالش سنتی EM این است که داده‌ها یک تار عنکبوتی بدون برچسب از ساختارها هستند و باید با چند مرحله‌ی پردازشی، نورون‌ها و اتصال‌ها را از دل تصاویر بیرون کشید؛ کاری که امروز با کمک هوش مصنوعی + بازبینی انسانی، شدنی‌تر شده است.

🔝پیشرفت‌های روش‌شناختی باعث شده تا بازسازی کانکتوم‌های بزرگ‌مقیاس و حتی کل‌ مغز در چند جاندار ممکن شود مثل:
🪰کانکتوم کل مغز مگس بالغ (FlyWire)
🐭کانکتومیکس کارکردی در قشر بینایی موش (MICrONS)
💆‍♂یک میلی‌متر مکعب از قشر مغز انسان


📚منبع
🔗Telegram
🔗LinkedIn
🔗Instagram
🔥5❤‍🔥3
🌙ای ماه که دامن بلندت یلداست
پیشانی روشن تو عرش اعلاست
🌿«قد قامت» تو؛ قد تو و قامت تو
🔆در‌ سینه‌ام انگار، قیامت برپاست

🍉شب چله بر تمامی علم‌دوستان مبارک باد و خنشان!
17