💠 صحبت‌های آقای مصطفی شاه‌حسینی

مدیر اجرایی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی
شاخه دانشجویی ایران

🆔 @RSGIran

#رویداد

قدردان حضور شما هستیم 🍀


🌐 تیم اجرایی انجمن #زیست‌شناسی_محاسباتی
شاخه دانشجویی ایران


🆔 @RSGIran

#رویداد

به تیم ما بپیوندید! 🦾

🔸 چنانچه علاقمند به همکاری داوطلبانه با تیم انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی، شاخه دانشجویی ایران هستید، ما در مواردی خاص به افرادی با توانایی‌های مرتبط نیازمندیم.

👇 می‌توانید از طریق فرم زیر، مهارت‌های موردنیاز رو چک کنید و اگر اون توانایی‌ها رو در خودتون می‌بینید! فرم رو تکمیل کنید تا به زودی باهم صحبت کنیم و فرصت‌های همکاری رو بررسی کنیم.

فرم ارسال درخواست:
🔹https://forms.gle/dNVi6UTe2w8FogKe8

🤝 این همکاری داوطلبانه‌است و همچنین این فراخوان مربوط به امور اجرایی، برنامه‌ریزی‌ها و مدیریت انجمن می‌باشد.

@RSGIran

#جذب

🔵 زیست شناسی سامانه ای چیست؟

علم مدل‌سازی سیستم‌های زیستی و تحلیل و آنالیز داده‌های زیستی به کمک مدل‌های ریاضیاتی و محاسباتی را علم زیست‌شناسی سامانه‌ای یا systems biology می‌نامند. علوم زیستی، بنیان این شاخه‌ی بین‌رشته‌ای پیچیده و جذاب است.

❕درک و فهم ارتباط پیچیده میان  pathwayهای سامانه‌های زیستی یکی از مهمترین چالش‌ها در زیست‌شناسی است. به کارگیری تکنولوژی‌های محاسباتی قدرتمند، تاثیر بسزایی در رفع این چالش داشته است.

⁉️ تفاوت Computational Biology و Systems Biology چیست؟
شاخه‌های علم در عصر کنونی محدود به تعاریف سنتی نیستند اما اگر بخواهیم کمی به بیان تفاوت‌های این دو علم بپردازیم می‌توان گفت:
علم Systems Biology به مطالعه سیستم‌های زیستی و تعاملات آن‌ها می‌پردازد، در حالیکه Computational Biology از الگوریتم‌ها و مدل‌های ریاضی برای درک تک‌تک فرآیندهای زیستی استفاده می‌کند.

🧬 انجمن جهانی زیست شناسی محاسباتی - شاخه دانشجویی ایران
🆔 @RSGIran

#زیست‌شناسی_محاسباتی
#زیست‌شناسی_سامانه‌ای

مقایسه‌ی سایت‌های Coursera و edX

1️⃣ از لحاظ تعداد دوره‌های ارائه شده:
تعداد دوره‌های ارائه شده توسط Couresera(بیش از ۴۰۰۰ دوره) در مقایسه با edX (حدوداً ۲۵۰۰ دوره) بیشتر است و تنوع بالاتری دارد.

2️⃣ از لحاظ هزینه:
هر دو پلتفرم دوره‌های رایگان زیادی دارند اما Coursera در قبال دوره‌های غیررایگان هزینه‌ی بیشتری نسبت به edX دریافت می‌کند.

3️⃣ از لحاظ گواهی پایان دوره:
گواهی هر دو دوره معتبر است ولی گواهی‌های Coursera متداول‌تر هستند.

4️⃣ از لحاظ ساختار دوره‌ها:
دوره‌های edX از لحاظ زمانی انعطاف بیشتری دارند و به شکلی هستند که فرد تا حدی با سرعت خودش یادگیری را جلو ببرد در حالی‌که دوره‌های Coursera اغلب تاریخ شروع و پایان مشخصی دارند.

5️⃣ از لحاظ بنیان‌گذاری:
سایت edX یک موسسه‌ی غیر سود محور است که اغلب هدف آن منافع عام است و توسط #دانشگاه_هاروارد و MIT تاسیس شده است و سایت Coursera یک شرکت خصوصی است که در ارائه‌ی دوره‌ها با دانشگاه‌ها و موسسات مشارکت می‌کند.

🆔️@RSGIran

#معرفی_سایت

🔹️بیوانفورماتیک از نگاه سلول ! 😍🔬

بیوانفورماتیک علمی است که در آن از تکنیک‌های انفورماتیکی از جمله ریاضیات کاربردی، علوم کامپیوتر و آمار برای درک و سازماندهی اطلاعات مولکولی و زیست‌شناسی استفاده میشود و به مطالعه و توسعه روش‌های محاسباتی برای شناسایی ساختار، عملکرد و تکامل ژن‌ها، #پروتئین‌ ها و کل #ژنوم می‌پردازد .

🆔@RSGIran

#بیوانفورماتیک

🔬"سلول‌‌های بنیادی، کیمیای علم بیوتکنولوژی"

سلول‌های بنیادی؛ سلول‌هایی که قابلیت تکامل به انواع سلول‌های تخصصی بدن را دارند. این سلول‌ها با ابزارها و پیشرفت‌های امروزه‌ی علم بیوتکنولوژی چنان قدرت خلقی به انسان‌ها می‌دهند که کم نیست اگر بگوییم این سلول‌ها کیمیای علم بیوتکنولوژی هستند.

✅کلونینگ گوسفند دالی، امید به درمان بیماری‌های قلبی، مغزی، دیابت، ALS، بیماری‌های ژنتیکی و حتی تولید گوشت آزمایشگاهی!
همه‌ی موارد ذکر شده نشان دهنده آینده‌ی امیدوار کننده‌ی پیش روی علم زیست‌شناسی با این سلول‌ها است.

🔎برای آشنایی بیشتر با سلول‌های بنیادی می‌توانید لینک‌های زیر را مطالعه کنید که به زبان ساده‌ای حداقل اطلاعات لازم را برایتان فراهم کردند:
سایت Britannica
سایت NCBI
سایت yourgenome

🧫توضیح تصویر: سلول‌های قلبی رشد یافته از #سلول‌های‌بنیادی در آزمایشگاه و پتری دیش برای مطالعه‌ی بیشتر ریتم ضربان قلب
(مالکیت:The McEwen Centre for Regenerative Medicine, University Health Network)

🗞جدیدترین اخبار این حوزه را با همین هشتگ با شما به اشتراک می‌گذاریم.

🆔️@RSGIran

#سلول‌_بنیادی
#زیست‌شناسی_سلولی

🎧سمفونی آمینواسیدها
اثر Marcus J.  Buehler

🎵 اگر #پروتئین‌ ها صدا داشتند، چه موسیقی‌ای می‌نواختند؟

🆔️@RSGIran

🧠تولد یک نورون: تبدیل سلول بنیادی به یک نورون🧠

حقایقی جالب درباره سلول‌های مغزی:

1️⃣اغلب نورون‌ها پیش از تولد شکل می‌گیرند، اما در نواحی مشخصی از مغز، سلول‌های جدیدی تحت فرآیندی به نام نوروژنسیس(neurogenesis) در طول زندگی می‌توانند رشد کنند.

2️⃣سلول‌های بنیادی علاوه بر این‌که می‌توانند به #سلول‌های‌بنیادی تقسیم شوند و تعداد خود را حفظ کنند، می توانند به سلول‌های دیگری نیز تکامل پیدا کنند. مانند: نورون‌ها

3️⃣در طول زمانی که انسان می‌خوابد، سیستم گلیمپاتیک(glymphatic system) مغز با از بین بردن #پروتئین‌ های زائد نورون‌ها را تمیز می‌کند و در همین حین سلول‌های پشتیبان مغز کوچک‌ می‌شوند تا جریان مواد را تسهیل کنند.

4️⃣ارتباطات نورونی مغز شما در طی زمان و بخاطر انعطاف‌پذیری‌شان تغییر می‌کنند. این امر تحت تاثیر تجربیات شماست.

🆔️@RSGIran

#سلول‌_بنیادی
#زیست‌شناسی_سلولی

🟪 آیا مطالعات مریم میرزاخانی در علوم زیستی کاربرد دارد❓

شاید کارهای او ارتباط کاملا مستقیمی با علم زیست شناسی نداشته باشد، اما روش های هندسی و توپولوژیکی که او روی آنها کار کرده است، در زمینه های مختلف علوم زیستی کاربرد دارد. برای مثال، درک ساختارها یا شبکه‌های زیستی پیچیده ممکن است از نوع تحلیل هندسی و توپولوژیکی که میرزاخانی در آن تخصص داشت، بهره مند شود.

زیست شناسی محاسباتی اغلب از مفاهیم پیشرفته ریاضی برای مدل‌سازی و تحلیل سیستم‌های بیولوژیک استفاده می‌کند. بنابراین، اصول ریاضی که مریم میرزاخانی روی آنها کار کرده است به طور بالقوه می تواند در زمینه های زیست شماسی محاسباتی به کار رود.

در ادامه، بیشتر راجع به کاربرد روش های توپولوژیک و هندسه ی ریمانی در علوم زیست پزشکی خواهیم گفت. قابل ذکر است که این اصول در مهندسی هوافضا و بسیاری از علوم دیگر نیز کاربرد دارد.

ادامه دارد ...

بیشتر درباره مریم میرزاخانی بخوانید:

🆔 @RSGIran

#مریم_میرزاخانی
#زیست‌شناسی_محاسباتی

نگرش شبکه ای در کشف دارو

نگرش شبکه‌ای (Network Analysis) در #کشف‌دارو دارای کاربردهای متعددی است. در ادامه به برخی از آنها اشاره می کنیم:

1️⃣ شناسایی هدف‌های دارویی(target discovery): از طریق تحلیل شبکه‌های بیولوژیک، می‌توان هدف‌های مختلف داروها را شناسایی کرد. این به محققان کمک می‌کند تا به سمت مولکول‌هایی برای درمان بیماری‌ها حرکت کنند.

2️⃣ تجدید کاربری داروها(drug repurposing): با تحلیل شبکه‌های بیولوژیک، می‌توان داروهای موجود را برای درمان بیماری‌های دیگر به کار برد. این کار می‌تواند زمان و هزینه توسعه داروهای جدید را کاهش دهد.

3️⃣ شناخت دقیق عوامل بیولوژیک: با تحلیل شبکه‌های پروتئینی، ژنتیکی، و مولکولی، می‌توان نقش دقیق مولکول‌ها و #پروتئین‌ ها در عملکرد سیستم‌های بیولوژیک را درک کرد. این اطلاعات می‌توانند در توسعه داروها و درمان بیماری‌ها مفید باشند.

🆔 @RSGIran

#دارو
#بیوانفورماتیک

ادامه ...

4️⃣ پیش‌بینی عوارض جانبی داروها: با تحلیل تأثیرات داروها بر شبکه‌های بیولوژیک، می‌توان عوارض جانبی و اثرات غیرمنتظره داروها را پیش‌بینی کرد و به بهبود ایمنی داروها کمک کرد.

5️⃣ توسعه درمان های هدفمندتر: از طریق درک دقیق‌تر سیستم‌های بیولوژیک، می‌توان داروها و درمان های هدفمندتر و کارآمدتری را طراحی کرد.

در مجموع، نگرش شبکه‌ای در کشف داروها به ترکیب داده‌ها و تحلیل شبکه‌های پیچیده بیولوژیک کمک می‌کند و در بهبود فرآیند تحقیقات داروسازی و توسعه درمان‌های نوین بسیار تأثیرگذار است.

🆔 @RSGIran

#دارو
#بیوانفورماتیک

بیوانفورماتیک: تلفیق زیست‌شناسی، علوم کامپیوتر و تکنولوژی آنالیز داده‌ها و تفسیر داده‌های زیستی.

چرا به علم بیوانفورماتیک احتیاج داریم؟

🔹️درک اصول زیستی: بیوانفورماتیک به ما کمک می‌کند تا حجم زیادی از داده‌های به دست آمده با تحقیقات زیستی را آنالیز کنیم. ساختار و عملکرد ژن‌ها، #پروتئین‌ ها، فرآیند بیان ژن و تکامل موجودات زنده را بررسی نماییم.

🔸️توسعه‌ و #طراحی‌دارو ها و روش‌های درمانی. برای مثال: تشخیص ژن موثر در بیماری و طراحی داروهایی برای هدف قرار دادن این ژن.

🔹️بهبود محصولات کشاورزی و غذایی با کمک به تغییر ژنتیکی بذرها و دام و طیور.

🔸️حفاظت از محیط‌زیست. برای مثال با تشخیص عوامل آلودگی و توسعه‌ی روش‌های نوین برای رفع آن.

🔹️شخصی‌سازی #دارو ها: برای مثال با تشخیص جهش ژنی موثر در ایجاد #سرطان در یک بیمار و توسعی روش درمانی مناسب برای هدف قرار دادن این جهش‌ها.

این‌ها تنها تعداد اندکی از کاربردهای بیوانفورماتیک هستند.

در آینده توضیحات بیشتری در مورد هر یک از کاربردهای بیوانفورماتیک خواهیم داد.

🆔 @RSGIran

#بیوانفورماتیک

تا حالا به تفاوت‌های بیوانفورماتیک💻 و بیوتکنولوژی🧬🧪 فکر کردید؟

در این پست به صورت اجمالی تفاوت های این دو رشته رو بررسی کردیم.


🆔@RSGIran

#بیوانفورماتیک
#بیوتکنولوژی