🔥چرا نباید این کارگاه را از دست بدهید؟🔥

🥇در این کارگاه افتخار این را داریم تا در محیطی دوستانه میزبان شما عزیزان و خانم دکتر فاطمه فروتن، که مدت محدودی در ایران حضور دارند، باشیم.

🥈در طول این کارگاه دو روزه، شرکت‌کنندگان به منظور ثمربخشی هرچه بیشتر فرآیند یادگیری، با نظارت خانم دکتر فاطمه فروتن پروژه‌ای عملی را روی یک پروتئین پیش می‌برند.

✨ثبت‌نام✨

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

👀تصور کنید به گنجینه‌ای از اطلاعات ژنتیکی تقریباً از همه موجودات روی زمین دسترسی دارید.
🙂این دقیقاً همان چیزی است که GenBank ارائه میدهد!

🎮بانک اطلاعاتی GenBank که توسط مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) نگهداری می‌شود، یکی از جامع‌ترین و پرکاربردترین پایگاه‌های داده در زمینه زیست‌شناسی محاسباتی است. مجموعه‌ی گسترده‌ای از توالی‌های نوکلئوتیدی از آرایه‌های متنوعی از گونه‌ها، ویروس‌ها و باکتری‌ها گرفته تا گیاهان و حیوانات را در خود جای داده است.

🖥اهمیت GenBank فراتر از حجم انبوه داده آن است. توضیحات و فراداده‌های دقیق برای هر دنباله ارائه می‌دهد و بینش‌هایی را در مورد عملکرد ژن، ساختار و روابط تکاملی ارائه می‌دهد. محققان می‌توانند از این اطلاعات برای کاربردهای مختلف مانند هم‌ترازی #توالی ، پیش‌بینی ژن و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک استفاده کنند.

🕯علاوه بر این، GenBank با مجموعه‌ای از ابزارهای #بیوانفورماتیک قدرتمند ارائه شده توسط NCBI یکپارچه شده است. این ابزارها کاربران را قادر می‌سازند تا تجزیه و تحلیل‌های پیچیده را انجام دهند، داده‌ها را تجسم کنند و اطلاعات را به طور موثر بازیابی کنند.

✔️چه در حال بررسی اساس ژنتیکی یک بیماری، کاوش الگوهای تکاملی یا توسعه برنامه‌های بیوتکنولوژیکی جدید باشید، GenBank داده‌های اساسی و قابلیت‌های تحلیلی مورد نیاز برای پیشبرد تحقیقات شما را فراهم می‌کند. در دسترس بودن و ماهیت جامع، آن را به منبعی ضروری برای هر کسی که در #زیست‌شناسی_محاسباتی کار می‌کند تبدیل می‌کند.✔️

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

#معرفی_پایگاه‌داده

✨همراهان عزیز RSG ایران توجه فرمایید:

🚩مهلت استفاده از تخفیف ثبت‌نام زودهنگام تنها تا فردا شب اعتبار دارد!!
.
⭐️درصورتی که هنوز ثبت‌نام خود را نهایی نکرده اید، می‌توانید تا فردا شب با تخفیف ثبت‌نام زودهنگام از این کارگاه بهره‌مند شوید.

📣«بیست و یکمین #ژورنال_کلاب شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران»

❓موضوع:

"Fast and accurate peptide-MHC modeling and Binding probability prediction"

🧑🏻‍💻 با حضور جناب آقای امیرحسین حاجی علی‌عسگری

✨«آقای امیرحسین حاجی‌ علی‌عسگری، مدرک کارشناسی ارشد خود را از دانشگاه گوتینگن در رشته‌ی زیست‌شناسی مولکولی دریافت کرده و در حال حاضر کاندیدای دکترای گروه زیست‌شناسی محاسباتی در موسسه‌ی Max Planck است. زمینه‌ی تخصصی ایشان در توسعه‌ی روش‌های نوین مدل‌سازی و پیش‌بینی تعاملات ساختاری بین #پروتئین‌ ها و کاربرد این دانش در ایمونولوژی محاسباتی است.»

❗️جهت کسب اطلاعات بیش‌تر درمورد سابقه‌ی آموزشی و پژوهشی ایشان، می‌توانید به صفحه‌ی لینکدین و گوگل‌اسکالر ایشان مراجعه نمائید.

🗓تاریخ: یکشنبه، ۲۸ مرداد ۱۴۰۳(۱۸ اوت)
⏰ ساعت: ۲۰ الی ۲۲

🔗 لینک ثبت‌نام: سایت رایازی
🌐 این رویداد به صورت آنلاین برگزار می‌گردد.

🔖 دوستان علاقه‌مند جهت شرکت در #ژورنال_کلاب توجه داشته‌باشند که جهت ایجاد پیش‌زمینه‌ی ذهنی بهتر و بهره‌مندی و مشارکت بیش‌تر شما عزیزان، مطالعه‌ی مقالات زیر پیشنهاد می‌شود.

📌 لینک مقاله اول
📌 لینک مقاله دوم

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

#ژورنال_کلاب

🙂با این پادکست ها خلاقیت و کسب و کار دانش‌بنیان رو یاد بگیر🙂

⏸پادکست طبقه ۱۶
⭐️این پادکست به میزبانی سهیل علوی اجرا می‌شود و دوستان او در طبقه شانزدهم اقامتگاهش در تورنتو گرد هم می‌آیند تا در مورد استارتاپ‌ها، فناوری و جنبه‌های مختلف زندگی و تجربیات شخصی و حرفه‌ای کارآفرینان صحبت کنند.
این پادکست شامل گفتگوهای جذابی با کارآفرینان، مدیران شرکت‌ها و افراد موفق در زمینه‌های مختلف است.
سهیل، بنیان‌گذار یک استارت‌آپ موفق در زمینه‌ی ارتباطات است.
✔️برخی اپیزودهای پیشنهادی ما از این پادکست: اپیزودهای ۱۲۰، ۱۲۳، ۱۳۲


⏸پادکست‌‌های Axial
⭐️شرکت Axial، یک شرکت سرمایه‌گذاری است که با تمرکز بر شرکت‌های علوم‌زیستی فعالیت می‌کند.
این شتاب‌دهنده با بنیان‌گذاران و مخترعان بزرگ همکاری می‌کند و روی شرکت‌هایی مانند Appia Bio و Seranova Bio سرمایه‌گذاری کرده است.
🎮سه مجموعه پادکست با نام‌های inventors، founders (Axial) و Axial podcast توسط این شرکت ساخته می‌شود.
✔️این پادکست‌ها شامل مصاحبه‌هایی با مخترعان و کارآفرینان بزرگ حیطه‌ی بیوتک و داستان‌های واقعی از سرگذشت شرکت‌ها و محصولات بیوتک است.
➕در بسیاری از اپیزودهای آن راجع به کاربردهای #بیوانفورماتیک و #زیست‌شناسی_محاسباتی در صنعت خواهید شنید.


⏸کانال یوتیوب Kooshiar
⭐️کسی که می‌خواست ریاضی‌دان شود و الان، مولکول طراحی می‌کند!
کوشیار عظیمیان یک متخصص برجسته در زمینه #هوش‌مصنوعی و دیتاساینس است که تجربه‌ی کار در شرکت‌هایی نظیر فیس‌بوک را دارد.
🔥او اولین دستیار هوش مصنوعی text-to-protein را ابداع کرده است.
مطالب کانال کوشیار شامل موضوعات مختلفی از تکنولوژی، هوش‌مصنوعی و کاربرد آن‌ها در علوم زیستی و پزشکی می‌شود. او همچنین تلاش می‌کند برخی اخبار روز #هوش‌مصنوعی را پوشش دهد و محتواهای آموزنده‌ای در زمینه‌ی نوآوری و کسب‌وکار تولید می‌کند.


⏸پادکست Founders
⭐️دیوید سنرا هر هفته بیوگرافی یک کارآفرین بزرگ تاریخ را بررسی می‌کند. هدف این پادکست این است که از تجربه‌های این کارآفرینان درس‌هایی برای کار و زندگی خود بگیرید.


⏸کانال یوتیوبGV(Google Ventures)
⭐️کانال یوتیوبGV به انتشار محتواهای مرتبط با سرمایه‌گذاری، استارتاپ‌ها و کارآفرینی می‌پردازد. این کانال میزبان مصاحبه‌ها و گفتگوهایی با بنیان‌گذاران و کارآفرینان موفق است و به بررسی روندهای جدید و نوآوری‌های صنعتی می‌پردازد.
✔️در برخی اپیزودها، شاهد حضور کارآفرینان برتر عرصه‌ی علوم کامپیوتر و علوم زیستی و پزشکی هستیم.


⏸پادکست Learning with Lowell
⭐️این پادکست توسط لوول تامپسون میزبانی می‌شود و به بررسی موضوعات مرتبط با رهبری، علم و کارآفرینی می‌پردازد.
هدف این پادکست، کاوش عمیق در زندگی و تجربیات افرادی است که در حال ایجاد تغییرات مثبت در جهان هستند.
لوول تامپسون، میزبان پادکست، خود یک یادگیرنده‌ی مادام‌العمر و بنیان‌گذار استارتاپ‌ها است که تجربیات ارزشمندی را با مخاطبان به اشتراک می‌گذارد.
در هر قسمت از این پادکست، مهمانانی از زمینه‌های مختلف مانند #بیوتکنولوژی ، روان‌شناسی، ریاضیات و علوم زیستی حضور دارند.
➕برای مثال، برخی از اپیزودهای اخیر شامل مباحثی درباره تحقیقات ضد پیری، چالش‌های تأمین غذا برای فضانوردان و کشاورزی در سایر سیاره‌ها و brain-cmputer interface هستند.

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

🔍بینش‌های جدید در مورد زیست‌شناسی تومور با استفاده از فناوری توالی‌یابی نانوپور در مطالعات #سینگل_سل🔍

🔥مطالعات تک سلول یا Single-Cell آن‌چنان فضای #ژنومیکس و #ترنسکریپتومیکس را متحول کرده است که در سال‌ ۲۰۱۳ به‌خاطر توسعه‌ی اولیه و در سال ۲۰۱۹ برای اضافه شدن قابلیت‌های چندوجهی اومیکس، به عنوان مِتُد سال در مجله‌ی Nature معرفی شده است.
✔️در این روش، پژوهشگران می‌توانند نسبت به روش‌های سنتی(انداز‌ه‌گیری میانگین تمام سلول‌های نمونه یا Bulk) ویژگی‌های سلولی مثل بیان ژن را عمیق‌تر بررسی کنند.
➕دستگاه شرکت 10xGenomics با روش مبتنی بر میکروسیال، مطالعات در سطح سلول یعنی پایه و اساس حیات را امکان پذیر کرده است.

❓توالی‌یابی نانوحفره یا Nanopore Sequencing یک فناوری است که در آن حفره‌ی کوچکی روی یک غشا تعبیه شده است. هنگامی که مولکول‌های تک‌رشته‌ای DNA یا RNA از این نانوپور عبور می‌کنند، تغییرات مربوط به نوکلئوتیدهای مختلف در یک جریان یونی اندازه‌گیری می‌شوند.
➕این فناوری علاوه‌بر خوانش‌های بلند، داده‌‌ی real-time و استفاده‌ی میدانی به دلیل قابل‌حمل بودن دستگاه، با بی‌نیاز ساختن مطالعات سینگل سل از انجام PCR amplification خطاهای احتمالی آن را کاهش می‌دهند. شناخته‌شده‌ترین پلتفرم متعلق بهOxford Nanopore Technologies می‌باشد.

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

⚡️اولین جلسه کارگاه دو روزه طراحی پروتئین، با نظارت سرکار خانم دکتر فروتن و استقبال  شما عزیزان برگزار شد
.
❤️امیدواریم در رویدادهای آتی و سایر کارگاه‌ها بتونیم در خدمت شما همراهان گرامی باشیم❤️

⚠️شناسایی ژن RARRES1 به عنوان یک بایومارکر ارزشمند در تشخیص و پیش‌بینی پیشرفت ملانومای پوستی (SKCM)⚠️

🔴ملانومای پوستی (Skin Cutaneous Melanoma یا SKCM) یکی از بدخیم‌ترین انواع #سرطان‌ های پوستی است که از سلول‌های ملانوسیت منشأ می‌گیرد و به دلیل پیش‌آگهی نامطلوب و نرخ بالای مرگ‌ومیر، به‌عنوان یکی از چالش‌های بزرگ در درمان سرطان‌های پوستی شناخته می‌شود. با وجود پیشرفت‌هایی که در زمینه ایمنی‌درمانی و درمان‌های هدفمند صورت گرفته است، هنوز هم نرخ بقا برای بیماران با ملانومای پیشرفته بسیار پایین است. این موضوع نیاز به شناسایی بیومارکرهای جدید و اهداف درمانی مؤثر را برای بهبود تشخیص و درمان این بیماری افزایش داده است.

❓در این مقاله، محققین به بررسی نقش ژن RARRES1 در ملانومای پوستی پرداخته و ارتباط آن با ویژگی‌های بالینی و پیش‌آگهی بیماران را مورد بررسی قرار می‌دهند.

🎮با استفاده از داده‌های پایگاه‌های #TCGA و GEO، محققان تحلیل‌هایی انجام دادند که نشان داد بیان ژن RARRES1 در بافت‌های ملانومای پوستی به طور معناداری کاهش یافته و این کاهش با ویژگی‌های بالینی نامطلوب و پیش‌آگهی ضعیف مرتبط است.
نتایج ROC analysis نیز نشان داد که ژن RARRES1 دارای دقت تشخیصی قابل توجهی با AUC برابر ۰/۷۳۲ است.

✔️این ژن همچنین با مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با پاسخ‌های ایمنی، تکثیر سلولی، آپوپتوز و اتوفاژی در SKCM ارتباط داشت. افزایش بیان RARRES1 باعث سرکوب تکثیر و مهاجرت سلول‌های سرطانی و افزایش آپوپتوز و انسداد جریان اتوفاژی شد. این نتایج نشان می‌دهد که RARRES1 می‌تواند به عنوان یک عامل سرکوب‌کننده تومور عمل کرده و به عنوان یک هدف درمانی و بیومارکر تشخیصی در ملانوما مورد استفاده قرار گیرد.

➕در مجموع، این تحقیقات نقش ژن RARRES1 را به عنوان یک بیومارکر ارزشمند در تشخیص و پیش‌بینی پیشرفت ملانومای پوستی (SKCM) برجسته کرده و پتانسیل آن را برای استفاده در درمان شخصی‌سازی‌شده سرطان تایید می‌کند.

🔗مقاله‌ی کامل را از این لینک می‌توانید دنبال کنید.


🙂برای آشنایی بیشتر با پایگاه داده‌ی TCGA می‌توانید به این پست‌ها مراجعه کنید:
🥇دیتاست TCGA چیست؟
🥈دیتاست TCGA چه کاربردهایی دارد؟
🥉تاریخچه‌ی پروژه‌‌ی اطلس ژنوم سرطان


🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

🔈شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران، تقدیم می‌کند:

✨چهارمین سخنرانی، از مجموعه سخنرانی‌های CB TALK✨

🗓تاریخ: چهارشنبه، ۳۱ مرداد(۲۱ اوت)
⏰ ساعت: ۲۰ الی ۲۲

🎙در این سخنرانی میزبان ارائه‌ای از جناب آقای فریبرز صادقی، با نظارت جناب آقای دکتر بابک نجار اعرابی و جناب آقای دکتر علی شریفی زارچی، خواهیم بود.



🟢آقای فریبرز صادقی اکنون به عنوان دستیار پژوهشی در آزمایشگاه Machine Leaning and Computational Modeling Lab، در دپارتمان ECE دانشگاه تهران، فعالیت دارند و از علایق پژوهشی ایشان می‌توان به موارد زیر اشاره نمود:
🟢Causality | Reinforcement Learning | Causal RL | Causal Generative Modeling | Causal Representation Learning



🟢آقای دکتر بابک نجار اعرابی هم اکنون استاد تمام دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر دانشگاه تهران هستند. ایشان مدرک دکترای خود را در رشته مهندسی برق از دانشگاه Texas A&‌M اخذ نموده‌اند.
🟢زمینه های تحقیقاتی و علمی ایشان شامل:
یادگیری ماشین، سیستم های یادگیری شناختی، بینایی ماشین، شناخت الگو، سیستم های عصبی فازی، شناسایی سیستم، پیش بینی و مدل سازی در محیط های پیچیده می‌باشد.

📌جهت کسب اطلاعات بیش‌تر درمورد سابقه‌ی آموزشی و پژوهشی ایشان، می‌توانید به صفحه‌ی گوگل اسکالر ایشان مراجعه نمائید.



🌐لینک ثبت‌نام: سایت رایازی

🚀Telegram 
🖼LinkedIn 
🖼Instagram

#رویداد
#CB_Talk

⭐️یادآوری⭐️

🟢به دلیل استقبال شما عزیزان از اولین جلسه‌ی CB TALK شاخه دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی، تصمیم بر ادامه‌ی این جلسه در CB TALK دیگری شد. حالا در چهارمین CB TALK انجمن، این فرصت را خواهیم داشت تا با مروری بر اولین CB TALK، مجدداً میزبان ارائه‌ای از آقای فریبرز صادقی و نظارت آقای دکتر بابک نجار اعرابی و آقای دکتر علی شریفی زارچی باشیم.

✔️اگر تاکنون ثبت‌نام خود را نهایی نکرده‌اید، می‌توانید از طریق لینک این پست اقدام نمایید.✔️

🔥جذاب‌ترین اخبار اخیر دنیای زیست‌شناسی🔥

1️⃣هشدار سازمان بهداشت جهانی: شیوع آبله میمونی، تهدیدی جدید برای سلامت انسان‌ها
➕سازمان بهداشت جهانی(WHO) اعلام کرده که شیوع mpox در جمهوری دموکراتیک کنگو به دلیل افزایش موارد ابتلا و احتمال گسترش بیشتر آن به عنوان یک وضعیت اضطراری بهداشت عمومی با اهمیت بین‌المللی شناخته شده است.

➡️WHO has declared mpox a global health emergency. What happens next?


2️⃣پیشرفت بزرگ در ترمیم غضروف: روش جدید برای درمان مشکلات مفصلی
➕دانشمندان در دانشگاه نورث‌وسترن آمریکا موفق به توسعه ماده‌ای شده‌اند که می‌تواند به ترمیم غضروف هیالین، نوعی از بافت غضروفی که در مفاصل وجود دارد، کمک کند. این ماده که به‌صورت مایع به زانوهای آسیب‌دیده گوسفندان تزریق شد، به عنوان یک داربست عمل کرد و باعث رشد مجدد غضروف هیالین شد.

➡️A bioactive supramolecular and covalent polymer scaffold for cartilage repair in a sheep model


3️⃣گامی نوین در شناخت آلزایمر: مدل‌سازی سه‌بعدی پروتئین‌های مغزی
➕یک مطالعه جدید برای اولین بار ساختار مولکولی موجود در مغز افراد مبتلا به بیماری آلزایمر را آشکار کرده است. محققان مدل‌های سه‌بعدی از پروتئین‌های موجود در مغز، به‌ویژه دو پروتئین بتا-آمیلوئید و تائو که با آلزایمر مرتبط هستند، تولید کرده‌اند.

➡️CryoET of β-amyloid and tau within postmortem Alzheimer’s disease brain


4️⃣کنترل ذهن با فناوری نانو: فعال‌سازی مغز موش‌ها با میدان‌های مغناطیسی
دانشمندان در کره با استفاده از ترکیبی از ژنتیک، نانوذرات و میدان‌های مغناطیسی، فناوری جدیدی به نام Nano-MIND را توسعه داده‌اند که امکان کنترل از راه دور و دقیق مغز را فراهم می‌کند. این روش در موش‌های مهندسی شده به کار گرفته شد، به طوری که با تغییر میدان مغناطیسی، رفتارهایی مانند تغذیه، تعامل اجتماعی و مراقبت از نوزادان به صورت آنی در آن‌ها تغییر کرد.

➡️In vivo magnetogenetics for cell-type-specific targeting and modulation of brain circuits


5️⃣تشخیص سرطان با هوش مصنوعی: همکاری Paige و مایکروسافت برای مدل‌های پیشرفته پزشکی
➕مایکروسافت و Paige از مدل‌های پیشرفته هوش مصنوعی Virchow2 و Virchow2G برای تشخیص و درمان سرطان رونمایی کرده‌اند.

➡️Paige and Microsoft unveil next-gen AI models for cancer diagnosis


🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

#خبر
#مقاله
#بیوانفورماتیک
#زیست‌شناسی_محاسباتی
#زیست‌شناسی_سلولی

🔔توسعه یک مدل یادگیری عمیق برای تشخیص سرطان با بازرسی موتیف‌های انتهایی cfDNA🔔

🔼تست‌های مبتنی‌ بر DNA آزاد(cfDNA) یکی از روش‌های مهم برای تشخیص سرطان هستند. cfDNA در پلاسما عمدتاً از سلول‌های خون‌ساز منشأ می‌گیرد که از طریق آپوپتوز و یا نکروز وارد جریان خون می‌شوند که قطعات DNA آزاد شده از سلول‌های توموری می‌توانند با آن‌ها ترکیب شوند. مطالعات نشان داده‌اند که اندازه cfDNA در بیماران سرطانی کوتاه‌تر از افراد سالم است و الگوهای موتیف انتهایی cfDNA نیز در بیماران سرطانی متفاوت است.

➕در این مطالعه، یک روش مبتنی بر یادگیری عمیق به نام "بازرسی موتیف انتهایی از طریق ترانسفورمر"(EMIT) برای رتبه‌بندی فراوانی موتیف‌های انتهایی cfDNA مدل‌سازی و توسعه داده شده. در حقیقت EMIT یک معماری مبتنی بر ترنسفورمر است که برای مدل‌سازی توزیع الگوهای انتهایی(end-motifs) با استفاده از اطلاعات متنی در سراسر توالی طراحی شده است. در این روش، توالی الگوهای انتهایی cfDNA، به ترتیب فراوانی مرتب شده و به عنوان ورودی به EMIT داده می‌شود. این معماری شامل یک لایه تعبیه(embedding) و یک ترنسفورمر انکودر(transformer encoder) است که به شناسایی توزیع الگوهای مختلف کمک می‌کند. پس از پیش‌آموزش مدل EMIT با استفاده از  masked language modeling، این مدل برای استخراج ویژگی‌ها و انجام پروجکشن خطی جهت تشخیص #سرطان به کار می‌رود. EMIT با استفاده از ۴۶۰۶ نمونه از شش مجموعه داده که شامل کارسینومای هپاتوسلولار (HCC)، سرطان کولورکتال (CRC)، سرطان ریه (LUCA) و کارسینومای مری (ESCA) بودند جمع‌آوری و بررسی شده. این مجموعه داده‌ها شامل نمونه‌های cfDNA پلاسما بودند که تحت انواع مختلفی از توالی‌یابی ژنومی قرار گرفتند. نتایج نشان می‌دهند که ویژگی‌های تفکیک‌کننده سرطان در داخل EMIT کدگذاری و به نمایش گذاشته شده.

📊با تحلیل ماتریس‌های چندسری EMIT، دریافت می‌شود که موتیف‌های پایانی خاصی در گروه‌های سرطان، attention scores بیشتری نسبت به گروه‌های کنترل داشتند. به عنوان مثال، در مجموعه داده HCC با توالی‌یابی کل ژنوم(HGS)، موتیف‌های CGTC و TATT در گروه سرطان نمرات بالاتر و موتیف‌های TCTG، TCGC و TAGC نمرات کمتری داشتند. این نتایج نشان‌دهنده‌ی وجود الگوهای متمایز موتیف‌های پایانی در گروه‌های سرطان در مقایسه با گروه‌های کنترل است.

👀در نتیجه، مدل یادگیری عمیق مبتنی بر ترانسفورمر می‌تواند نشانگرهای تفکیک‌کننده‌ی سرطان را از موتیف‌های انتهایی cfDNA یاد بگیرد تا این نشانگرها برای تشخیص بیماران مبتلا به سرطان مورد استفاده قرار بگیرند. EMIT با استفاده از روابط غیرخطی بین الگوهای انتهایی مختلف، بر محدودیت‌های روش‌های موجود که این الگوها را به صورت مستقل در نظر می‌گیرند، غلبه می‌کند. توانایی EMIT در پردازش داده‌های متنوع cfDNA به صورت کارآمد و بدون نیاز به پیش‌پردازش گسترده، آن را به ابزاری امیدبخش برای تشخیص زودهنگام سرطان تبدیل می‌کند.

🔗مقاله‌ی کامل را از این لینک می‌توانید دنبال کنید.

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

#مقاله

🟢دی‌ان‌ای آزاد در گردش(cfDNA) قطعاتی از DNA است که پس از آپوپتوز یا نکروز سلولی به جریان خون آزاد می‌شود.
➕در بیماران مبتلا به سرطان، سلول‌های تومور نیز DNA به جریان خون آزاد می‌کنند و معمولاً سطوح بالاتری از cfDNA در آن‌ها یافت می‌شود.

✔️ظرفیت تشخیص سرطان‌های جدید، واریانت‌های مقاوم به درمان و ناهمگونی تومور با استفاده از فناوری‌ غیرتهاجمی براساس DNA توموری در گردش(ctDNA) موجود در خون، نوید انقلابی در زمینه تشخیص، پیشگیری، و درمان سرطان را می‌دهد.

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

#مقاله

✨دومین کارگاه شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران با همکاری انجمن INRP دانشگاه علوم پزشکی تهران✨

⭐️با کمال افتخار اعلام می‌داریم که در این کارگاه با تدریس جناب آقای دکتر رضا کربلایی، پژوهشگر ارشد دانشگاه جانز هاپکینز، میزبان علاقمندان به علم زیست‌شناسی محاسباتی خواهیم بود.

👀این کارگاه که هم به صورت حضوری و هم به صورت غیرحضوری قابل شرکت است، فرصتی استثنایی برای یادگیری و تجربه‌ی مستقیم در زمینه‌ی زیست‌شناسی محاسباتی فراهم می‌آورد و در فضایی دوستانه و همکاری‌محور، به آشنایی با محیط لینوکس برای کاربران بیوانفورماتیک می‌پردازیم.

🗓تاریخ برگزاری(حضوری و غیرحضوری):

- یکشنبه ۱۱ شهریور
- سه‌شنبه ۱۳ شهریور
⏰ از ساعت ۸ الی ۱۷
مکان: مرکز رشد استعداد‌های درخشان، دانشگاه تهران

💬 جلسه‌ی پرسش و پاسخ(آنلاین):

- چهارشنبه ۲۱ شهریور
⏰ از ساعت ۱۰ الی ۱۲

⚠️ظرفیت محدود:
⚠️۲۵ نفر حضوری
⚠️۲۰ نفر غیرحضوری


🟢سرفصل‌های اصلی که در این ورکشاپ ارائه می‌شوند:

۱.مقدمه‌ای بر لینوکس و کدهای پایه‌ای مهم
۲. مفاهیم ضروری پوسته یونیکس: هدایت‌ها (Redirections)، پایپ (Pipe)، مدیریت و تعامل با فرآیندها و جایگزینی فرمان (Command Substitution)
۳. کار با سرورهای راه دور
۴. کار با داده‌های بیوانفورماتیک (شامل دانلود و همگام‌سازی، یکپارچگی داده‌ها، بررسی تفاوت‌های بین داده‌ها، فشرده‌سازی داده‌ها و کار با داده‌های فشرده‌شده)
۵. ابزارهای داده‌ای یونیکس: شامل بازرسی و دستکاری داده‌های متنی با ابزارهای یونیکس: less، head، wc، ls، awk، cut، hexdump و غیره.
۶. اسکریپت‌نویسی شل برای بیوانفورماتیک، نوشتن خطوط پردازش و موازی‌سازی وظایف: اسکریپت‌نویسی مقدماتی Bash، خودکارسازی پردازش فایل با find و xargs، Make و Makefiles: گزینه‌ای دیگر برای خطوط پردازش (Pipelines)


⚡️تخفیف‌های ویژه⚡️

✔️هزینه‌ی ثبت‌نام عادی:
➕حضوری:۱.۲۰۰‌.۰۰۰هزارتومان
➕غیرحضوری: ۱.۰۵۰.۰۰۰

👀اگر:

- تا هفتم شهریور ماه ثبت‌نام کنید😀
حضوری: ۱.۰۵۰  هزار تومان
غیرحضوری: ۹۰۰ هزار تومان

- دانشجو باشید و تا هفتم شهریور ماه ثبت‌نام کنید😀
حضوری: ۹۵۰ هزار تومان
غیرحضوری:۸۷۰ هزار تومان

- در رویداد HBC شرکت کرده باشید😀
حضوری: ۹۲۰ هزار تومان
غیرحضوری: ۸۵۰ هزار تومان

🔥شما شامل تخفیف خواهید شد!

🙂جهت دریافت کد تخفیف با ما در ارتباط باشید.🙂

🔗لینک ثبت‌نام حضوری
🔗لینک ثبت‌نام آنلاین

💎آقای دکتر رضا کربلایی ، پژوهشگر ارشد(بیوانفورماتیک) در بخش روان‌پزشکی دانشکده پزشکی دانشگاه جانز هاپکینز هستند. تحقیقات ایشان در دانشگاه جانز هاپکینز با هدف شناسایی مکان‌های ژنتیکی مرتبط با اختلال دوقطبی و اسکیزوفرنی  با همکاری پروفسور پیتر زندی و دکتر فرناندو گوئز انجام می‌شود. همچنین ایشان در دانشگاه تمپل با یک تیم بزرگ از محققان، از جمله دکتر دبرا بانگسر و متیو ویمر، همکاری می‌کنند تا مکانیزم‌های اپی‌ژنتیک مرتبط با حساسیت و مقاومت به سوءمصرف مواد را روشن کنند. .
➕برای کسب اطلاعات بیشتر درباره‌ی سابقه‌ی آموزشی و پژوهشی ایشان، به صفحات لینکدین و گوگل‌اسکالر ایشان مراجعه فرمایید.

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

🚀@NeuroINRP

#ورکشاپ

⭐️همراهان گرامی ISCB RSG IRAN،

با کمال افتخار به اطلاع شما می‌رسانیم که در این ویدیو می‌توانید نظرات ارزشمند عزیزانی را که در کارگاه قبلی شرکت کردند، مشاهده کنید. اکنون فرصتی بی‌نظیر پیش روی شماست تا در دومین کارگاه ISCB RSG IRAN به ما بپیوندید.

💎دکتر کربلایی، پژوهشگر ارشد دانشگاه جانز هاپکینز، تنها به مدت دو هفته در ایران حضور دارند و ما مفتخریم که میزبانی ایشان و شما عزیزان را در این کارگاه به عهده داشته باشیم.

🔥این فرصت را از دست ندهید و با ما همراه شوید تا از دانش و تجربیات دکتر کربلایی بهره‌مند شویم. منتظر دیدار شما هستیم!

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

❓گامی نو در تنظیم‌گری سازمان غذا و داروی ایران در حیطه‌ی درمان‌های نوین سلول، بافت و ژن‌درمانی❓

✔️ سه داروی جدید در دسته سلول‌درمانی و پزشکی بازساختی به فهرست دارویی کشور اضافه شد.

🟢 این داروها شامل:
🥇 دستروسل: سلول‌های مزانشیمی آلوژن مشتق از جفت و پرده‌های جنینی برای بیماری GvHD
🥈 رویین شیت: ورقه اپیدرمی سلول‌های کراتینوسیت آلوژن جهت ترمیم سوختگی
🥉 رویین گرف: جایگزین پوستی دولایه از سلول‌های کراتینوسیت و فیبروبلاست آلوژن بر روی بستر کلاژنی برای درمان زخم‌های مزمن

⭐️این اقدام آغاز فصلی نو در تنظیم‌گری درمان‌های نوین در ایران به شمار می‌رود.

🔥سلول‌درمانی روشی در پزشکی است که در آن سلول‌های طبیعی یا مهندسی‌شده به بدن بیمار تزریق یا کاشته می‌شوند تا آسیب‌ها و بیماری‌ها را درمان کنند.
این سلول‌ها ممکن است از بدن خود بیمار گرفته شوند(اتولوگ)، از یک فرد دیگر(آلوژن) و یا حتی از منابع دیگری مانند جنین‌ها یا بند ناف استخراج شوند.
این روش در درمان بیماری‌های مختلف، از جمله سرطان، اختلالات خونی، و آسیب‌های بافتی کاربرد دارد و هدف آن بازسازی و ترمیم بافت‌های آسیب‌دیده یا ناکارآمد است.

🖥منبع خبر:ستاد توسعه فناوری‌های پزشکی بازساختی و سلول بنیادی

🔍گردآورنده: ابوالحسن بهاری

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

#خبر

📣هفته دسترسی رایگان به محتواهای پلت‌فرم DataCamp
🗓 ۵ شهریور ماه الی ۱۱ شهریور ماه

🔥به‌مدت یک هفته به تمام محتواهای پلتفرم DataCamp به‌صورت رایگان دسترسی پیدا کنید.


🔍از ۲۶ آگوست تا ۱ سپتامبر (معادل ۵ام شهریور ماه لغایت ۱۱ام شهریور ماه ۱۴۰۳) هر فردی می‌تواند با یک حساب کاربری رایگان در DataCamp به محتواها و آموزش‌های DataCamp Premium دسترسی داشته باشد. تمامی دوره‌ها در نسخه‌ی تحت وب در دسترس هستند؛ بنابراین نیازی به نرم‌افزار اضافی ندارید.

🔗 چه بخواهید:
🖥 مهارت‌های برنامه نویسی خود را بهبود و ارتقا دهید
🔼 رزومه خود را بهتر کنید
🌐اولین قدم‌هایتان را برای کار با ChatGPT بردارید
🕯یا در نهایت تیم خود را ارتقا دهید.
✔️پلت‌فرم DataCamp به شما امکان یادگیری نامحدود در سطح‌های مقدماتی، متوسط و پیشرفته را می‌دهد.

👀در این هفته‌ی بخصوص شما می‌توانید به
بیش از ۵۰۰ دوره داده‌های تعاملی و هوش مصنوعی: از جمله مقدمه‌هایی بر ChatGPT، Python، SQL و... .
➕همچنین در کنار آن، دوره‌های پیشرفته MLOps، یادگیری عمیق، پردازش تصویر و... دسترسی پیدا کنید .


➡️datacamp-free-access-week

🚀Telegram
🖼LinkedIn
🖼Instagram

#خبر