پرایمر | Primer
3.18K subscribers
306 photos
131 videos
51 files
829 links
📍رسانه علمی دانشجویی پرایمر
💠سردبیر: حورا اخوان‌فرید
@houra_akhavanfarid
💠مدیرمسئول: نیما عشقی
@nima_4718
@Primer_admin

💻http://primerjournal.sbu.ac.ir

🔗 انجمن علمی دانشجویی علوم و فناوری زیستی دانشگاه شهید بهشتی
https://t.me/SBUBIOSOCIETY
Download Telegram
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
مکانیسم عمل واکسن ساخته شده توسط شرکت Johnson & Johnson
#کرونا
🧬 نشریه علمی پرایمر | تلگرام | اینستاگرام
واکسن ساخته شده توسط شرکت Johnson & Johnson
🧬نوع واکسن:
محققان آدنو ویروس ۲۶ را مهندسی کردند و ژن بیماری‌زای آن را خارج کردند تا خود این ویروس نتواند بیماری‌زا باشد. در تحقیقات پیشین از این ویروس در واکسن‌های علیه ابولا، H.I.V و Zika استفاده شده بود. این ویروس در حالت طبیعی نشانه‌های سرماخوردگی و علائم شبه آنفولانزا را نشان می‌دهد. همچنین ویروس می‌تواند وارد سلول‌ها شود ولی وارد فاز چرخه‌ی لیتیک یا همان تکثیر داخل سلول نمی‌شود و بنابراین بیماری‌زا نیست.
🧬نحوه‌ی عملکرد:
ویروس کرونا در سطح خود پروتئینی را کد میکند که برای ورود به سلول‌های انسانی کاربرد دارد و محققان از همین موضوع برای تولید واکسن استفاده می‌کنند. آدنو ویروس حاوی ژنوم از نوع DNA دو رشته است و در این واکسن نیز از DNA دو رشته استفاده شده به این صورت که ژن کد کننده‌ی پروتئین سطحی کرونا را داخل ژنوم ویروس وارد کردند.
🧬مقایسه‌ی این واکسن با واکسن‌های دیگر:
واکسن‌های مدرنا و فایزر_بیونتک از RNA تک رشته ساخته شدند. همچنین واکسن آسترازنکا از آدنو ویروس شامپانزه استفاده کرده است. واکسن‌های مبتنی بر آدنو ویروس، پایدارترند زیرا DNA به اندازه‌ی RNA شکننده نیست و همچنین پوشش پروتئینی سخت آدنو ویروس می‌تواند از محتوای ژنتیکی داخلش محافظت کند. این واکسن می‌تواند تا سه ماه در دمای ۲ تا ۸ درجه‌ی سانتی گراد در یخچال نگهداری شود. همچنین در یک دوز ارائه می‌شود در حالیکه تا کنون تمام واکسن‌ها در دو دوز ارائه شده‌اند.
🧬عملکرد واکسن بعد از تزریق:
بعد از اینکه به بازوی فرد واکسن تزریق می‌شود، آدنو ویروس‌ها وارد سلول‌ها می‌شوند و در نهایت DNA خود را وارد هسته می‌کنند. چون این ویروس مهندسی شده، نمی‌تواند از خودش نسخه‌برداری کند اما ژن پروتئین سطحی کرونا توسط سلول رونویسی شده و تبدیل به mRNA می‌شود. این mRNA از هسته خارج شده و ترجمه می‌شود تا پروتئین‌های سطحی کرونا را این بار روی سطح سلول‌های انسانی بسازد. این آنتی‌ژن‌های سطحی اکنون توسط سیستم ایمنی به عنوان عامل بیگانه شناسایی می‌شوند و علیه این نوع پروتئین آنتی بادی ضد کرونا ترشح می‌شود. وقتی سلول واکسینه شده بمیرد، این پروتئین‌های سطحی می‌توانند توسط سلول‌های ارائه دهنده‌ی آنتی ژنی (APC) جذب شده و آن‌ها نیز سلول‌های T را تحریک می‌کنند تا هم ایمنی سلولی و هم ایمنی همورال فعال شود.
هنوز زمان موثر بودن این واکسن دقیق مشخص نیست و ممکن است تعداد آنتی بادی‌ها و سلول‌های T کشنده در ماه‌های بعد از واکسیناسیون کاهش یابد اما ممکن است سلول‌های B و T خاطره تا دهه ها یا سالها حفظ شوند.
🧬خط زمانی ساخت واکسن:
در ماه ژانویه ۲۰۲۰ این شرکت شروع به فعالیت در باره‌ی این واکسن کرد. در ماه جولای فاز ۱ و ۲ بالینی با همین یک دوز انجام شد. و در سپتامبر فاز ۳ به انجام رسید با مجموع ۴۳۷۸۷ نفر شرکت کننده در آمریکای شمالی، لاتین و جنوبی و آفریقا با تولید آنتی بادی در ۹۰ درصد افراد و اثربخشی ۶۶ درصد در مقابل موارد متوسط تا شدید و ۱۰۰ درصد در جلوگیری از بستری شدن و مرگ و میر. در ۲۷ فوریه مجوز استفاده‌ی اضطراری از FDA آمریکا صادر شد.
🧬اثرات جانبی واکسن:
تاکنون نشانه‌های شبه آنفولانزا، سردرد و درد در ناحیه‌ی تزریق مشاهده شده است، در مقایسه با واکسن‌های فایزر و مدرنا موارد کمتری نشانه‌های آلرژی از خودشان بروز دادند. این واکسن فعلا برای ۱۸ سال به بالا استفاده می‌شود.
🧬references : 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6
#کرونا
🧬 نشریه علمی پرایمر | تلگرام | اینستاگرام
#معرفی_کتاب 📚
#کتاب_بخوانیم

نام کتاب:
تراریخته در آینه حقیقت

📝 مهدی معلی، زهرا حاجت پور

🔎آنچه در این کتاب می خوانیم:

🔹از سال 1394 که خبر بومی سازی این فناوری و تولید ملی محصولات تراریخته در کشورمان منتشر شد، حجم عظیمی از شبهات در مورد این فناوری به وجود آمد.

🔹این در حالی است که مهندسی ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی توانسته است در کنار حذف عوارض روش های سنتی به‌نژادگری، محدودیت های این روش ها را از مقابل به‌نژادگران بردارد و محصولاتی سالم تر و منطبق با شرایط اقلیمی و اگرو اکولوژیک ارائه کند.

🔹جنجال های رسانه ای علیه این فناوری با آغاز رونمایی از دو محصول تراریخته در سال 1394 در حالی بود که امنیت غذایی کشور در دو دهه گذشته به طور فزاینده ای به واردات این محصولات وابسته بوده است. به طوری که واردات محصولات تراریخته به کشور تا سالانه 5 میلیارد دلار گزارش شده است؛ اما جریان ضد تراریخته تنها زمانی فعال شد که اخبار تولید بومی این محصولات منتشر شد.

🔹در این کتاب تلاش بر این است به شبهاتی در مورد مواضع حقوقی نظام برخی کشور ها، سلامت محصولات تراریخته، فتوای مقام معظم رهبری و سایر مراجع عظام تقلید، قوانین رسمی کشور و پرونده سازی رسانه ها علیه این فناوری پاسخ داده شود.


🧬 نشریه علمی پرایمر | تلگرام | اینستاگرام
tararikhte.pdf
5.5 MB
#معرفی_کتاب 📚
#کتاب_بخوانیم

نام کتاب:
تراریخته در آینه حقیقت

📝 مهدی معلی، زهرا حاجت پور

🧬 نشریه علمی پرایمر | تلگرام | اینستاگرام
شماره دوم نشریه به توان سلول.pdf
10.7 MB
🔔دومین شماره از نشریه "به توان سلول" منتشر شد.
🧬🔬🧫🧪

🔻در این شماره خواهید خواند:

🔹زندگی‌نامه پدر علم ژنتیک ایران، پروفسور داریوش فرهود
🔹ابعاد متفاوت واکسن‌های کرونا
🔹التهاب، شمشیری دولبه برای بیماری آلزایمر
🔹سلول‌های بنیادی، مرهمی برای بیماری MS
🔹چاپگر سه‌بعدی
🔹سلول‌های بنیادی و مهندسی بافت قسمت دوم
🔹روش‌های تحویل اجزاء سیستم CRISPER/Cas با تمرکز بر نانوذرات
🔹زیست نگار

🧬📚
📚نشریه دانشجویی به توان سلول
📚@Btavancell_AUT
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🧑🏻‍🦱 سلام، رشتت چیه؟
🧑🏻‍🔬 سلام، بیوتک...بیوتکنولوژی.
🧑🏻‍🦱بیوچی؟😳🤔
🧑🏻‍🔬بیوتکنولوژی، زیست‌فناوری.
🧑🏻‍🦱خب...حالا چیکار میکنین؟چه فایده‌ای داره؟
🧑🏻‍🔬بچه‌های پرایمر یه ویدیو خوب در این مورد تهیه کردن. بریم ببینیم؟
🧑🏻‍🦱باشه، بریم...

🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬

📝 متن: علیرضا صمدی، محمدامین مخفی

🎙 صدا: علی دهقانی، علی فرزین، روناک فرمانیان

🎥 تدوین: احسان صدریان

🧬نشریه علمی پرایمر | تلگرام | اینستاگرام
🌏#اخبار_هفته 🌍

🐁مطالعات نشان میدهد که اسپرم موش پیر به دلیل تغییرات اپی ژنتیک، ژن های کمتری را به نسل بعد منتقل میکند.
*

🧬کشف انتقال ژن افقی بین گونه های متفاوت باکتریایی که منجر به تولید میکروب های هیبرید و تغییر دودمانه و عملکرد میشود.

*

💉تزریق هورمون زنانه پروژسترون به مردان میتواند از شدت بیماری Covid-19 در مردان بکاهد.

*

🫀تحقیقات نشان میدهد که درصد بالاتر چربی در بدن، زنان را در برابر مرگ ناشی از بیماری های قلبی بیشتر محافظت میکند.

*

🦠یک مطالعه جدید نشان می دهد ویروس های کرونا، از جمله ویروس عامل COVID-19 ، ممکن است در برابر ارتعاشات فراصوت آسیب پذیر باشد. شبیه سازی ها نشان می دهد امواج فراصوت در فرکانس های تصویربرداری پزشکی می توانند پوشش و اسپایک های ویروس را خرد و پاره کنند.

*

👩🏻‍🦳محققان مکانیسم جدیدی را در زمینه نازکی و ریزش مو در طی پیری شناسایی کرده اند. آن ها با مطالعه تقسیم سلولی سلول های بنیادی فولیکول مو در موش های جوان و مسن ، دریافتند که موش های جوان به درستی تقسیم سلولی متقارن و نامتقارن را برای بازسازی فولیکول های مو متعادل می کنند. با این حال، در طول پیری، یک نوع غیر معمول تقسیم سلولی نامتقارن پدید می آید که منجر به ریزش مو می شود. این مطالعه می تواند به ایجاد رویکردهای جدید برای تنظیم پیری اعضای بدن و بیماری های مرتبط با پیری کمک کند.


🧬 @PrimerSBU 🧬

*

🧬🔹 Instagram 🔹 🧬

*
🌸🌼🌸🌼🌸🌼🌸

فرارسيدن نوروز و سال نو را شادباش می‌گويیم.

سالی سرشار از شادی و کامروايی داشته باشيد.

🌸🌼🌸🌼🌸🌼🌸


🧬نشریه علمی پرایمر | تلگرام | اینستاگرام
کاربرد نانوبیوسنسورها در تشخیص SARA-CoV-2

بیماریهای سارس، مرس و SARS-CoV-2 اپیدمی هایی هستند که در دو دهه اخیر بشر با آنها مواجه شده است. این عفونتها به صورت برونشیتها، نومونیا یا شدیدتر، یعنی بیماریهای تنفسی گاهی کشنده، ظاهر میشوند. کرونا ویروس جدید به نظر میرسد که با عفونتهای مالیمتری همراه است، اما در جهان با سرعت بیشتری گسترش یافته و به یک پاندمی تبدیل شده است. حال میخواهیم به هنر نانوتکنولوژی بر پایه ی بیوسنسورهای
(nanothchnology-basd affinity biosensores)
برای تشخیص سارس، مرس و SARS-CoV-2 اشاره کنیم. نانوبیوسنسورها بیوسنسورهایی بر پایه ی آنتی بادی یا DNA هستند با تبدیل بر پایه ی الکتروشیمیایی، نوری یا FET.
در توضیح FET-based transduction باید گفت در سالهای اخیر، تلاش عمده ای برای استفاده از دستگاههای مبتنی بر اثر ترانزیستور میدانی (FET) برای شناسایی مولکولهای بیولوژیکی در محیط های الکترولیتی صورت گرفته است. این حسگرهای زیستی از بار مولکولهای زیستی برای عبور جریان از طریق ترانزیستور استفاده میکنند. غالباً، ترانزیستور بر اساس یک نانوساختار شبه یک بعدی مانند نانوسیم (NW) یا نانولوله ساخته شده است و مولکولهای زیستی مستقیماً به سطح ساختار مقیاس نانو متصل می شوند.

👈 مطالعه بیشتر

#نانوبیوتکنولوژی
#نانوبیوسنسور

🧬نشریه علمی پرایمر | تلگرام | اینستاگرام
#بیوتکنولوژی_پزشکی

آیا EB بدون درمان باقی می ماند⁉️

🧬بیماری پروانه ای (EB)یک بیماری نادر پوستی و ارثی است که از بدو تولد با تاول های پوستی و مخاطی دردناک نمایان می شود. درتوارث این بیماری، گروهی از ژن های ژنودرماتوز که به حالت اتوزومی غالب یا مغلوب منتقل می شوند؛ با شکنندگی پوست و غشاهای مخاطی مشخص شده و منجر به تشکیل تاول و فرسایش آن می شوند.شدت این بیماری بدون واگیر، پیش رونده و افزاینده است و حتی امکان مرگ را برای مبتلایان دارد. این بیماری ناشی از یک جهش ژنتیکی در کراتین یا کلاژن است. گفته می شود شیوع آن ۱ از ۵۰۰۰۰ و درصد ابتلا به آن در تمامی مردان و زنان نژادهای گوناگون بشری برابر است.
🩺به گفته متخصصان،پیش بینی شده درمان این بیماری به پزشکی دقیق متکی باشد که شامل ترکیبی از رویکرد های مکمل است.این روش های درمانی با اهداف بازیابی عملکرد ژن های معیوب با درمان های تسکین دهنده علائم همراه هستند تا ویژگی های خاص فرم های مختلف EB و عوارض هر بیمار را برطرف کنند.
🔷رویکردهایی با هدف بازگرداندن بیان عملکردی پروتئین معیوب مانند ژن درمانی in vivo و ex vivo، سلول درمانی،جایگزینی پروتئین و رویکرد های دارویی،نتایج امیدوارکننده ای را نشان داده اند.علاوه بر این، دانش بهبود یافته بیماری زایی EB، راه را برای درمان های تسکین دهنده علائم،با استفاده از دارو های تغییر کاربری داده شده در برخی فرم های این بیماری، باز کرده است.
📣در حال حاضر از استراتژی های درمانی مختلف در حال توسعه، چندین مورد منجر به آزمایش های بالینی موفقیت آمیز شده اند که می توانند دلیل بیماری (درمان های شفابخش)،علائم آن (درمان های تسکین دهنده علائم) وموضعی یا سیستمیک برای رفع ضایعات پوستی و/یا مخاطی باشند که منجر به اثربخشی دائمی یا گذرا می شوند و نیاز به تجویزهای مکرر دارند.
🔷درمان های شفابخش با وجود داشتن بالا ترین پتانسیل،بسیار چالش برانگیز هستند. با وجود پیشرفت های چشم گیر دهه اخیر در این زمینه، روش های ژن درمانی در برخی فرم های این بیماری، پس از پیوند ژن صفحات اپیتلیال اصلاح شده با وکتورهای رترو ویروسی کلاسیک ، موفقیت آمیز بوده اند؛ در حالی که روشهای افزودن ژن، ویرایش ژن یا پرش اگزون برای فرم های دیگر EB نویدبخش هستند.
در مقابل، درمان های تسکین دهنده علائم ،متکی به درک بیماری زایی EB هستند و در آنها ازIMP یا داروهای تغییر کاربری داده شده استفاده می شود. شامل تزریق داخل وریدی BM-MSC آلوژنیک که منجر به کاهش گذرا اما قابل توجه خارش، التهاب پوستی و فیبروز می شود.درحالیکه شناسایی دقیق جهش های مولکولی می تواند رویکرد های اصلاح بیماری را هدایت کند.

🌐 مطالعه بیشتر

🧬نشریه ی علمی پرایمر | تلگرام | اینستاگرام
#فراخوان_حمایت_از _پژوهشگران_علم_و_الهیات.

محورهای پژوهش:
۱-علوم فیزیکی ، فناوری های مرتبط و الهیات
۲-علوم و فناوری های زیستی و الهیات
۳-علوم شناختی،فناوری های مرتبط و الهیات
۴-علوم اجتماعی، علوم انسانی و الهیات
۵-مباحث کلی علم والهیات.

برای کسب اطلاعات بیشتر به آدرس زیر مراجعه نمایید:
www.sbu.ac.ir/web/frst
یا با شماره های زیر تماس حاصل فرماييد👇👇👇
02129905461- 09334295563
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
خب، قسمت دوم #synbio هم رسید....
✳️ چجوری برای کارهای مهندسی ژنتیک، سلول مستعد (competent) آماده کنیم؟🤔

✳️ یکی از روش‌های مستعدکردن سلول‌های میزبان برای دریافت DNA خارجی استفاده از کلسیم‌کلرید یا CaCl2 هست. در این ویدیو یاد می‌گیریم چطور اینکارو انجام بدیم😃🧬

🔤 ترجمه: ناهید رسولی ابیز، درنا حاجیانی، فاطمه زارع، امیرحسین شامخی، محمدامین مخفی

🎙 دوبله: علیرضا صمدی

🎥 تدوین: نرگس بامداد
#synbio

📱مشاهده این پست در اینستاگرام

🧬 نشریه علمی پرایمر | تلگرام | اینستاگرام
نشریه علمی پرایمر را میتوانید در صفحه اینستاگرام، توییتر و کانال آپارات نیز دنبال کنید.🤩


🧬نشریه‌ علمی پرایمر |تلگرام|اینستاگرام|آپارات|توییتر
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
🧬چرا نمی‌توانیم واکسن‌ها را از روی درصد اثربخشی با هم مقایسه کنیم؟

در این ویدئو به این سوالات پاسخ داده می‌شود:
🧑🏻‍🔬درصد اثر بخشی یا Efficacy rate واکسن‌ها به چه معنی است؟
👩🏼‍🔬آیا واکسن‌های فایزر و مدرنا با اثربخشی ۹۵ و ۹۴ درصد بهترین واکسن هستند؟
👩🏽‍🔬اگر واکسن‌های موجود با اثربخشی پایینتر را بزنیم بهتر است یا واکسن نزنیم؟
👨🏻‍🔬واکسن باعث می‌شود کرونا نگیریم یا اینکه بستری نشویم؟

🧬ترجمه و تدوین: درنا حاجیانی و ناهید رسولی ابیز

#کرونا
مشاهده پست در اینستاگرام
مشاهده پست در آپارات

🧬نشریه علمی پرایمر |تلگرام|اینستاگرام|آپارات|توییتر
واکسن روسی Sputnik V

🧬نوع واکسن:
برای واکسن اسپوتنیک یا نام دیگر Gamaleya، محققان از دو وکتور آدنو ویروس ۲۶ (Ad26) و آدنو ویروس ۵ (Ad5) سرماخوردگی استفاده کردند؛ بدین صورت که ژن کد کننده‌ی پروتئین Spike کرونا را وارد این دو کرده و نیز ژن‌های بیماری‌زای آن‌ها را جدا کردند.
🧬نحوه‌ی عملکرد:
ویروس کرونا در سطح خود پروتئینی را کد می‌کند که برای ورود به سلول‌های انسانی کاربرد دارد. آدنو ویروس، ژنومی از نوع DNA دو رشته دارد. با جدا کردن ژن بیماری‌زای این دو وکتور ویروسی و اضافه کردن ژن کد کننده‌ی گلیکوپروتئین سطحی کرونا (cDNA) این واکسن ساخته شده است. بعد از اینکه به عضله دلتوئید (یک سوم بالایی بازو) واکسن تزریق شد، بهتر است تزریق در دست غیر غالب فرد گیرنده واکسن انجام شود، آدنو ویروس‌ها وارد سلول‌های ماهیچه‌ی عضلانی شده و DNA خود را وارد هسته می‌کنند. ژن پروتئین سطحی کرونا توسط سلول رونویسی شده و تبدیل به mRNA شده و بعد از خروج از هسته ترجمه می‌شود تا پروتئین‌های سطحی کرونا را روی سطح سلول‌های انسانی بسازد و در نهایت باعث پاسخ ایمنی همورال و سلولی بشود.
🧬مقایسه‌ی این واکسن با واکسن‌های دیگر:
این واکسن ۹۱.۶ درصد اثربخشی دارد. در واکسن J &J از یک آدنوویروس ۲۶ استفاده شد و در واکسن آسترازنکای آکسفورد از آدنوویروس شامپانزه استفاده شده است.
واکسن اسپوتنیک در دو دوز نیم میلی‌لیتری ارائه می‌شود؛ در دوز اول آدنوویروس ۲۶ در ویال‌های آبی رنگ تزریق می‌شود و در دوز دوم که ۲۱ روز بعد از دوز اولیه است، آدنو ویروس ۵ در ویال‌های قرمز رنگ تزریق می‌شود؛ به این خاطر که گاهی محققین نگرانند که علیه یک واکسن آدنو ویروس، آنتی‌بادی ترشح شود، برای جلوگیری از آن، از دو نوع آدنوویروس در دو دوز استفاده کردند که این موضوع فقط در واکسن اسپوتنیک وجود دارد و در واکسن‌های دیگر از مواد مشابه در هر دو دوز استفاده شده است. همچنین در دمای ۱۸- درجه‌ی سانتی گراد یا کمتر، نگهداری و توزیع می‌شود. این واکسن هم اکنون درخواست برای گرفتن تاییدیه‌ی آژانس دارویی اروپا (EMA) را کرده و در حال بررسی است همچنین بیش از ۵۰ کشور جهان این واکسن را سفارش داده‌اند.
🧬خط زمانی ساخت واکسن:
در ژانویه ۲۰۲۰ تحقیقات فاز اولیه بالینی شروع شد. در سپتامبر نتایج فاز یک و دو بالینی منتشر شد. در دسامبر، آسترازنکا فاز یک بالینی را برای ساخت ترکیبی از واکسن اسپوتنیک و آکسفورد-آسترازنکا شروع کرد. در ژانویه ۲۰۲۱ این شرکت فاز یک بالینی را برای واکسن تک دوزی شروع کرد. در ۲ فوریه نتایج اثربخشی و ایمنی بالای این واکسن در فاز ۳ بالینی با بیش از ۲۰ هزار شرکت کننده در مجله‌ی لنست منتشر شد.
🧬اثرات جانبی واکسن:
دردهای عضلانی و مفصلی، گلو درد، ضعف، احساس ناخوشی و سردرد و یا عوارض موضعی مانند درد و تورم و قرمزی محل تزریق هستند. عوارض عموما خودبخود بهبود می‌یابند ولی می‌توان از مسکن‌های ضد التهابی غیر استروئیدی (NSAIDs) برای کنترل تب و یا از آنتی‌هیستامین‌ها برای عوارض موضعی استفاده کرد.
🧬واکسن در ایران:
ایران واکسیناسیون خود را با این واکسن شروع کرد. اولین محموله‌ی آن ۱۶ بهمن ۱۳۹۹ و چهارمین محموله‌ی آن ۵ فروردین ۱۴۰۰ وارد کشور شده با مجموع ۴۲۰هزار دوز. همچنین طبق گفته‌ی سفیر ایران در روسیه، کشت سلولی برای تولید این واکسن در ایران با همکاری روسیه در فروردین توسط یکی از شرکت‌های خصوصی شروع خواهد شد تا تولید واکسن را در اردیبهشت داشته باشیم.
#کرونا
🧬references: 1, 2, 3, 4, 5

🧬نشریه‌ علمی پرایمر |تلگرام|اینستاگرام|آپارات|توییتر
معرفی💥دوره برنامه‌نویسی R با رویکرد بیوانفورماتیکی 🧬 در دانشگاه تهران

تخفیف ۵۰ درصدی به تعداد ۱۰ عدد: NewCode 🎁
مدرک بین‌المللی آکادمی MPT اتریش 🇦🇹
پشتیانی ۶‌ ماهه رایگان بعد از دوره 🤝
شامل دو بخش مقدماتی و پیشرفته ✌️

لینک ثبت‌نام در این دوره:👇
https://zil.ink/bioinfcamp
اطلاعات بیشتر با عضویت در کانالِ 👇
@BioinfCamp
@BioinfCamp
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
⁉️ بیوانفورماتیک چیست؟ 🔬

✳️ با پیشرفت مهندسی ژنتیک حجم انبوهی از داده ها جمع آوری می‌شود که این موضوع مشکلات جدیدی را به وجود می‌آورد. بیوانفورماتیک به کمک ما می‌آید تا با این موانع مقابله کنیم...

🎙 صدا: علیرضا صمدی

📝 جمع آوری: فاطمه طهورائی

🎥 تدوین: احسان صدریان

🧬نشریه علمی پرایمر |تلگرام|اینستاگرام|آپارات|توییتر
پرایمر | Primer
🌐 #معرفی_سایت ucsu genom browser 🧬نشریه علمی پرایمر |تلگرام|اینستاگرام|آپارات|توییتر
#معرفی_سایت

🧬 وقتی که ما نیازمند شناسایی ژن های همسایه ژن هدف خود هستیم میتوانیم از سایت ucsu genom browser استفاده کنیم.

این سایت ابزارهای متفاوتی دارد که با توجه به هدف ما، به قسمت genom browser مراجعه میکنیم.
*برای اینکه بتوانیم نوع جاندار و کروموزوم را تعیین کنیم از genom browser ، گزینه reset all user setting را انتخاب کرده و نام جاندار یا گونه خود را انتخاب می کنیم.

نکته قابل توجه دیگر این است که در قسمت assembly، محتوای ژنی استخراج شده از داوطلب های متفاوتی را قرار داده که آن که معمول تر است را میتوانیم انتخاب کنیم و نحوه تشخیص داوطلب معمول تر ، جستجو در مقالات می باشد.

در مرحله بعد باید نام ژن را بنویسیم، برای مثال وقتی نام ژن Sox را وارد می کنیم تعداد زیادی از انواع ژن sox می آورد که با توجه به هدف خود انتخاب میکنیم.

وقتی وارد صفحه اصلی شدیم،در قسمت بالا نمای کلی ژن روی کروموزوم و اینکه از چه بازه ای شروع شده و تمام می شود قابل مشاهده است.
بازه تعیین شده قابل تغییر است که میتوانیم با استفاده از آن همسایه های ژن هدف خود را مشاهده کنیم. اگر با این نکته مواجه شدید که از هر ژن تعداد زیادی مشاهده میکنید به خاطر ایزوفرم های هر ژن است. برای مثال یک آنزیم با افینیتی بالا و آنزیم دیگر با افینیتی پایین هردو محصول یک ژن با دو ایزوفرم متفاوت است.

با استفاده از آیکون های zoom in میتوان زوم شد و با دقت بیشتری مشاهده کرد و با zoom out میتوانیم صفحه را خلوت تر کنیم‌.

در پایین صفحه قسمت mapping and sequence، آیکون های متفاوتی برای تنظیمات وجود دارد برای مثال میتوان GC percent را در حالت dense قرار دهیم که به صورت نمودار کل توالی را نشان می دهد و در محل های AT ارتفاع نمودار صفر می شود.

یکی دیگر از تنظیمات در بخش gens and gens prediction می باشد. در این بخش ژن هایی که نمایش میابند را تنطیم می کنیم. برلی جلوگیری از شلوغ شدن صفحه و نمایش همه ژن ها حتی آنهایی که پروتئین کد کننده ندارند، همه گزینه ها را hide انتخاب می کنیم فقط refsequence را full می گذاریم.


🧬نشریه علمی پرایمر |تلگرام|اینستاگرام|آپارات|توییتر