پرایمر | Primer
3.18K subscribers
306 photos
131 videos
51 files
829 links
📍رسانه علمی دانشجویی پرایمر
💠سردبیر: حورا اخوان‌فرید
@houra_akhavanfarid
💠مدیرمسئول: نیما عشقی
@nima_4718
@Primer_admin

💻http://primerjournal.sbu.ac.ir

🔗 انجمن علمی دانشجویی علوم و فناوری زیستی دانشگاه شهید بهشتی
https://t.me/SBUBIOSOCIETY
Download Telegram
🧬ورژن 3 COBRA از جدیدترین ورژن‌‌ها است و تحولات زیادی کردی از جمله پوشش دادن روش‌های جدید مدل سازی. به صورت کلی اگر بخواهیم کارهایی که به وسیله‌ی COBRA می‌توان انجام داد بگوییم به این موارد اشاره می‌کنیم: مدل سازی کینتیک در مقیاس ژنوم، به تصویر کشیدن شبکه‌های متابولیک، تخمین و کاربرد محدودیت‌های ترمودینامیکی، ادغام با داده‌های omic، نمونه برداری یکسان از مدل‌هایی با ابعاد زیاد، دقت اتمی بازسازی‌های متابولیک و ...
در جدول یک می‌توانید مقایسه‌ای از ورژن‌های ۲ و ۳ COBRA ببینید.
سایت اصلی COBRA
برای مطالعه‌ی بیشتر و استفاده از لینک‌ گروه‌ افرادی که با COBRA کار میکنند می‌توانید از مقاله‌ی منتشر شده در نیچر با لینک زیر کمک بگیرید.
🧬reference
#synthetic_biology #systems_biology
@primerSBU / instagram
انتشار اولین شماره «فصلنامه علمی- دانشجویی زیست فناوری» دانشگاه شهاب دانش

💎با محوریت معرفی رشته‌های زیست فناوری

🔻شماره ۱- پاییز ۹۹
#فصلنامه #علمی #دانشجویی #زیست #فناوری
فصلنامه شماره 1_ پاییز 99(1).pdf
28.7 MB
«فصلنامه علمی- دانشجویی زیست فناوری» دانشگاه شهاب دانش قم

فصلنامه شماره 1_ پاییز 99
🕳چالش حذف زباله از فاضلاب: اجازه دهید تکنولوژی از طبیعت استفاده کند!
-سومین روش های تیمار کردن که قادر به از بین بردن آلاینده های شیمیایی و بیولوژیکی اند، با موفقیت توسعه یافته و در مقیاس کامل اجرا شده اند،امکان استفاده از تصفیه خانه های فاضلاب به عنوان واحدهای بازیافت، قادر به تولید فاضلاب قابل استفاده ی مجدد در فعالیت های مختلف از جمله آبیاری کشاورزی میباشد.
- با این حال، سومین تیمار ها فقط بخشی از باکتری های فاضلاب را حذف میکند، و فرصت رشد و/یا فعالیت مجدد را به باکتری های بالقوه ی خطرناک میدهد، رقابت ضعیف بین میکروارگانیسم های زنده تسهیل میشود؛ تحت شعار " افزودن با تکنولوژی، رهبری با طبیعت" ،تیمار و ذخیره ی فاضلاب تیمارشده باید تعادل را برای توسعه ی یک سپر محافظتی علیه پایین آوردن کیفیت میکروبی و توسعه ی باکتری های بالقوه ی خطرناک پیدا کرد.
-در قرن پیش یک چالش بزرگ مهندسان محیط ،توسعه ی یک سیستم تیمار بود که بتواند بار مواد آلی قابل تجزیه و عوامل بیماری زا را از فاضلاب کاهش دهد.
-اما بیش از یک قرن نوآوری و توسعه ی صنعتی، طرز زندگی ما و در نتیجه نوع آلاینده های تخلیه شده در فاضلاب را به طرز چشمگیری تغییر داد.

📎برای مطالعه ی ادامه ی مطلب کلیک کنید.
#بیوتک_میکروبی
#microbial_biotechnology

📱@PrimerSBU/instagram
💧تصفیه آب با الهام از کانال‌های پروتئینی بیولوژیکی

🔸 کانال‌های پروتئینی موجود در غشاهای طبیعی برای انتقال آب و مواد بصورت انتخابی، دارای منافذی هستند‌. یکی‌ از کانال‌های پروتئینی سلول، آکواپورین‌ها هستند که آب را از یک سلول به سلول دیگر منتقل می‌کنند‌. این کانال‌ها به ویژه در سلول‌هایی که باید حجم زیادی از آب را مبادله کنند، از اهمیت خاصی برخوردار هستند.‌ نمونه‌ این سلول‌ها دربدن انسان، سلول‌های کلیه هستند که روزانه ده‌ها لیتر آب را مبادله میکنند.

🔹 شیمیدانان با الهام از فعالیت هدایت آب از طریق آکواپورین‌ها، توانستند با استفاده از ترکیبات ساده تر مصنوعی، عملکردهای انتقالی مانند موارد طبیعی را بدست آورند. آن‌‌ها بدین منظور از پلی آمید استفاده کردند که دارای فضای خالی بیشتری برای انتقال آب می‌باشد.

🔸 انتقال سریع آب از طریق کانال‌های آب مصنوعی دارای مزایای زیاد و کاربردهای مهم عملی مانند نمک زدایی پیشرفته ، یا تولید آب با خلوص زیاد برای استفاده در پزشکی یا صنایع الکترونیکی یا تصفیه یک مرحله ای محلول های بسیار رقیق می‌باشد.

🔹🔸 Reference 1
🔸🔹 Reference 2

#Biomimetic

@primerSBU / Instagram
🧬مهندسی کاریوتایپ به وسیله ادغام کروموزوم منجر به جدایی تولید مثل در مخمر می شود

🔬استفاده از ارگانیسم های مهندسی شده به منظور بازیافت مواد زائد یا غنی کردن خوراک دام‌ها نیازمند آزادسازی آنها در محیط می‌باشد اما احتمال آمیزش این سویه‌های نوین با انواع طبیعی و جایگزینی آنها در اکوسیستم مورد نظر یکی از موانع موجود در عملیاتی شدن این روشها است.

🧑‍🔬محققان دانشگاه نیویورک با استفاده از تکنولوژی ویرایش ژنوم CRISPR-Cas9 اقدام به حذف سانترومرها و تلومرهای موجود در 14 کروموزوم از مجموع 16 کروموزوم مخمر S. cerevisiae کردند. حذف این نواحی باعث می‌شود که DNA باقی مانده از آنها مرحله به مرحله با هم ادغام شده و در نهایت دو کروموزوم بزرگ حاوی 6000 ژن که هر کدام تقریبا نیمی از ماده ژنتیکی اولیه مخمر را دارد بوجود بیاید. تا پیش از این، محققان نتوانسته بودند مخمر مهندسی شده‌ای را ایجاد نمایند که توانایی زنده ماندن با دو کروموزوم را داشته باشد؛ علت آن، اندازه بسیار بزرگ کروموزوم ها بود که تا قبل از این پژوهش، همواره به عنوان مانعی بزرگ در مطالعات مهندسی ژنتیک مطرح می شد.

🧫لقاح سلول‌های جنسی حاصل از این سویه جدید با سویه معمولی مخمر زاده‌هایی را به وجود می‌آورد که به دلیل تفاوت فاحش در سری کروموزوم های والدینی توانایی تولید مثل را نداشته و به دلیل جفت نشدن ماده ژنتیکی آنها طی تولید مثل جنسی، از بین می‌روند؛ پدیده‌ای که از آن تحت عنوان reproductive isolation نام برده می‌شود.

🩺علاوه بر کاربردهای ذکر شده برای این سویه، اطلاعات بدست آمده از این مطالعه می‌تواند به درک هرچه بیشتر مکانیسم بیماری های حاصل ازتعداد کروموزوهای غیرمعمول مانند سندروم داون و همچنین مسیر تکاملی ایجاد موجودات با تعداد کروموزو‌های مختلف کمک کند.
🔎مطالعه بیشتر
#GeneticEngineering
@primerSBU/Instagram

💊NANO DRUG: P.1
داروهای نانو علمی انقلابی و همه گیر در قرن بیست و یکم است.
استفاده از فناوری نانو در زمینه دارویی امکان تغییر قابل توجه در دوره تشخیص و درمان بیماریهای مختلف تهدید کننده زندگی را دارد.💊💉
در زمینه داروهای نانو ، طی 2 دهه گذشته پیشرفت قابل توجهی انجام شده است ، در نتیجه تعدادی از محصولات ، از جمله داروها و عوامل تصویربرداری ، امکان مداخلات درمانی و تشخیصی موثرتر و کمتر را فراهم می کنند.سیستم های دارویی نانو با بهبود فراهمی زیستی داروهای خوراکی مصرف شده ، تحویل هدفمند به بافتهای خاص و نیمه عمر طولانی(با کاهش ایمنی زایی) داروهای تزریقی سروکار دارند ،بنابراین سیستم های دارویی نانو فرکانس کمتری را فراهم می کنند.🔬🧪
برای دستیابی به این روش ، سیستم انتقال دارو نانو مانند دندریمرها ، نانوکریستال ها ، امولسیون ها ، لیپوزوم ها ، نانوذرات چربی جامد ، میسل ها و نانوذرات پلیمری ایجاد شده است.
#بیوتک_دارویی #نانو_دراگ_دلیوری
@primerSBU
📱INSTAGRAM
درک زیست شناسی از طریق ساخت ژنوم
قسمت‌ اول
🧬اکثر زیست شناسان به دنبال این هستند که جهان زیستی را همانگونه که وجود دارد، درک کنند. این موضوع مستلزم مشخص کردن چگونگی زیست سلولی و تنوع آن توسط ژنوم­‌ها و سیستم­‌های زیستی است. دستکاری ژنتیکی موجودات تا کنون نقش اساسی در این زمینه داشته. کروموزوم­‌های ساختگی تحت عنوان ژنومیک­‌های سنتزی، فرمی جدید از دستکاری ژنتیکی هستند. امروزه کروموزوم­‌هایی در سایزهای مگا باز از موادی سنتزی تولید می­‌شوند که این مواد از ژنوم­‌های طبیعی و مولکول­‌های موجود دیگر یا مخلوطی از هر دو به دست می­‌آیند. در طی ساخت، محتوا و ساختار این کروموزوم­‌ها می­­‌توانند نسبت به الگوی طبیعیشان اصلاح شوند تا ما بتوانیم فرضیه­‌های زیستی را تست کنیم.
🧬ژنوم ویروس­‌ها چون نسبت به بقیه سایز کوچکتری دارد، اولین کروموزوم سنتز شده کروموزوم ویروسی بود؛ که از اوایل دهه­‌ی 2000 ساخت آن‌ها شروع شد و تعدادی از کروموزوم­‌های ویروسی مثل هپاتیت C، هرپس نوع 1 و کرونا ویروس عامل COVID-19 تا به امروز ساخته شده­‌اند. اگرچه در سال 2008 سنتز کروموزوم­‌های باکتریایی و قارچی نیز پیشرفت کردند از جمله ای‌کلای و ساکارومایسز سرویزیه. در این مسیر پژوهشگران می­‌توانند تغییرات دلخواهی روی ژن­‌ها انجام دهند و نتیجه و فنوتیپ حاصل از هر تغییر را مشاهده کنند.
🧬روش­‌های متفاوت دستکاری ژنی به وسیله­‌ی ژنوم سنتزی وجود دارد که شامل بازسازی، از نو کد کردن، کمینه سازی، از نو مهندسی کردن موجود، کایمریک و بازسازی ژنوم است که در پست بعدی هر روش را با جزئیات بیشتری توضیح می‌دهیم.
🧬reference
#synthetic_biology #systems_biology
 @primerSBU / instagram
🧬ویدئویی مرتبط
👎1
Forwarded from سیناپس | Synapse (•Mitra•)
🔈 فراخوان جذب همکار در تولید محتوای رسانه ای نشریه ی سیناپس

نشریه ی سیناپس، نشریه ی پر افتخار زیست شناسی دانشگاه شهید بهشتی، از دانشجویان تمامی رشته ها که علاقمند به فعالیت در تولید محتوای اینستاگرام و وب سایت نشریه هستند دعوت به همکاری می‌نماید.

چنانچه با تولید محتوا، گرافیک و طراحی سایت آشنا هستید به آیدی زیر مراجعه فرمایید:

@fatemeh7657
"اقتصاد زیستی متانول: ارتقاء عملکرد برنج در شالیزار با سلول های میکروبی تهیه شده از ترکیب یک کربنه ی مشتق شده از گاز طبیعی"
*
متیلوتروف ها که از متیل به عنوان تنها منبع کربن استفاده میکنند، میکروارگانیسم های امیدوار کننده ای اند که میتوان آنها را در یک اقتصاد زیستی بر پایه ی متانول به کار گرفت که در آن انواع ترکیبات مفید از طریق بیوتکنولوژی، از متانول مشتق شده از گاز طبیعی تولید می شوند.
*
متیلوتروف های صورتی رنگ (PPFM)، باکتری های phyllospheric
گیاهی اند که به عنوان تقویت کننده ی رشد گیاهچه و زیست توده ی گیاهان شناخته میشوند.
*
با این حال بهبود بازده محصول، با تلقیح PPFMها در سطح مزرعه، به خوبی بررسی نشده است. اما بهبود عملکرد چندین رقم برنج را با محلول پاشی PPFMها، در این جا شرح داده اند.
*
پس از انتخاب سویه های PPFM و ارقام برنج، با تست رشد گیاهچه در محیط in vitro، بیشتر آزمایشات مربوط به شالیزار را انجام دادند و نتیجه ای که گرفتند این بود: "عملکرد محصول یکی از ارقام برنج، در یک شالیزار تجاری برای تولید در یک دوره ی ۵ساله، بهبود یافته است."
*
محلول پاشی یک باره ی سلول های PPFM(به صورت زنده یا کشته شده) یا یک پلی ساکارید دیواره ی سلولی، در فیلوسفر عمل کرده و بطور موثری عملکرد محصول را بهبود میبخشد.
*
نتایج نشان میدهد که روند ایجاد شده با PPFM برای بهبود تولید غذا در اقتصاد زیستی متانول، امکان پذیر است.
***
📎برای مطالعه ی کامل مقاله اینجا را کلیک کنید.
#بیوتک_میکروبی
#Microbial_biotechnology
📱@primerSBU/instagram
انجمن علمی بیوتکنولوژی دانشگاه شهید بهشتی برگزار می‌کند :

🦠 وبینار تخصصی کرونا

مهمانان :

🔹 جلسه اول :
🔸 دکتر حسین شاهسوارانی
📍مکانیسم واکسن‌های در حال تولید از جمله واکسن‌های mRNA
🗓 پنج شنبه ۲۷ آذر ماه ساعت ۱۹

🔹 جلسه دوم :
🔸 دکتر فرناز فاطمی
📍مکانیسم بیماری زایی و کیت‌های تشخیصی
🗓 جمعه ۲۸ آذر ماه ساعت ۱۹


📌‌ «شرکت در این وبینار رایگان است»


👈🏻 جهت ثبت نام و دریافت لینک ورود به وبینار، به یکی از آیدی‌های تلگرامی زیر پیام بدهید :

@mohammadali_ca
@rgh_ghasemi



🆔@SBUbiotechnology
🔬ساخت الکترودهای( E-skin) زیست سازگار و ارزان پوست

👩🏻‍🔬دانشمندان در سراسر جهان در تلاشند پوست الکترونیکی تولید کنند که به بدن متصل شود و علائم حیاتی را کنترل کند. این پوست های الکترونیکی برای استفاده روزمره باید راحت ، تنفس پذیر و انعطاف پذیر باشند. طلا به طور معمول برای ساخت الکترودهایی که سیگنالهای الکتریکی را در این کاربردها هدایت می کنند ، استفاده می شود. اما طلا گران است ، شامل یک فرآیند ساخت پیچیده است و برای استفاده در بدن انسان باید استریل شود.
از جمله مواد جایگزین امیدوار کننده برای الکترودها ، پلیمر PEDOT: PSS است.
این ماده با پوست انسان سازگار است ، انعطاف پذیر ، نسبتاً ارزان است و می توان آن را به راحتی ساخت و به صورت الکترود در آورد.
آنها همچنین دریافتند که الکترودها هنگام قرارگیری بر روی پوست می‌توانند برای کنترل حرکات مفصل ، دمای پوست و فعالیت الکتریکی قلب به کار گرفته می‌شوند.
📖برای مطالعه بیشتر کلیک کنید.
#Biomimetics
Instagram/@primerSBU
دانشمندان گوجه فرنگی غنی شده از L-DOPA را به عنوان منبع جدید و مقرون به صرفه یکی از داروهای ضروری جهان معرفی کردند.
🧬مرکز John Innes  با معرفی ژنی که مسئول سنتز L-DOPA در چغندر است (جایی که در تولید رنگدانه های بتالین فعالیت می کند) میوه گوجه فرنگی را اصلاح کرد.
🧬«لوودوپا» از تیروزین ، اسید آمینه موجود در بسیاری از غذاها تولید می شود. تیم تحقیقاتی ژنی را رمزگذاری کردند که یک تیروزیناز است ، آنزیمی که از تیروزین برای ساخت مولکول هایی مانند L-DOPA استفاده می کند. این باعث افزایش سطح L-DOPA به طور خاص در قسمت میوه گیاه شده و منجر به بازدهی بالاتر میزان تولید L-DOPA در کل گیاه شد.
💊«لوودوپا» پیش ماده اسید آمینه دوپامین عصبی-شیمیایی است و در بیماران مبتلا به پارکینسون به عنوان دارو استفاده می شود.
🍀بیشترین مورد مطالعه باقلا مخملی است که تا 10٪ L-DOPA در دانه های خود دارد. اما این مسئله ساز است زیرا این گیاه پوشیده از  کرک های گزنده ای است که حاوی موکوس است که می تواند باعث تحریک و واکنش های آلرژیک در کارگران مزرعه ای شود که محصول را برداشت می کنند.
🖇 مطالعه بیشتر
#geneticengineering/Instagram
@PrimerSBU
۲۷ آذر روز ملی زیست فناوری گرامی باد. 🌹

@primerSBU / Instagram
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
#مهندسی_متابولیک

🧬 دکتر Nielsen در این ارائه به مهندسی متابولیک و تغییر متابولیسم سلول‌های مخمر برای تولید محصولات مختلف می‌پردازد.

🧬 دکتر Jens Nielsen هم‌اکنون سرپرست بخش Systems and Synthetic Biology در دانشگاه صنعتی Chalmers(سوئد) و همچنین مدیر انستیتو نوآوری‌های زیستی(دانمارک) است. او نویسنده بیش از 700 مقاله،50 پتنت و 40 کتاب است.تحقیقات او شامل درک متابولیسم در انسان و میکروب‌ها و توسعه مسیرهای بیوشیمیایی برای تولید مواد مختلف می‌باشد.


🧬 گردآوری و ترجمه: امیر ابراهیمی


@primerSBU / Instagram
💊NANO DRUG: P.2
روش‌های تهیه داروهای نانو در دو دسته طبقه‌بندی میشوند: ۱) تولید نانو از بالا به پایین: از پودر دارویی در اندازه ماکرو شروع شده تا به یک ماده کوچک‌تر کاهش می‌یابد۲)تولید نانو از پائین به بالا: شروع از یک مولکول محلول تا تشکیل رسوب
از چالش‌های عمده تولید داروهای نانو در مقیاس وسیع و تعداد بالا تولید دستگاه‌های نانو با دقتِ زیر 20nm ، ساخت ساختارهای سه بعدیِ نانو و ... است
فناوری‌های ترکیبیِ از بالا به پایین و از پایین به بالا، روش معمول استفاده است که با نزدیک شدن به ابعاد بحرانی 50nm با مشکلات عمده‌ای مواجه میشود (همچنین ابزارهای طرح‌ریزی گران‌قیمت هستند)
لیتوگرافی نوری فرآیندی است که برای ساخت الگو در میکروساخت استفاده میشود.
فناوری‌های جدید بجز لیتوگرافی نوری شامل: لیتوگرافی‌های اشعه ایکس، پرتو الکترونیکی و ...است. این فناوری ها توسعه‌یافته اند اما به دلیل اشکالاتی که در هزینه‌های زیاد وجود دارد، برای تولید در مقیاس بزرگ صنعتی مورد استفاده نیستند. اما چاپ لیپوگرافی مشکلات هزینه و توان تولید را حل کرده.

#نانو_دراگ_دلیوری #بیوتک_دارویی

@primerSBU / Instagram