پرایمر | Primer
3.18K subscribers
306 photos
131 videos
51 files
829 links
📍رسانه علمی دانشجویی پرایمر
💠سردبیر: حورا اخوان‌فرید
@houra_akhavanfarid
💠مدیرمسئول: نیما عشقی
@nima_4718
@Primer_admin

💻http://primerjournal.sbu.ac.ir

🔗 انجمن علمی دانشجویی علوم و فناوری زیستی دانشگاه شهید بهشتی
https://t.me/SBUBIOSOCIETY
Download Telegram
primer 4.pdf
17.5 MB
چهارمین شماره گاهنامه علمی دانشجویی پرایمر منتشر شد 🤩

صاحب امتیاز : انجمن علمی بیوتکنولوژی دانشگاه شهید بهشتی
مدیر مسئول : فاطمه مستوفی
سردبیر : امیر ابراهیمی
----------------------------------------
📜 در این شماره میخوانیم :

🦠 چرا کرونا ویروس به آسانی بین مردم گسترش می‌یابد؟

🔋 ویروس؛ ابزاری بیولوژیک برای ساخت نسل آینده باتری‌های جهان

💧تصفیه آب به کمک نانوتکنولوژی و بیومیمتیک

🔺 پرونده ویژه : تراریخته؛ مصاحبه با دکتر مسعود توحیدفر

💉 آیا مبتلا کردن عمدی داوطلبان آزمایش واکسن COVID-19 اخلاقی است؟

📖 و چندین موضوع خواندنی دیگر ...


@primerSBU / Instagram
🔬تقلید از سلول‌های مغز برای درک پارکینسون

دانشمندان ابزاری را اختراع کردند که از سلول‌های مغزی افراد مبتلا به بیماری پارکینسون تقلید می‌کند و می‌تواند به یافتن روش‌های جدید درمان بیماری کمک کند.
این ابزار که به صورت organ-on-a-chip می‌باشد،از یک پلیمر شفاف یا شیشه با کانال‌های کوچک حاوی سلول‌های زنده ساخته می‌شود و مایعات از طریق کانال‌ها گردش می‌کنند تا شبیه محیط اطراف بافت شود.
جریان مداوم در کانال‌ها سلول‌های عصبی را رشد می‌دهند و این ابزار باعث می‌شود که به طور همزمان بتوانیم برروی آن آزمایشات مختلف انجام‌دهیم در پارکینسون سلول‌های تولید کننده دوپامین در دستگاه عصبی مرکزی از بین میرود محققان با استفاده از سلول‌های بنیادی آن‌ها را به وجود آوردند و با ایجاد یک جریان مداوم درون کانال‌ها شرایطی را برای تقلید از مغز انسان بوجود آوردند تا بتوانند این بیماری را مطالعه کنند.
📖برای مطالعه بیشتر کلیک کنید.
#Biomimetics
instagram/@PrimerSBU
🐭مدل‌های اصلاح ژنتیکی شده‌ی موش برای کمک به مبارزه با COVID-19

محققین برای آزمایش دارو‌ها و واکسن‌ها علیه بیماری کرونا و همچنین مطالعه مکانیزم های مولکولی به شدت به مدل های حیوانی نیازمند هستند.
طیف وسیعی از حیوانات خانگی و آزمایشگاهی برای یافتن مدل آزمایشگاهی مناسب به آزموده شده‌اند اما متأسفانه تعداد کمی از آنها از جمله گربه‌ها، راسوها، همسترها و میمون‌ها مستعد بیمار شدن هستند. متأسفانه بسیاری از این گونه ها برای پیشرفت سریع آزمایش ها برای اکثر محققان نه در دسترس هستند و نه استفاه از آنها کارآمد است.
موش یکی از پر استفاده‌ترین حیوانات آزمایشگاهی هستند که در تحقیقات زیست پزشکی به دانشمندان در تشخیص ، درمان و ساخت واکسن برای بسیاری از بیماری های انسان کمک می‌کنند.
🐀متأسفانه گونه وحشی موش ها نسبت به SARS-CoV-2 مقاوم هستند و فقط زمانی که اصلاح ژنتیکی شده باشند که ACE2 انسانی را بیان کنند می‌توانند مبتلا به SARS-CoV-2 شوند. دانشمندان با اصلاح ژنتیکی موش‌ها از آنها برای مطالعه بر روی این بیماری استفاده می‌کنند.
📎 برای مشاهده‌ی مقاله و مطالعه‌ی بیشتر اینجا کلیک کنید.
#GeneticEngineering
@primerSBU/Instagram
🌏#اخبار_هفته 🌍

🔬پروتئینی که تصور میشد تنها در توسعه نورون ها در مغز نقش دارد، در توسعه و رشد سلول های سرطان پانکراس نقش اساسی دارد.

*

🦠لرزش و حرکات پروتئین های spike در کرونا ویروس می تواند نقش اساسی در ورود آن به سلول و ایجاد عفونت داشته باشد.

*

🦖تحقیقات جدید نشان از این دارد که جمعیت دایناسور ها قبل از برخورد شهاب سنگ رو به کاهش نبوده و تئوری انقراض دایناسور ها توسط شهاب سنگ را تایید میکند.

*

🌊باکتری های بزرگ اقیانوسی که در برابر شرایط متغیر و بسیار نامساعد در محیط زندگی خود به خوبی اداپته می شوند

*

📜مطالعات نشان می دهد که داروی Baricitinib، که برای درمان آرترید به کار می رود، امکان زنده ماندن افراد مسن مبتلا به Covid-19 را افزایش می دهد.

*

🥀علف کشی که ممکن است با اثر گذاری بر میکروبیوم روده انسان سبب بیماری شود

*

💊چگونه باکتری عامل بیماری سل به سرعت به آنتی بیوتیک ها مقاوم می شود؟ پاسخ این موضوع در domain های اپی ژنتیکی نهفته است.

*

🌿یافته ها نشان می دهند گیاهی که برای تولید دارو در طب سنتی چینی استفاده میشود به نحوی تکامل یافته است که کمتر در معرض دید انسان قرار گیرد.



🧬 @PrimerSBU 🧬

*

🧬🔹 Instagram 🔹 🧬

*
سیستم تحویل داروی ضد سرطان مبتنی بر نانوذرات ( nano drug delivery) از کیتین میگو !!
تحویل دارو معمای تکراری در درمان سرطان است. دانشمندان، بسیاری از داروهای ضد سرطان را ایجاد کرده‌اند اما اغلب به بافت‌های سالم آسیب میرسانند و یا حتی قبل از رسیدن به محل تومور در حریان خون تجزیه میشوند.
در تحقیق‌های انجام شده، این نانوذرات‌ها هیچ عارضه نامطلوبی نشان ندادند که احتمالا به دلیل طبیعی بودن پلیمر (کیتین) است. اما محلول بالینی مورد استفاده برای تاکسول، میتواند باعث سمیت کبدی در موش‌ها شود.
قطر این نانوذرات حدودا 20.6 نانومتر است.
این تیم تحقیقاتی دریافتند وقتی نانو الیاف مملو از دارو را به بدن تزریق کنند، به سرعت به نانوذرات تجزیه شده (با برخورد به پروتیین‌های سرم در خون) و میتوانند آزادانه در جریان خون گردش کنند و به نقاط تومور برسند.آنها دریافت که این نانوذرات گردش تاکسول را در جریان خون بیشتر نگه می دارند و به دارو زمان بیشتری برای رسیدن به محل تومور می دهد (در جریان خون موش ۲۵ ساعت و در تحقیقات بالینی ۲ ساعت)

ادامه‌مطلب

@PrimerSBU / Instagram
🧬در دو دهه‌ی گذشته پیشرفت‌های قابل توجهی در حوزه‌ی زیست مولکولی صورت گرفته که منجر به طوفانی از داده در مورد ترکیب مولکولی ارگانیسم‌ها و محیط اطرافشان شده است. در حال حاضر اندازه گیری‌های کمّی مولکولی در مقیاس ژنوم روتین هست و شامل داده‌های ژنومیک، متابولومیک، ترانسکریپتومیک و پروتئومیک می‌شود.
🧬این انبوه داده‌ها باعث گسترش طیف گسترده‌ای از الگوریتم‌ها و نرم افزارهایی برای آنالیز و پیش پردازش داده‌ها شده. پیش پردازش در اصل، متغیرهای اندازه گیری شده را تبدیل به تخمین‌هایی از مقدار هر گونه‌ی مولکولی موجود در یک نمونه‌ می‌کند. آنالیز، این کمی‌سازی گونه‌های مولکولی را می‌گیرد تا به دانش جدید زیستی دست یابد. گرچه همچنان با وجود پیشرفت‌های زیاد و جدید، یک چالش اساسی فهمیدن دقیق سیستم‌های زیستی است. بازسازی متابولیک در مقیاس ژنوم (که کمی در پست قبلی اشاره کردیم) یک ساختار علمی است که اطلاعات مربوط به تغییرات بیوشیمیایی رخ داده در یک سیستم بیوشیمیایی انتخاب شده را خلاصه می‌کند (تصویر بالا).
#synthetic_biology #systems_biology
@primerSBU / instagram
🧬 constraint_based reconstruction and analysis یا COBRA یک چارچوب تجزیه و تحلیل یکپارچه‌ی‌ مکانیستیک است که برای هر سیستم بیوشیمیایی با اطلاعات مکانیکی اولیه از جمله در مواردی‌ که اطلاعات مکانیکی کامل نباشد نیز قابل اجرا است.
🧬رویکرد کلی، ارائه‌‌ی مکانیستیک رابطه‌ی میان ژنوتیپ و فنوتیپ با مدل‌ سازی‌های ریاضی و محاسباتی محدودیت‌هایی است که به فنوتیپ یک سیستم بیوشیمیایی، از طریق قوانین فیزیکوشیمیایی، ژنتیک و محیط اعمال می‌شود. ورژن 1.04 COBRA یک نرم افزار منبع باز بود که در محیط Matlab اجرا می‌شد و تخمین کمی فنوتیپ‌های متابولیکی که از روش‌های در دسترس COBRA در آن زمان استفاده می‌کردند، تسهیل می‌کرد. با گسترش جامعه‌ی COBRA و رشد فیلوژنی روش‌های آن، نیاز به تجمیع و شفاف کردن روش‌های COBRA بود که منجر به ایجاد ورژن 2.05 آن شد؛ در این نسخه طیف وسیعی از روش‌های ارتقایافته‌ برای شبیه سازی، آنالیز و پیش بینی تنوعی از فنوتیپ‌ها با استفاده از بازسازی‌های متابولیک در مقیاس ژنوم شد.
#synthetic_biology #systems_biology
@primerSBU / instagram
🧬ورژن 3 COBRA از جدیدترین ورژن‌‌ها است و تحولات زیادی کردی از جمله پوشش دادن روش‌های جدید مدل سازی. به صورت کلی اگر بخواهیم کارهایی که به وسیله‌ی COBRA می‌توان انجام داد بگوییم به این موارد اشاره می‌کنیم: مدل سازی کینتیک در مقیاس ژنوم، به تصویر کشیدن شبکه‌های متابولیک، تخمین و کاربرد محدودیت‌های ترمودینامیکی، ادغام با داده‌های omic، نمونه برداری یکسان از مدل‌هایی با ابعاد زیاد، دقت اتمی بازسازی‌های متابولیک و ...
در جدول یک می‌توانید مقایسه‌ای از ورژن‌های ۲ و ۳ COBRA ببینید.
سایت اصلی COBRA
برای مطالعه‌ی بیشتر و استفاده از لینک‌ گروه‌ افرادی که با COBRA کار میکنند می‌توانید از مقاله‌ی منتشر شده در نیچر با لینک زیر کمک بگیرید.
🧬reference
#synthetic_biology #systems_biology
@primerSBU / instagram
انتشار اولین شماره «فصلنامه علمی- دانشجویی زیست فناوری» دانشگاه شهاب دانش

💎با محوریت معرفی رشته‌های زیست فناوری

🔻شماره ۱- پاییز ۹۹
#فصلنامه #علمی #دانشجویی #زیست #فناوری
فصلنامه شماره 1_ پاییز 99(1).pdf
28.7 MB
«فصلنامه علمی- دانشجویی زیست فناوری» دانشگاه شهاب دانش قم

فصلنامه شماره 1_ پاییز 99
🕳چالش حذف زباله از فاضلاب: اجازه دهید تکنولوژی از طبیعت استفاده کند!
-سومین روش های تیمار کردن که قادر به از بین بردن آلاینده های شیمیایی و بیولوژیکی اند، با موفقیت توسعه یافته و در مقیاس کامل اجرا شده اند،امکان استفاده از تصفیه خانه های فاضلاب به عنوان واحدهای بازیافت، قادر به تولید فاضلاب قابل استفاده ی مجدد در فعالیت های مختلف از جمله آبیاری کشاورزی میباشد.
- با این حال، سومین تیمار ها فقط بخشی از باکتری های فاضلاب را حذف میکند، و فرصت رشد و/یا فعالیت مجدد را به باکتری های بالقوه ی خطرناک میدهد، رقابت ضعیف بین میکروارگانیسم های زنده تسهیل میشود؛ تحت شعار " افزودن با تکنولوژی، رهبری با طبیعت" ،تیمار و ذخیره ی فاضلاب تیمارشده باید تعادل را برای توسعه ی یک سپر محافظتی علیه پایین آوردن کیفیت میکروبی و توسعه ی باکتری های بالقوه ی خطرناک پیدا کرد.
-در قرن پیش یک چالش بزرگ مهندسان محیط ،توسعه ی یک سیستم تیمار بود که بتواند بار مواد آلی قابل تجزیه و عوامل بیماری زا را از فاضلاب کاهش دهد.
-اما بیش از یک قرن نوآوری و توسعه ی صنعتی، طرز زندگی ما و در نتیجه نوع آلاینده های تخلیه شده در فاضلاب را به طرز چشمگیری تغییر داد.

📎برای مطالعه ی ادامه ی مطلب کلیک کنید.
#بیوتک_میکروبی
#microbial_biotechnology

📱@PrimerSBU/instagram
💧تصفیه آب با الهام از کانال‌های پروتئینی بیولوژیکی

🔸 کانال‌های پروتئینی موجود در غشاهای طبیعی برای انتقال آب و مواد بصورت انتخابی، دارای منافذی هستند‌. یکی‌ از کانال‌های پروتئینی سلول، آکواپورین‌ها هستند که آب را از یک سلول به سلول دیگر منتقل می‌کنند‌. این کانال‌ها به ویژه در سلول‌هایی که باید حجم زیادی از آب را مبادله کنند، از اهمیت خاصی برخوردار هستند.‌ نمونه‌ این سلول‌ها دربدن انسان، سلول‌های کلیه هستند که روزانه ده‌ها لیتر آب را مبادله میکنند.

🔹 شیمیدانان با الهام از فعالیت هدایت آب از طریق آکواپورین‌ها، توانستند با استفاده از ترکیبات ساده تر مصنوعی، عملکردهای انتقالی مانند موارد طبیعی را بدست آورند. آن‌‌ها بدین منظور از پلی آمید استفاده کردند که دارای فضای خالی بیشتری برای انتقال آب می‌باشد.

🔸 انتقال سریع آب از طریق کانال‌های آب مصنوعی دارای مزایای زیاد و کاربردهای مهم عملی مانند نمک زدایی پیشرفته ، یا تولید آب با خلوص زیاد برای استفاده در پزشکی یا صنایع الکترونیکی یا تصفیه یک مرحله ای محلول های بسیار رقیق می‌باشد.

🔹🔸 Reference 1
🔸🔹 Reference 2

#Biomimetic

@primerSBU / Instagram
🧬مهندسی کاریوتایپ به وسیله ادغام کروموزوم منجر به جدایی تولید مثل در مخمر می شود

🔬استفاده از ارگانیسم های مهندسی شده به منظور بازیافت مواد زائد یا غنی کردن خوراک دام‌ها نیازمند آزادسازی آنها در محیط می‌باشد اما احتمال آمیزش این سویه‌های نوین با انواع طبیعی و جایگزینی آنها در اکوسیستم مورد نظر یکی از موانع موجود در عملیاتی شدن این روشها است.

🧑‍🔬محققان دانشگاه نیویورک با استفاده از تکنولوژی ویرایش ژنوم CRISPR-Cas9 اقدام به حذف سانترومرها و تلومرهای موجود در 14 کروموزوم از مجموع 16 کروموزوم مخمر S. cerevisiae کردند. حذف این نواحی باعث می‌شود که DNA باقی مانده از آنها مرحله به مرحله با هم ادغام شده و در نهایت دو کروموزوم بزرگ حاوی 6000 ژن که هر کدام تقریبا نیمی از ماده ژنتیکی اولیه مخمر را دارد بوجود بیاید. تا پیش از این، محققان نتوانسته بودند مخمر مهندسی شده‌ای را ایجاد نمایند که توانایی زنده ماندن با دو کروموزوم را داشته باشد؛ علت آن، اندازه بسیار بزرگ کروموزوم ها بود که تا قبل از این پژوهش، همواره به عنوان مانعی بزرگ در مطالعات مهندسی ژنتیک مطرح می شد.

🧫لقاح سلول‌های جنسی حاصل از این سویه جدید با سویه معمولی مخمر زاده‌هایی را به وجود می‌آورد که به دلیل تفاوت فاحش در سری کروموزوم های والدینی توانایی تولید مثل را نداشته و به دلیل جفت نشدن ماده ژنتیکی آنها طی تولید مثل جنسی، از بین می‌روند؛ پدیده‌ای که از آن تحت عنوان reproductive isolation نام برده می‌شود.

🩺علاوه بر کاربردهای ذکر شده برای این سویه، اطلاعات بدست آمده از این مطالعه می‌تواند به درک هرچه بیشتر مکانیسم بیماری های حاصل ازتعداد کروموزوهای غیرمعمول مانند سندروم داون و همچنین مسیر تکاملی ایجاد موجودات با تعداد کروموزو‌های مختلف کمک کند.
🔎مطالعه بیشتر
#GeneticEngineering
@primerSBU/Instagram

💊NANO DRUG: P.1
داروهای نانو علمی انقلابی و همه گیر در قرن بیست و یکم است.
استفاده از فناوری نانو در زمینه دارویی امکان تغییر قابل توجه در دوره تشخیص و درمان بیماریهای مختلف تهدید کننده زندگی را دارد.💊💉
در زمینه داروهای نانو ، طی 2 دهه گذشته پیشرفت قابل توجهی انجام شده است ، در نتیجه تعدادی از محصولات ، از جمله داروها و عوامل تصویربرداری ، امکان مداخلات درمانی و تشخیصی موثرتر و کمتر را فراهم می کنند.سیستم های دارویی نانو با بهبود فراهمی زیستی داروهای خوراکی مصرف شده ، تحویل هدفمند به بافتهای خاص و نیمه عمر طولانی(با کاهش ایمنی زایی) داروهای تزریقی سروکار دارند ،بنابراین سیستم های دارویی نانو فرکانس کمتری را فراهم می کنند.🔬🧪
برای دستیابی به این روش ، سیستم انتقال دارو نانو مانند دندریمرها ، نانوکریستال ها ، امولسیون ها ، لیپوزوم ها ، نانوذرات چربی جامد ، میسل ها و نانوذرات پلیمری ایجاد شده است.
#بیوتک_دارویی #نانو_دراگ_دلیوری
@primerSBU
📱INSTAGRAM
درک زیست شناسی از طریق ساخت ژنوم
قسمت‌ اول
🧬اکثر زیست شناسان به دنبال این هستند که جهان زیستی را همانگونه که وجود دارد، درک کنند. این موضوع مستلزم مشخص کردن چگونگی زیست سلولی و تنوع آن توسط ژنوم­‌ها و سیستم­‌های زیستی است. دستکاری ژنتیکی موجودات تا کنون نقش اساسی در این زمینه داشته. کروموزوم­‌های ساختگی تحت عنوان ژنومیک­‌های سنتزی، فرمی جدید از دستکاری ژنتیکی هستند. امروزه کروموزوم­‌هایی در سایزهای مگا باز از موادی سنتزی تولید می­‌شوند که این مواد از ژنوم­‌های طبیعی و مولکول­‌های موجود دیگر یا مخلوطی از هر دو به دست می­‌آیند. در طی ساخت، محتوا و ساختار این کروموزوم­‌ها می­­‌توانند نسبت به الگوی طبیعیشان اصلاح شوند تا ما بتوانیم فرضیه­‌های زیستی را تست کنیم.
🧬ژنوم ویروس­‌ها چون نسبت به بقیه سایز کوچکتری دارد، اولین کروموزوم سنتز شده کروموزوم ویروسی بود؛ که از اوایل دهه­‌ی 2000 ساخت آن‌ها شروع شد و تعدادی از کروموزوم­‌های ویروسی مثل هپاتیت C، هرپس نوع 1 و کرونا ویروس عامل COVID-19 تا به امروز ساخته شده­‌اند. اگرچه در سال 2008 سنتز کروموزوم­‌های باکتریایی و قارچی نیز پیشرفت کردند از جمله ای‌کلای و ساکارومایسز سرویزیه. در این مسیر پژوهشگران می­‌توانند تغییرات دلخواهی روی ژن­‌ها انجام دهند و نتیجه و فنوتیپ حاصل از هر تغییر را مشاهده کنند.
🧬روش­‌های متفاوت دستکاری ژنی به وسیله­‌ی ژنوم سنتزی وجود دارد که شامل بازسازی، از نو کد کردن، کمینه سازی، از نو مهندسی کردن موجود، کایمریک و بازسازی ژنوم است که در پست بعدی هر روش را با جزئیات بیشتری توضیح می‌دهیم.
🧬reference
#synthetic_biology #systems_biology
 @primerSBU / instagram
🧬ویدئویی مرتبط
👎1
Forwarded from سیناپس | Synapse (•Mitra•)
🔈 فراخوان جذب همکار در تولید محتوای رسانه ای نشریه ی سیناپس

نشریه ی سیناپس، نشریه ی پر افتخار زیست شناسی دانشگاه شهید بهشتی، از دانشجویان تمامی رشته ها که علاقمند به فعالیت در تولید محتوای اینستاگرام و وب سایت نشریه هستند دعوت به همکاری می‌نماید.

چنانچه با تولید محتوا، گرافیک و طراحی سایت آشنا هستید به آیدی زیر مراجعه فرمایید:

@fatemeh7657