🎁✨ کد تخفیف ده هزارتومانی به تعداد محدود، به دانشجویان دانشگاه شهید بهشتی تعلق میگیرد. برای دریافت کد تخفیف به آیدی زیر پیام بدهید.
@S_97_97


🆔 @SBUbiotechnology

🧫"میکروبیوم پایدار:یک سمفونی که توسط فاژهای مصنوعی،تنظیم شده است."
ما توسط میکروب ها،اکثرا باکتری ها و ویروس ها و فاژ هایشان در داخل و خارج بدنمان احاطه شده ایم. این باکتری ها در فعل و انفعالات مداوم با فاژ ها، چندین عملکرد مهم برای سلامتی ما را تنظیم میکنند. خوشبختانه آنها رام شدنی هستند، اما ما برای دستکاری ایمن آنها و بهبود سلامت انسان به ابزاری دقیق نیازمندیم.در اینجا،ما استدلال میکنیم که پیشرفتهای اخیر در فناوری‌های تک سلول،شناسایی محیط کشت و زیست شناسی مصنوعی فرصت های مهیجی را برای ایجاد این ابزارها و همچنین اشکال کردن فعل و انفعالات فاژ- باکتری در بدن فراهم می کند.
-استراتژی های modulation فعلی
اما اخیراً درک نقش میکروبیوم در حفظ و رشد بدن خود را آغاز کرده ایم. با این حال دستکاری آنها خیلی زودتر آغاز شده و به قرن چهارم چین بر می گردد که از پیوند مدفوع برای درمان مسمومیت غذایی شدید و اسهال استفاده می‌شد. کشف پروبیوتیک هاهم به قرن ۱۹ برمیگردد زمانیکه Lactobacillus bulgaricus و Lactobacillus acidophilus برای مزایای احتمالی شان برای سلامتی انسان معرفی شدند.
گرچه این استراتژیها نتایج امیدوارکننده‌ای را از طریق بهبود ساختار میکروبیوم،تنظیم سیستم ایمنی، سرکوب کردن پاتوژن ها ،کاهش سطوح سمیت و ضعیف کردن توسعه ی تومورها، نشان داده‌اند، همچنین برخی از نگرانی ها درباره ی ایمنی و کارآیی آنها وجود دارد.
-میتوانیم از فاژها استفاده کنیم؟
فاژها -به عنوان تعدیل کننده ی میکروبیوم- می‌توانند به مواردی از جمله ویژگی و ایمنی بپردازند. واژه ها برای درمان عفونت ها در اروپای شرقی از دهه ۱۹۳۰ استفاده می شدند و در سال‌های اخیر پذیرش و بالقوه آنها به عنوان ضد میکروب در سراسر جهان افزایش یافته است. در جهان غرب چندین کاربرد موفق از فاژ ها علیه باکتری های multi-resistant روی بیماران اخیرا گزارش شده است. آنها همچنین اخیراً اثر تنظیمی امیدوار کننده ای را روی باکتری های دستگاه گوارش نشان داده اند. با این حال استفاده از فاژها محدودیت هایی دارد که باید قبل از به حقیقت پیوستن کاربرد آنها رفع شود.
🧷برای مطالعه ی بیشتر اینجا را کلیک کنید.

#بیوتک_میکروبی
#Microbial_biotechnology
📱@primerSBU/instagram

سلام به همراهان همیشگی پرایمر 🤩

قسمت‌های بعدی آموزش طراحی پرایمر را در ادامه براتون ارسال خواهیم کرد؛ امیدواریم براتون مفید باشه 🌹

بخش‌های قبلی این آموزش را از طریق لینک‌های زیر میتونید مشاهده کنید :

1⃣ قسمت ۱
2⃣ قسمت ۲
3⃣ قسمت ۳
4⃣ قسمت ۴
@primerSBU / Instagram

#بیوانفورماتیک 👩🏻‍💻🧑🏻‍💻
#طراحی_پرایمر_۵

@primerSBU 🧬
اینستاگرام نشریه

#بیوانفورماتیک 👩🏻‍💻🧑🏻‍💻
#طراحی_پرایمر_۶

@primerSBU 🧬
اینستاگرام نشریه

#بیوانفورماتیک 👩🏻‍💻🧑🏻‍💻
#طراحی_پرایمر_۷

@primerSBU 🧬
اینستاگرام نشریه

چهارمین شماره گاهنامه علمی دانشجویی پرایمر منتشر شد 🤩

✨ صاحب امتیاز : انجمن علمی بیوتکنولوژی دانشگاه شهید بهشتی
✨ مدیر مسئول : فاطمه مستوفی
✨ سردبیر : امیر ابراهیمی
----------------------------------------
📜 در این شماره میخوانیم :

🦠 چرا کرونا ویروس به آسانی بین مردم گسترش می‌یابد؟

🔋 ویروس؛ ابزاری بیولوژیک برای ساخت نسل آینده باتری‌های جهان

💧تصفیه آب به کمک نانوتکنولوژی و بیومیمتیک

🔺 پرونده ویژه : تراریخته؛ مصاحبه با دکتر مسعود توحیدفر

💉 آیا مبتلا کردن عمدی داوطلبان آزمایش واکسن COVID-19 اخلاقی است؟

📖 و چندین موضوع خواندنی دیگر ...


@primerSBU / Instagram

🔬تقلید از سلول‌های مغز برای درک پارکینسون

دانشمندان ابزاری را اختراع کردند که از سلول‌های مغزی افراد مبتلا به بیماری پارکینسون تقلید می‌کند و می‌تواند به یافتن روش‌های جدید درمان بیماری کمک کند.
این ابزار که به صورت organ-on-a-chip می‌باشد،از یک پلیمر شفاف یا شیشه با کانال‌های کوچک حاوی سلول‌های زنده ساخته می‌شود و مایعات از طریق کانال‌ها گردش می‌کنند تا شبیه محیط اطراف بافت شود.
جریان مداوم در کانال‌ها سلول‌های عصبی را رشد می‌دهند و این ابزار باعث می‌شود که به طور همزمان بتوانیم برروی آن آزمایشات مختلف انجام‌دهیم در پارکینسون سلول‌های تولید کننده دوپامین در دستگاه عصبی مرکزی از بین میرود محققان با استفاده از سلول‌های بنیادی آن‌ها را به وجود آوردند و با ایجاد یک جریان مداوم درون کانال‌ها شرایطی را برای تقلید از مغز انسان بوجود آوردند تا بتوانند این بیماری را مطالعه کنند.
📖برای مطالعه بیشتر کلیک کنید.
#Biomimetics
instagram/@PrimerSBU

🐭مدل‌های اصلاح ژنتیکی شده‌ی موش برای کمک به مبارزه با COVID-19

محققین برای آزمایش دارو‌ها و واکسن‌ها علیه بیماری کرونا و همچنین مطالعه مکانیزم های مولکولی به شدت به مدل های حیوانی نیازمند هستند.
طیف وسیعی از حیوانات خانگی و آزمایشگاهی برای یافتن مدل آزمایشگاهی مناسب به آزموده شده‌اند اما متأسفانه تعداد کمی از آنها از جمله گربه‌ها، راسوها، همسترها و میمون‌ها مستعد بیمار شدن هستند. متأسفانه بسیاری از این گونه ها برای پیشرفت سریع آزمایش ها برای اکثر محققان نه در دسترس هستند و نه استفاه از آنها کارآمد است.
موش یکی از پر استفاده‌ترین حیوانات آزمایشگاهی هستند که در تحقیقات زیست پزشکی به دانشمندان در تشخیص ، درمان و ساخت واکسن برای بسیاری از بیماری های انسان کمک می‌کنند.
🐀متأسفانه گونه وحشی موش ها نسبت به SARS-CoV-2 مقاوم هستند و فقط زمانی که اصلاح ژنتیکی شده باشند که ACE2 انسانی را بیان کنند می‌توانند مبتلا به SARS-CoV-2 شوند. دانشمندان با اصلاح ژنتیکی موش‌ها از آنها برای مطالعه بر روی این بیماری استفاده می‌کنند.
📎 برای مشاهده‌ی مقاله و مطالعه‌ی بیشتر اینجا کلیک کنید.
#GeneticEngineering
@primerSBU/Instagram

🌏#اخبار_هفته 🌍

🔬پروتئینی که تصور میشد تنها در توسعه نورون ها در مغز نقش دارد، در توسعه و رشد سلول های سرطان پانکراس نقش اساسی دارد.

*

🦠لرزش و حرکات پروتئین های spike در کرونا ویروس می تواند نقش اساسی در ورود آن به سلول و ایجاد عفونت داشته باشد.

*

🦖تحقیقات جدید نشان از این دارد که جمعیت دایناسور ها قبل از برخورد شهاب سنگ رو به کاهش نبوده و تئوری انقراض دایناسور ها توسط شهاب سنگ را تایید میکند.

*

🌊باکتری های بزرگ اقیانوسی که در برابر شرایط متغیر و بسیار نامساعد در محیط زندگی خود به خوبی اداپته می شوند

*

📜مطالعات نشان می دهد که داروی Baricitinib، که برای درمان آرترید به کار می رود، امکان زنده ماندن افراد مسن مبتلا به Covid-19 را افزایش می دهد.

*

🥀علف کشی که ممکن است با اثر گذاری بر میکروبیوم روده انسان سبب بیماری شود

*

💊چگونه باکتری عامل بیماری سل به سرعت به آنتی بیوتیک ها مقاوم می شود؟ پاسخ این موضوع در domain های اپی ژنتیکی نهفته است.

*

🌿یافته ها نشان می دهند گیاهی که برای تولید دارو در طب سنتی چینی استفاده میشود به نحوی تکامل یافته است که کمتر در معرض دید انسان قرار گیرد.



🧬 @PrimerSBU 🧬

*

🧬🔹 Instagram 🔹 🧬

*

سیستم تحویل داروی ضد سرطان مبتنی بر نانوذرات ( nano drug delivery) از کیتین میگو !!
تحویل دارو معمای تکراری در درمان سرطان است. دانشمندان، بسیاری از داروهای ضد سرطان را ایجاد کرده‌اند اما اغلب به بافت‌های سالم آسیب میرسانند و یا حتی قبل از رسیدن به محل تومور در حریان خون تجزیه میشوند.
در تحقیق‌های انجام شده، این نانوذرات‌ها هیچ عارضه نامطلوبی نشان ندادند که احتمالا به دلیل طبیعی بودن پلیمر (کیتین) است. اما محلول بالینی مورد استفاده برای تاکسول، میتواند باعث سمیت کبدی در موش‌ها شود.
قطر این نانوذرات حدودا 20.6 نانومتر است.
این تیم تحقیقاتی دریافتند وقتی نانو الیاف مملو از دارو را به بدن تزریق کنند، به سرعت به نانوذرات تجزیه شده (با برخورد به پروتیین‌های سرم در خون) و میتوانند آزادانه در جریان خون گردش کنند و به نقاط تومور برسند.آنها دریافت که این نانوذرات گردش تاکسول را در جریان خون بیشتر نگه می دارند و به دارو زمان بیشتری برای رسیدن به محل تومور می دهد (در جریان خون موش ۲۵ ساعت و در تحقیقات بالینی ۲ ساعت)

ادامه‌مطلب

@PrimerSBU / Instagram

🧬در دو دهه‌ی گذشته پیشرفت‌های قابل توجهی در حوزه‌ی زیست مولکولی صورت گرفته که منجر به طوفانی از داده در مورد ترکیب مولکولی ارگانیسم‌ها و محیط اطرافشان شده است. در حال حاضر اندازه گیری‌های کمّی مولکولی در مقیاس ژنوم روتین هست و شامل داده‌های ژنومیک، متابولومیک، ترانسکریپتومیک و پروتئومیک می‌شود.
🧬این انبوه داده‌ها باعث گسترش طیف گسترده‌ای از الگوریتم‌ها و نرم افزارهایی برای آنالیز و پیش پردازش داده‌ها شده. پیش پردازش در اصل، متغیرهای اندازه گیری شده را تبدیل به تخمین‌هایی از مقدار هر گونه‌ی مولکولی موجود در یک نمونه‌ می‌کند. آنالیز، این کمی‌سازی گونه‌های مولکولی را می‌گیرد تا به دانش جدید زیستی دست یابد. گرچه همچنان با وجود پیشرفت‌های زیاد و جدید، یک چالش اساسی فهمیدن دقیق سیستم‌های زیستی است. بازسازی متابولیک در مقیاس ژنوم (که کمی در پست قبلی اشاره کردیم) یک ساختار علمی است که اطلاعات مربوط به تغییرات بیوشیمیایی رخ داده در یک سیستم بیوشیمیایی انتخاب شده را خلاصه می‌کند (تصویر بالا).
#synthetic_biology #systems_biology
@primerSBU / instagram

🧬 constraint_based reconstruction and analysis یا COBRA یک چارچوب تجزیه و تحلیل یکپارچه‌ی‌ مکانیستیک است که برای هر سیستم بیوشیمیایی با اطلاعات مکانیکی اولیه از جمله در مواردی‌ که اطلاعات مکانیکی کامل نباشد نیز قابل اجرا است.
🧬رویکرد کلی، ارائه‌‌ی مکانیستیک رابطه‌ی میان ژنوتیپ و فنوتیپ با مدل‌ سازی‌های ریاضی و محاسباتی محدودیت‌هایی است که به فنوتیپ یک سیستم بیوشیمیایی، از طریق قوانین فیزیکوشیمیایی، ژنتیک و محیط اعمال می‌شود. ورژن 1.04 COBRA یک نرم افزار منبع باز بود که در محیط Matlab اجرا می‌شد و تخمین کمی فنوتیپ‌های متابولیکی که از روش‌های در دسترس COBRA در آن زمان استفاده می‌کردند، تسهیل می‌کرد. با گسترش جامعه‌ی COBRA و رشد فیلوژنی روش‌های آن، نیاز به تجمیع و شفاف کردن روش‌های COBRA بود که منجر به ایجاد ورژن 2.05 آن شد؛ در این نسخه طیف وسیعی از روش‌های ارتقایافته‌ برای شبیه سازی، آنالیز و پیش بینی تنوعی از فنوتیپ‌ها با استفاده از بازسازی‌های متابولیک در مقیاس ژنوم شد.
#synthetic_biology #systems_biology
@primerSBU / instagram

🧬ورژن 3 COBRA از جدیدترین ورژن‌‌ها است و تحولات زیادی کردی از جمله پوشش دادن روش‌های جدید مدل سازی. به صورت کلی اگر بخواهیم کارهایی که به وسیله‌ی COBRA می‌توان انجام داد بگوییم به این موارد اشاره می‌کنیم: مدل سازی کینتیک در مقیاس ژنوم، به تصویر کشیدن شبکه‌های متابولیک، تخمین و کاربرد محدودیت‌های ترمودینامیکی، ادغام با داده‌های omic، نمونه برداری یکسان از مدل‌هایی با ابعاد زیاد، دقت اتمی بازسازی‌های متابولیک و ...
در جدول یک می‌توانید مقایسه‌ای از ورژن‌های ۲ و ۳ COBRA ببینید.
سایت اصلی COBRA
برای مطالعه‌ی بیشتر و استفاده از لینک‌ گروه‌ افرادی که با COBRA کار میکنند می‌توانید از مقاله‌ی منتشر شده در نیچر با لینک زیر کمک بگیرید.
🧬reference
#synthetic_biology #systems_biology
@primerSBU / instagram

#اخبار_هفته 🌍

💉چالش های پیش روی واکسن کووید


😬اضطراب: شروع سریع تر بیماری آلزایمر


☝️حافظه ی "اثر انگشت" تشکیلات مغز را نشان میدهد.


🤯مغز چگونه حافظه های حسی را شکل میدهد.



🌽کشاورزان هندوراس به فواید ذرت تراریخته گواهی میدهند.


🦠ژنوم های غول پیکر ویروس سوار بر ژنوم های جلبک پیدا شده اند.


✂️سنجش دیجیتالی CRISPR-Cas-Assisted برای تشخیص سریع SARS-CoV-2

***
📱@PrimerSBU/instagram

✨انتشار اولین شماره «فصلنامه علمی- دانشجویی زیست فناوری» دانشگاه شهاب دانش

💎با محوریت معرفی رشته‌های زیست فناوری

🔻شماره ۱- پاییز ۹۹
#فصلنامه #علمی #دانشجویی #زیست #فناوری

«فصلنامه علمی- دانشجویی زیست فناوری» دانشگاه شهاب دانش قم

فصلنامه شماره 1_ پاییز 99

🕳چالش حذف زباله از فاضلاب: اجازه دهید تکنولوژی از طبیعت استفاده کند!
-سومین روش های تیمار کردن که قادر به از بین بردن آلاینده های شیمیایی و بیولوژیکی اند، با موفقیت توسعه یافته و در مقیاس کامل اجرا شده اند،امکان استفاده از تصفیه خانه های فاضلاب به عنوان واحدهای بازیافت، قادر به تولید فاضلاب قابل استفاده ی مجدد در فعالیت های مختلف از جمله آبیاری کشاورزی میباشد.
- با این حال، سومین تیمار ها فقط بخشی از باکتری های فاضلاب را حذف میکند، و فرصت رشد و/یا فعالیت مجدد را به باکتری های بالقوه ی خطرناک میدهد، رقابت ضعیف بین میکروارگانیسم های زنده تسهیل میشود؛ تحت شعار " افزودن با تکنولوژی، رهبری با طبیعت" ،تیمار و ذخیره ی فاضلاب تیمارشده باید تعادل را برای توسعه ی یک سپر محافظتی علیه پایین آوردن کیفیت میکروبی و توسعه ی باکتری های بالقوه ی خطرناک پیدا کرد.
-در قرن پیش یک چالش بزرگ مهندسان محیط ،توسعه ی یک سیستم تیمار بود که بتواند بار مواد آلی قابل تجزیه و عوامل بیماری زا را از فاضلاب کاهش دهد.
-اما بیش از یک قرن نوآوری و توسعه ی صنعتی، طرز زندگی ما و در نتیجه نوع آلاینده های تخلیه شده در فاضلاب را به طرز چشمگیری تغییر داد.

📎برای مطالعه ی ادامه ی مطلب کلیک کنید.
#بیوتک_میکروبی
#microbial_biotechnology

📱@PrimerSBU/instagram

💧تصفیه آب با الهام از کانال‌های پروتئینی بیولوژیکی

🔸 کانال‌های پروتئینی موجود در غشاهای طبیعی برای انتقال آب و مواد بصورت انتخابی، دارای منافذی هستند‌. یکی‌ از کانال‌های پروتئینی سلول، آکواپورین‌ها هستند که آب را از یک سلول به سلول دیگر منتقل می‌کنند‌. این کانال‌ها به ویژه در سلول‌هایی که باید حجم زیادی از آب را مبادله کنند، از اهمیت خاصی برخوردار هستند.‌ نمونه‌ این سلول‌ها دربدن انسان، سلول‌های کلیه هستند که روزانه ده‌ها لیتر آب را مبادله میکنند.

🔹 شیمیدانان با الهام از فعالیت هدایت آب از طریق آکواپورین‌ها، توانستند با استفاده از ترکیبات ساده تر مصنوعی، عملکردهای انتقالی مانند موارد طبیعی را بدست آورند. آن‌‌ها بدین منظور از پلی آمید استفاده کردند که دارای فضای خالی بیشتری برای انتقال آب می‌باشد.

🔸 انتقال سریع آب از طریق کانال‌های آب مصنوعی دارای مزایای زیاد و کاربردهای مهم عملی مانند نمک زدایی پیشرفته ، یا تولید آب با خلوص زیاد برای استفاده در پزشکی یا صنایع الکترونیکی یا تصفیه یک مرحله ای محلول های بسیار رقیق می‌باشد.

🔹🔸 Reference 1
🔸🔹 Reference 2

#Biomimetic

@primerSBU / Instagram

🧬مهندسی کاریوتایپ به وسیله ادغام کروموزوم منجر به جدایی تولید مثل در مخمر می شود

🔬استفاده از ارگانیسم های مهندسی شده به منظور بازیافت مواد زائد یا غنی کردن خوراک دام‌ها نیازمند آزادسازی آنها در محیط می‌باشد اما احتمال آمیزش این سویه‌های نوین با انواع طبیعی و جایگزینی آنها در اکوسیستم مورد نظر یکی از موانع موجود در عملیاتی شدن این روشها است.

🧑‍🔬محققان دانشگاه نیویورک با استفاده از تکنولوژی ویرایش ژنوم CRISPR-Cas9 اقدام به حذف سانترومرها و تلومرهای موجود در 14 کروموزوم از مجموع 16 کروموزوم مخمر S. cerevisiae کردند. حذف این نواحی باعث می‌شود که DNA باقی مانده از آنها مرحله به مرحله با هم ادغام شده و در نهایت دو کروموزوم بزرگ حاوی 6000 ژن که هر کدام تقریبا نیمی از ماده ژنتیکی اولیه مخمر را دارد بوجود بیاید. تا پیش از این، محققان نتوانسته بودند مخمر مهندسی شده‌ای را ایجاد نمایند که توانایی زنده ماندن با دو کروموزوم را داشته باشد؛ علت آن، اندازه بسیار بزرگ کروموزوم ها بود که تا قبل از این پژوهش، همواره به عنوان مانعی بزرگ در مطالعات مهندسی ژنتیک مطرح می شد.

🧫لقاح سلول‌های جنسی حاصل از این سویه جدید با سویه معمولی مخمر زاده‌هایی را به وجود می‌آورد که به دلیل تفاوت فاحش در سری کروموزوم های والدینی توانایی تولید مثل را نداشته و به دلیل جفت نشدن ماده ژنتیکی آنها طی تولید مثل جنسی، از بین می‌روند؛ پدیده‌ای که از آن تحت عنوان reproductive isolation نام برده می‌شود.

🩺علاوه بر کاربردهای ذکر شده برای این سویه، اطلاعات بدست آمده از این مطالعه می‌تواند به درک هرچه بیشتر مکانیسم بیماری های حاصل ازتعداد کروموزوهای غیرمعمول مانند سندروم داون و همچنین مسیر تکاملی ایجاد موجودات با تعداد کروموزو‌های مختلف کمک کند.
🔎مطالعه بیشتر
#GeneticEngineering
@primerSBU/Instagram

🌏#اخبار_هفته 🌍

👶🏻ثبت رکورد جدید! جنینی که ۲۷ سال پیش فریز شده بود، متولد شد.

*

🍗برای اولین بار در جهان: صدور مجوز فروش گوشت های تولید شده در آزمایشگاه

*

🐬مطالعه ی فیزیولوژی پستانداران دریایی و نحوه محافظت آنها از بافت ها در شرایط کم اکسیژن، دیدی تازه در مورد اثرات COVID-19 به ما میدهد.

*

🐁استفاده از غشای گلبول سفید برای انتقال مستقیم دارو های ضدالتهابی و آنتی بیوتیک به سلول های ریه ی آلوده به عفونت در موش

*

🦠مدلسازی سه بعدی پروتئین ها توضیح میدهد که چگونه COVID-19 بعضی حیوانات را آلوده میکند و بعضی دیگر را نه

*

🌱ساخت ترکیبات الهام گرفته شده از آلکالویید های گیاهی برای محافظت برنج، کیوی و مرکبات در برابر عفونت های باکتریایی.

*

🧬بارکد های مولکولی که تصمیم میگیرند کدام اسپرم وارد سلول تخمک شود.

*

💊"آنتی آنتی بیوتیک" دارویی که از مقاومت میکروارگانیسم ها در برابر آنتی بیوتیک جلوگیری میکند.

*

🧬 @PrimerSBU 🧬

*

🧬🔹 Instagram 🔹 🧬

*