پرایمر | Primer
3.18K subscribers
306 photos
131 videos
51 files
829 links
📍رسانه علمی دانشجویی پرایمر
💠سردبیر: حورا اخوان‌فرید
@houra_akhavanfarid
💠مدیرمسئول: نیما عشقی
@nima_4718
@Primer_admin

💻http://primerjournal.sbu.ac.ir

🔗 انجمن علمی دانشجویی علوم و فناوری زیستی دانشگاه شهید بهشتی
https://t.me/SBUBIOSOCIETY
Download Telegram
🌏#اخبار_هفته 🌍

🔬تحقیقات جدید نشان از تاثیرات کروموزوم Y بر عملکرد اندام های غیر جنسی دارد و این که چرا مرد ها به نحوی متفاوت نسبت به زنان، از بیماری هایی مانند Covid-19 رنج میبرند.

*

🦠کشف گروهی از ویروس ها که به باکتری های هضم کننده کربوهیدرات های پیچیده موجود در روده بزرگ انسان حمله میکنند و مشکلاتی را ایجاد می کنند.
*

🔍میتوکندری های متقلبی که از مکانیسم های استرس سلولی به نفع خود استفاده می کنند!

*

🧠مطالعات جدید نشان می دهد که سایز مغز پریمات ها نمی تواند هوش آن ها را پیش بینی کند.

*

🌱محققان راه جدیدی برای حفاظت از گیاهان در برابر قارچ ها یافتند.

*

🐒تحقیقات نشان می دهد که شمپانزه ها در صورت از دست دادن والدین پیش از رسیدن به دوران جوانی، دچار رنج و مشکلات اجتماعی می شوند.

*

🧪دانشمندان یک آنزیم اصلی گیاه را مهندسی کرده و آن را به منظور ایجاد یک محیط آزمایشگاهی بهینه برای مطالعه نحوه سرعت بخشیدن به فتوسنتز و بهبود محصول، در باکتری اشریشیا کلای قرار دادند.

*

ترکیبی کشنده از دو ویروس منتقل شده توسط پشه ها ممکن است محرک سکته مغزی باشد.


*

🐠مدل های جدید نشان می دهند که ماهیگیری به روش صنعتی منجر به شکل گیری رفتار های ضد اجتماعی در ماهی ها می شود.

*


🧬 @PrimerSBU 🧬

*

🧬🔹 Instagram 🔹 🧬

*
Forwarded from .
🛍هدیه‌ای برای همه دانشجویان🛍

آموزش مجازی صفر تا صد WORD

💰هزینه دوره : کاملا "رایگان"

🎥 20 جلسه فیلم آموزشی

🎓 در کانال رسمی پروژه دانشجویی


حتما با دیگر دانشجویان به اشتراک بگذارید تا همه از این دوره رایگان استفاده کنند .
_____________________

🎓 کانال پروژه دانشجویی

🆔 @FIRST_PROJE

🆔 @FIRST_PROJE

کانال پروژه دانشجویی را به دیگر دانشجویان معرفی کنید.
🧪مهندسی چند پیمانه ای ساکارومایسز سرویزیه برای تولید تیتر بالایی از تیروزول و salidroside

تیروزول و محصول گلیکوزیله شده ی آن، salidroside عناصر مهمی در داروها،مواد غذایی و مواد آرایشی اند. علیرغم توانایی ساکارومایسز سرویزیه در سنتز طبیعی تیروزول، عملکرد بالا از سنتز de novo یک چالش باقی گذاشته است. در اینجا، روش های مهندسی متابولیک استفاده شد تا برای سطوح بالای تولید تیروزول و salidroside از گلوکز، سویه های S.cerevisae را بسازند. ابتدا تولید تیروزول از مهار بازخوردی (feedback inhibition) باز شد. سپس transketolase و ریبوز-۵-فسفات کتول-ایزومراز برای تعدیل عرضه‌ی پیش ساز ها ،بیش بیان شدند. بعد، chorismate synthase و chorismate mutase  برای بیشینه ساختن شار آمینو اسید آروماتیک به سمت سنتز تیروزول،بیش بیان شدند. در نهایت، مسیر رقابت برای هدایت بیشتر شار کربن به سنتز تیروزول حذف شد.

📎برای مطالعه ی ادامه ی مطلب اینجا را کلیک کنید.
#Microbial_biotechnology

@primerSBU

📱instagram
🔬ساخت رگ‌های خونی الکترونیکی
🩸محققان در چین و سوئیس رگ‌های خونی الکترونیکی ایجاد کرده‌اند که می‌توانند به طور فعال تنظیم شوند تا تغییرات ظریف بدن را پس از کاشت و قرارگیری در بدن به طور دقیق بررسی کنند.این رگ‌های خونی از یک غشای رسانای فلزی-پلیمری که انعطاف پذیر و قابل تجزیه‌اند ساخته‌ می‌شوند و از عروق خونی طبیعی تقلید می‌کنند و می‌توانند به طور موثر جای عروق اصلی در خرگوش را بگیرند.
🩸این رگ‌ها می‌توانند برای تحویل موثر مواد ژنتیکی،آزادسازی دارو و ایجاد بافت جدید رگ‌های خونی اندوتلیال نقش موثری داشته باشند .رگ های الکترونیکی نسبت به رگ‌های ساخته شده توسط مهندسی بافت(TEBV) مورد التهاب قرار نمی‌گیرند و می‌توا‌نند به بازسازی رگ‌های خونی کمک کنند.
📖برای مطالعه بیشتر کلیک کنید
#Biomimetics
instagram/@primerSBU
🧬🩸درمان سندروم ویسکوت - آلدریچ توسط ژن درمانی در سلول های بنیادی خون‌ساز.
سندروم ویسکوت - آلدریچ یک بیماری وابسته به کروموزم X است که به دلیل نقص در سلول های ایمنی بدن (لنفوسیت های T و B) و پلاکت ها ایجاد می‌شود و سبب عفونت های مکرر ، اگزمای پوستی و خونریزی های مداوم می‌شود.
دانشمندان با استفاده از ویرایش ژنوم مبتنی بر CRISPR/Cas9 توانستند بدون آسیب به سلول های بنیادی تا شصت درصد جهش هایی که سبب ایجاد این مشکل ژنتیکی در سلول های بنیادی خونساز می‌شود را اصلاح کنند.
این اصلاح سبب میشود که سنتز پروتئین سندروم ویسکوت - آلدریچ (WASp) به حالت طبیعی بازگردد و سبب اصلاح نقص عملکرد در سلول های لنفاوی شود.
سلول های که با این روش اصلاح شده اند ماندگاری بالای دارند و هم چنین عملکرد قابل قبولی از خود نشان می‌دهند.
این روش راه را برای رسیدن به درمانی ایمن تر و کارامد تر و در عین حال کم هزینه تر هموار می‌کند.
📎 برای مشاهده‌ی مقاله و مطالعه‌ی بیشتر اینجا کلیک کنید.
#GeneticEngineering
@primerSBU/Instagram
محققان با استفاده از نانوذرات دارویی موفق به کاهش سلول‌های سرطانی پانکراس شدند. یک چالش مهم و اصلی در درمان سرطان پانکراس زمان تشخیص آن است که احتمال دارد بیش از حد گسترش یافته باشد.مؤسسه پزشکی سانفورد پروتئینی به‌نام “Slug” را شناسایی کرده‌اند که به کنترل حرکت سلول کمک می‌کند. پروتئین Slug به‌خودی خود با دارو قابل هدف‌گیری نیست، اما محققان دو پروتئین دیگر به نام‌های ERK و eIF2 آلفا را کشف کرده‌اند که با پروتئین Slug برهمکنش دارند.محققان به دنبال یافتن پاسخی برای نحوه واکنش سلول‌های سرطانی در هنگام کاهش مواد مغذی مورد نیاز برای رشد آن‌ها بودند که پروتئین Slug را گزینه مناسبی برای این منظور یافتند. محققان برای هدف قرار دادن فسفاتیدیل سرین، نشانگر زیستی موجود بر سطح سلول‌های پانکراسی، از نانوذرات استفاده کردند. آن‌ها دریافتند ترکیبی از نانوداروها به همراه شیمی درمانی استاندارد به عنوان اولین قدم، برای کنترل سلول‌های سرطان پانکراس از درمان با هرکدام از این روش‌ها به تنهایی مؤثرتر است. این نانوذرات در حال حاضر در مبتلایان به سرطان مغز مورد بررسی قرار می‌گیرند.مطالب بیشتر
💊#Medicinal_biotech
@primerSBU/instagram
کاربرد برنامه‌ریزی خطی در زیست‌شناسی

قسمت اول

✳️در مهندسی متابولیک و تولید یک ماده ارزشمند از یک سیستم زیستی، با شبکه‌هایی پیچیده مواجه هستیم. گاهی لازم است برای افزایش تولید این ماده، مسیرهای رقابتی دیگر را سرکوب کنیم یا نرخ واکنش آن‌ها را کاهش دهیم‌. علاوه بر این، باید تاثیر این تغییرات را بر کل سیستم زیستی مورد نظر (باکتری، گیاه و ...) بسنجیم.

✳️پرواضح است که انجام این کارها و سنجیدن تمام جوانب برای یک سیستم زیستی مثل ای.کلای (با نزدیک به 3000 واکنش تاکنون شناخته‌شده) به طور دستی و آزمون و خطا بسیار سخت و شاید غیرممکن باشد.

✳️خوشبختانه هنوز ریاضی را داریم! یکی از تکنیک‌هایی که بعنوان یک بیوتکنولوژیست می‌توانیم از ریاضی قرض بگیریم،" برنامه‌ریزی خطی" یا Linear Programming است. این روش کاربرد زیادی در محاسبه سود و زیان و بهینه‌کردن هزینه‌ها در اقتصاد دارد. با کمک این روش، می‌توانیم مسائل مهندسی متابولیک را بعنوان یک مسئله بهینه‌سازی با یکسری قیود خطی فرض و آنرا حل کنیم.

💻اینکه چطور و با چه ابزاری با این مسائل مواجه شویم، در قسمت‌های بعد به آن می‌پردازیم.

@PrimerSBU / instagram

#system_biology
should i or shouldn't i ?

💥💥فعالیت هر سلول عصبی نشان میدهد که ما چقدر در تصمیمات خود مطمئن هستیم.💥💥

⚡️طی پژوهشی دردانشگاه بن (bonn university) دانشمندان با بررسی فعالیت سلول های عصبی، رابطه ای بین انها و میزان مطمئن بودن ما درتصمیم گیری هایمان یافتند.⚡️

⚡️با اندازه گیری فعالیت نورون ها در لوب گیجگاهی دریافتند که هرچه فرد در یک تصمیم مطمئن تر باشد فرکانس ایمپالس های عصبی در این ناحیه بیشتر است.⚡️

⚡️لوب گیجگاهی مسئول پردازش خاطره هاست. با این مطالعه برای اولین بار مشخص شد که نه تنها تصمیماتی که میگیریم در این لوب ذخیره میشوند بلکه اینکه چقدر در تصمیم گیری خود مطمئن بودیم هم ذخیره خواهد شد. چنین فرایند یادگیری (learning process) ممکن است ما را از گرفتن تصمیم های اشتباه
در سری های بعد منع کند.⚡️

🖇مطالعه ی مقاله

#Neuroscience

@primerSBU / instagram
🔸 دانشمندان چینی با الهام از طبیعیت توانستند لاستیک هایی مشابه با لاستیک های طبیعی ولکانیزه شده تولید کنند.این مواد به همان اندازه مواد طبیعی، سخت و بادوام هستند. در واقع زنجیره های کوتاه پروتئینی که به زنجیره های جانبی backbone پلیمری متصل شده اند، پایداری cross-linkage های فیزیکی را تضمین میکنند و به ماده اثر "خود تقویت کنندگی" را تحت فشار های استرین، میدهند.

🔹 لاستیک‌های طبیعی از انواع پلیمرهای الاستیک تشکیل شده است که برای استفاده در لاستیک ، صنعت خودرو و کالاهایی مانند تشک های لاستیکی پردازش می شوند. اگرچه برخی از لاستیک های مصنوعی ، پلی ایزوپرن ها ، دارای ساختار اصلی مانند لاستیک طبیعی هستند ، اما لاستیک های طبیعی ولکانیزه هنوز به وضوح برتر هستند ، زیرا به طور قابل توجهی قوی تر و سخت تر میباشند. همچنین در قیاس با لاستیک های سنتی، بازیافت این مواد بسیار راحت تر است.

📚 مطالعه بیشتر

#Biomimetic

@primerSBU / Instagram
🧬 استفاده از تکنیک کریسپر برای درمان ناشنوایی ارثی در مطالعات پیش بالینی

🧑‍🔬محققان توانستند برای نخستین بار ناشنوایی مادرزادی را با کمک ابزار مهندسی ژنتیک درمان کنند. ناشنوایی یک اختلال ژنتیکی است که اصولا غیرقابل درمان است.

🦻ناشنوایی ژنتیکی به دو نوع عمده سندرمیک و غیر سندرمیک تقسیم می گردد. در نوع اول (سندرمیک) علاوه بر ناشنوایی و یا کم شنوایی علایم و اختلالات دیگری نیز وجود دارند. در حالت دوم و یا غیر سندرمیک ناشنوایی و یا کم شنوایی تنها علامت بیماری بوده و همراه با سایر عوارض و علایم نمی باشد. البته قابل ذکر است که عدم توان تکلم (لال بودن) نتیجه ناشنوایی بوده و در هر دو گروه بیماران دیده می شود و عامل آن عدم یادگیری مهارت تکلم از راه گوش دادن می باشد.

🩺 اما اکنون محققان شیوه درمانی را آزمایش کردند که به طور موفقیت آمیز ناشنوایی در موش ها را معکوس کرد و امیدی برای درمان آن در انسان را نیز به وجود آورده است.

🧬 محققان دانشگاه هاروارد برای این منظور از روش کریسپر CAS9 استفاده کردند. کریسپر در حقیقت تکنیکی برای ویرایش و بازآرایی DNA در سلول های زنده است. در موش هایی که به طور مادرزاد ناشنوا متولد شده اند، این روش ژن عامل ناشنوایی به نام TMC1 را خاموش کرد. عامل ناشنوایی و کم شنوایی پیچیده می باشد و تاکنون ژن های بسیار زیادی در این زمینه توسط محققان گزارش گردیده است.

🔬انسان هایی که چنین متغیر ژنتیکی داشته باشند، دچار ناشنوایی تدریجی می شوند و محققان امیدوارند این روش درمانی را برای انسان نیز به کار ببرند.

#geneticengineering
@PrimerSBU / Instagram
🔎مطالعه بیشتر
نشریه "به توان سلول".pdf
15.2 MB
🔔نخستین شماره نشریه "به توان سلول" منتشر شد.

🔬🧬🦠🧫

در این شماره میخوانیم:

🔹کرونا و سلول های بنیادی
🔹گزیده ای از مصاحبه روزنامه گاردین با خانم جنیفر دودنا از کاشفان کریسپر و برنده ی جایزه نوبل شیمی ۲۰۲۰
🔹مروری بر بیماری آلزایمر
🔹مقدمه ای بر پزشکی بازساختی
🔹ام اس و سلول های بنیادی
🔹مصاحبه با خانم مرضیه موسی زاده دانشجوی دکتری نانوبیوتکنولوژی


📚@Btavancell_AUT
🌱برنامه ریزی مجدد ترکیبی متابولیسم لیپید ها در گیاهان: راهی به سمت تولید انبوه قارچ تقویت شده ی زیستی arbuscular mycorrhizal

-قارچ arbuscular mycorrhizal fungi (AMF)قدیمی ترین، گسترده ترین و عملا مهمترین همزیستی روی زمین است که به تغذیه ی جهان کمک می کند.

-با این حال،تولید انبوه ماده ی تلقیحی تمیز (به عبارت دیگر تولید in vitro) ، ایمن و قوی با هزینه های مقرون به صرفه همچنان یک چالش اساسی است.

- اخیرا Luginbuehl و همکارانش دریافتند که گیاهان لیپیدهای شریک همزیستی را عرضه میکنند، بنابراین" AMF را با یک منبع قوی کربن برای نیاز های متابولیکی خود تامین می کنند".

-از این رو،مهندسی گیاهان برای افزایش تحویل لیپیدها به AMF میتواند راهی خلاقانه برای تولید نسل جدیدی از ماده ی تلقیحی AMF تقویت شده ی زیستی، با کیفیت بالا و مقرون به صرفه برای کاربرد در اکوسیستم های کشاورزی ارائه دهد.

📎ادامه ی مطلب
#بیوتکنولوژی_میکروبی
#microbial_biotechnology
@primerSBU
📱instagram
آیا رویکردهای مقایسه ای انکولوژی میتواند انقلابی در کشف داروی سرطان ایجاد کند؟
علی رغم صرف وقت و منابع و پیشرفت های چشمگیر در مدل های آزمایشی بیماری ، تحقیقات سرطان همچنان از موفقیت بسیار کم در تفسیر اکتشافات پیش بالینی به عمل بالینی رنج می برد. عدم موفقیت مداوم در تولید داروی سرطان ، به ویژه در اواخر دوره آزمایش انسانی ، نه تنها بر نتایج بیمار تأثیر می گذارد ، بلکه هزینه درمان ها را نیز افزایش میدهد. یکی از جهات امیدوار کننده، انکولوژی مقایسه ای است .مطالعه سرطان در بین گونه ها اغلب شامل بیماران دامپزشکی است که به طور طبیعی به سرطان مبتلا میشوند. انکولوژی مقایسه ای از قدرت تجزیه و تحلیل متقابل برای درک عوامل اصلی مکانیسم‌های محافظت از سرطان و همچنین عوامل موثر در شروع و پیشرفت سرطان استفاده میکند.
انکولوژی مقایسه ای به غلبه بر موانع فعلی کشف دارو کمک می کند. چالش های کشف داروی سرطان شامل دسترسی محدود به نمونه های بیمار برای آزمایش، مدل های ناکافی برای مطالعه سیستم ایمنی بدن و ریزمحیط تومور و عدم وجود مدل هایی است که ناهمگنی تومور بیمار را بطور کامل نشان میدهند.
#Cancer
ادامه مطلب
@PrimerSBU / Instagram
کاربرد برنامه ریزی خطی در زیست شناسی
قسمت دوم
بخش اول: آنالیز توازن فلاکس یا FBA (flux balance analysis ) شیوه‌ی بسیار گسترده برای مطالعه‌ی شبکه‌های بیوشیمیایی مخصوصا بازسازی شبکه‌های متابولیک در سطح ژنوم است؛ این بازسازی شبکه شامل تمام واکنش‌های شناخته شده در یک ارگانیسم و نیز ژن‌های کدکننده‌ی آنزیم آن می‌باشد. FBA می‌تواند جریان متابولیت‌ها را در این شبکه‌ی متابولیک محاسبه کند؛ بنابر این به ما این امکان را می‌دهد نرخ رشد ارگانیسم یا نرخ تولید یک متابولیتی که در حوزه‌ی بیوتکنولوژی اهمیت دارد پیش‌بینی کنیم.
اولین گام در FBA این است که واکنش‌های متابولیک را به صورت ریاضی بیان کنیم؛ بدین صورت که باید بر اساس ضریب‌های استوکیومتری هر واکنش، یک ماتریس عددی ارائه کنیم. این ماتریس، جریان را محدود می‌کند و مقدار کل هر ماده‌ای که تولید می‌شود باید برابر با کل ماده در شرایط پایا باشد. تمام واکنش ها میتوانند بالا یا پایینتر از این محدودیت باشند که به ما مینیمم و ماکسیمم ممکن جریان واکنش‌ها را می‌دهد.
#synthetic_biology #system_biology
@primerSBU / instagram
بخش دوم : در گام بعدی FBA باید فنوتیپ دلخواه را در یک شکل هدف بیولوژیکی تعریف کنیم. برای واضح شدن مثالی میزنیم: حالت پیش بینی رشد را در نظر بگیرید؛ هدف تولید بیومس است یعنی نرخی که در آن مواد متابولیک تبدیل به مواد زیست‌توده‌ای مثل نوکلئیک اسید، پروتیین و لیپید می‌شوند. این تولید بیومس مصنوعی باعث اضافه شدن یک ستون اضافی به ماتریس ما می‌شود و در نتیجه  شبیه مسیر اصلی، متابولیت‌ها را مصرف می‌کند. بنابر این جریان این واکنش برابر با مقدار تجربی آن می‌شود. در موارد دیگر شاید یک واکنش و یک هدف برای اثر روی فنوتیپ وجود نداشته باشد. از نظر ریاضی عملکرد یک هدف باعث تعریف کیفی می‌شود و بیان می‌کند که هر واکنش چقدر در ایجاد یک فنوتیپ دخالت می‌کند. این مجموعه (نمایش‌های ریاضی واکنش‌های متابولیک و نیز هدف)، میتواند سیستم معادلات خطی را تعریف کند که در FBA این معادلات توسط برنامه‌ریزی خطی (linear programing) حل می‌شوند. الگوریتم های محاسباتی برنامه‌ریزی خطی بسیاری وجود دارد که میتوانند خیلی سریع در معادلات سیستم‌های بزرگ، راه حل را بیابند. یکی از آنها ابزاری به نام COBRA است بر مبنای متلب، پایتون و جولیا است که درباره‌ی آن در روزهای آتی بیشتر صحبت می‌کنیم؛ شما میتوانید از لینک‌های زیر با COBRA بیشتر آشنا شوید.
https://cobrapy.readthedocs.io/en/latest/getting_started.html

https://opencobra.github.io/cobratoolbox/stable/

https://github.com/opencobra/COBRA.jl

🧬reference
#synthetic_biology
@primerSBU /instagram
🌏#اخبار_هفته 🌍

⚠️هشدار سازمان ملل: در صورت عوض نشدن رفتار انسان با طبیعت، در آینده پاندمی هایی بسیار مرگبار تر و زیان بار تر از Covid-19 را شاهد خواهیم بود.


*

🦈نگرانی محققان از واکسنی بالقوه که میتواند پاندمی کرونا را به اتمام برساند اما به ضرر گونه ی دیگری از جانداران تمام شود: کوسه ها

*

زندگی، پس از مرگ: چگونه حشراتی که از بدن جاندار مرده برمیخیزند، جسد را تبدیل به اسکلت میکنند.

*

🔎کشف گروه جدیدی از گیرنده های چشایی در زبان


*

🔬رسپتور های کوتاه شده سلول های سیستم ایمنی که مدتها به عنوان ناقص و غیرفعال در نظر گرفته میشدند، می توانند با همتایان طبیعی خود به غشای سلول متصل شوند و مسیری برای ساخت داروها و روش های درمانی جدید پدید آورند.

*

⚠️خطرات استفاده از روش ویرایش ژنی کریسپر روی جنین

*

🦠کشف مسیری کلیدی در لیزوزوم ها که کرونا ویروس از آن برای خروج از سلول استفاده میکند.

*

🐙با لمس کردن مزه را حس کنید! دانشمندان از چگونگی کارکرد سنسور های موجود در بادکش های پای اختاپوس پرده برداشتند.

*

🔖ساخت زبان بایومیمتیک با استفاده از پرینت سه بعدی


*

🌔کشف آب مایع در کره ماه توسط ناسا و افزایش امید ها به سکونت در ماه

*

🧬 @PrimerSBU 🧬

*

🧬🔹 Instagram 🔹 🧬

*
🧐گوشی همراه خود را با لباس شارژ کنید!!

💡گرسنگی ما برای انرژی سیری ناپذیر است؛ حتی با افزایش عرضه ابزارهای الکترونیکی جدید، این روند همچنان افزایش می یابد. علاوه بر این، ما برای شارژ مجدد تلفن های هوشمند، تبلت ها و لپ تاپ های خود به طور دائم به منبع تغذیه وابسته هستیم.

💡محققان Empa و ETH موفق به تولید ماده ای شدند که مانند یک کنسانتره خورشیدی لومینسانس کار می کند و حتی می تواند برای منسوجات نیز استفاده شود و امکانات زیادی را برای تولید انرژی به طور مستقیم در مکان مورد نیاز و در استفاده از وسایل الکترونیکی روزمره ایجاد می کند.

💡در آینده، پریزهای برق (حداقل برای این منظور) احتمالاً منسوخ می شوند و برق از لباس شخصی ما تأمین می شود. با اعمال یک پلیمر جدید روی الیاف نساجی، کت ها، پیراهن‌ها و موارد مشابه، می توان از آنها به عنوان منبع انرژی سیار استفاده کرد.

💡مطالعه بیشتر...

#Biomimetic

@primerSBU / Instagram