آزمایشگاه پارس سیلیکو
921 subscribers
245 photos
61 videos
91 files
212 links
اولین آزمایشگاه خصوصی بیوانفورماتیک کشور

Pars Silico is one of the leading Middle Eastern companies in the field of Chemoinformatics and Bioinformatics. Founded in 2013 ...
ParsSilico.com
ارتباط:
@bioinformatics1
Download Telegram
🎁لیست آدرس های فعال سایت Sci-Hub
sci-hub.la
sci-hub.tv
sci-hub.tw
sci-hub.hk
sci-hub.name
http://80.82.77.84
http://80.82.77.83
🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🌍نقشه پراکندگی شرکت های بیوتکنولوژی اروپا!

از نظر تعداد شرکت ها
1)آلمان
2)انگلیس
3)فرانسه

جزئیات بیشتر 👇
https://labiotech.eu/map/

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📊نظرسنجی دوره های آینده پارس سیلیکو 📝نظر به اهمیت علوم کامپیوتر ریاضیات و آمار در زیست شناسی ، آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو تصمیم به برگزاری دوره های کاربردی در این زمینه ها دارد. 🗳کدامیک از دوره های زیر را پیشنهاد می دهید؟
anonymous poll

یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک – 49
👍👍👍👍👍👍👍 43%

ریاضی و آمار در زیست شناسی – 36
👍👍👍👍👍 32%

الگوریتم های بیوانفورماتیک – 28
👍👍👍👍 25%

👥 113 people voted so far.
Forwarded from ICBMB2018 (kamareh)
پانزدهمین کنگره سراسری بیوشیمی و ششمین کنگره بین المللی بیوشیمی و بیولوژی مولکولی 3 الي 6 شهریور ماه 97 در دانشگاه علوم پزشکی اصفهان.
راه های ارتباط با کنگره:
لینک سایت:
www.icbmb2018.com
لینک کانال تلگرام:
t.me/icbmb2018
تماس با دبیرخانه:
09032225747
💊طبق گزارش منتشر شده، در سال 2017 سازمان FDA تعداد 16 دارو پزشکی شخصی را در سال 2017 تایید کرده است👇

https://goo.gl/BHGT8Y

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🛎فرصت شغلی

✔️Searching for a PhD-level computational biologist to work on malaria genomics and transcriptomics at #broadinstitute and #HarvardChanSPH. Please RT
https://tinyurl.com/ycs6ktg8

▪️QUALIFICATIONS

▫️Ph.D. in computational biology, genetics, computer science, statistics, math, molecular biology, or related field, or equivalent practical experience.

▫️Expertise in Illumina sequencing data analysis tools and general knowledge of statistical methods for genomic and transcriptomic data analysis.

▫️Demonstrated ability to clearly communicate scientific ideas and results in oral presentations.

▫️A publication record reflecting high productivity and the ability to write clearly.

▫️Interest in infectious diseases and global health

▫️Familiarity with population genetic and molecular evolutionary analysis methods, including tests of natural selection and phylogenetics

▫️Fluency in Unix, standard bioinformatics tools (Python, R, or equivalent), and a programming language (C/C++, Java)

▫️Excellent communication, organization, and time management skills

Creative, organized, motivated, team player
👑ازمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics
📊بنچمارک - مقایسه مپرهای NGS
#NGS #aligner #mapping #sequencing

👑ازمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics
✍️مقاله 👇
یادگیری ماشین مبتنی بر شبکه و الگوریتم های تئوری گراف برای درمان دقیق سرطان
www.nature.com/articles/s41698-017-0029-7


🥇 پارس سیلیکو پیشرو در بیوانفورماتیک

@practicalbioinformatics
Forwarded from Exirlabs
Rare Disease Day
امروز روز جهانی بیماری های نادر بود و در سرتاسر جهان مردم تشویق به کمک های خیرخواهانه به فعالیت های پژوهشی جهت پیشگیری و درمان این دسته از بیماریها شدند.
@ExirLabs
💐پارس سیلیکو این افتخار را داشت که در سومين كنفرانس زيست شناسي سامانه هاي ايران حضور داشته باشد.

🌹با تشکر از عوامل برگزاری این کنفرانس بسیار عالی و پربار

icsb2018
📣دوره ۳ روزه انالیز بیان ژن

🕰 ۷ الی ۹ فروردین

🎁۲۰ درصد تخفیف ثبت نام تا ۲۰ اسفند

📞 اطلاعات بیشتر:
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
🌍 www.goo.gl/9ytXkG

آزمایشگاه پارس سیلیکو👇
@practicalbioinformatics
▪️تبدیل فرمت FASTQ به FASTA با استفاده از خط فرمان

✍️ابزار های فراوانی برای تبدیل FASTQ به FASTA وجود دارد ولی یک دستور ساده در ترمینال لینوکس به راحتی میتونه این کارو انجام بدهد. و نیازی به دانلود و نصب نرم افزاری نیست.👇

paste - - - - < file.fq | cut -f 1,2 | sed 's/^@/>/' | tr "\t" "\n" > file.fa

#NGS
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics
▪️تبدیل فایل BAM به BED فرمت

✍️برای تبدیل فایل BAM به BED فرمت از این دستور پرل در خط فرمان استفاده کنید .👇👇

samtools view file.bam | perl -F'\t' -ane '$strand=($F[1]&16)?"-":"+";$length=1;$tmp=$F[5];$tmp =~ s/(\d+)[MD]/$length+=$1/eg;print "$F[2]\t$F[3]\t".($F[3]+$length)."\t$F[0]\t0\t$strand\n";'

#NGS #mapping
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📣دوره آموزشی بیوانفورماتیک عمومی ( انلاین )

مدت دوره: ۲ ماه

💳هزینه دوره: ۵۰۰ هزار تومان

🎁 ۳۰ درصد تخفیف تا ۲۵ اسفند

شروع دوره: نیمه دوم فروردین

🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📣 دوره آموزشی بیوانفورماتیک عمومی ( انلاین )

🔔(این دوره بصورت غیر حضوری و انلاین برگزار خواهد شد)
www.goo.gl/ZJwJWJ
مدت دوره: ۲ ماه

💳هزینه دوره: ۵۰۰ هزار تومان

🎁 ۳۰ درصد تخفیف تا ۲۵ اسفند

شروع دوره: نیمه دوم فروردین

📋سرفصل‌ ها:

▫️بیوانفورماتیک مقدماتی
▫️آشنایی با انواع فرمت ها توالی های بیو مولکولی
▫️آشنایی با دیتابیس های توالی نوکلئیک اسید
▫️آشنایی با دیتابیس های توالی پروتئینی
▫️بیوانفورماتیک ساختاری
▫️کموانفورماتیک
▫️طراحی پرایمر
▫️فیلوژنی مولکولی
▫️و..

📞 اطلاعات بیشتر:
▫️۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
▫️۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
🌍 www.goo.gl/9ytXkG
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔 امروز روز میکروبیوم بود .

😋 به خاطر اینکه در این زمینه چند مقاله بسیار عالی در مجله cell و science منتشر شد.

🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو پیشرو در علوم زیستی
@practicalbioinformatics
🔔امروز روز میکروبیوم بود .

😃 یه خاطر اینکه در این زمینه چند مقاله بسیار عالی در مجله cell و science انتشار یافت.

📝The Human Gut Microbiome: From Association to Modulation
✍️Thomas S.B. Schmidt , Jeroen Raes, Peer Bork
8 March 2018
▫️آیا ما باید میکروبیوم خود را توالی یابی کنیم؟ ما میکروب هایمان را شکل می دهیم یا میکروب های ما به ما شکل می دهند؟

📝The Past and Future Biology of the Human Microbiome in an Age of Extinctions
✍️Martin J. Blaser
8 March 2018
▫️سرنوشت تکاملی انسان به طور مستقیم با میکروبیوم ما مرتبط است. پیشرفت های پزشکی و تکنولوژیکی موجب تغییرات بزرگی در ترکیب و بلوغ جوامع میکروبی مرتبط با انسان شده است و حساسیت ما به بیماری های عفونی و پیشرفته را افزایش داده. ترمیم و بازسازی میکروبیوم انسان باید اولویت زیست پزشکی باشد.

📝Gut bacteria selectively promoted by dietary fibers alleviate type 2 diabetes
✍️Liping Zhao, Feng Zhang1, Xiaoying Ding، ,...
Science 09 Mar 2018
▫️رژیم غذایی سرشار از فیبر با تغییر ترکیب میکروبیوم روده عوارض دیابت نوع 2 را کاهش میدهد.

📝Translocation of a gut pathobiont drives autoimmunity in mice and humans
✍️S. Manfredo Vieira1, M. Hiltensperger1, V. Kumar2, ...
Science 09 Mar 2018
▫️جابجایی "میکروب های مستعد بیماریزای" روده به اندام های دیگر مانند کبد باعث ایجاد بیماری های اتوایمنی در انسان می شوند.

🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
Microbiome.rar
2.9 MB
🔔مقالات معرفی شده در پست قبلی را از اینجا دریافت کنید
The Human Gut Microbiome..
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📣 سمپوزیوم یک روزه آشنایی با #بیوانفورماتیک
🔴 ثبت نام #رایگان تا ۲۹ اسفند
🔴 همراه با ارائه #گواهی حضور
📆 ۳۰ فروردین ۹۷
📌 دانشگاه #الزهرا
✒️ ثبت نام:
https://evand.com/events/bioinformatics