goo.gl/9GR1qJ
✍️ نرم افزار Cytoscape یک نرم افزار یوانفورماتیک متن باز و رایگانی است که برای مصور سازی شبکه های میانکنش مولکولی و نیز برای یکپارچه سازی این میانکنش ها با پروفایل های بیان ژنی و دیگر داده های آماری به کار می رود. برای این نرم افزار اپلیکیشن های زیادی برای تحلیل شبکه و بررسی های مولکولی، پشتیبانی فرمت های فایلها، اسکریپت نویسی و ارتباط با دیتابیس ها وجود دارند.
جدیدترین نسخه این نرم افزار 3.4.0 می باشد. که شما می توانید از طریق این کانال دریافت کنید.
▫️ادرس وب سایت:
cytoscape.org
سعی خواهد شد آموزش این نرم افزار در کانال ارائه شود.
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️ نرم افزار Cytoscape یک نرم افزار یوانفورماتیک متن باز و رایگانی است که برای مصور سازی شبکه های میانکنش مولکولی و نیز برای یکپارچه سازی این میانکنش ها با پروفایل های بیان ژنی و دیگر داده های آماری به کار می رود. برای این نرم افزار اپلیکیشن های زیادی برای تحلیل شبکه و بررسی های مولکولی، پشتیبانی فرمت های فایلها، اسکریپت نویسی و ارتباط با دیتابیس ها وجود دارند.
جدیدترین نسخه این نرم افزار 3.4.0 می باشد. که شما می توانید از طریق این کانال دریافت کنید.
▫️ادرس وب سایت:
cytoscape.org
سعی خواهد شد آموزش این نرم افزار در کانال ارائه شود.
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
Cytoscape_3_4_0_windows_64bit-parssilico.exe
119.4 MB
💎نسخه 3.4 و 64 بیتی نرمافزار Cytoscape
💾 حجم: 120 مگابایت
🔔 توجه داشته باشید برای نصب و اجرا Cytoscape نیاز به نصب جدیدترین ورژن جاوا، نسخه 8 می باشد
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
💾 حجم: 120 مگابایت
🔔 توجه داشته باشید برای نصب و اجرا Cytoscape نیاز به نصب جدیدترین ورژن جاوا، نسخه 8 می باشد
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/qaum4C
✍️معرفی دیتابیس RepurposeDB
داروی مناسب در دز صحیح، برای بیمار درست، در زمان لازم و از مسیر صحیح، یکی از نتایج پزشکی فردمحور و multi-omic است. تغییر کاربری دارو (drug repositioning) به صورت سیستماتیک ما را قادر می سازد تا بینش خودمان از تحلیل های محاسباتی که با یافته های تجربی و آزمایشگاهی ترکیب شده است را در زمان کوتاه تری به یافته های علمی ثابت شده ترجمه کنیم. از اولین گزارشی از تغییر کاربری دارو که ابتدای دهه ی 1950 منتشر شد تا امروز، بیش از 250 گزارش موفق در این مورد منتشر شده است. خالقان RepurposeDB مجموعه ی از این گزارش ها را مورد بررسی قرار داده و یک کد مولکولی برای تغییر کاربری دارو را استخراج کردیم. تحلیل داده هایی که به شکل داروها، اندیکاسیون های اولیه و اندیکاسیون های ثانویه وجود داشتند از اولویت های مولکولی؛ دسته بندی های لیگاندها، نقش های عملکردی و مسیرهای موفقیت تغییر کاربری داروها پرده برداشتند. دیتابیس RepurposeDB در ایجاد مدل های پیش بینی تغییر کاربری دارو می تواند کمک کننده باشد و می تواند تاثیر بزرگی در تغییر کاربری داروی فرد محور داشته باشد که زمینه ی درمانی در حال ظهور و جدیدی در پزشکی فرد محور و مبتنی بر داده هاست.
▫️آدرس دسترسی به این دیتابیس👇👇
repurposedb.dudleylab.org
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️معرفی دیتابیس RepurposeDB
داروی مناسب در دز صحیح، برای بیمار درست، در زمان لازم و از مسیر صحیح، یکی از نتایج پزشکی فردمحور و multi-omic است. تغییر کاربری دارو (drug repositioning) به صورت سیستماتیک ما را قادر می سازد تا بینش خودمان از تحلیل های محاسباتی که با یافته های تجربی و آزمایشگاهی ترکیب شده است را در زمان کوتاه تری به یافته های علمی ثابت شده ترجمه کنیم. از اولین گزارشی از تغییر کاربری دارو که ابتدای دهه ی 1950 منتشر شد تا امروز، بیش از 250 گزارش موفق در این مورد منتشر شده است. خالقان RepurposeDB مجموعه ی از این گزارش ها را مورد بررسی قرار داده و یک کد مولکولی برای تغییر کاربری دارو را استخراج کردیم. تحلیل داده هایی که به شکل داروها، اندیکاسیون های اولیه و اندیکاسیون های ثانویه وجود داشتند از اولویت های مولکولی؛ دسته بندی های لیگاندها، نقش های عملکردی و مسیرهای موفقیت تغییر کاربری داروها پرده برداشتند. دیتابیس RepurposeDB در ایجاد مدل های پیش بینی تغییر کاربری دارو می تواند کمک کننده باشد و می تواند تاثیر بزرگی در تغییر کاربری داروی فرد محور داشته باشد که زمینه ی درمانی در حال ظهور و جدیدی در پزشکی فرد محور و مبتنی بر داده هاست.
▫️آدرس دسترسی به این دیتابیس👇👇
repurposedb.dudleylab.org
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/gr0hbX
ابزار AQUA-DUCT ابزار جدیدی است که انالیز جریان مولکول های حلال را در شبیه سازی دینامیک مولکولی آسان می کند. AQUA-DUCT به ما اجازه می دهد تا رفتار مولکول های حلال را در تمام مراحل شبیه سازی زیر نظر بگیریم و آن را تحلیل و تصویرسازی کنیم. این گونه تحلیل ها می تواند برای بررسی آنزیمهای دارای جایگاه فعال مدفون که از طریق تونل هایی با ماده حلال پیرامونی در ارتباط هستند، مفید باشد. جریان آب را می توان از طریق خواص مولکولی ترکیب آمینو اسیدهای به کار رفته، در تونل ها یا برای آنزیمهای پیچیده تر، از طریق درهای کنترلی که مسیرهای دسترسی را باز می کنند یا می بندند، کنترل کرد.
▫️آدرس دسترسی به این ابزار👇👇
aquaduct.pl/
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
ابزار AQUA-DUCT ابزار جدیدی است که انالیز جریان مولکول های حلال را در شبیه سازی دینامیک مولکولی آسان می کند. AQUA-DUCT به ما اجازه می دهد تا رفتار مولکول های حلال را در تمام مراحل شبیه سازی زیر نظر بگیریم و آن را تحلیل و تصویرسازی کنیم. این گونه تحلیل ها می تواند برای بررسی آنزیمهای دارای جایگاه فعال مدفون که از طریق تونل هایی با ماده حلال پیرامونی در ارتباط هستند، مفید باشد. جریان آب را می توان از طریق خواص مولکولی ترکیب آمینو اسیدهای به کار رفته، در تونل ها یا برای آنزیمهای پیچیده تر، از طریق درهای کنترلی که مسیرهای دسترسی را باز می کنند یا می بندند، کنترل کرد.
▫️آدرس دسترسی به این ابزار👇👇
aquaduct.pl/
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
آزمایشگاه پارس سیلیکو
goo.gl/9GR1qJ ✍️ نرم افزار Cytoscape یک نرم افزار یوانفورماتیک متن باز و رایگانی است که برای مصور سازی شبکه های میانکنش مولکولی و نیز برای یکپارچه سازی این میانکنش ها با پروفایل های بیان ژنی و دیگر داده های آماری به کار می رود. برای این نرم افزار اپلیکیشن…
goo.gl/4R3o7C
✍️معرفی و آموزش Cytoscape (صفحه خوش آمدگویی) بخش 1
▫️"گزینه From Network Database ": این گزینه به شما اجازه می دهد تا یک شبکه را از دیتابیس های عمومی اینتراکشن یا از وب سرور Pathway وارد کنید. اگر می خواهید داده های یک شبکه ی عمومی را آنالیز کنید یا اگر یک ژن خاص یا دسته ای از ژنها را دارید و می خواهید اینتراکنش های آنها را بیابید، از این گزینه استفاده کنید. جزییات در زیر آمده است.
▫️" گزینه Organism Networks ": دسته ای از آیکن ها که در پایین ایکون From Network Database قرار گرفته شده اند و شامل مجموعه ای از شبکه ها مدل های ارگانیسم مانند انسان، موش و.. می باشد که از BioGRID گرفته شده اند.
در طرف راست صفحه ی خوش آمدگویی، دو گزینه ی دیگر قرار دارند که برای بارگذاری کارهای موجود استفاده می شوند:
▫️"گزینه Open Recent Session": این لیستی از تمام فایل های کارهایی است که تا بحال باز کرده اید
. توجه کنید که "نمونه شبکه مخمر" همیشه وجود دارد و دسترسی به galFiltered.cys را مهیا می کند که اغلب برای نشان دادن ویژگی های سیتواسکیپ به کار می رود.
▫️"گزینه Open Session File": به شما اجازه می دهد تا برای بارگذاری فایل های کارهای سایتواسکیپ، فایل های سیستمی شما مورد جستجو قرار گیرد.
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️معرفی و آموزش Cytoscape (صفحه خوش آمدگویی) بخش 1
▫️"گزینه From Network Database ": این گزینه به شما اجازه می دهد تا یک شبکه را از دیتابیس های عمومی اینتراکشن یا از وب سرور Pathway وارد کنید. اگر می خواهید داده های یک شبکه ی عمومی را آنالیز کنید یا اگر یک ژن خاص یا دسته ای از ژنها را دارید و می خواهید اینتراکنش های آنها را بیابید، از این گزینه استفاده کنید. جزییات در زیر آمده است.
▫️" گزینه Organism Networks ": دسته ای از آیکن ها که در پایین ایکون From Network Database قرار گرفته شده اند و شامل مجموعه ای از شبکه ها مدل های ارگانیسم مانند انسان، موش و.. می باشد که از BioGRID گرفته شده اند.
در طرف راست صفحه ی خوش آمدگویی، دو گزینه ی دیگر قرار دارند که برای بارگذاری کارهای موجود استفاده می شوند:
▫️"گزینه Open Recent Session": این لیستی از تمام فایل های کارهایی است که تا بحال باز کرده اید
. توجه کنید که "نمونه شبکه مخمر" همیشه وجود دارد و دسترسی به galFiltered.cys را مهیا می کند که اغلب برای نشان دادن ویژگی های سیتواسکیپ به کار می رود.
▫️"گزینه Open Session File": به شما اجازه می دهد تا برای بارگذاری فایل های کارهای سایتواسکیپ، فایل های سیستمی شما مورد جستجو قرار گیرد.
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/DVSsll
✍️معرفی Cytoscape (صفحه خوش آمدگویی) بخش 2
💎 گزینه From Network Database
انتخاب گزینه From Network Database صفحه ی واسطه ی the Interaction Database Universal Client را باز می کند:
▪️در این بخش، جستجوی خود را وارد کنید مثلا ژن یا مجموعه ژن هایی که مورد نظر شماست مانند "BRCA2".
▪️در کشوی "Search Mode"، شما می توانید نوع جستجوی خود را به Search Interactome تغییر دهید تا بتوانید به جستجوی یک اینتراکتوم کامل بر اساس گونه ها بپردازید.
▪️بخش Select Database، دیتابیس های موجود را نشان می دهد. بعد از آغاز جستجو با کلیک کردن بر روی کلمه ی Search، نتایج جستجو در ستون Records Found قابل مشاهده است:
▪️در بخش Select Database، نتایج را از طریق چک باکس ستون Import انتخاب کنید یا از انتخاب خارج کنید. وقتی آماده بودید بر روی Import کلیک کنید.
▪️می توانید تمام اینتراکشن ها را وارد کنید یا تعدادی از آنها را انتخاب نکنید. با کلیک بر روی Import، شبکه های یافته شده وارد می شوند.
▪️منو The Interaction Database Universal Client نیز از اینجا قابل دسترسی است:
File → Import→ Public Databases
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️معرفی Cytoscape (صفحه خوش آمدگویی) بخش 2
💎 گزینه From Network Database
انتخاب گزینه From Network Database صفحه ی واسطه ی the Interaction Database Universal Client را باز می کند:
▪️در این بخش، جستجوی خود را وارد کنید مثلا ژن یا مجموعه ژن هایی که مورد نظر شماست مانند "BRCA2".
▪️در کشوی "Search Mode"، شما می توانید نوع جستجوی خود را به Search Interactome تغییر دهید تا بتوانید به جستجوی یک اینتراکتوم کامل بر اساس گونه ها بپردازید.
▪️بخش Select Database، دیتابیس های موجود را نشان می دهد. بعد از آغاز جستجو با کلیک کردن بر روی کلمه ی Search، نتایج جستجو در ستون Records Found قابل مشاهده است:
▪️در بخش Select Database، نتایج را از طریق چک باکس ستون Import انتخاب کنید یا از انتخاب خارج کنید. وقتی آماده بودید بر روی Import کلیک کنید.
▪️می توانید تمام اینتراکشن ها را وارد کنید یا تعدادی از آنها را انتخاب نکنید. با کلیک بر روی Import، شبکه های یافته شده وارد می شوند.
▪️منو The Interaction Database Universal Client نیز از اینجا قابل دسترسی است:
File → Import→ Public Databases
✍️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🎁 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🌹سال خوبی را برای شما آرزومند است🌹
📢 @practicalbioinformatics
🌍www.ParsSilico.com
☎️09106665590
🌹سال خوبی را برای شما آرزومند است🌹
📢 @practicalbioinformatics
🌍www.ParsSilico.com
☎️09106665590
📢دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی با همکاری پارس سیلیکو برگزار می کند:
▫️کارگاه های بهار
⏱اردیبهشت ماه
▫️کارگاه های بیوانفورماتیک، طراحی دارو
🎁با تخفیف های ویژه
ParsSilico.com
@practicalbioinformatics
▫️کارگاه های بهار
⏱اردیبهشت ماه
▫️کارگاه های بیوانفورماتیک، طراحی دارو
🎁با تخفیف های ویژه
ParsSilico.com
@practicalbioinformatics
goo.gl/qk8CFi
✍️واکنش های رسانه ها به دستکاری ژنوم انسان
به تازگی من گزارش آکادمی ملی علوم آمریکا درباره دستکاری ژنوم انسان رو مطالعه کردl این گزارش درباره خیلی از مشکلات و چالش های علمی و اخلاقی در زمینه دستکاری ژن های انسانی اشاره کرده است گزارش آکادمی به صورت محتاطانه از دست کاری سلول های جنسی انسانی استقبال کرده بود اما در صورتی که این دستکاری ها به صورت شفاف ، تحت نظارت و در جهت منافع سلامت انسان صورت گیرد
از این رو من در اینجا من یک سری از واکنش های رسانه های جهانی را به این گزارش برای شما ارایه میدهم.
Human genome editing shouldn’t be used for enhancement – yet (New Scientist)
https://www.newscientist.com/article/2121264-human-genome-editing-shouldnt-be-used-for-enhancement-yet/
With stringent oversight, heritable human genome editing could be allowed (Science Daily)
https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170214130539.htm
Genome-edited humans get green light from expert panel (Ars Technica)
https://arstechnica.com/science/2017/02/science-experts-endorse-genetically-editing-humans/
US scientists back gene editing but warn against ‘designer babies’ (Telegraph)
http://www.telegraph.co.uk/science/2017/02/14/us-scientists-back-gene-editing-warn-against-designer-babies/
CRISPR should be used to combat disease, not make designer babies (yet) (Wired)
http://www.wired.co.uk/article/crispr-disease-designer-babies-regulations
No red line against CRISPR’ing early embryos, experts rule (STAT)
https://www.statnews.com/2017/02/14/national-academy-crispr-report/
US panel gives yellow light to human embryo editing (Science)
http://www.sciencemag.org/news/2017/02/us-panel-gives-yellow-light-human-embryo-editing
Review favours human gene editing under stringent conditions (Financial Times)http://www.sciencemag.org/news/2017/02/us-panel-gives-yellow-light-human-embryo-editing
Germline gene editing should be allowed – in certain cases (BioWorld Online)
http://www.bioworld.com/content/germline-gene-editing-should-be-allowed-%E2%80%93-certain-cases
Human Gene Editing Receives Science Panel’s Support (New York Times)
https://www.nytimes.com/2017/02/14/health/human-gene-editing-panel.html
Ethicists advise caution in applying CRISPR gene editing to humans (Washington Post)
https://www.washingtonpost.com/news/speaking-of-science/wp/2017/02/14/ethicists-advise-caution-in-applying-crispr-gene-editing-to-humans/
Human gene editing therapies are OK in certain cases, panel advises (Science News)
https://www.sciencenews.org/article/human-gene-editing-therapies-are-ok-certain-cases-panel-advises
✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️واکنش های رسانه ها به دستکاری ژنوم انسان
به تازگی من گزارش آکادمی ملی علوم آمریکا درباره دستکاری ژنوم انسان رو مطالعه کردl این گزارش درباره خیلی از مشکلات و چالش های علمی و اخلاقی در زمینه دستکاری ژن های انسانی اشاره کرده است گزارش آکادمی به صورت محتاطانه از دست کاری سلول های جنسی انسانی استقبال کرده بود اما در صورتی که این دستکاری ها به صورت شفاف ، تحت نظارت و در جهت منافع سلامت انسان صورت گیرد
از این رو من در اینجا من یک سری از واکنش های رسانه های جهانی را به این گزارش برای شما ارایه میدهم.
Human genome editing shouldn’t be used for enhancement – yet (New Scientist)
https://www.newscientist.com/article/2121264-human-genome-editing-shouldnt-be-used-for-enhancement-yet/
With stringent oversight, heritable human genome editing could be allowed (Science Daily)
https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170214130539.htm
Genome-edited humans get green light from expert panel (Ars Technica)
https://arstechnica.com/science/2017/02/science-experts-endorse-genetically-editing-humans/
US scientists back gene editing but warn against ‘designer babies’ (Telegraph)
http://www.telegraph.co.uk/science/2017/02/14/us-scientists-back-gene-editing-warn-against-designer-babies/
CRISPR should be used to combat disease, not make designer babies (yet) (Wired)
http://www.wired.co.uk/article/crispr-disease-designer-babies-regulations
No red line against CRISPR’ing early embryos, experts rule (STAT)
https://www.statnews.com/2017/02/14/national-academy-crispr-report/
US panel gives yellow light to human embryo editing (Science)
http://www.sciencemag.org/news/2017/02/us-panel-gives-yellow-light-human-embryo-editing
Review favours human gene editing under stringent conditions (Financial Times)http://www.sciencemag.org/news/2017/02/us-panel-gives-yellow-light-human-embryo-editing
Germline gene editing should be allowed – in certain cases (BioWorld Online)
http://www.bioworld.com/content/germline-gene-editing-should-be-allowed-%E2%80%93-certain-cases
Human Gene Editing Receives Science Panel’s Support (New York Times)
https://www.nytimes.com/2017/02/14/health/human-gene-editing-panel.html
Ethicists advise caution in applying CRISPR gene editing to humans (Washington Post)
https://www.washingtonpost.com/news/speaking-of-science/wp/2017/02/14/ethicists-advise-caution-in-applying-crispr-gene-editing-to-humans/
Human gene editing therapies are OK in certain cases, panel advises (Science News)
https://www.sciencenews.org/article/human-gene-editing-therapies-are-ok-certain-cases-panel-advises
✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/csD8Ka
✍️لیست تعدادی ازمجلات مهم در زمینه بیوانفورماتیک و زیست شناسی محاسباتی را خدمتتان ارایه میدهم.
▪️Name Impact Factor
▫️Bioinformatics IF=5.766
▫️BMC Bioinformatics IF=2.435
▫️BMC Systems Biology IF=3.150
▫️Briefings in Bioinformatics IF=8.399
▫️Computational Biology and Chemistry IF=1.014
▫️Computers in Biology and Medicine IF=1.521
▫️Current Bioinformatics IF=0.770
▫️Evolutionary Bioinformatics IF=1.404
▫️Genome Biology IF=11.313
▫️Genome Research IF=11.351
▫️Journal of Computational Biology IF=1.537
▫️Journal of Biomedical Informatics IF=2.447
▫️Journal of Bioinformatics and Computational Biology IF=0.931
▫️Molecular Systems Biology IF=10.872
▫️Microbiome IF=9.000
▫️Nature Genetics IF=31.616
▫️Nature Reviews Genetics IF=35.898
▫️Nucleic Acids Research IF=9.202
▫️PLOS Computational Biology IF=4.587
▫️PLOS Genetics IF=6.661
▫️Scientific Reports IF=5.228
✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️لیست تعدادی ازمجلات مهم در زمینه بیوانفورماتیک و زیست شناسی محاسباتی را خدمتتان ارایه میدهم.
▪️Name Impact Factor
▫️Bioinformatics IF=5.766
▫️BMC Bioinformatics IF=2.435
▫️BMC Systems Biology IF=3.150
▫️Briefings in Bioinformatics IF=8.399
▫️Computational Biology and Chemistry IF=1.014
▫️Computers in Biology and Medicine IF=1.521
▫️Current Bioinformatics IF=0.770
▫️Evolutionary Bioinformatics IF=1.404
▫️Genome Biology IF=11.313
▫️Genome Research IF=11.351
▫️Journal of Computational Biology IF=1.537
▫️Journal of Biomedical Informatics IF=2.447
▫️Journal of Bioinformatics and Computational Biology IF=0.931
▫️Molecular Systems Biology IF=10.872
▫️Microbiome IF=9.000
▫️Nature Genetics IF=31.616
▫️Nature Reviews Genetics IF=35.898
▫️Nucleic Acids Research IF=9.202
▫️PLOS Computational Biology IF=4.587
▫️PLOS Genetics IF=6.661
▫️Scientific Reports IF=5.228
✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️معرفی مقاله
مقاله ای در زمینه بررسی تنوع ژنتیکی برروی عملکرد و ساختار پروتئینی با بررسی بیش از صد ها پروتئین
مطالعه این مقاله را به دوستان علاقه مند پیشنهاد میکنم👇👇
✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
مقاله ای در زمینه بررسی تنوع ژنتیکی برروی عملکرد و ساختار پروتئینی با بررسی بیش از صد ها پروتئین
مطالعه این مقاله را به دوستان علاقه مند پیشنهاد میکنم👇👇
✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
2017_Impact_of_genetic_variation.pdf
3.4 MB
📝 Impact of genetic variation on three dimensional structure and function of proteins
✒️ Author: A. Prlić
⏳ Year: 2017
✨ #variation #Protein
🌐 www.ParsSilico.com
@practicalbioinformatics
✒️ Author: A. Prlić
⏳ Year: 2017
✨ #variation #Protein
🌐 www.ParsSilico.com
@practicalbioinformatics
goo.gl/UHzJJX
🔔 وبینار رایگان Upcoming Webinar
💎با موضوع :معرفی آموزش ابزارWebMeV جهت انالیز داده های RNA-Seq
Public RNA-Seq Data Analysis using WebMeV
📢 توضیح :
In this tutorial, we will demonstrate the followings:
▫️ How to upload private data and perform RNASeq analysis on WebMeV
▫️How to pull level 3 TCGA data and use clinical data to stratify the cohort
▫️How to perform complex set operation to create trait specific cohorts
▫️Use WebMeV to perform RNASeq analysis and explore high dimensional data
▫️Use WebMeV to perform unsupervised RNASeq analysis
▫️How to pull GEO data sets directly from GEO
🏆مجری برگزاری: The Center for Cancer Computational Biology
🕘 جمعه 18 فروردین ماه ساعت 18:30 الی 19:30
🌐 لینک ثبت نام goo.gl/uw1BZ8
✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔 وبینار رایگان Upcoming Webinar
💎با موضوع :معرفی آموزش ابزارWebMeV جهت انالیز داده های RNA-Seq
Public RNA-Seq Data Analysis using WebMeV
📢 توضیح :
In this tutorial, we will demonstrate the followings:
▫️ How to upload private data and perform RNASeq analysis on WebMeV
▫️How to pull level 3 TCGA data and use clinical data to stratify the cohort
▫️How to perform complex set operation to create trait specific cohorts
▫️Use WebMeV to perform RNASeq analysis and explore high dimensional data
▫️Use WebMeV to perform unsupervised RNASeq analysis
▫️How to pull GEO data sets directly from GEO
🏆مجری برگزاری: The Center for Cancer Computational Biology
🕘 جمعه 18 فروردین ماه ساعت 18:30 الی 19:30
🌐 لینک ثبت نام goo.gl/uw1BZ8
✔️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/vWAuah
🔔موقعیت شغلی
✍️متخصص بیوانفورماتیک
محل:شیکاگو
دپارتمان بیوشیمی و ژنتیک مولکولی دانشگاه فاینبرگ به دنبال متخصصان بیوانفورماتیک می گردند که دارای توانایی انجام پروژه در زمینه های توالی یابی نسل جدید با استفاده از دیتاستهای ChIp-seq , RNA-seq و از این دست باشند.
🔍شرایط لازم :
دارا بودن مدرک دکترا و یا فوق لیسانس در رشته های بیوانفورماتیک، ریاضات زیستی و علوم کامپیوتر با پیش زمینه زیستی
داشتن مهارت کافی در لینوکس R, پایتون و یا پرل
و..
اطلاعات بیشتر:
goo.gl/CRlHV5
✔️عضویت در کانال پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔موقعیت شغلی
✍️متخصص بیوانفورماتیک
محل:شیکاگو
دپارتمان بیوشیمی و ژنتیک مولکولی دانشگاه فاینبرگ به دنبال متخصصان بیوانفورماتیک می گردند که دارای توانایی انجام پروژه در زمینه های توالی یابی نسل جدید با استفاده از دیتاستهای ChIp-seq , RNA-seq و از این دست باشند.
🔍شرایط لازم :
دارا بودن مدرک دکترا و یا فوق لیسانس در رشته های بیوانفورماتیک، ریاضات زیستی و علوم کامپیوتر با پیش زمینه زیستی
داشتن مهارت کافی در لینوکس R, پایتون و یا پرل
و..
اطلاعات بیشتر:
goo.gl/CRlHV5
✔️عضویت در کانال پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/NmrHGf
✍️برنامه ی ژنوم قطر، کنسرسیوم تحقیقاتی خود را آغاز کرد.
13 مارچ 2017، بیش از 90 محقق ژنومیکس دور هم جمع شدند تا در کنسرسیوم تحقیقاتی برنامه ی ژنوم قطر (QGP) مشارکت کنند. این کنسرسیوم تازه ترین اقدام از مجموعه تلاش های QGP برای بهره برداری از "پزشکی دقیق" است.
این محققان در این کنسرسیوم، نمایندگان چندین موسسه در قطر از جمله QGP، بیوبانک قطر، مرکز تحقیقاتی و بالینی السدرة، شرکت تعاونی پزشکی حماد، انستستو مطالعات پزشکی قطر، موسسه ی پزشکی ویل کرنل شعبه ی قطر، موسسه ی تحقیقات محاسباتی قطر و دانشگاه قطر هستند. بسیاری از این محققان دارای همکارانی در بسیاری از نقاط جهان هستند.
اسما الثانی مدیر برنامه ژنوم قطر و رییس بیوبانک قطر می گوید: "افتتاح این کنسرسیوم تحقیقاتی گامی حیاتی در مسیر ما به سمت پزشکی دقیق است. با گرد هم آوری این تعداد محققان از موسسات گوناگون، ما در برنامه ژنوم قطر به هماهنگی یک پروژه ی ملی برای نقشه یابی ژنوم قطری ها کمک خواهیم کرد".
این پژوهشگران بر روی جستجوی مجموعه داده های عظیم ژنوتیپی و فنوتیپی که برای شناسایی ویژگی های کلیدی ژنوم قطری ها توسط دو موسسه ی بیوبانک قطر و QGP تولید خواهند شد، کار خواهند کرد. از این دانش در ایجاد و گسترش روش های درمانی فردمحور بیماری ها و نیز روش های پیشگیری استفاده خواهد شد .
🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️برنامه ی ژنوم قطر، کنسرسیوم تحقیقاتی خود را آغاز کرد.
13 مارچ 2017، بیش از 90 محقق ژنومیکس دور هم جمع شدند تا در کنسرسیوم تحقیقاتی برنامه ی ژنوم قطر (QGP) مشارکت کنند. این کنسرسیوم تازه ترین اقدام از مجموعه تلاش های QGP برای بهره برداری از "پزشکی دقیق" است.
این محققان در این کنسرسیوم، نمایندگان چندین موسسه در قطر از جمله QGP، بیوبانک قطر، مرکز تحقیقاتی و بالینی السدرة، شرکت تعاونی پزشکی حماد، انستستو مطالعات پزشکی قطر، موسسه ی پزشکی ویل کرنل شعبه ی قطر، موسسه ی تحقیقات محاسباتی قطر و دانشگاه قطر هستند. بسیاری از این محققان دارای همکارانی در بسیاری از نقاط جهان هستند.
اسما الثانی مدیر برنامه ژنوم قطر و رییس بیوبانک قطر می گوید: "افتتاح این کنسرسیوم تحقیقاتی گامی حیاتی در مسیر ما به سمت پزشکی دقیق است. با گرد هم آوری این تعداد محققان از موسسات گوناگون، ما در برنامه ژنوم قطر به هماهنگی یک پروژه ی ملی برای نقشه یابی ژنوم قطری ها کمک خواهیم کرد".
این پژوهشگران بر روی جستجوی مجموعه داده های عظیم ژنوتیپی و فنوتیپی که برای شناسایی ویژگی های کلیدی ژنوم قطری ها توسط دو موسسه ی بیوبانک قطر و QGP تولید خواهند شد، کار خواهند کرد. از این دانش در ایجاد و گسترش روش های درمانی فردمحور بیماری ها و نیز روش های پیشگیری استفاده خواهد شد .
🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📢دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی با همکاری پارس سیلیکو برگزار می کند:
▫️کارگاه های بهار
⏱اردیبهشت ماه
▫️کارگاه های بیوانفورماتیک، طراحی دارو
🎁با تخفیف های ویژه
ParsSilico.com
@practicalbioinformatics
▫️کارگاه های بهار
⏱اردیبهشت ماه
▫️کارگاه های بیوانفورماتیک، طراحی دارو
🎁با تخفیف های ویژه
ParsSilico.com
@practicalbioinformatics