Последние новости из жизни команды MagnyCell:


🧬НАУКА
Мы наконец-таки отобрали три главных гена синтеза магнитосом и собрали первые генетические конструкции. Также мы пообщались с Денисом Груздевым - ученым-экспертом в области магниточувствительных бактерий, работающим в Колумбии. Он рассказал нам о тонкостях и «подводных камнях» лабораторной работы в области магнитогенетики.

📈РАЗВИТИЕ СТАРТАПА
Наш стартап активно ищет финансирование. В ближайшее время мы планируем запустить Бумстартер.
Также мы приняли участие в проектно-образовательном интенсиве “Архипелаг 2022”. В ходе интенсива мы прошли несколько питч-сессии, пообщались с финансовыми экспертами и получили много информации о привлечении инвестиций в биотехе.

📚НАУЧ-ПОП
Наша команды выступила этим летом на фестивале “Бессонница” и на Geek Picnic с тремя лекциями. Мы также провели несколько научно-популярных экспериментов для детей и взрослых. Маленьким детям предлагалось сделать магнитного лизуна и магнитную икру, а взрослым поучаствовать в биологической викторине и социальном опросе про ГМО. Всем желающим показали настоящие дозаторы из биологической лаборатории и научили ими пользоваться. Помимо этого, наш научный руководитель Илья Зубарев прочитал лекцию “Глаза и уши клетки: Как мы воспринимаем мир” на @SBERLOGABIG. С записью лекции можно ознакомиться здесь.

🎥ВИДЕО-ВИЗИТКА
Мы наконец-то закончили монтировать нашу видео-визитку. В ближайшее время вы сможете увидеть ее в этой группе.

А пока делимся с вами воспоминаниями с «Бессонницы»)

Всем привет, на связи снова команда MagnyCell!

Съемки, обработка и монтаж закончены, замечания и предложения учтены, изменения и корректировки внесены.

А что это значит❓

Мы готовы презентовать вам свою видео-визитку!

В ней мы отвечаем на главные вопросы:
✔️ Кто мы такие?
✔️ Чем мы занимаемся сейчас и чем планируем заниматься в будущем?
✔️ В чем актуальность нашего проекта?

Подготовка, сам процесс съемки и постпродакшн получились крайне увлекательными.
Помимо основной пользы - получения визитки - эти мероприятия очень поспособствовали сплочению команды!)

Поэтому мы выражаем огромную признательность каждому, кто приложил руку к созданию данного видео, а также большая благодарность нашему оператору-монтажеру Александру (@alexio_mr)!

Всем привет! На связи команда MagnyCell и её PI Зубарев Илья.
Мы решили обновить формат наших соцсетей. Теперь они будут идти в виде блога о проекте и некоторых организационных постов.
Давайте немного обо мне. Примерно три года назад я пришёл в науку, проработав до этого как исполнитель на разных проектах. Я занимался гистологией и клеточной биологией, с детства было хобби электронная микроскопия.
Сейчас мои проекты связаны с изучением внутриклеточной сигнализации эукариотических клеток и с разработкой новых технологий в биологии.
Идея нашего проекта MagnyCell появилась у меня давно и я не первый человек, кто думал про возможность сделать магниточувствительные клетки.
Это красивая идея, что мы можем поднести магнит к клетке, она почувствует магнитное поле и отреагирует на него.
Есть несколько способов приобрести магниточувствительность и в следующих публикациях я о них расскажу.

Всем привет! На связи Илья Зубарев и команда MagnyCell!
Сегодня суббота 3 сентября, а значит многие из вас перелистнули календарь и почувствовали осень на улице. Местами сыро, холодно, ветер. Всё это мы воспринимаем нашими рецеторами тепла и механочувствительности. А что же с восприятием магнитного поля? Есть же железо в наших эритроцитах, почему поднося магнит мы не примагничиваемся? Конечно, всё дело в форме этого железа, даже ионы железа могут реагировать на магнитные поля, но реакция эта очень слабая. Только однодомные магнитные частицы могут реагировать на магнитное поле. В некоторых статьях (см фото к посту) было показано, что эти магнитные наночастицы могут накапливаться в мозге человека и вызывать различные нарушения.

Почему в нормальном состоянии не образуются магнитные наночастицы в организме человека?
На это есть несколько причин. Такая наночастица железа должна быть спрятана в биологическую мембрану иначе клетку повредят активные формы кислорода, образуемые наночастицей. Такой способности у клетки нет и всё железо откладывается в цитозоле.
И даже если предположить, что нет принципиальных ограничений и в некоторых клетках человека появятся магнитные наночастицы то возникает вопрос зачем это всё. С точки зрения эволюции отбор не поддерживал бы способность чувствовать магнитное поле. Мы не птицы, которым нужно регулярно мигрировать и не бактерии, которые живут рядом с магнитными рудами и нуждаются в них. Возможно только в железном веке способность искать железные руды нам пошла бы на пользу, но если верить истории мы справились и без этого.

Всем привет! На связи Илья Зубарев и команда MagnyCell!

Вы слышали про магниторецепцию у птиц, моллюсков, насекомых, летучих мышей и даже человека.
Есть мнение, что в основе такой магниторецепции могут лежать белки криптохромы или магнитные наночастицы магнетита.
Основная проблема всех этих исследований - невоспроизводимость результатов. Самой значительной проблемой, которая влияет на верификацию магнитного чувств у животных является то, что, несмотря на более чем 40 лет исследований явления магниторецепции, всё ещё не был идентифицирован сенсорный рецептор, способный чувствовать слабое магнитное поле Земли.

Для моллюска Tochuina tetraquetra был сконструирован лабиринт, в котором учёные определили направление миграции особей. При изменении внешнего магнитного поля у этих моллюсков не менялась направление миграции, что ставит под сомнение их магниторецепцию. Дальнейшая работа с особями Tochuina не смогла идентифицировать нейроны, которые бы проявили быстрые изменения в своей работе, как результат влияния магнитных полей на них.

Есть серия работ по магниторецепции у плодовой мухи Drosophila melanogaster, в которых показана роль криптохромов в восприятии магнитного поля (в 5 Гс — в 10 раз больше, чем магнитное поле Земли). Но до сих пор остается невыясненным, каким образом криптохромы делают магниторецепцию возможной. Дрозофилы не проявили способности реагировать на значительно более слабое земное магнитное поле.

В клювах ряда птиц был обнаружены наночастицы магнетита, вероятно, как орган магниточувствительности. Однако не нашлось доказательств того, что магнетит, размещённый в клювах голубей, может каким-то образом реагировать на столь слабое магнитное поле, каким является земное.

В многочисленных экспериментах, которые проводились с целью исследования магниторецепции, учёные использовали магнитные поля более мощные, чем магнитное поле Земли. И во многих таких исследованиях не было выявлена чёткая связь между реакцией животных и наличием магнитного поля.

Основной вопрос том, что такие рецепторы должны находиться в малой области мозга и через специальные магнитные сенсоры воспринимать поле. Сегодня, исследователи могут сами сконструировать клетки с нужными синтетическими рецепторами и регулировать их активность магнитным полем. Какие условия для этого нужны и что было сделано я расскажу в следующих постах.

Всем привет! На связи Илья Зубарев и команда MagnyCell!

Я хотел бы подойти к рассказам как формируются магнитосомы у бактерий, что уже сделано в магнитогенетике, почему она не работает и какие условия нужны для того, чтобы она заработала. Но всё нет возможности собраться и написать серию постов.

Сегодня я хотел бы сказать про ортогональную биологию и синтетические рецепторные белки. Это свежее направление в синтетической биологии, разрабатывающее изменённые рецепторы. Такие рецепторы могут воспринимать небиологические сигналы (типа тех веществ, которые наш организм не способен воспринимать). Иногда такие рецепторы состоят из нескольких частей, как из различных кубиков Лего и могут воспринимать обычный сигнал, но вызывать совершенно новый эффект в клетках.
Например, для интерлейкина 2 были сделаны синтетическая пара: только эта пара могла взаимодействовать друг с другом.
Представьте, что от тополиного пуха у вас была бы не только аллергия, но и менялся уровень гормонов, менялась бы обоняние или что-то ещё)))
Или валерьянка внезапно повышала бы потенцию.
Зачем это нужно? Такие синтетические рецепторы могут контролируемо активировать определённый сигнальный путь и гены без активации других путей. Например, рецепторы инсулина есть на многих клетках организма, но можно попробовать сконструировать такие рецепторы, которые тканеспецифично вызывали бы изменённый ответ на инсулин. И так можно сделать с любым сигналом и путём, идущим в геном. Таким образом в перспективе можно будет лечить заболевания, связанные с сигнальными путями, корректируя нарушения передачи сигнала. Или приобретать способность чувствовать новые запахи, например. Мы все слышали о собаках, которые отлично ищут наркотики, а представьте что они смогут искать вообще любое вещество через синтетический рецептор?
В магнитогенетике мы тоже конструируем искусственный сигнальный путь, но меняем мы не рецептор, а добавляем нового участника - магнитосому. С помощью неё мы сможем регулировать передачу сигналов и, как следствие, активность генов.

Сегодня в 19:00 по Москве

🚀 @SBERLOGABIO online seminar on biology:
👨‍🔬 А. Латыпова, И. Зубарев «Магниточувствительность клеток»
⌚️ Пятница 09 сентября, 18.00 по Москве

Слышали ли вы о магниточувствительности? О том, как птицы и муравьи ориентируются по силовым линиям магнитного поля Земли? Может быть, вы даже подозреваете, что на ваше самочувствие влияют магнитные бури? На нашей лекции вы узнаете, как научное сообщество рассматривает феномен магниточувствительности и какие организмы обладают общепризнанной способностью воспринимать магнитное поле. Мы расскажем, как сообщить клетке такую способность, а также как использовать это для исследовательских целей.

Докладчики: Анастасия Латыпова - студентка МФТИ, Физтех-школа биологической и медицинской физики
Зубарев Илья - научный сотрудник лаборатории молекулярной эндокринологии МГУ, лаборатории регуляции клеточной сигнализации МФТИ

Add to Google calendar

Зум линк будет доступен в канале https://t.me/sberlogabig перед началом доклада.

Для тех, кто пропустил )

https://youtu.be/v89TH2bbd2c

Всем привет! На связи Илья Зубарев и команда MagnyCell!

Во многих исследованиях в области магнитогенетики использовались магнитные поля с магнитными наночастицами (МНЧ), прикрепленными к клеточной мембране или к определенному белку, для приложения механической силы и преобразования механического стимула в биохимический сигнал. В этих статьях было показано, что МНЧ в сочетании с магнитными полями обладают способностью регулировать клеточную активность с помощью нескольких механизмов: механических сил, активации рецепторов путем регулируемой олигомеризации или тепловых эффектов.
Такие частицы могут локалтно тянуть белки, открывая ионные каналы, локально разогревать белок, изменяя его конформацию, а в некоторых случаях вращаться вдоль своей оси, также меняя конформацию белков. Мишенью таких наночастиц как правило становятся механочувствительные или термочувствительные белки. С ними всё понятно и в целом получается неплохо регулировать их активность магнитным полем.
Фундаментальным вопросом и вызовом магнитогенетики является то, насколько универсальным этот инструмент может быть. Можно ли в результате локального нагрева и деформаций активировать любой рецептор и сигнальный путь?
Есть работы, в которых через магнитные наночастицы димеризовали рецепторы к инсулину. Есть единичные упоминания и про другие тирозинкиназы.
Если мы покажем универсальность такого подхода для многих белков это откроет огромные возможности и для науки и для биотехнологий.

Всем привет! На связи Илья Зубарев и команда MagnyCell!

Есть ряд статей с прекрасным разбором магнитогенетики и её критикой и в них озвучены две интересные проблемы. Все воспроизводимые результаты в магнитогенетике получены на наночастицах с диаметром от 20 нм. Было несколько статей в Природе, в которых утверждалось, что возможно использовать железосодержащие белки, типа ферритина, для магнитогенетики. Однако теоритические расчёты и эксперименты показывают, что расположение и количество атомов железа в таких белках не достаточно для механической или термической стимуляции рецептора/ионного канала. При этом эти отличия весьма существенные, на несколько порядков.
Но если предположить, что мы работаем с крупной наночастицей, в которой сотни тысяч атомов железа обеспечивают её магнитные свойства, возникает несколько другая проблема. Активация клеток в магнитном поле происходит в сотни раз медленнее, чем активация светочувствительных белков светом (0,5 секунды против 0,005 секунды).

В недавней статье этот предел был преодолён и учёные смогли сделать магнитоуправляемых мушек дрозофил. В магнитном поле такие мушки меняли поведение и подвижность.
На картинке мухи, пляшущие под действием магнита))

https://www.nature.com/articles/s41563-022-01281-7

Всем привет! На связи Илья Зубарев и команда MagnyCell!

Совсем недавно вышла одна интересная статья про криптохромы. Я писал, что эти белки связывают с магниторецепцией, а в статье рассматривают ещё одну роль этих молекул.
Авторы статьи https://www.nature.com/articles/s41467-022-32562-z утверждают, что криптохромы могут реагировать на фазы луны. Вот оно что! Фазы луны определяют поведение разных животных, их желание размножаться и мигрировать. В дни полнолуния у некоторых животных происходит пик их половой активности.
При чём здесь луна? Рецептор света L-криптохром (L-Cry) различает разную продолжительность лунного света, а также солнечный и лунный свет.
Тот случай, когда можно понять, через какие белки лунная призма даёт силу.
Но к восприятию магнитного поля земли такие белки не имеют никакого отношения.

Всем привет! На связи Илья Зубарев и команда MagnyCell!

Чего только не придумают люди. Магнитоуправляемые микророботы? Почему бы и нет!
Это же лучше, чем робот как в фильме матрица, которого доставали из главного героя! Как пишут авторы статьи (https://link.springer.com/article/10.1007/s10544-021-00590-z), микророботы, изготовленные из мягких материалов, обладают удивительными характеристиками и большим потенциалом для применения, например, в малоинвазивной хирургии. Материалы таких роботов могут быть разными (гели, полимеры), но общей характеристикой является мягкость и способность реагировать на магнитное поле. А что, берёшь робота, и он что-то делает, ещё и контролируется магнитным полем. Проблема в том, что для таких роботов нужно энергоснабжение и хорошая управляемость. Как всегда в подобных статьях говорится о таргетной терапии, использовании их для хирургических операций и даже восстановления окружающей среды.
Проблема подобных прорывных ультрасовременных перспективных нанобиотехнологий в том, что они не идут дальше красивой идеи в статьях. Об этом пишут уже лет 30, много чего сделали, а на практике ничего не используется.

С одной стороны это удобная позиция самих исследователей, когда вы занимаетесь хайповой темой и получаете большое финансирование. Каждый раз вы говорите что вы вот вот совершите очередной прорыв и опубликуете передовые статьи. В такой ситуации не обязательно доводить что-то до «продукта», достаточно предлагать красивые идеи.

Но, что более важно, в нашем организме работают биологические законы и без их понимания невозможно правильно взаимодействовать с живыми клетками. Всё, что работает внутри нас, должно работать по нашим правилам.
В этом отношении мы можем брать подсказки у самой жизни во всём её многообразии.

Всем привет! На связи Илья Зубарев и команда MagnyCell!

👀
В некоторой части своей работы я сталкивался с подходом, который называется биомимикрия (bioinspiration). В этой концепции предполагается, что живые организмы за миллионы лет эволюции приобрели различные свойства, на основе которых человек может сделать новые технологии. Крыло стрекозы супергидрофобно, в крыльях бабочек есть фотонные кристаллы, микроструктуры на коже акул делают её максимально пригодной для плавания и тд. На основе таких «биологических изобретений» учёные разрабатывают гидрофобные покрытия, солнечные панели, «умные предметы». Вы возможно видели в интернете ролики как человека в супергидрофобной одежде поливают грязью и он остаётся чистым - всё с него стекает.
Это всё здорово, но в биологии кроме самих подобных приспособлений есть возможность их обновления. Так, те же гекконы регулярно линяют, тогда как «умное покрытие» статично и обновляться не может. Именно поэтому через несколько стирок вещи, которые были супергидрофобны- теряют свои свойства. Эти применения всё про материаловедение.
Но другой аспект биомимикрии нашёл применение в биоинженерии и биотехнологиях. Использование живых систем для живого даёт возможность менять и регулировать многие биологические процессы. Редактировать ДНК, вставлять фрагменты генов, создавать химерные молекулы и тд. Но и здесь нужно понимать правила, по которым работает человек. Доходит до того, что для регенерации тканей, в том числе костной, используют чайный гриб, паутину, кораллы, шёлк, траву или что-то ещё. И каждый исследователь говорит, что именно его чайный 🍄 можно использовать для заживления ран. Прежде чем использовать что-либо, нужно понимать как работает биологический процесс, по каким правилам. При желании можно вырастить клетки на кусочке сыра (и такие статьи есть https://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/2017/ra/c7ra02146a), но у него есть лучшее гастрономическое применение)

Или даже комбо: сыр (казеин) + шёлк https://www.researchgate.net/publication/337246965_Incorporation_of_SPION-casein_core-shells_into_silk-fibroin_nanofibers_for_cardiac_tissue_engineering

Магнитосомы это тоже про биомимикрию, когда идею от бактерий мы хотим перенести в клетки животных. Подробнее про это я расскажу в следующий раз.