🔍 ارتباط بین MicroRNome با عفونت زایی SARS-CoV
🌐همانطور که می‌دانیم SARS-CoV نزدیک‌ترین ویروس به COVID-19 هست به طوری که در حال حاضر از ویروس کرونا جدید در مقالات با عنوان SARS-CoV2 یاد می‌کنند. بنابراین بررسی مطالعات انجام شده بر روی SARS-CoV به شناخت هرچه بهتر ما نسبت به SARS-CoV2 کمک خواهد کرد. در این مقاله با بررسی و تحلیل MicroRNome به پایه و اساس مولکولی عفونت زایی SARS-CoV در سلول‌های بنیادین برونشوآلوئولار پرداخته شده است.

🔖سندروم شدید حاد تنفسی (SARS) توسط کروناویروس سارس (SARS-CoV) ایجاد می‌شود که میزان قابل توجهی از مرگ را در پی دارد. یکی از ویژگی‌های بالینی معمول در ارتباط با SARS-CoV فیبروز ریوی و به دنبال آن نارسایی ریه است. اگر چه بعد از پاندمی SARS-CoV پیشرفت‌های قابل توجهی در جهت شناخت این ویروس و مکانیسم‌های بسیار موثر در میانکنش آن با سلول میزبان در هنگام شروع عفونت انجام شده است، اما همچنان یک حفره بزرگ در دانش ما درمورد نحوه ورود این ویروس به سلول و جزئیات میانکنش آن با سلول میزبان وجود دارد. تغییر سریع ژنوم ویروسی عامل دیگری است که پاسخ به این پرسش‌ها را دو چندان سخت‌تر می کند. این مقاله بر روی یک مفهوم جدید تحت عنوان میانکنش‌های ویروس-سلولِ میزبان به وسیله‌ی میانجی گری microRNAها تمرکز کرده است. این مطالعه شامل تحلیل داده‌های miRNA array، پیشگویی هدف و همچنین آنالیز miRNA-mRNA enrichment می‌باشد که در نهایت منجر به ترسیم یک نقشه میانکنش پیچیده میان فاکتورهای مرتبط با بیماری، miRNAها و BASC در مسیر SARS می شود. داشتن چنین نقشه‌ای از میانکنش‌ها منجر به یافتن مارکرهای تشخیصی می‌شود که در مشاهده‌ی کلی تعامل‌های ایجاد شده برای پیشرفت بیماری مفید خواهد بود.

ادامه‌ی مطلب....

📝تعداد کلمات: ۲۶۱
⏰زمان مطالعه: کمتر از دو دقیقه

📝 تهیه و تنظیم: #غزاله_فهیمیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
ncbi

📝 تهیه و تنظیم: #یاسمین_کیانیان دانشجوی دکتری #شیمی_آلی_محاسباتی دانشگاه تربیت مدرس

سه‌شنبه‌ها: #موقعیت_شغلی

جهت اطلاع از ساعات کاری، مهارت های مورد نیاز و آخرین مهلت ارسال مدارک به سایت کدکول مراجعه کنید.

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🎯زیست شناسی سرطان

👨‍🏫مدرس:دکتر صادق باباشاه (عضو هیئت علمی گروه ژنتیک دانشگاه تربیت مدرس)

💠ویژگی های دوره:
🔻آشنايي با مباني ژنتيك سرطان

🔻 آشنايي با مباني تكنيك هاي آزمايشگاهي ضروري در بيولوژي و پزشكي مولكولي

🔻 آشنايي با چالش هاي علمي در درمان سرطان و ايده سازي براي يك پروژه 

🔻 مباحث بصورت پروژه محور و در قالب مقاله تدريس مي شود. 

🌀 ساخت عینک هوشمند مقابله با Covid-19 توسط استارتاپ چینی راکید

🔍 یک استارتاپ چینی که محصولات واقعیت-افزوده برای استفاده درصنعت و بازی‌ها تولید می‌کند، در میان همه‌گیری کرونا فضا را برای طراحی عینکی که دما را حین حرکت اندازه گیری می‌کند مناسب یافته و اقدام به ساخت آن کرده است.
🖲 در راستای مقابله با شیوع Covid-19 در اواخر سال ۲۰۱۹، استارتاپ راکید در هانگجو عینکی را تولید کرد که به پیدا کردن علائم بیماری کمک می‌کند. مدیر ارشد راکید ژیانگ ونژی اظهار داشت که تقاضا برای عینک‌های T1 این کمپانی افزایش یافته، پس از آنکه تقریبا ۱۰۰۰ عینک که تنها در طول دو هفته تولید شده بود، به دولت‌ها، مراکز صنعتی و مدارس فروخته شد.
⌨ژیانگ اظهار داشت :"به جز اندازه گیری درجه حرارت در حالت ثابت، T1 دارای قابلیت چک کردن درجه حرارت از فاصله دور و در حال حرکت را دارد، که کمک بزرگی محسوب می‌شود."
📷 این عینک‌ها به سنسور مادون قرمز و دوربین مجهزند که به استفاده کننده امکان مشاهده درجه حرارت بدن افراد را می‌دهد.

ادامه‌ی مطلب...

📃تعداد کلمات: ۲۷۰
⏰زمان مطالعه: حدود دو دقیقه

تهیه و تنظیم: #الهام_افخمی دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهار شنبه‌ها: #اخبار_فناوری

📌منبع:
Gadgets

🦠💉 چه زمانی واکسن کرونا در دسترس عموم قرار خواهد گرفت؟

📝 ترجمه: #سارا_فیاض_زاده دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه ها: #فیلم

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

#طنز
از همینجاها شروع میشه... 🤫☠

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

چگونه سرورهای پیش‌نویس (preprint server) مانع از انتشار مطالعات ضعیف در رابطه با ویروس کُرُنا می‌شوند.


💻 زمانی‌که "بارابیسی" دانشمند محاسباتی دانشگاه نورث‌استرن، در بوستون ماساچوست، ماه گذشته مقاله‌ای را به سرور پیش‌نویس bioRxiv ارسال کرد با پاسخی غیرمنتظره از این سرور مواجه شد: bioRxiv دیگر نوشته‌هایی که در آن با روش‌های محاسباتی روش‌های درمانی بیماری COVID19 را پیش‌بینی می‌کنند، نمی‌پذیرد و پیشنهاد می‌کند که به جای ارسال مقاله به‌صورت پیش‌نویس، مطالعه خود را برای peer review به یک ژورنال ارسال کند.

از آنجایی که دانشمندان سراسر جهان برای مقابله با بحران بیماری  COVID19 تحقیقات خود را با سرعت بالایی پیش می‌برند، قواعد انتشار مقاله در موضوعات مرتبط با این همه‌گیری به سرعت در حال تغییر هستند. سرورهای پیش‌نویس – که دانشمندان دستنوشته‌های خود را قبل از peer review در آن قرار می‌دهند- با مطالعات زیادی پر گشته‌است. دو سرور معروف برای این بیماری bioRxiv و medRxiv حدود 3000 مطالعه در این مبحث را پست کرده‌اند.

معیارهای شایستگی واضح هستند: نتایج به سرعت قابل‌انتشار باشند، سیاست‌های بالقوه اطلاع‌رسانی و سرعت بخشیدن به پژوهش‌ها می‌توانند منجر به گسترش واکسن و روش‌های درمانی گردند. اما شهرت سرورهایی که این مطالعات را دریافت می‌کنند به شدت زیر ذره‌بین قرار گرفته است. بدون peer review بررسی کیفیت این کارها مشکل است، و به اشتراک‌گذاری مطالعات ضعیف می‌تواند مضر باشد، به‌ویژه زمانی‌که پژوهش اثر آنی بر روی فعالیت‌های پزشکی دارد. این امر موجب گشته است که پلتفرم‌های bioRxiv و medRxiv روندهای غربالگری معمول خود را ارتقاء بخشند.

ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: ۳۳۸
⏰زمان مطالعه: کمتر از دو دقیقه

شنبه‌ها: #علمی_اجتماعی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
nature

🔮💯سرمایه‌گذاری مطمئن روی یک زبان درست‼️

شما هم جزء آن دسته از برنامه‌نویسا 👨🏻‍💻و زیست شناسهایی 👩‍🔬هستین که تصمیم گرفتین در این فرصت قرنطینه یک زبان برنامه‌نوسی جدیدی رو یاد بگیرن ‼️ اگر مصمم شدین تا پایتون رو یاد بگیرن اما مطمئن نیستین 🤔 که چطوری باید اینکار رو شروع کنید، یه سر به ✨💠 مدرسه بهاره بیوانفورماتیک بزنید اونجا با بهترین 👨‍🏫 مدرسا این زبان رو یاد میگیری👌👌

رمز ذهن خارق‌العاده

دانلود کتاب

📝تهیه و تنظیم: #دانیال‌خدیوی
دانشجوی ارشد بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🦇چگونه خفاش‌ها بدون اینکه بیمار شوند ویروس کرونا را منتقل می‌کنند؟

💡تصور می‌شود خفاش‌ها منشا ویروس‌های کرونا مانند MERS، سندرم شدید تنفسی حاد (SARS) و اخیراً ویروس SARS-CoV-2 که باعث COVID-19 می‌شود، هستند. در حالیکه این ویروس‌ها می‌توانند باعث ایجاد بیماری‌های جدی و اغلب کشنده در انسان شوند، به دلایلی که به خوبی مشخص نیست، به خفاش‌ها آسیبی نمی‌رسانند.

📋تاکنون ویروس SARS-CoV-2 بیش از ۳.۵ میلیون نفر را در سرتاسر جهان آلوده کرده است و منجر به مرگ هفت درصد از مبتلایان شده است. ویروس MERS در سال ۲۰۱۲ نزدیک به ۲۵۰۰ نفر را آلوده کرد، اما از هر سه نفر، یک نفر جان خود را از دست داد. هیچ واکسنی برای SARS-CoV-2 یا MERS وجود ندارد.

🔬یک تیم تحقیقاتی نشان داده است هنگامی که خفاش‌ها در معرض ویروس MERS قرار می‌گیرند، سلول‌های خفاش پروتئین‌های التهابی که نشان دهنده‌ی بیماری است، تولید نمی‌کند بلکه با حفظ یک واکنش ضد ویروسی طبیعی و یک جهش در یک ژن از ویروس با هم سازگار می‌شوند.

🦠ویروس و خفاش به صورت سازگار با هم زندگی می‌کنند و ویروس بدون ضرر به مدت طولانی در بدن خفاش باقی می‌ماند تا زمانی که عوامل استرس‌زا این تعادل ظریف را از بین ببرد.

📚در گام بعدی این تیم تحقیقاتی روی درک چگونگی سازگاری ویروس MERS با خفاش در برابر عفونت و تکثیر در شتر و سلول‌های انسانی تمرکز خواهد کرد. این اطلاعات ممکن است برای پیش بینی ویروس خفاش بعدی که منجر به بیماری همه گیر خواهد شد، حیاتی باشد.

ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: ۴۴۰
⏰زمان مطالعه: حدود دو دقیقه

دوشنبه‌ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
nature

🧬🐧 بایو لینوکس🤔⁉️

آموزش 0⃣ تا 0⃣0⃣1⃣ کاربردی ترین سیستم عامل

🎯کاربرد لینوکس در :

🛠مهندسی پروتئین

📊 آنالیز بیان ژن

و ....

سه‌شنبه‌ها: #موقعیت_پسادکتری

جهت اطلاع از مهارت های مورد نیاز و مزایا این موقعیت به سایت کدکول مراجعه کنید.

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

فلز-مایع ساخته شد؛ جهش علمی در ساخت فضاپیماها و ربات‌ها


دانشمندان آنچه که به عنوان اولین شبکه فلزی مایع در جهان شناخته می‌شود را با استفاده از آلیاژهای مختلف ساخته‌اند.

محققان قبلاً یک سری نمونه‌های اولیه ساخته‌اند که ماده سازنده آن پس از گرم شدن تا نقطه ذوب دوباره به شکل اصلی خود باز می‌گردد. نمونه‌های اولیه شامل لانه زنبور و توپ فوتبال می‌باشد. با این حال، جذاب‌ترین آنها دستی است که با آب شدن فلز به آرامی باز می‌شود. آیا به زودی باید منتظر ترمیناتور باشیم؟!

این فلز-مایع جدید ممکن است برای ناسا یا سایر شرکت‌های فضایی مانند اسپیس ایکس بسیار مفید باشد. به گفته بسیاری از محققان نیز ساختن فضاپیمای بین سیاره‌ای با این فلز كاملاً منطقی به نظر می‌رسد. آن‌ها همچنین ذکر کرده اند که: "اگر فضاپیما در هنگام فرود بر روی ماه یا مریخ در اثر برخوردها صدمه‌ای ببیند، شما می‌توانید به راحتی بخش صدمه دیده را حرارت داده تا دوباره به شکل اولیه خود باز گردد."

برای خواندن ادامه‌ی مطلب به سایت کدکول مراجعه کنید.

🔖تعداد کلمه: کمتر از ۲۰۰
⏰زمان مطالعه: کمتر از دو دقیقه

چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری

📌منبع:
curiosmos

🎧 کتاب صوتی "آینده ذهن"

🔴 موضوع: رویاها

📝 صفحات 206 تا 214

🖋نویسنده: میچیو کاکو

پنجشنبه‌ها: #کتاب_صوتی

#آینده_ذهن
#میچیو_کاکو

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

💠منبع: کانال خوانش کتاب برای انسان خردمند
@Homosapiensfa💫

#طنز
وقتی نصف برنامه‌ات کپی پیسته! 🤦🏻‍♀

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

⌛️طول دوره 6 هفته

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

📜 با ارائه مدرک معتبر

🌀ظرفیت محدود

🐍مشاوره رایگان:

🆔 @codecool5

🔑چگونه دخانیات باعث تشدید سرطان می‌شود؟

📈امروزه سرطان یک مشکل قابل توجه در خاورمیانه و جمعیت جهانی است. ارتباط مستقیم بین استعمال دخانیات و سرطان به خوبی مشخص شده است.

🚬قرار گرفتن طولانی مدت در معرض دود دخانیات بر خطر ابتلا به سرطان می‌افزاید. عوامل سرطان زا در معرض دود دخانیات باعث آسیب DNA شده و نقش مهمی در سلامت افراد سیگاری، غیر سیگاری و در درجه اول کودکان دارند. سرطان نتیجه نقص‌های ژنومیک و اپی‌ژنمیک است که منجر به یک ناهنجاری اولیه می‌شود اما با عواقب نامطلوب سلامتی به پایان می‌رسد.

🔎علاوه بر آسیب و جهش DNA، دود دخانیات می‌تواند باعث تغییر در متیلاسیون DNA و بیان ژن در ارتباط با سرطان شود. از تغییرات ژنومیک و اپی‌ژنمیکی در ژن‌های مرتبط با سرطان می‌توان برای پیش‌بینی خطرات سرطان ناشی از قرار گرفتن در معرض دود سیگار، استفاده کرد.

📋بیوانفورماتیک ابزارهای ضروری را برای شناسایی ژن‌های بیان شده در افراد سیگاری فعال و غیر سیگاری فراهم می کند و می‌تواند به ایجاد چارچوبی برای مدیریت وقایع مرتبط با تکامل بیماری از جمله سرطان کمک کند.

ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: ۳۰۶
⏰زمان مطالعه: کمتر از دو دقیقه

📝 تهیه و تنظیم: #احمدرضا_رسولی دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه‌ها: #علمی_اجتماعی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
frontiers

ژنومیکس در ابر

دریافت کتاب

تهیه و تنظیم: #الهام_افخمی دانشجوی ارشد#بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه‌ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🌀 نقش احتمالی سلول‌های لنفوسیت T در مصونیت افراد نسبت به بیماری Covid-19

🔸 محققان در خون افرادی که از عفونت کروناویروس بهبود یافته‌اند، سلول‌های لنفوسیت T را یافتند که ویروس عامل بیماری COVID-19 را هدف قرار می‌دهند.

🔹 به گزارش این محققان، افرادی که هرگز در معرض ویروس کرونا قرار نگرفته‌اند، می‌توانند دارای سلول‌های T تشخیص دهنده این ویروس باشند.

🔸 این یافته نشان می‌دهد که عفونت‌های قبلی با سایر ویروس‌های کرونا، مانند آن‌هایی که باعث سرماخوردگی معمولی می‌شوند، می‌توانند مقداری حفاظت در برابر کروناویروس جدید را برای جلوگیری مردم از ابتلا به این بیماری فراهم کنند.

🔹 هنوز مشخص نیست که آیا این دفاع‌ها می‌توانند مردم را از عفونت با ویروس SARS-CoV-2 محافظت کنند و اگر چنین است تا چه مدت این حفاظت ادامه دارد.

🔖 نتایج این تحقیق به تازگی در مجله Cell منتشر شده است.

ادامه‌ی مطلب....

🔖 تعداد کلمات: ۵۵۰ کلمه
⏰ زمان مطالعه: حدود ۳ دقیقه

📝تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان
دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌 لینک مقاله:
Cell

🔍استفاده از ابر رایانه Summit
ساخت شرکت IBM در بهره‌مندی از روش‌های ارائه شده برای مبارزه با پاندامی کوید 19.

💻دانشمندان از قدرت عظیم ابر رایانه Summit در آزمایشگاه ملی Oak Ridge استفاده کرده‌اند تا از طریق میلیون‌ها مقاله و ژورنال پزشکی برای شناسایی واکسن‌ها، داروها و اقداماتی که می‌توانند در سرکوب یا متوقف کردن انتشار COVID-19 موثر باشند، استفاده کنند.

🔬 تیمی متشکل از محققان ORNL و Georgia Tech در حال استفاده از روش‌های هوش مصنوعی هستند که برای کشف اطلاعات مربوط به حدود ۱۸ میلیون اسناد تحقیقاتی موجود طراحی شده‌اند. آن‌ها به دنبال یافتن ارتباطات موثر بین ۸۴ میلیارد مفهوم، کلمات کلیدی و مرجع مرتبط با COVID-19 مانند تب بالا، سرفه خشک و تنگی نفس و راه حل‌های پزشکی موجود بودند.

🎤سرپرست تیم تحقیقاتی پروژه، هدف این تحقیقات را به صورت زیر بیان نمود:
"هدف ما کمک به توانایی پزشکان و محققان در شناسایی اطلاعات در مورد داروهای موثر است که قبلاً توسط دولت فدرال ایالات متحده تأیید شده‌اند."

بررسی یک زیر مجموعه عظیم از ۶ میلیون سند بین سال‌های ۲۰۱۰ تا ۲۰۱۵ هشتاد دقیقه و بررسی تمامی ۱۸ میلیون رکورد موجود در تمامی مجلات کمتر از یک روز به طول انجامید. تمامی نتایج برای بازخورد با محققان پزشکی به اشتراک گذاشته شد که راه را برای استفاده بهینه از دانش تولیدی در ادوار گذشته هموار می‌نماید.

ادامه‌ی مطلب...

📃تعداد کلمات: ۲۵۰
⏰زمان مطالعه: حدود دو دقیقه

تهیه و تنظیم: #پرهام_حاجی‌شفیع
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهار شنبه‌ها: #اخبار_فناوری

📌منبع :
scitechdaily

🛑آگهی استخدام🛑

💠در کنار بزرگان بیوانفورماتیک ایران بدرخش

📌بعد از گذراندن دوره با تدریس اساتید هیئت علمی دانشگاه تهران و تربیت مدرس

🔰در صورت کسب حداکثر نمره به همراه مصاحبه غیرحضوری و اعطای مدرک معتبر