Bioinformatics
📚برنامه نویسی پایتون برای زیست شناسی و بیوانفورماتیک و فراتر 📝تهیه و تنظیم: #مسلم_عسگری پژوهشگر حوزه #بیوانفورماتیک یکشنبه ها: #معرفی_کتاب #برنامه_نویسی ✅کانال بیوانفورماتیک ایران @iran_bioinformatics 💫
Tim_J_Stevens,_Wayne_Boucher_Python.pdf
7.7 MB
فایل #pdf کتاب "برنامه نویسی پایتون برای زیست شناسی و بیوانفورماتیک و فراتر"
#برنامه_نویسی
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
#برنامه_نویسی
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🌀ارائه ابزاری به نام BEST برای تجزیه و تحلیل الگوی بیان ژن سلولهای مغز
📝بینظمی در الگوهای بیان ژن در چندین اختلال روانی گزارش شده است. تحقیقات در حوزهی مکانیسم مولکولی روانپزشکی به دلیل دشوار بودن نمونهبرداری، به اطلاعات تحقیقات ژنتیکی متکی است. با استفاده از دادههای مرجع از مطالعات بیان ژن سلولهای مغز، آنالیز جامعی روی الگوهای بیان ژن در نتایج ژنتیکی روانپزشکی انجام شده است.
این الگوی بیان مکانی- زمانی، شواهدی در بعضی از مناطق مغز ارائه میدهد و نشان دهندهی مراحل رشد و مسیرهای مولکولی است که احتمالاً در آسیب روانی درگیر هستند.
در حال حاضر، ابزار آنلاینی برای تجزیه و تحلیل سیستماتیک این گونه از دادهها وجود ندارد، که مانع استفاده از آنالیز داده ها توسط محققان غیر انفورماتیک مانند زیست شناسان آزمایشگاهی و زیست شناسان مولکولی بالینی می شود.
💻 در این مقاله یک وب سرور جهت تجزیه و تحلیل الگوی بیان ژن سلول های مغز در سطح زمان-مکان را توسعه دادهشده است.
این تحقیقات کمک می کند تا ارتباطی بین مطالعات ژنتیکی و مکانیسم بیماری پیدا شود، ایجاد سرنخ هایی برای شناسایی ژن های کلیدی و سیستم مولکولی فراهم می کند و تجزیه و تحلیل مربوط به منطقهی حساس به بیماری در مغز و مرحله بیماری را پشتیبانی می کند.
📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعیپور
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبهها: #مقاله
📌برای مطالعه بشتر به سایت کدکول مراجعه کنید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5164
📝تعداد کلمات: ۳۴۰
⏰زمان مطالعه: کمتر از ۲ دقیقه
📌منبع:
https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-019-3222-6
📝بینظمی در الگوهای بیان ژن در چندین اختلال روانی گزارش شده است. تحقیقات در حوزهی مکانیسم مولکولی روانپزشکی به دلیل دشوار بودن نمونهبرداری، به اطلاعات تحقیقات ژنتیکی متکی است. با استفاده از دادههای مرجع از مطالعات بیان ژن سلولهای مغز، آنالیز جامعی روی الگوهای بیان ژن در نتایج ژنتیکی روانپزشکی انجام شده است.
این الگوی بیان مکانی- زمانی، شواهدی در بعضی از مناطق مغز ارائه میدهد و نشان دهندهی مراحل رشد و مسیرهای مولکولی است که احتمالاً در آسیب روانی درگیر هستند.
در حال حاضر، ابزار آنلاینی برای تجزیه و تحلیل سیستماتیک این گونه از دادهها وجود ندارد، که مانع استفاده از آنالیز داده ها توسط محققان غیر انفورماتیک مانند زیست شناسان آزمایشگاهی و زیست شناسان مولکولی بالینی می شود.
💻 در این مقاله یک وب سرور جهت تجزیه و تحلیل الگوی بیان ژن سلول های مغز در سطح زمان-مکان را توسعه دادهشده است.
این تحقیقات کمک می کند تا ارتباطی بین مطالعات ژنتیکی و مکانیسم بیماری پیدا شود، ایجاد سرنخ هایی برای شناسایی ژن های کلیدی و سیستم مولکولی فراهم می کند و تجزیه و تحلیل مربوط به منطقهی حساس به بیماری در مغز و مرحله بیماری را پشتیبانی می کند.
📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعیپور
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبهها: #مقاله
📌برای مطالعه بشتر به سایت کدکول مراجعه کنید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5164
📝تعداد کلمات: ۳۴۰
⏰زمان مطالعه: کمتر از ۲ دقیقه
📌منبع:
https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-019-3222-6
📝 تهیه و تنظیم: #یاسمین_کیانیان دانشجوی دکتری #شیمی_آلی_محاسباتی دانشگاه تربیت مدرس
سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_شغلی
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📌 منبع:
https://www.nature.com/naturecareers/job/bioinformaticsdata-scientist-channing-division-of-network-medicine-bwh-713519
💬مشاوره موقعیت شغلی:
https://instagram.com/codecool_bioinformatics?igshid=18sf4fvz6g1z6
سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_شغلی
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📌 منبع:
https://www.nature.com/naturecareers/job/bioinformaticsdata-scientist-channing-division-of-network-medicine-bwh-713519
💬مشاوره موقعیت شغلی:
https://instagram.com/codecool_bioinformatics?igshid=18sf4fvz6g1z6
🇮🇷🇮🇷رنگ آمیزی مولکول های زیستی با رنگ های نسل جدید
🎯فرزاد ارجمندیراد، استادیار شیمی معدنی و عضو هیئت علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد بناب در آذربایجان شرقی موفق به تولید نسل جدیدی از رنگهای فلورسانس برای رنگآمیزی مولکولهای زیستی شده است. از این رنگ میتوان در فرایند pcr برای آشکارسازی مولکولهای DNA و … استفاده نمود.
📝این رنگ گیاهی با ساختار نانو برای تشخیص DNA و RNA و اسیدهای نوکلئیک در روش ژل آگارز و دستگاههای تشخیص فلورسانسی طراحی و سنتز شده است و قابلیت رقابت با محصولات شیمیایی مشابه ساخت امریکا مانند gel green و sybr green را دارد.
📋روش استفاده از این ماده مشابه روش دیگر مواد فلورسانسی است . 3 الی 5 میکرولیتر در سی الی پنجاه سیسی محلول ژل آگارز یک الی دو درصد با بافر نیم ایکس TBE در همان شرایط ولتاژ و زمان معمول دستگاههای الکتروفورز.
💡شرایط نگهداری آن نیاز به دماهای پایین ندارد و در دمای معمولی و دماهای زیر 20درجه و یا حتی بالای 80 درجه سانتیگراد نیز پایدار است و بدون هراس از قرار گرفتن در مقابل نور خورشید، قابل استفاده میباشد. البته این رنگ بهصورت اضافه شدن به نمونه DNA در حین بارگذاری در چاهکهای ژل به میزان نیم الی یک میکرولیتر هم کارایی خوبی دارد.
📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبهها: #اخبار_فناوری
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را میتوانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5165
📝تعداد کلمات: 427 کلمه
⏰زمان مطالعه: کمتر از سه دقیقه
📌منبع:
https://zist-fan.ir/%d8%b1%d9%86%da%af-%d8%a2%d9%85%db%8c%d8%b2%db%8c-%d9%85%d9%88%d9%84%da%a9%d9%88%d9%84%e2%80%8c-%d9%87%d8%a7%db%8c-%d8%b2%db%8c%d8%b3%d8%aa%db%8c-%d8%a8%d8%a7-%d8%b1%d9%86%da%af-%d9%87%d8%a7%db%8c/
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🎯فرزاد ارجمندیراد، استادیار شیمی معدنی و عضو هیئت علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد بناب در آذربایجان شرقی موفق به تولید نسل جدیدی از رنگهای فلورسانس برای رنگآمیزی مولکولهای زیستی شده است. از این رنگ میتوان در فرایند pcr برای آشکارسازی مولکولهای DNA و … استفاده نمود.
📝این رنگ گیاهی با ساختار نانو برای تشخیص DNA و RNA و اسیدهای نوکلئیک در روش ژل آگارز و دستگاههای تشخیص فلورسانسی طراحی و سنتز شده است و قابلیت رقابت با محصولات شیمیایی مشابه ساخت امریکا مانند gel green و sybr green را دارد.
📋روش استفاده از این ماده مشابه روش دیگر مواد فلورسانسی است . 3 الی 5 میکرولیتر در سی الی پنجاه سیسی محلول ژل آگارز یک الی دو درصد با بافر نیم ایکس TBE در همان شرایط ولتاژ و زمان معمول دستگاههای الکتروفورز.
💡شرایط نگهداری آن نیاز به دماهای پایین ندارد و در دمای معمولی و دماهای زیر 20درجه و یا حتی بالای 80 درجه سانتیگراد نیز پایدار است و بدون هراس از قرار گرفتن در مقابل نور خورشید، قابل استفاده میباشد. البته این رنگ بهصورت اضافه شدن به نمونه DNA در حین بارگذاری در چاهکهای ژل به میزان نیم الی یک میکرولیتر هم کارایی خوبی دارد.
📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبهها: #اخبار_فناوری
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را میتوانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5165
📝تعداد کلمات: 427 کلمه
⏰زمان مطالعه: کمتر از سه دقیقه
📌منبع:
https://zist-fan.ir/%d8%b1%d9%86%da%af-%d8%a2%d9%85%db%8c%d8%b2%db%8c-%d9%85%d9%88%d9%84%da%a9%d9%88%d9%84%e2%80%8c-%d9%87%d8%a7%db%8c-%d8%b2%db%8c%d8%b3%d8%aa%db%8c-%d8%a8%d8%a7-%d8%b1%d9%86%da%af-%d9%87%d8%a7%db%8c/
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
💻 دوره طراحی محاسباتی دارو
مدرس ها:
👨🏻🏫 دکتر سجاد قرقانی (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تهران و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران )
👨🏻🏫 دکتر مانی (عضو هیئت علمی گروه شیمی تجزیه دانشگاه تربیت مدرس )
🕰طول دوره: هشت هفته
💎10 درصد تخفیف دانشجویی
😃 برگزای کلاس به صورت آنلاین💻
♦️جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool5
🌞کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞
@Iran_Bioinformatics💫
مدرس ها:
👨🏻🏫 دکتر سجاد قرقانی (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تهران و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران )
👨🏻🏫 دکتر مانی (عضو هیئت علمی گروه شیمی تجزیه دانشگاه تربیت مدرس )
🕰طول دوره: هشت هفته
💎10 درصد تخفیف دانشجویی
😃 برگزای کلاس به صورت آنلاین💻
♦️جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool5
🌞کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞
@Iran_Bioinformatics💫
⌛️طول دوره 6 هفته
👨💻#برنامه_نویسی_R_مقدماتی
📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
@BioinformaticsSchools
👨💻#برنامه_نویسی_R_مقدماتی
📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
@BioinformaticsSchools
⌛️طول دوره 6 هفته
👨💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی
📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
@BioinformaticsSchools
👨💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی
📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
@BioinformaticsSchools
🌀کشف نخستین شواهد تجربی برای اثبات فرضیه خوداهلی کردن
🔹 انسان ها همواره حیواناتی رام، مهربان و تربیت شده که ما اکنون می بینیم نبوده اند. 🧟♂️ شاید اجداد ما وحشی و رام نشدنی بوده و گذر زمان و انتخاب بیشتر صفات همکاری و تعاون باعث شده است که در مسیر پیشرفت تمدن قدم بردارند.
🔸 حیوانات اهلی 🐮در مقایسه با همتایان وحشی خود نه تنها از نظر خلق و خوی بلکه از نظر ظاهری نیز متفاوت اند و این تفاوت های فیزیکی هنگام مقایسه جمجمه 💀 انسان مدرن و خویشاوندان منقرض شده اش مثل نئاندرتال ها هم دیده می شود.
🔹این تفاوت ها به طور کلی تحت عنوان سندرم اهلی کردن شناخته می شوند. دلیل وجود این تفاوت ها به کمبود برخی از ژن ها 🧬 در سلول های جنینیِ ستیغ عصبی که مسئول رشد صورت هستند برمی گردد.
🔸 از آنجایی که این تغییرات فقط در جانوران اهلی دیده می شود به نظر می رسد که ژن های دخیل در رشد صورت می توانند در تغییرات شخصیتی مرتبط با اهلی شدن نیز درگیر باشند.
🔹 برای بررسی این ارتباط پژوهشگران بر روی ژنی تمرکز کردند که نقش کلیدی در یک نوع اختلال رشدی به نام سندرم ویلیامز- بورن ایفا می کند. اشخاص دارای این سندرم نسبت به انسان های عادی چهره های کودکانه تری داشته و دارای شخصیتی دوستانه تر، پرحرف و قابل اعتماد و کاملاً غیر پرخاشگر هستند.
🎯 نتایج این بررسی نشان می دهد هر چه فعالیت ژن BAZ1B بیشتر کاهش یابد ویژگی های چهره مرتبط با سندرم ویلیامز – بورن نمایان تر می شود. از طرفی کمبود این ژن در سلول های جنینی ستیغ عصبی دلیل مهم تفاوت چهره ما در مقایسه با نئاندرتال ها است."
🔹 اینگونه که به نظر می رسد این نتایج تأیید کننده ارتباط بین تغییرات فیزیکی و رفتار دوستانه در جانوران اهلی است.
📃 این تحقیق به تازگی در مجله Science Advances منتشر شده است.
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5166
🔖 945 کلمه
⏰ زمان مطالعه: کمتر از 5 دقیقه
📝 تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
شنبه ها: #علمی_اجتماعی
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌منبع:
https://www.sciencealert.com/experimental-evidence-shows-how-humans-could-have-domesticated-ourselves
🔹 انسان ها همواره حیواناتی رام، مهربان و تربیت شده که ما اکنون می بینیم نبوده اند. 🧟♂️ شاید اجداد ما وحشی و رام نشدنی بوده و گذر زمان و انتخاب بیشتر صفات همکاری و تعاون باعث شده است که در مسیر پیشرفت تمدن قدم بردارند.
🔸 حیوانات اهلی 🐮در مقایسه با همتایان وحشی خود نه تنها از نظر خلق و خوی بلکه از نظر ظاهری نیز متفاوت اند و این تفاوت های فیزیکی هنگام مقایسه جمجمه 💀 انسان مدرن و خویشاوندان منقرض شده اش مثل نئاندرتال ها هم دیده می شود.
🔹این تفاوت ها به طور کلی تحت عنوان سندرم اهلی کردن شناخته می شوند. دلیل وجود این تفاوت ها به کمبود برخی از ژن ها 🧬 در سلول های جنینیِ ستیغ عصبی که مسئول رشد صورت هستند برمی گردد.
🔸 از آنجایی که این تغییرات فقط در جانوران اهلی دیده می شود به نظر می رسد که ژن های دخیل در رشد صورت می توانند در تغییرات شخصیتی مرتبط با اهلی شدن نیز درگیر باشند.
🔹 برای بررسی این ارتباط پژوهشگران بر روی ژنی تمرکز کردند که نقش کلیدی در یک نوع اختلال رشدی به نام سندرم ویلیامز- بورن ایفا می کند. اشخاص دارای این سندرم نسبت به انسان های عادی چهره های کودکانه تری داشته و دارای شخصیتی دوستانه تر، پرحرف و قابل اعتماد و کاملاً غیر پرخاشگر هستند.
🎯 نتایج این بررسی نشان می دهد هر چه فعالیت ژن BAZ1B بیشتر کاهش یابد ویژگی های چهره مرتبط با سندرم ویلیامز – بورن نمایان تر می شود. از طرفی کمبود این ژن در سلول های جنینی ستیغ عصبی دلیل مهم تفاوت چهره ما در مقایسه با نئاندرتال ها است."
🔹 اینگونه که به نظر می رسد این نتایج تأیید کننده ارتباط بین تغییرات فیزیکی و رفتار دوستانه در جانوران اهلی است.
📃 این تحقیق به تازگی در مجله Science Advances منتشر شده است.
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5166
🔖 945 کلمه
⏰ زمان مطالعه: کمتر از 5 دقیقه
📝 تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
شنبه ها: #علمی_اجتماعی
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌منبع:
https://www.sciencealert.com/experimental-evidence-shows-how-humans-could-have-domesticated-ourselves
👨🏻🎓 دوره آموزشی: ژنتیک سرطان
👨🏻🏫مدرس: دکتر صادق باباشاه (عضو هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس)
📜 با ارائه گواهی معتبر
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
@BioinformaticsSchools
👨🏻🏫مدرس: دکتر صادق باباشاه (عضو هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس)
📜 با ارائه گواهی معتبر
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
@BioinformaticsSchools
📚 زنان نامرئی
📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
یکشنبه ها: #معرفی_کتاب
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
یکشنبه ها: #معرفی_کتاب
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🌀تمایز ترموفیل ها و مزوفیل ها با استفاده از روش های مبتنی بر یادگیری ماشین
👨🏻💻تمایز ترموفیل ها و مزوفیل ها با استفاده از روش های مبتنی بر یادگیری ماشین را می توان به دو دسته ی روش های مبتنی بر توالی و مبتنی بر ساختار تقسیم کرد.
🕵🏽️♂️در این مقاله، محققان از روش های مبتنی بر ساختار استفاده کرده اند و برای تمایز میان ترموفیل ها و مزوفیل ها ویژگی های ساختاری را از پروتئین ها استخراج کرده اند. در این مطالعه از پایگاه داده protherm استفاده کرده اند که این پایگاه داده شامل اطلاعات آزمایشگاهی مربوط به جهش های مختلف در پروتئین های متفاوت است.
💡در این مطالعه با استفاده از پایگاه داده protherm، نه ویژگی شامل: ویژگیهای آمینواسیدی، وزن مولکولی آمینواسیدها، ویژگی ساختاری مانند سطح در دسترس و ویژگی انرژتیک(انرژی آزاد که با نرم افزار Rosetta محاسبه شده است) و ... را استخراج کردند. سپس برای ساخت مدل مورد نظر از پنج الگوریتم مختلف با نظارت یادگیری ماشین استفاده گردید که عبارتند از: جنگل تصادفی(RF)، شبکه عصبی، naïve Bayes، support vector machine(SVM) ، K nearest neighbor.
🔍در این تحقیق، عملکرد طبقه بندی های دودویی و سه تایی( Binary and ternary classifications) بهتراز رگرسیون بود.
🔖با توجه به نتایج به دست آمده در این تحقیق، اگوریتم های RF و SVM با دقت 85% و 90% بهترین الگوریتم، در تمایز میان ترموفیل و مزوفیل می باشند.
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://www.codecool.ir/journal%20detail?file=5168
📝 تهیه و تنظیم: #غزاله_فهیمیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
📝تعداد کلمات: 274
⏰زمان مطالعه: کمتر از 2دقیقه
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌لینک مقاله:
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0138022
👨🏻💻تمایز ترموفیل ها و مزوفیل ها با استفاده از روش های مبتنی بر یادگیری ماشین را می توان به دو دسته ی روش های مبتنی بر توالی و مبتنی بر ساختار تقسیم کرد.
🕵🏽️♂️در این مقاله، محققان از روش های مبتنی بر ساختار استفاده کرده اند و برای تمایز میان ترموفیل ها و مزوفیل ها ویژگی های ساختاری را از پروتئین ها استخراج کرده اند. در این مطالعه از پایگاه داده protherm استفاده کرده اند که این پایگاه داده شامل اطلاعات آزمایشگاهی مربوط به جهش های مختلف در پروتئین های متفاوت است.
💡در این مطالعه با استفاده از پایگاه داده protherm، نه ویژگی شامل: ویژگیهای آمینواسیدی، وزن مولکولی آمینواسیدها، ویژگی ساختاری مانند سطح در دسترس و ویژگی انرژتیک(انرژی آزاد که با نرم افزار Rosetta محاسبه شده است) و ... را استخراج کردند. سپس برای ساخت مدل مورد نظر از پنج الگوریتم مختلف با نظارت یادگیری ماشین استفاده گردید که عبارتند از: جنگل تصادفی(RF)، شبکه عصبی، naïve Bayes، support vector machine(SVM) ، K nearest neighbor.
🔍در این تحقیق، عملکرد طبقه بندی های دودویی و سه تایی( Binary and ternary classifications) بهتراز رگرسیون بود.
🔖با توجه به نتایج به دست آمده در این تحقیق، اگوریتم های RF و SVM با دقت 85% و 90% بهترین الگوریتم، در تمایز میان ترموفیل و مزوفیل می باشند.
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://www.codecool.ir/journal%20detail?file=5168
📝 تهیه و تنظیم: #غزاله_فهیمیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
📝تعداد کلمات: 274
⏰زمان مطالعه: کمتر از 2دقیقه
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌لینک مقاله:
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0138022
www.codecool.ir
تمایز ترموفیل ها و مزوفیل ها با استفاده از روش های مبتنی بر یادگیری ماشین
در سال های اخیر در زمینه های
بیوتکنولوژی صنعتی و مهندسی پروتئین، پروتئین هایی که نسبت به دما مقام
باشند،بسیار حائز اهمیت شده است. از این رو پروتین های مزوفیل و ترموفیل کاربرد
زیادی دارند.
تمایز ترموفیل ها و مزوفیل ها با استفاده
از روش های مبتنی بر…
بیوتکنولوژی صنعتی و مهندسی پروتئین، پروتئین هایی که نسبت به دما مقام
باشند،بسیار حائز اهمیت شده است. از این رو پروتین های مزوفیل و ترموفیل کاربرد
زیادی دارند.
تمایز ترموفیل ها و مزوفیل ها با استفاده
از روش های مبتنی بر…
⌛️طول دوره ۶ هفته
👨💻#آشنایی_با_دستورات_پرکاربرد_لینوکس
📜 با ارائه گواهی معتبر
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
https://t.me/BioinformaticsSchools/190
👨💻#آشنایی_با_دستورات_پرکاربرد_لینوکس
📜 با ارائه گواهی معتبر
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
https://t.me/BioinformaticsSchools/190
📝 تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_تحصیلی
جهت کسب اطلاعات بیشتر از شرایط و مزایای این دوره و ارسال رزومه به سایت کدکول مراجعه فرمایید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5169
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics 💫
سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_تحصیلی
جهت کسب اطلاعات بیشتر از شرایط و مزایای این دوره و ارسال رزومه به سایت کدکول مراجعه فرمایید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5169
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics 💫
👨🏻🎓 دوره آموزشی: پکیج جامع طراحی پروتئین
👨🏻🏫مدرس: دکتر سیدشهریار عرب (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتی ایران )
📜 با ارائه گواهی معتبر
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
https://t.me/BioinformaticsSchools/190
👨🏻🏫مدرس: دکتر سیدشهریار عرب (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتی ایران )
📜 با ارائه گواهی معتبر
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
https://t.me/BioinformaticsSchools/190
🌀 استفاده از یک ابزار پوشیدنی برای کمک به میلیونها انسان که دارای مشکل بلع هستند .
📋 یک دستگاه مانیتورینگ پوشیدنی برای آسانتر و مقرون به صرفه تر شدن درمان برای میلیون ها نفر از مبتلایان به اختلال بلع، توسط محققان دانشگاه پورودو قرار است به بازار عرضه شود.
⚙️ ابزار های دیگری که برای کمک به افراد مبتلا به اختلال بلع وجود دارد علاوه بر گران قیمت بودن قابل استفاده در خانه یا مناطق دور روستایی نیستند.
💻 محققان یک برچسب حسگر قابل نصب بر روی پوست درست کردند که محکم به ناحیه گردن وصل می شود و با کابل های کوچک به یک واحد فرستنده بی سیم متصل می شود.برچسب حسگر قابل نصب بر روی پوست ، فعالیت و حرکت عضلات مرتبط با بلع را اندازه گیری و ثبت می کند. این اطلاعات سپس توسط یك واحد جداگانه كه به پیراهن بیمار متصل است به صورت بی سیم فرستاده میشود تا بعدا توسط پزشک تجزیه و تحلیل شود .
🔖 تکمیل موفقیت آمیز عمل بلع نیاز به هماهنگی دقیق بیش از 30 جفت ماهیچه سر و گردن ، شش جفت اعصاب جمجمه و مدار پیچیده در ساقه مغز و چندین نواحی مغز دارد. هرگونه اختلال در این مسیرها می تواند منجر به اختلالات شدید در بلع شود.
📎 بیش از 9 میلیون بزرگسال و بیش از 500000 کودک هر ساله در ایالات متحده اختلال بلع شدید را تجربه می کنند.
📝تهیه و تنظیم: #الهام_افخمی
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبهها: #اخبار_فناوری
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را میتوانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5170
📝تعداد کلمات: 214 کلمه
⏰زمان مطالعه: کمتر از 2 دقیقه
📌منبع:
purdue.edu/newsroom/releases/2019/Q4/millions-with-swallowing-problems-could-be-helped-through-new-wearable-device.html
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📋 یک دستگاه مانیتورینگ پوشیدنی برای آسانتر و مقرون به صرفه تر شدن درمان برای میلیون ها نفر از مبتلایان به اختلال بلع، توسط محققان دانشگاه پورودو قرار است به بازار عرضه شود.
⚙️ ابزار های دیگری که برای کمک به افراد مبتلا به اختلال بلع وجود دارد علاوه بر گران قیمت بودن قابل استفاده در خانه یا مناطق دور روستایی نیستند.
💻 محققان یک برچسب حسگر قابل نصب بر روی پوست درست کردند که محکم به ناحیه گردن وصل می شود و با کابل های کوچک به یک واحد فرستنده بی سیم متصل می شود.برچسب حسگر قابل نصب بر روی پوست ، فعالیت و حرکت عضلات مرتبط با بلع را اندازه گیری و ثبت می کند. این اطلاعات سپس توسط یك واحد جداگانه كه به پیراهن بیمار متصل است به صورت بی سیم فرستاده میشود تا بعدا توسط پزشک تجزیه و تحلیل شود .
🔖 تکمیل موفقیت آمیز عمل بلع نیاز به هماهنگی دقیق بیش از 30 جفت ماهیچه سر و گردن ، شش جفت اعصاب جمجمه و مدار پیچیده در ساقه مغز و چندین نواحی مغز دارد. هرگونه اختلال در این مسیرها می تواند منجر به اختلالات شدید در بلع شود.
📎 بیش از 9 میلیون بزرگسال و بیش از 500000 کودک هر ساله در ایالات متحده اختلال بلع شدید را تجربه می کنند.
📝تهیه و تنظیم: #الهام_افخمی
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبهها: #اخبار_فناوری
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را میتوانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
https://codecool.ir/journal%20detail?file=5170
📝تعداد کلمات: 214 کلمه
⏰زمان مطالعه: کمتر از 2 دقیقه
📌منبع:
purdue.edu/newsroom/releases/2019/Q4/millions-with-swallowing-problems-could-be-helped-through-new-wearable-device.html
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
👨🏻🎓 دوره آموزشی: پکیج جامع یادگیری ماشین با رویکرد بیوانفورماتیکی
👨🏻🏫مدرس: دکتر جواد ظهیری (عضو هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس)
📜 با ارائه گواهی معتبر
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
https://t.me/BioinformaticsSchools/190
👨🏻🏫مدرس: دکتر جواد ظهیری (عضو هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس)
📜 با ارائه گواهی معتبر
🔰10 درصد تخفیف دانشجویی
و 5 درصد تخفیف برای 3 نفر اول ثبت نامی
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🌀 برای کسب اطلاعات بیش تر در مورد تخفیف های در نظر گرفته شده به کانال زیر مراجعه نمائید:
https://t.me/BioinformaticsSchools/190
🎧 #پادکست "تأثیر ذهن بر ژنتیک"
🔷 این قسمت: معجزه خندیدن😁😁😁
📝🎙 تهیه و تنظیم: #محمد_افشاری
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
پنجشنبه ها: #پادکست
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
🔷 این قسمت: معجزه خندیدن😁😁😁
📝🎙 تهیه و تنظیم: #محمد_افشاری
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
پنجشنبه ها: #پادکست
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫