[ File :Deep Learning for the Life Sciences(2019).pdf ]
فایل #pdf کتاب "یادگیری عمیق برای علوم زیستی"

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🌀روش های محاسباتی برای آنالیز سیستماتیک تغییرات مولکولی مرتبط با سالخوردگی

🔬در سال های اخیر پیشرفت در زمینه توالی یابی و به خصوص توالی یابی با عملکرد بالا، افق جدیدی را برای محققان زیست شناسی گشوده است. از طرفی تکنولوژی omics منجر به ایجاد چالش های جدیدی از جمله پردازش، یکپارچه سازی و تفسیر داده های حاصل از این تکنولوژی شده است. به دنبال پیشرفت در این زمینه، روش های جدید محاسباتی راه گشای تحلیل این داده های خام شده اند.

🧬🧬آنالیز داده های omics به منظور درک مبحث سالخوردگی، یکی از زمینه هایی است که در سال های اخیر به آن توجه شده است. این تحقیقات با چالش جدیدی روبرو هستند و آن هم بُعد زمان است که در این نوع مطالعات از اهمیت ویژه ای برخوردار می باشد. در طی سالخوردگی شبکه های سلولی وضعیت خود را به دلایلی چون آسیب دیدن DNA و همچنین کاهش تلومر که خود درنتیجه سالخوردگی اتفاق می افتد ، تغییر می دهند.

👨‍💻چالش های اصلی که در این نوع از تحقیقات وجود دارد بدین شرح است: 1)داده ها الزاما باید در طول زمان تفسیر شوند 2)با افزایش سالخوردگی، ناهمگنی سیستم های زیستی افزایش می یابد. 3)تمایز (تغییرات در سطح سلولی و مولکولی) میان علت سالخوردگی و نتایج حاصل از سالخوردگی کار دشواری است.

🎯 در این مقاله مروری، روشهای محاسباتی انتخاب و بررسی شده اند که در ترکیب با تکنیکهای پروفایلینگ مولکولی به ارتقا درک ما نسبت به زیست شناسی سالخوردگی کمک می کند. به علاوه نویسندگان روش های محاسباتی را بر اساس اینکه برای پردازش چه نوع داده هایی(single omics یا multiple omics) طراحی شده اند، دسته بندی کرده اند.

📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.

http://codecool.ir/journal%20detail?file=5119

🔖 267 کلمه
⏰ زمان مطالعه: کمتر از 2 دقيقه

📝 تهیه و تنظیم: #غزاله_فهیمیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📌لینک مقاله:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1740675718300148

📝 تهیه و تنظیم: #عطیه_احمدی دانشجوی ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_شغلی

برای اطلاعات بیشتر به سایت ما سر بزنید :

http://codecool.ir/journal%20detail?file=5122

✅کانال بیوانفورماتیک ایران

@Iran_bioinformatics 💫

💥مقاله برتری کوانتومی گوگل رسید💥

💡با توجه به درز اطلاعات ماه پیش، بیشتر ما از رسیدن به برتری کوانتومی توسط گوگل باخبریم.

✅ این بدان معناست که یک کامپیوتر کوانتومی بهتر از یک کامپیوتر کلاسیک در محاسبات عمل می‌کند. اکنون کمپانی گوگل با انتشار مقاله ای در نیچر این خبر را به رسمیت شناخت.

♾محاسباتی که گوگل انتخاب کرد، چک کردن خروجی یک تولید کننده عدد تصادفی کوانتومی، کاربرد های بسیار محدودی دارد. اما "این دستاورد علمی با فرض اینکه ماندگار باشد، که به عقیده‌ی من هست، دستاورد بسیار بزرگی است" اسکات آرونسون، پژوهشگر علوم کامپیوتر تئوری.

🚫اما همه تحت تاثیر این واقعه قرار نگرفته اند. آی‌بی‌ام یک پیش‌چاپ از مقاله ای را دوشنبه منتشر کرد که در آن گفته شده که با استفاده از یک رویکرد دیگر یک کامپیوتر کلاسیک می‌تواند محاسبات را به سرعت یک کامپیوتر کوانتومی انجام دهد.

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📝تهیه و تنظیم: #سیدعلی_میرمصطفی
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

#اخبار_فناوری

📌لینک سایت:
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=5104

🔖 ۱۵۰ کلمه
⏰ زمان مطالعه: کمتر از ۱ دقيقه

📌منبع:
✅https://www.nature.com/articles/d41586-019-03213-z?utm_source=Nature+Briefing&utm_campaign=3b8eb6cbd7-briefing-dy-20191023&utm_medium=email&utm_term=0_c9dfd39373-3b8eb6cbd7-44439713
✅https://www.nature.com/articles/s41586-019-1666-5

[ File :Quantum supremacy using a programmable superconducting processor.pdf ]

فایل #pdf مقاله برتری کوانتومی گوگل

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🎞اپی ژنتیک

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

📝 ترجمه و صداگذاری: #محمد_افشاری
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه ها: #فیلم

📌منبع:
https://www.youtube.com/watch?v=PYTjTGLmg1Q

#داستان_طنز
تصویری که والدین و استاد راهنمای من از درس خوندن خودش ارائه میده! 😅

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🌀نوعی از امواج مغزی در پاکسازی مغز شما در حین خواب نقش دارند 🧠


😴 در حالی که شما خواب هستید، امواج کند ناشی از فعالیت الکتریکی در مغز شما می توانند به از بین رفتن مواد زائد و مضر کمک کنند. این فرایند ممکن است در جلوگیری از بیماری های تخریب کننده عصب (نورودژنریتیو) مثل آلزایمر نقش داشته باشد.

🔹بسیاری از عملکردهای این امواج ناشناخته است، اما مشخص شده است که آن ها هنگام خواب عمیق، آهسته تر و هنگام بیدار شدن سریع تر هستند و همچنین این موج های مغزی در تثبیت خاطرات ما در هنگام خواب نقش دارند.

👨‍💻 یک گروه تحقیقاتی به رهبری لورا لوئیس از دانشگاه بوستون طی پژوهش خود دریافتند که در طول خواب، امواج بزرگی از مایع مغزی نخاعی هر 20 ثانیه به داخل مغز و خارج از آن جریان می یابد که این امواج در افراد مبتلا به بیماری های تخریب کننده عصب مثل آلزایمر کم تر و ضعیف تر است و این امر می تواند در چگونگی پاکسازی مواد زائد تأثیر بگذارد.

👩‍🔬لوئیس می گوید: گاهی اوقات زمانی که مردم به اندازه ی کافی نمی خوابند، مغز آن ها در خواب شبانه بعدی به میزان بیشتری از این امواج کند الکتریکی تولید می کند. این ممکن است راهی برای مغز باشد که بخشی از خواب از دست رفته را جبران کند.

🔖نتایج این پژوهش به تازگی در مقاله ای تحت عنوان "خواب عمیق نوسانات مایع مغزی را هدایت می کند" منتشر گردیده است.


📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5123

🔖 528 کلمه
⏰ زمان مطالعه: کم تر از 3 دقیقه


📝 تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها: #علمی_اجتماعی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
https://www.newscientist.com/article/2222016-a-type-of-brainwave-may-help-clean-your-brain-while-you-sleep/

💢 شروع کلاس جمعه

📆 ۱۷ آبان ماه

⏰ ساعت ۱۳ تا ۱۵:۳۰

⌛️طول دوره ۵ هفته

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool5

📚جادوی واقعیت: چگونه میفهمیم چه چیزی واقعا درست است

📝تهیه و تنظیم: #دانیال_خدیوی دانشجو ارشد بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

فایل #pdf کتاب "جادوی واقعیت"

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🌀ساخت مدل شبکه عصبی عمیق با الهام از الگوریتم جنگل تصادفی برای آنالیز داده های بیان ژن

💎مدل شبکه عصبی از جمله مدل های پرکاربرد در یادگیری ماشین است اما بر خلاف کاربرد گسترده اش استفاده از این مدل برای دسته بندی داده های بیان ژن با مشکل جدی مواجه است.

⛔️در داده های بیان ژن تعداد ویژگی ها (p) نسبت به تعداد نمونه ها (n) بسیار بیشتر است و این ویژگی با مدل شبکه عصبی عمیق همراستا نیست و نمی توان از آن برای دسته بندی داده های بیان ژن استفاده کرد.

🎯عدم وجود ارتباط معنادار میان ویژگی ها موجب می شود نتوانیم در مرحله پیش پردازش داده ها، ویژگی ها را کاهش دهیم. برای حل این مشکل نویسندگان این مقاله ترکیب الگوریتم جنگل تصادفی (random forest) نظارت شده و شبکه عصبی عمیق یا به اختصار (FDNN) را پیشنهاد داده اند.

🔑در الگوریتم جنگل تصادفی که مبتنی بر یادگیری دسته جمعی (Ensemble Learning) است با توجه به آنکه تعداد نمونه ها زیاد نیست ابتدا نمونه ها تکرار می شوند و جهت ساخت مدل بخشی از نمونه ها و تعدادی از ویژگی ها استفاده می شود. استفاده از چنین روشی در مدل شبکه عصبی عمیق موجب کاهش احتمال حساس شدن مدل به نمونه های یادگیری می شود و قدرت مدل را افزایش می دهد.

💉جهت ارزیابی ظرفیت این مدل ترکیبی از شبیه سازی های آزمایشگاهی و آنالیز داده های واقعی دو مجموعه داده RNA استفاده شده است.

💡این مدل نسبت به مدل جنگل تصادفی و شبکه عصبی عمیق از عملکرد بهتری برخوردار است و معنادار تر به انتخاب ویژگی ها می پردازد.


📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5124

🔖 264 کلمه
⏰ زمان مطالعه: کم تر از 3 دقیقه


📝 تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی دانشجو ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📌لینک مقاله:
https://www.nature.com/articles/s41598-018-34833-6

📝 تهیه و تنظیم: #نیلوفر_سید_مجیدی دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_شغلی

برای اطلاعات بیشتر به سایت ما سر بزنید :

http://codecool.ir/journal%20detail?file=5125

✅کانال بیوانفورماتیک ایران

@Iran_bioinformatics 💫

📱دستکاری سلول های مغزی با استفاده از تلفن هوشمند

👨‍⚕️تیمی از دانشمندان کره ی جنوبی و ایالت متحده دستگاهی اختراع کردند که میتواند از طریق گوشی هوشمند مدار‌های عصبی را کنترل کند. این کنترل به وسیله ایمپلنت کوچک مغزی انجام میشود. با انتشار این مطلب در ژورنال نیچر مهندسی زیست پزشکی، محققان گفته ا‌ند این ایمپلنت اولین دستگاه عصبی بی سیم است که قابلیت دارو رسانی چندگانه دارد و میتواند تلاشهای مارا در رمزگشایی بیماری‌های مغزی از قبیل پارکینسون، آلزایمر، اعتیاد و افسردگی را سرعت بخشد.

🔧این وسیله از کارتریج‌های دارویی قابل تعویض (شبیه لگو) و بلوتوث‌های قدرتمند کم مصرف برای انتقال دارو و نور به نورون‌های هدف استفاده می‌کند.

🌡دستگاه عصبی بی سیم، تعدیل عصبی به واسطه ماده شیمیایی و یا نور را به صورت مزمن امکان پذیر میسازد که قبلا امکان پذیر نبوده است.

🧪این فناوری به طرز چشم گیری روشهای متداول مورد استفاده دانشمندان را که معمولا شامل لوله های فلزی و الیاف نوری سفت و سخت برای تحویل دارو و نور بود را تحت الشعاع قرار داده است. روشهای قبلی جدا از محدود کردن حرکت سوژه (به دلیل ارتباطات فیزیکی با تجهیزات حجیم و ساختار نسبتاً محکم)، به مرور زمان باعث ایجاد ضایعه در بافت نرم مغز می شدند و برای کاشت طولانی مدت مناسب نبودند اما این دستگاه به محققان اجازه می دهد چندین ماه همان مدارهای مغزی را مطالعه کنند بدون اینکه نگرانی در مورد از بین رفتن دارو داشته باشند.


✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📝تهیه و تنظیم: #ساره_عامری_فر
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

#اخبار_فناوری

📌لینک سایت:
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5126

🔖۲۳۳ کلمه
⏰ زمان مطالعه: کمتر از ۳ دقيقه

📌منبع:
✅https://www.nature.com/articles/s41551-019-0432-1

🎧 بخش اول کتاب صوتی "فیزیک غیرممکن‌ها"

🖋نویسنده: میچیو کاکو

پنجشنبه ها: #کتاب_صوتی

#فیزیک_غیرممکن‌ها
#میچیو_کاکو

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

💢 شروع کلاس جمعه

📆 ۲۴ آبان ماه

⏰ ساعت ۱۷ تا ۲۰:۲۰

⌛️طول دوره ۳ هفته

👨‍💻#برنامه_نویسی_آر_مقدماتی

🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool5

#داستان_طنز

من در حال دلداری به مقاله ا‌م، وقتی استادم می‌گه تا مقاله ا‌ت پذیرفته نشده پیش من نیا!


✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics

⚜️بنیاد ”جایزه پیشرفت شگرف” و مریم میرزاخانی

مریم میرزاخانی نامی آشنا برای همه ی ما ایرانیان است. او زنی است که به گفته یکی از دوستانش توانست خودش را به جهان مرد سالار ریاضیات تحمیل کند و به همه ثابت کند توانایی مستقل از جنسیت و نژاد است.

او نخستین زن برنده ی جایزه فیلدز است که درطول ۴۰ سال زندگی نقش برجسته ای در پیشبرد دینامیک و هندسه سطوح ریمانی و فضاهای هذلولی داشت.

نزدیک به سه سال از مرگ این بانوی ریاضیدان میگذرد که در۴ نوامبر۲۰۱۹ بنیاد جایزه پیشرفت شگرف اعلام کرد جایزه ای را مخصوص زنان ریاضیدان در نظر گرفته است که ارزش آن ۵۰۰۰۰دلار و نام آن جایزه ”مریم میرزاخانی” است.

برنده این جایزه باید دوسال قبل از اهدای جوایز مدرک دکتری خود را دریافت کرده باشد.

ریچارد تیلور از مدیران کمیته جایزه پیشرفت شگرف میگوید: ما این جایزه را با امید به اینکه زنان بیشتری پیرو راه مریم میرزاخانی در عرصه ریاضیات فعالیت کنند، قرار داده ایم و تقدیر از زنان ریاضیدان گوشه ای از دین ما را به مریم ادا میکند.

از موسسان جایزه پیشرفت شگرف میتوان به مارک زوکربرگ، موسس فیسبوک اشاره کرد

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics💫


📝تهیه و تنظیم: #عطیه_احمدی دانشجوی #ارشد_بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

📍لینک سایت:

http://www.codecool.ir/journal%20detail?file=5127
📌منبع:
https://breakthroughprize.org/News/56

📚کشف و طراحی محاسباتی دارو

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

فایل #pdf کتاب "کشف و طراحی محاسباتی دارو"
#طراحی_دارو

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📊تصویر سازی داده ها و نتایج، یکی از مهم ترین قسمت های مقاله است که می تونه در نگاه اول نظر ادیتور و داورها رو به خودش جلب کنه😍

🕰شروع دوره 24 آبان

🌀ظرفیت محدود

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool5