📝 تهیه و تنظیم: #یاسمین_کیانیان دانشجوی دکتری #شیمی_آلی_محاسباتی دانشگاه تربیت مدرس
سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_شغلی
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📌 منبع:
https://www.nature.com/naturecareers/job/bioinformatician-european-molecular-biology-laboratory-embl-708057
سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_شغلی
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📌 منبع:
https://www.nature.com/naturecareers/job/bioinformatician-european-molecular-biology-laboratory-embl-708057
🇮🇷🇮🇷ساخت دستگاه PCR با کمک فناوری میکروفلوئیدیک
🧬روش “PCR” به منظور تکثیر ژن مورد استفاده قرار میگیرد.. اخیراً به همت تیم پژوهشی دکتر امیر شاملو دانشیار دانشگاه صنعتی شریف از یک روش جدید به منظور تولید دستگاههای میکروفلوئیدیک استفاده شده است که قابلیت تعمیم در تمامی دستگاههای دیگر ساخته شده توسط پژوهشگران در حوزه میکرو و نانو را دارد. مزیت این روش، تولید دستگاههای میکروفلوئیدیک با قابلیت تحمل فشارهای بسیار بالا است.
💠🌀در سیستم های تجاری “PCR”، سیال در ظرفی قرار داده میشود و دمای آن توسط دستگاه بالا و پایین میشود اما در دستگاه ساخته شده که از نوع جریان پیوسته است، بر خلاف سیستمهای تجاری، سیال بر روی بخشهایی با دمای ثابت که دارای دمای مخصوص به فرآیند PCR هستند جریان پیدا میکنند و به دمای آن بخشها میرسند. به این ترتیب سیال با عبور مکرر از بخشهایی با دمای مشخص سیکلهای حرارتی “PCR” را طی میکند.
💡🔦🥇از مزایای پیوسته بودن جریان دستگاه ساخته شده میتوان به تغییر سریع دما، کاهش هزینه ساخت، کاهش نیاز به مواد اولیهی واکنش، عدم ورود آلودگیها و مواد اضافه موجود بر روی دیوارهها به داخل سیال نمونه و امکان اجرای روشهای “PCR” مختلف نظیر “Digital PCR” اشاره کرد.
📝نتایج حاکی از آن است که با استفاده از نانوذرات، دستگاه ساخته شده میتواند کارایی مشابه دستگاههای تجاری را همراه با کاهش زمان فرایند حاصل نماید. همچنین نشان داده شده است که نانوذرات میتوانند تا 5 برابر (وحتی بیشتر) نتایج “PCR” را بهبود دهند.
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics 💫
📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی دانشجوی #ارشد_بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبه ها : #فناوری
📌ادامه مطلب :
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=5114
📌منبع:
https://zist-fan.ir/%d8%b3%d8%a7%d8%ae%d8%aa-%d8%af%d8%b3%d8%aa%da%af%d8%a7%d9%87-pcr-%d9%81%d9%86%d8%a7%d9%88%d8%b1%db%8c-%d9%85%db%8c%da%a9%d8%b1%d9%88%d9%81%d9%84%d9%88%d8%a6%db%8c%d8%af%db%8c%da%a9/
🧬روش “PCR” به منظور تکثیر ژن مورد استفاده قرار میگیرد.. اخیراً به همت تیم پژوهشی دکتر امیر شاملو دانشیار دانشگاه صنعتی شریف از یک روش جدید به منظور تولید دستگاههای میکروفلوئیدیک استفاده شده است که قابلیت تعمیم در تمامی دستگاههای دیگر ساخته شده توسط پژوهشگران در حوزه میکرو و نانو را دارد. مزیت این روش، تولید دستگاههای میکروفلوئیدیک با قابلیت تحمل فشارهای بسیار بالا است.
💠🌀در سیستم های تجاری “PCR”، سیال در ظرفی قرار داده میشود و دمای آن توسط دستگاه بالا و پایین میشود اما در دستگاه ساخته شده که از نوع جریان پیوسته است، بر خلاف سیستمهای تجاری، سیال بر روی بخشهایی با دمای ثابت که دارای دمای مخصوص به فرآیند PCR هستند جریان پیدا میکنند و به دمای آن بخشها میرسند. به این ترتیب سیال با عبور مکرر از بخشهایی با دمای مشخص سیکلهای حرارتی “PCR” را طی میکند.
💡🔦🥇از مزایای پیوسته بودن جریان دستگاه ساخته شده میتوان به تغییر سریع دما، کاهش هزینه ساخت، کاهش نیاز به مواد اولیهی واکنش، عدم ورود آلودگیها و مواد اضافه موجود بر روی دیوارهها به داخل سیال نمونه و امکان اجرای روشهای “PCR” مختلف نظیر “Digital PCR” اشاره کرد.
📝نتایج حاکی از آن است که با استفاده از نانوذرات، دستگاه ساخته شده میتواند کارایی مشابه دستگاههای تجاری را همراه با کاهش زمان فرایند حاصل نماید. همچنین نشان داده شده است که نانوذرات میتوانند تا 5 برابر (وحتی بیشتر) نتایج “PCR” را بهبود دهند.
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics 💫
📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی دانشجوی #ارشد_بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبه ها : #فناوری
📌ادامه مطلب :
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=5114
📌منبع:
https://zist-fan.ir/%d8%b3%d8%a7%d8%ae%d8%aa-%d8%af%d8%b3%d8%aa%da%af%d8%a7%d9%87-pcr-%d9%81%d9%86%d8%a7%d9%88%d8%b1%db%8c-%d9%85%db%8c%da%a9%d8%b1%d9%88%d9%81%d9%84%d9%88%d8%a6%db%8c%d8%af%db%8c%da%a9/
🌺نخستین سالگرد تأسیس کانال 🌺
با نهایت درود و احترام خدمت تمام کاربران گرامی 🌹🌹🌹
🎉 سابقه فعالیت گروه زیست داده کاو کدکول به سال 1395 بر می گردد و یک سال پیش نیز در چنین روزی این گروه با هدف ارائه خدمات آموزشی و پژوهشی و همچنین انتشار مطالب و اخبار علمی به دانش پژوهان و علاقه مندان به زیست شناسی و بویژه بیوانفورماتیک اقدام به راه اندازی سایت و کانال تلگرامی خود نمود.
🙏 در اینجا بر خود لازم می دانیم که از تمامی شما کاربران عزیز و گرانقدر که همیشه همراه ما بودید و با پیشنهادات ارزشمندتان ما را در جهت بهبود هر چه بهتر خدمات این گروه یاری رساندید نهایت تشکر و سپاسگزاری را داشته باشیم.
🎉 امید است که با آغاز دومین سال فعالیت گروه زیست داده کاو کدکول، در کنار شما عزیزان که هیچگاه نظرات سازنده خود را از ما دریغ نمی کنید و همچنین با زحمات بی دریغ تمامی دوستانی که در این گروه فعالیت دارند بتوانیم خدمتگزاران بهتری برای شما دانش پژوهان عزیز بوده و موجبات رضایت شما را فراهم آوریم.
🌷🌷🌷💐💐💐💐🌷🌷🌷
با نهایت درود و احترام خدمت تمام کاربران گرامی 🌹🌹🌹
🎉 سابقه فعالیت گروه زیست داده کاو کدکول به سال 1395 بر می گردد و یک سال پیش نیز در چنین روزی این گروه با هدف ارائه خدمات آموزشی و پژوهشی و همچنین انتشار مطالب و اخبار علمی به دانش پژوهان و علاقه مندان به زیست شناسی و بویژه بیوانفورماتیک اقدام به راه اندازی سایت و کانال تلگرامی خود نمود.
🙏 در اینجا بر خود لازم می دانیم که از تمامی شما کاربران عزیز و گرانقدر که همیشه همراه ما بودید و با پیشنهادات ارزشمندتان ما را در جهت بهبود هر چه بهتر خدمات این گروه یاری رساندید نهایت تشکر و سپاسگزاری را داشته باشیم.
🎉 امید است که با آغاز دومین سال فعالیت گروه زیست داده کاو کدکول، در کنار شما عزیزان که هیچگاه نظرات سازنده خود را از ما دریغ نمی کنید و همچنین با زحمات بی دریغ تمامی دوستانی که در این گروه فعالیت دارند بتوانیم خدمتگزاران بهتری برای شما دانش پژوهان عزیز بوده و موجبات رضایت شما را فراهم آوریم.
🌷🌷🌷💐💐💐💐🌷🌷🌷
#طنز_تلخ
#دیتابیس
و اینگونه شد که همه پایگاه های داده یک کار انجام میدهند!!!
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
#دیتابیس
و اینگونه شد که همه پایگاه های داده یک کار انجام میدهند!!!
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🌀ابداع یک ابزار جدید برای بازسازی تکامل پروتئین ها
🔸آیا قلمرو، فرمانرو، شاخه، رده، راسته، خانواده، جنس و گونه و استعاره درخت زندگی داروین که در زیست شناسی دبیرستان آموخته ایم را به خاطر می آورید؟
➖ این روش بهترین حدس علم برای توصیف دودمان های موجودات زنده است که چگونه ژن ها به مرور زمان جهش یافته و تقسیم می شوند تا موجودات را به آن چه امروزه هستند تغییر دهند.
⁉️چه می شود اگر بتوانید مدل بهتری از تغییر تکاملی را ایجاد کنید که می تواند تصویر واضح تری از گذشته به شما ارائه دهد؟
🔹کریستن نایگل و رومن اسلوتسکی همین کار را انجام داده اند. کار آن ها نشان می دهد که چگونه می توان مدل هایی را ساخت که قادر هستند تغییرات تکاملی را بسیار دقیق تر از گذشته بازسازی کنند، که نویدبخش پیشرفت در درک چگونگی عملکرد بیماری ها در بدن انسان است.
👨🔬اسلوتسکی گفت: من می دانستم كه مجبورم روشی را برای ترکیب کردن اطلاعات همه این مدل ها بیابم، زیرا من نمی توانستم تنها از رایج ترین آن ها استفاده كنم. این چالش غیر منتظره ای بود که منجر به ارائه ی این کار شد.
👨💻محققان می توانند از ابزار جدید نایگل و اسلوتسکی برای درک این که چگونه پروتئین های بسیار مشابه تکامل می یابند استفاده کرده و سپس داروهای بهتری را برای هدف قرار دادن اختصاصی یک پروتئین طراحی نمایند.
🔖 مقاله این دو پژوهشگر تحت عنوان "ASPEN، روشی برای بازسازی تکامل پروتئین با دقت بهتر و با استفاده از مدل های ترکیبی" پنجشنبه 17 اکتبر در مجله eLife منتشر شده است.
📌ادامه مطلب :
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5115
📝تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
شنبه ها: #علمی_اجتماعی
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌 منبع:
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/10/191017135740.htm
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5115
🔸آیا قلمرو، فرمانرو، شاخه، رده، راسته، خانواده، جنس و گونه و استعاره درخت زندگی داروین که در زیست شناسی دبیرستان آموخته ایم را به خاطر می آورید؟
➖ این روش بهترین حدس علم برای توصیف دودمان های موجودات زنده است که چگونه ژن ها به مرور زمان جهش یافته و تقسیم می شوند تا موجودات را به آن چه امروزه هستند تغییر دهند.
⁉️چه می شود اگر بتوانید مدل بهتری از تغییر تکاملی را ایجاد کنید که می تواند تصویر واضح تری از گذشته به شما ارائه دهد؟
🔹کریستن نایگل و رومن اسلوتسکی همین کار را انجام داده اند. کار آن ها نشان می دهد که چگونه می توان مدل هایی را ساخت که قادر هستند تغییرات تکاملی را بسیار دقیق تر از گذشته بازسازی کنند، که نویدبخش پیشرفت در درک چگونگی عملکرد بیماری ها در بدن انسان است.
👨🔬اسلوتسکی گفت: من می دانستم كه مجبورم روشی را برای ترکیب کردن اطلاعات همه این مدل ها بیابم، زیرا من نمی توانستم تنها از رایج ترین آن ها استفاده كنم. این چالش غیر منتظره ای بود که منجر به ارائه ی این کار شد.
👨💻محققان می توانند از ابزار جدید نایگل و اسلوتسکی برای درک این که چگونه پروتئین های بسیار مشابه تکامل می یابند استفاده کرده و سپس داروهای بهتری را برای هدف قرار دادن اختصاصی یک پروتئین طراحی نمایند.
🔖 مقاله این دو پژوهشگر تحت عنوان "ASPEN، روشی برای بازسازی تکامل پروتئین با دقت بهتر و با استفاده از مدل های ترکیبی" پنجشنبه 17 اکتبر در مجله eLife منتشر شده است.
📌ادامه مطلب :
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5115
📝تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
شنبه ها: #علمی_اجتماعی
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌 منبع:
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/10/191017135740.htm
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5115
💢 شروع کلاس جمعه
📆 ۱۷ آبان ماه
⏰ ساعت ۱۳ تا ۱۵:۳۰
⌛️طول دوره ۵ هفته
👨💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی
🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی
📜 با ارائه مدرک معتبر
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool3
📆 ۱۷ آبان ماه
⏰ ساعت ۱۳ تا ۱۵:۳۰
⌛️طول دوره ۵ هفته
👨💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی
🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی
📜 با ارائه مدرک معتبر
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool3
🌺 به مناسبت نخستین سالگرد تاسیس کانال، مدیریت گروه کدکول تصمیم دارد در سه بخش مجزا به معرفی مختصری از اعضای تخصصی این گروه و فعالیت های آن ها بپردازد.
📌گروه زیست داده کاو کدکول از سال 1395 به طور رسمی کار خود را آغاز نمود. آموزش مهارت های بیوانفورماتیکی و خدمات تحلیل داده های حجیم از ابتدا بیشترین تقاضای مخاطبین مجموعه کدکول بوده است.
🔶در هسته مرکزی گروه، اساتید برتر کشور در حوزه بیوانفورماتیک حضور دارند.
💎دکتر سید شهریار عرب از اعضای هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس و فعالین پارک علم و فناوری این دانشگاه هستند.
💎 دکتر جواد ظهیری عضو دیگر هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس از برجسته ترین مدرسین علوم کامپیوتر و بیوانفورماتیک هستند.
💎 دکتر سجاد قرقانی عضو هیئت علمی دانشگاه تهران (مرکز تحقیقات بیوشیمی بیوفیزیک = IBB) از اعضای هیات مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران می باشند.
📌گروه زیست داده کاو کدکول از سال 1395 به طور رسمی کار خود را آغاز نمود. آموزش مهارت های بیوانفورماتیکی و خدمات تحلیل داده های حجیم از ابتدا بیشترین تقاضای مخاطبین مجموعه کدکول بوده است.
🔶در هسته مرکزی گروه، اساتید برتر کشور در حوزه بیوانفورماتیک حضور دارند.
💎دکتر سید شهریار عرب از اعضای هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس و فعالین پارک علم و فناوری این دانشگاه هستند.
💎 دکتر جواد ظهیری عضو دیگر هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس از برجسته ترین مدرسین علوم کامپیوتر و بیوانفورماتیک هستند.
💎 دکتر سجاد قرقانی عضو هیئت علمی دانشگاه تهران (مرکز تحقیقات بیوشیمی بیوفیزیک = IBB) از اعضای هیات مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران می باشند.
✏️وفق دادن روش یادگیری ماشین کلاسیک و مدرن
📚علی رغم اینکه پیشرفتها در حوزهی یادگیری ماشین و هوش مصنوعی در حال تغییر جامعه است، درک اساسی ما از موضوع هماهنگ با این پیشرفتها نیست.
در مدلهای کلاسیک یادگیری ماشین اعتقاد بر این است که مدل مناسب مدلی است که کاملاً با دادههای آموزش مطابقت نکند زیرا این موضوع منجر به کارایی ضعیف مدل روی دادههای تست میشود. با این وجود مدلهای طبقهبندی کنندهی مدرن تقریباً بر دادههای آموزش منطبق هستند. در واقع یکی از اصول اساسی در روشهای یادگیری ماشین کلاسیک ایجاد موازنه بین خطای آموزش و خطای تست است در حالی که در روشهای مدرن مانند شبکه عصبی که با دقت بالایی پیشبینی میکنند، این گونه نیست.
📝 این تناقض باعث بحث و گفتوگو بین پژوهشگران شده و آنها را با این سوالها مواجه کرده است که آیا اساساً این تئوری عملی است؟ ارتباط مبانی ریاضی یادگیری ماشین و مسائل دنیای واقعی چیست؟
💡پژوهشگران در این مقاله به این سوال پاسخ و درک روش کلاسیک و مدرن را در یک منحنی عملکرد یکپارچه وفق دادهاند. آنها طیف گستردهای از مدلها و مجموعه دادهها را بررسی کرده و ارتباط بین عملکرد، ساختار مدلهای یادگیری ماشین، محدودیتهای تحلیل کلاسیک و مفهوم تئوری و عملی یادگیری ماشین را شرح دادهاند.
📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعیپور
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک_آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
📌لینک سایت:
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5116
📌منبع:
https://www.pnas.org/content/116/32/15849.short
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📚علی رغم اینکه پیشرفتها در حوزهی یادگیری ماشین و هوش مصنوعی در حال تغییر جامعه است، درک اساسی ما از موضوع هماهنگ با این پیشرفتها نیست.
در مدلهای کلاسیک یادگیری ماشین اعتقاد بر این است که مدل مناسب مدلی است که کاملاً با دادههای آموزش مطابقت نکند زیرا این موضوع منجر به کارایی ضعیف مدل روی دادههای تست میشود. با این وجود مدلهای طبقهبندی کنندهی مدرن تقریباً بر دادههای آموزش منطبق هستند. در واقع یکی از اصول اساسی در روشهای یادگیری ماشین کلاسیک ایجاد موازنه بین خطای آموزش و خطای تست است در حالی که در روشهای مدرن مانند شبکه عصبی که با دقت بالایی پیشبینی میکنند، این گونه نیست.
📝 این تناقض باعث بحث و گفتوگو بین پژوهشگران شده و آنها را با این سوالها مواجه کرده است که آیا اساساً این تئوری عملی است؟ ارتباط مبانی ریاضی یادگیری ماشین و مسائل دنیای واقعی چیست؟
💡پژوهشگران در این مقاله به این سوال پاسخ و درک روش کلاسیک و مدرن را در یک منحنی عملکرد یکپارچه وفق دادهاند. آنها طیف گستردهای از مدلها و مجموعه دادهها را بررسی کرده و ارتباط بین عملکرد، ساختار مدلهای یادگیری ماشین، محدودیتهای تحلیل کلاسیک و مفهوم تئوری و عملی یادگیری ماشین را شرح دادهاند.
📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعیپور
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک_آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
📌لینک سایت:
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5116
📌منبع:
https://www.pnas.org/content/116/32/15849.short
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
codecool.ir
وفق دادن روش یادگیری ماشین کلاسیک و مدرن
علی رغم اینکه پیشرفتها در حوزهی یادگیری ماشین و هوش مصنوعی در حال تغییر جامعه است، درک اساسی ما از موضوع هماهنگ با این پیشرفتها نیست. در مدلهای کلاسیک یادگیری ماشین اعتقاد بر این است که مدل مناسب مدلی است که کاملاً با دادههای آموزش مطابقت نکند زیرا این…
Bioinformatics
🌺 به مناسبت نخستین سالگرد تاسیس کانال، مدیریت گروه کدکول تصمیم دارد در سه بخش مجزا به معرفی مختصری از اعضای تخصصی این گروه و فعالیت های آن ها بپردازد. 📌گروه زیست داده کاو کدکول از سال 1395 به طور رسمی کار خود را آغاز نمود. آموزش مهارت های بیوانفورماتیکی و…
🛠 تیم های تخصصی گروه زیست داده کاو کدکول در حوزه های زیر فعلالیت دارند:
🔶 آنالیز داده های حجیم زیستی
🔶 مشاوره پروژه های تحقیقاتی
🔶 طراحی و توسعه نرم افزار های تخصصی
🔶 طراحی و پیاده سازی وب سایت
🔶 طراحی و توسعه اپلیکیشن موبایل
🔶 تصویر سازی حرفه ای مقالات علمی
🔶 طراحی گرافیک
🔶 ترجمه تخصصی متون علمی
👨👨👦👦 اعضای تخصصی ما در کدکول که به بیش از 20 متخصص رسمی و انحصاری و 40 عضو پاره وقت می رسد، از برجسته ترین نخبگان برنامه نویسی، تحلیل داده، هوش مصنوعی (یادگیری ماشین)، داده کاوی و بیوانفورماتیک در بهترین دانشگاه های کشور هستند که در3 دپارتمان پژوهش، آموزش و توسعه و تولید ابزار های تحلیل داده گرد آمده اند.
🔶 سابقه فعالیت این عزیزان به سال های قبل از همکاری با گروه زیست داده کاو کدکول بر می گردد اما گروه زیست داده کاو کدکول مفتخر است که با بیش از 10 دانشگاه برتر کشور فعالیت داشته و توانسته در حوزه های آموزش و پژوهش به اساتید و دانشجویان خدمات علمی خود را ارائه کرده است.
🔶 آنالیز داده های حجیم زیستی
🔶 مشاوره پروژه های تحقیقاتی
🔶 طراحی و توسعه نرم افزار های تخصصی
🔶 طراحی و پیاده سازی وب سایت
🔶 طراحی و توسعه اپلیکیشن موبایل
🔶 تصویر سازی حرفه ای مقالات علمی
🔶 طراحی گرافیک
🔶 ترجمه تخصصی متون علمی
👨👨👦👦 اعضای تخصصی ما در کدکول که به بیش از 20 متخصص رسمی و انحصاری و 40 عضو پاره وقت می رسد، از برجسته ترین نخبگان برنامه نویسی، تحلیل داده، هوش مصنوعی (یادگیری ماشین)، داده کاوی و بیوانفورماتیک در بهترین دانشگاه های کشور هستند که در3 دپارتمان پژوهش، آموزش و توسعه و تولید ابزار های تحلیل داده گرد آمده اند.
🔶 سابقه فعالیت این عزیزان به سال های قبل از همکاری با گروه زیست داده کاو کدکول بر می گردد اما گروه زیست داده کاو کدکول مفتخر است که با بیش از 10 دانشگاه برتر کشور فعالیت داشته و توانسته در حوزه های آموزش و پژوهش به اساتید و دانشجویان خدمات علمی خود را ارائه کرده است.
📝 تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_پسادکتری
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📌منبع:
http://novinscholarships.com/?p=11382
سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_پسادکتری
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📌منبع:
http://novinscholarships.com/?p=11382
Bioinformatics
🌺 به مناسبت نخستین سالگرد تاسیس کانال، مدیریت گروه کدکول تصمیم دارد در سه بخش مجزا به معرفی مختصری از اعضای تخصصی این گروه و فعالیت های آن ها بپردازد. 📌گروه زیست داده کاو کدکول از سال 1395 به طور رسمی کار خود را آغاز نمود. آموزش مهارت های بیوانفورماتیکی و…
📑ازجمله فعالیت های یک سال اخیر مجموعه کدکول می توان به طور خلاصه به موارد زیر اشاره کرد:
👨🎓پذیرش بیش از 300 نفر دانشجوی علاقه مند به مهارت های علمی برتر در طول دو سال
👨🏫 برگزاری بیش از 1000 ساعت کلاس آموزشی در حوزه های برنامه نویسی، تحلیل داده های ژنتیکی، کار با داده های امیکس (پروتئومیکس-ژنومیکس).
👨💻 همکاری در بیش از ده ها پروژه داده کاوی و تحلیل داده
👨🔧 بیش از 100 ساعت مشاوره تخصصی در حوزه بیوانفورماتیک، طراحی وب و تحلیل داده
👨🎓پذیرش بیش از 300 نفر دانشجوی علاقه مند به مهارت های علمی برتر در طول دو سال
👨🏫 برگزاری بیش از 1000 ساعت کلاس آموزشی در حوزه های برنامه نویسی، تحلیل داده های ژنتیکی، کار با داده های امیکس (پروتئومیکس-ژنومیکس).
👨💻 همکاری در بیش از ده ها پروژه داده کاوی و تحلیل داده
👨🔧 بیش از 100 ساعت مشاوره تخصصی در حوزه بیوانفورماتیک، طراحی وب و تحلیل داده
🌱 "برگ مصنوعی" که با انرژی خورشید کار میکند با موفقیت از آب و CO2، گاز طبیعی پاک تولید کرد
🌿 محققان با الهام از فرایند فوتوسنتز که گیاه به وسیلهی آن با کمک انرژی خورشید، غذای مورد نیازش را از کربن دیاکسید میسازد، برگ مصنوعی ساختند که قادر است با انرژی خورشیدی از آب و کربن دیاکسید، گاز تولید کند.
🏭 گازی که در صنعت کاربرد فراوانی دارد و امروزه از سوخت فسیلی به دست میآید، میتواند با گاز تولید شده توسط برگ مصنوعی جایگزین شود.
⛽️ باتوجه به رو به اتمام بودن منابع سوختهای فسیلی، برگ مصنوعی با استفاده از انرژی خورشیدی و حفظ عملکرد خود تا حد قابل قبول در روزهای ابری جایگزین مناسبی برای تولید گاز مورد نیاز صنایع به حساب میآید.
⚙️ گاز تولید شده به وسیلهی برگ مصنوعی که سینگس(syngas) نامیده میشود، تنها از مخلوط هیدروژن و منواکسیدکربن تولید شده و از آن برای تولید طیف وسیعی از مواد مانند سوختها، مواد دارویی، پلاستیک، کود و ... استفاده میشود.
♻️ برخلاف فرایندهای صنعتی کنونی، هنگام تولید سینگس توسط برگ مصنوعی هیچ فرآوردهی کربن دیاکسید اضافی به اتمسفر آزاد نمیشود.
❇️ به گفتهی محققان این پروژه گام بعدی تولید اتانول به همین روش است، که بتوان از آن مستقیما به عنوان سوخت مایع استفاده کرد. هرچند فرایند تولید یک مرحلهای اتانول با انرژی خورشیدی از کربن دیاکسید بسیار چالش برانگیز است، این محققان امید دارند، با فناوری که به آن دست یافتهاند این فرایند هم در آیندهی نزدیک محقق شود.
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📝تهیه و تنظیم : #سارا_فیاضزاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری
⬅️ برای اطلاعات بیشتر به سایت کدکول سربزنید یا روی عنوان خبر کلیک کنید:
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5117
📌منبع :
https://www.nature.com/articles/s41563-019-0501-6
🌿 محققان با الهام از فرایند فوتوسنتز که گیاه به وسیلهی آن با کمک انرژی خورشید، غذای مورد نیازش را از کربن دیاکسید میسازد، برگ مصنوعی ساختند که قادر است با انرژی خورشیدی از آب و کربن دیاکسید، گاز تولید کند.
🏭 گازی که در صنعت کاربرد فراوانی دارد و امروزه از سوخت فسیلی به دست میآید، میتواند با گاز تولید شده توسط برگ مصنوعی جایگزین شود.
⛽️ باتوجه به رو به اتمام بودن منابع سوختهای فسیلی، برگ مصنوعی با استفاده از انرژی خورشیدی و حفظ عملکرد خود تا حد قابل قبول در روزهای ابری جایگزین مناسبی برای تولید گاز مورد نیاز صنایع به حساب میآید.
⚙️ گاز تولید شده به وسیلهی برگ مصنوعی که سینگس(syngas) نامیده میشود، تنها از مخلوط هیدروژن و منواکسیدکربن تولید شده و از آن برای تولید طیف وسیعی از مواد مانند سوختها، مواد دارویی، پلاستیک، کود و ... استفاده میشود.
♻️ برخلاف فرایندهای صنعتی کنونی، هنگام تولید سینگس توسط برگ مصنوعی هیچ فرآوردهی کربن دیاکسید اضافی به اتمسفر آزاد نمیشود.
❇️ به گفتهی محققان این پروژه گام بعدی تولید اتانول به همین روش است، که بتوان از آن مستقیما به عنوان سوخت مایع استفاده کرد. هرچند فرایند تولید یک مرحلهای اتانول با انرژی خورشیدی از کربن دیاکسید بسیار چالش برانگیز است، این محققان امید دارند، با فناوری که به آن دست یافتهاند این فرایند هم در آیندهی نزدیک محقق شود.
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📝تهیه و تنظیم : #سارا_فیاضزاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری
⬅️ برای اطلاعات بیشتر به سایت کدکول سربزنید یا روی عنوان خبر کلیک کنید:
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5117
📌منبع :
https://www.nature.com/articles/s41563-019-0501-6
Nature
Bias-free solar syngas production by integrating a molecular cobalt catalyst with perovskite–BiVO4 tandems
Nature Materials - Photoelectrochemical production of syngas from water and CO2 is technologically attractive but overpotentials, low selectivity and catalyst cost remain challenging. Tunable...
💢 شروع کلاس جمعه
📆 ۱۷ آبان ماه
⏰ ساعت ۱۰:۳۰ تا ۱۳
⌛️طول دوره ۵ هفته
👨💻#رسم_نمودارهای_علمی_با_آر
🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی
📜 با ارائه مدرک معتبر
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
📆 ۱۷ آبان ماه
⏰ ساعت ۱۰:۳۰ تا ۱۳
⌛️طول دوره ۵ هفته
👨💻#رسم_نمودارهای_علمی_با_آر
🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی
📜 با ارائه مدرک معتبر
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool5
🤯تکنولوژی خواندن ذهن، کاری که شرکت های خصوصی می توانند به آن دست یابند:
🌧هوا بارانی است و شما از محل کار به سمت ایستگاه قطار می روید و چتر🌂 هم به همراه ندارید. ناگهان یک بارانی در ویترین مغازه ایی توجه شما را جلب میکند و با خودتان فکر میکنید:" یک بارانی مانند این، برای چنین هوایی می تواند عالی باشد."
🚊در قطار همانطور که صفحه اینستاگرام خود را بالا و پایین می برید، باز هم یک بارانی مشابه میبینید! نگاه دقیقتری می اندازید، در واقع این همان بارانی است؛ ناگهان با خود فکر میکنید:" نکند با صدای بلند چیزی درباره بارانی گفته باشم؟ آیا اینستاگرام به نحوی ذهن من را خوانده است؟"
💻در سال گذشته، محققان ثابت کردند که می توانند با استفاده از الگوریتم های پیچیده هوش مصنوعی فعالیت های مغزی را با استفاده از ثبت و رمزگشایی سیگنال های عصبی یک فرد، به کلمات یا متن ترجمه کنند.
🛠یک BGI وسیله ایی است برای ایجاد ارتباط بین مغز و یک ماشین که اساس این تکنولوژی توانایی رمزگشایی سیگنال های عصبی مغز و تبدیل آن به دستوراتی است که برای ماشین قابل درک می باشد. اما سیگنال های مغزی پراکنده هستند و رمزگشایی آن ها بسیار پیچیده است.
📆در آوریل امسال (۲۰۱۹) یک تیم تحقیقاتی در دانشگاه کالیفرنیا، نتایج موفقیت آمیزی از ترجمه فعالیت های عصبی به کلمات با یک BGI با کمک یادگیری عمیق؛ گزارش کردند.
گوپالا آنومانچیپالی، سرگروه تیم میگوید:" این نتایج می تواند کمکی باشد برای افرادی که نمی توانند صحبت کنند مانند افرادی که مبتلا به اسکلروز جانبی آمیوتروفیک و یا سکته مغزی هستند، که از هوشیاری برخوردارند اما نمیتوانند حرکات ارادی داشته باشند."
🔖 409 کلمه
⏰ زمان مطالعه: کمتر از 3 دقيقه
📌 متن کامل این مطلب را در لینک زیر بخوانید:
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5118
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
تهیه تنظیم: #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت مدرس
شنبه ها: #علمی_اجتماعی
📚منبع:
https://www.theguardian.com/technology/2019/oct/24/mind-reading-tech-private-companies-access-brains
🌧هوا بارانی است و شما از محل کار به سمت ایستگاه قطار می روید و چتر🌂 هم به همراه ندارید. ناگهان یک بارانی در ویترین مغازه ایی توجه شما را جلب میکند و با خودتان فکر میکنید:" یک بارانی مانند این، برای چنین هوایی می تواند عالی باشد."
🚊در قطار همانطور که صفحه اینستاگرام خود را بالا و پایین می برید، باز هم یک بارانی مشابه میبینید! نگاه دقیقتری می اندازید، در واقع این همان بارانی است؛ ناگهان با خود فکر میکنید:" نکند با صدای بلند چیزی درباره بارانی گفته باشم؟ آیا اینستاگرام به نحوی ذهن من را خوانده است؟"
💻در سال گذشته، محققان ثابت کردند که می توانند با استفاده از الگوریتم های پیچیده هوش مصنوعی فعالیت های مغزی را با استفاده از ثبت و رمزگشایی سیگنال های عصبی یک فرد، به کلمات یا متن ترجمه کنند.
🛠یک BGI وسیله ایی است برای ایجاد ارتباط بین مغز و یک ماشین که اساس این تکنولوژی توانایی رمزگشایی سیگنال های عصبی مغز و تبدیل آن به دستوراتی است که برای ماشین قابل درک می باشد. اما سیگنال های مغزی پراکنده هستند و رمزگشایی آن ها بسیار پیچیده است.
📆در آوریل امسال (۲۰۱۹) یک تیم تحقیقاتی در دانشگاه کالیفرنیا، نتایج موفقیت آمیزی از ترجمه فعالیت های عصبی به کلمات با یک BGI با کمک یادگیری عمیق؛ گزارش کردند.
گوپالا آنومانچیپالی، سرگروه تیم میگوید:" این نتایج می تواند کمکی باشد برای افرادی که نمی توانند صحبت کنند مانند افرادی که مبتلا به اسکلروز جانبی آمیوتروفیک و یا سکته مغزی هستند، که از هوشیاری برخوردارند اما نمیتوانند حرکات ارادی داشته باشند."
🔖 409 کلمه
⏰ زمان مطالعه: کمتر از 3 دقيقه
📌 متن کامل این مطلب را در لینک زیر بخوانید:
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5118
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
تهیه تنظیم: #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت مدرس
شنبه ها: #علمی_اجتماعی
📚منبع:
https://www.theguardian.com/technology/2019/oct/24/mind-reading-tech-private-companies-access-brains
codecool.ir
تکنولوژی خواندن ذهن، کاری که شرکت های خصوصی می توانند به آن دست یابند
🌧هوا بارانی است و شما از محل کار به سمت ایستگاه قطار می روید و چتر🌂 هم به همراه ندارید. ناگهان یک بارانی در ویترین مغازه ایی توجه شما را جلب میکند و با خودتان فکر میکنید:" یک بارانی مانند این، برای چنین هوایی می تواند عالی باشد."🚊در قطار همانطور که صفحه اینستاگرام…
👍1
📝تهیه و تنظیم: #مسلم_عسگری پژوهشگر حوزه #بیوانفورماتیک
یکشنبه ها: #معرفی_کتاب
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
یکشنبه ها: #معرفی_کتاب
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
Deep Learning for the Life Sciences(2019).pdf
24.2 MB
[ File :Deep Learning for the Life Sciences(2019).pdf ]
فایل #pdf کتاب "یادگیری عمیق برای علوم زیستی"
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
فایل #pdf کتاب "یادگیری عمیق برای علوم زیستی"
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🌀روش های محاسباتی برای آنالیز سیستماتیک تغییرات مولکولی مرتبط با سالخوردگی
🔬در سال های اخیر پیشرفت در زمینه توالی یابی و به خصوص توالی یابی با عملکرد بالا، افق جدیدی را برای محققان زیست شناسی گشوده است. از طرفی تکنولوژی omics منجر به ایجاد چالش های جدیدی از جمله پردازش، یکپارچه سازی و تفسیر داده های حاصل از این تکنولوژی شده است. به دنبال پیشرفت در این زمینه، روش های جدید محاسباتی راه گشای تحلیل این داده های خام شده اند.
🧬🧬آنالیز داده های omics به منظور درک مبحث سالخوردگی، یکی از زمینه هایی است که در سال های اخیر به آن توجه شده است. این تحقیقات با چالش جدیدی روبرو هستند و آن هم بُعد زمان است که در این نوع مطالعات از اهمیت ویژه ای برخوردار می باشد. در طی سالخوردگی شبکه های سلولی وضعیت خود را به دلایلی چون آسیب دیدن DNA و همچنین کاهش تلومر که خود درنتیجه سالخوردگی اتفاق می افتد ، تغییر می دهند.
👨💻چالش های اصلی که در این نوع از تحقیقات وجود دارد بدین شرح است: 1)داده ها الزاما باید در طول زمان تفسیر شوند 2)با افزایش سالخوردگی، ناهمگنی سیستم های زیستی افزایش می یابد. 3)تمایز (تغییرات در سطح سلولی و مولکولی) میان علت سالخوردگی و نتایج حاصل از سالخوردگی کار دشواری است.
🎯 در این مقاله مروری، روشهای محاسباتی انتخاب و بررسی شده اند که در ترکیب با تکنیکهای پروفایلینگ مولکولی به ارتقا درک ما نسبت به زیست شناسی سالخوردگی کمک می کند. به علاوه نویسندگان روش های محاسباتی را بر اساس اینکه برای پردازش چه نوع داده هایی(single omics یا multiple omics) طراحی شده اند، دسته بندی کرده اند.
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5119
🔖 267 کلمه
⏰ زمان مطالعه: کمتر از 2 دقيقه
📝 تهیه و تنظیم: #غزاله_فهیمیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌لینک مقاله:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1740675718300148
🔬در سال های اخیر پیشرفت در زمینه توالی یابی و به خصوص توالی یابی با عملکرد بالا، افق جدیدی را برای محققان زیست شناسی گشوده است. از طرفی تکنولوژی omics منجر به ایجاد چالش های جدیدی از جمله پردازش، یکپارچه سازی و تفسیر داده های حاصل از این تکنولوژی شده است. به دنبال پیشرفت در این زمینه، روش های جدید محاسباتی راه گشای تحلیل این داده های خام شده اند.
🧬🧬آنالیز داده های omics به منظور درک مبحث سالخوردگی، یکی از زمینه هایی است که در سال های اخیر به آن توجه شده است. این تحقیقات با چالش جدیدی روبرو هستند و آن هم بُعد زمان است که در این نوع مطالعات از اهمیت ویژه ای برخوردار می باشد. در طی سالخوردگی شبکه های سلولی وضعیت خود را به دلایلی چون آسیب دیدن DNA و همچنین کاهش تلومر که خود درنتیجه سالخوردگی اتفاق می افتد ، تغییر می دهند.
👨💻چالش های اصلی که در این نوع از تحقیقات وجود دارد بدین شرح است: 1)داده ها الزاما باید در طول زمان تفسیر شوند 2)با افزایش سالخوردگی، ناهمگنی سیستم های زیستی افزایش می یابد. 3)تمایز (تغییرات در سطح سلولی و مولکولی) میان علت سالخوردگی و نتایج حاصل از سالخوردگی کار دشواری است.
🎯 در این مقاله مروری، روشهای محاسباتی انتخاب و بررسی شده اند که در ترکیب با تکنیکهای پروفایلینگ مولکولی به ارتقا درک ما نسبت به زیست شناسی سالخوردگی کمک می کند. به علاوه نویسندگان روش های محاسباتی را بر اساس اینکه برای پردازش چه نوع داده هایی(single omics یا multiple omics) طراحی شده اند، دسته بندی کرده اند.
📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
http://codecool.ir/journal%20detail?file=5119
🔖 267 کلمه
⏰ زمان مطالعه: کمتر از 2 دقيقه
📝 تهیه و تنظیم: #غزاله_فهیمیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌لینک مقاله:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1740675718300148