🌌 آیا می توان یک سیاه چاله را از بین برد؟

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

🎙صداگذاری و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

📝 ترجمه :#سارا_فیاض‌زاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه‌ها: #فیلم

#داستان_طنز
#رابطه_زیستی

📌وقتی زیادی درس میخونی...

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📱 آیا از طریق اطلاعات تلفن همراه می توان اقدام به خودکشی را پیش بینی نمود؟


⏰ ظهر هر چهارشنبه زنگ هشداری بر تلفن همراه حدود ۵۰ نوجوان در نیویورک و پنسیلوانیا ارسال می گردد و این سوالات را مطرح می کند:
🔹 در هفته گذشته چند بار به پایان دادن به زندگی خود فکر کرده اید؟
🔹 آیا برنامه ای برای پایان دادن به زندگی خود ریخته اید؟
🔹 آیا اقدامی جهت پایان دادن به زندگی خود انجام داده اید؟


📂 افراد ۱۳-۱۸ ساله پاسخ های خود را به سرورهای ایمن ارسال می کنند. آنها با آگاهی والدین خود، به ضبط شبانه روزی زندگی دیجیتال شان به مدت ۶ ماه توافق کرده اند، جزئیات و داده هایی که پرسشنامه های پزشکان قادر به پاسخگویی به آن نیستند، با این شیوه جمع آوری می گردد. مانند پیام های ارسالی، پست های شبکه های اجتماعی، لحن صدا در تماس های تلفنی، حالت چهره در سلفی ها، موسیقی پخش شده، میزان تحرک در طول روز و مقدار زمان در خانه ماندن.

⛔️ اکثر این نوجوانان اخیرا اقدام به خودکشی کرده بودند یا افکاری در این رابطه داشته اند و همه درگیر بیماری ذهنی چون افسردگی بوده اند.

💻 این مطالعه با نام 'ارزیابی تلفن همراه جهت پیش بینی خودکشی' (MAPS) یکی از چندین تلاش ابتدایی صورت گرفته برای محک جریان اطلاعات دستگاه تلفن همراه است و در تلاش برای پاسخگویی به این سوال است که "چطور می توان احتمال اقدام به خودکشی را پیش بینی نمود؟"


✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


📌منبع:
https://science.sciencemag.org/content/365/6455/742

📚تهیه و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #کتاب_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

💢شروع کلاس جمعه

📆 ۸ شهریور ماه

⏰ساعت ۱۹ تا ۲۱

⌛طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره ۳۴۹ هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4

🌀تکامل رژیم غذایی در میان درخت زندگی جانوری 🌮


🔸آن چه یک جانور می خورد اساسی ترین جنبه زیستی آن موجود است، اما جای تعجب است که تکامل رژیم غذایی تاکنون در سراسر فرمانروایی جانوران مورد مطالعه قرار نگرفته است.


🎯 در این مقاله یک تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی در مقیاس بزرگ برای پاسخگویی به سه سوال حل نشده 🔒درباره تکامل رژیم های غذایی جانوران انجام شده است.


1- آیا رژیم های غذایی در سراسر درخت فیلوژنی جانوران حفاظت شده است؟
2- آیا رژیم غذایی در نرخ ازدیاد گونه ها در میان شاخه های جانوری تأثیر دارد؟
3- رژیم غذایی اجداد جانوران و کلادهای اصلی جانوری چه بوده است؟


👨‍💻 در این پژوهش، دانشمندان داده های رژیم غذایی 1087 گونه و ترجیحات رژیم غذایی آن ها را بر روی یک درخت تکاملی ساخته شده از داده های توالی DNA ترسیم کردند و روابط تکاملی آن ها را مورد تجزیه و تحلیل قرار دادند.


📊 بررسی ها نشان می دهد که در بین جانوران، 🥩 رژیم غذایی گوشتخواری رایج (حدود 63 درصد)، 🥬گیاهخواری کمتر رایج (حدود 32 درصد) و 🍔 همه چیز خواری نسبتاً نادر (حدود 3 درصد) است.


🔺علیرغم اختلاف نظرهای زیاد درباره این که آیا صفات اکولوژیکی حفاظت شده یا ناپایدار هستند، این پژوهشگران حفاظت شدگی شدیدی را در رژیم غذایی طی یک دوره زمانی بسیار طولانی پیدا کردند.


🔹همچنین آشکار گردید که رژیم غذایی با میزان تنوع گونه ها در میان شاخه جانوران ارتباطی ندارد، برخلاف مطالعات قبلی که نشان می داد گیاهخواری باعث افزایش تنوع در برخی گروه های مهم (مثل سخت پوستان 🦞، حشرات🐞 و پستانداران 🐏) می شود.


🔻سرانجام این پژوهشگران به این نتیجه رسیدند که اجداد همه جانوران به احتمال زیاد گوشتخوار بوده اند، همان طور بسیاری از شاخه های اصلی (مانند بندپایان 🐜، نرم تنان 🐌 و طناب داران 🐃).


👨‍💻 نتایج حاصل از این پژوهش به طور قابل ملاحظه ای حاکی از آن است که بسیاری از گونه های گوشتخوار امروزی ممکن است این رژیم غذایی را از اجداد گوشتخوار در بازه زمانی بیش از 800 میلیون سال حفظ کرده باشند.



📝 تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=4087


📌لینک مقاله:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/evl3.127

📝تهیه و تنظیم : #ساره_عامری_فر دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


سه شنبه ها : #معرفی_سایت
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران

@Iran_bioinformatics💫

📌 جهت مشاهده سایر وبسایت های کاربردی به وب سایت ما به نشانی زیر مراجعه بفرمایید☺️👇

http://www.codecool.ir/journal?journal=3

🗣 محققان موفق به ابداع گجت پوشیدنی شدند که به افراد فاقد توانایی تکلم کمک می‌کند تا صحبت کنند.

🔉🎤 این دستگاه که گلوی گرافنی مصنوعی پوشیدنی ( Wearable Artificial Graphene Throat) نام دارد، به گلو می‌چسبد و حرکات گلو را به آوا تبدیل می‌کند.

📟 دستگاه‌هایی که قابلیت اندازه‌گیری حرکات ظریف روی پوست مانند ضربان قلب و نبض را داشته باشند، پیش از این ساخته شده بودند؛ اما توانایی تبدیل این حرکات به صدا را نداشتند و یا از لحاظ سخت افزاری به گونه‌ای بودند که پوشیدن آنها برای مدت طولانی امکان پذیر نبود.

🔳 همانطور که از اسم این گجت پیداست، از گرافن تهیه شده که به کمک لیزر روی ورقه‌ای بسیار نازک از پلی‌وینیل‌الکل قرارگرفته است که به راحتی به گلوی فرد می‌چسبد، انعطاف‌پذیر است و اندازه‌ی کوچکی دارد. این قسمت به کمک الکترودهایی به یک بازوبند متصل می‌شود، که خود شامل یک مدار، میکروکامپیوتر، تقویت کننده و رمزگشاست.

💡 با بهره‌گیری از خواص و عملکرد مکانیکی-الکتریکی فوق‌العاده‌ی گرافن و مدار ساخته شده توسط تیم تحقیقاتی با قابلیت دوگانه‌ی تشخیص و انتشار صوت، این دستگاه می‌تواند حرکات قوی یا ضعیف را در ناحیه گلو تشخیص دهد و آنها را تبدیل به آواهایی مثل «بله» و «خیر» کند.

👩🏻‍💻👨🏻‍🔧 این تیم تحقیقاتی بر این باور است که در آینده نزدیک، می‌توان به افراد فاقد توانایی تکلم آموزش داد تا سیگنال‌هایی را با گلوی خود تولید کنند که به کمک این دستگاه بتوان آن را به یک گفتار روان تبدیل کرد.

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

📝تهیه و تنظیم : #سارا_فیاض_زاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری



📌منبع:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/m/pubmed/31268667/

📌لینک سایت:
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=4089

#داستان_طنز
#من_و_استاد_راهنمام

📌وقتی استاد راهنمات از محوطه دانشگاه برت میداره میاره آزمایشگاه سر پایان نامه‌ات 😅

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

چرا و چگونه قسمت های بدن دچار خارش می شوند؟ چرا خاراندن احساس خوبی دارد؟
خارش، یک احساس عمومی ناشی از تحریک سلول های پوستی یا سلول های عصبی مرتبط با پوست است. در حالی که خارش می تواند یک مزاحمت باشد، به عنوان یک مکانیسم مهم حسی و حفاظتی، مانند سایر احساسات پوستی چون لمس ، درد ، لرزش ، سرما و گرما نیز عمل می کند.

خارش علامت غالب بسیاری از بیماری های پوستی است و همچنین در برخی از بیماری ها که بر کل بدن تأثیر می گذارد نیز وجود دارد.
احساس خارش پوست به دلیل تحریک پروپیواسپتورها (انتهای عصب حساس به خارش) توسط واسطه های مکانیکی، حرارتی یا شیمیایی بوجود می آید.

به طور کلی، خارش شامل فعال شدن پروپیواسپتورهای سلولهای عصبی تخصصی به نام الیاف C می باشد که از نظر عملکردی مجزا هستند و فقط احساس خارش را منتقل می کنند. این الیاف C هنگامی که به صورت سطحی بر روی پوست تحریک می شوند، سیگنال هایی را در امتداد عصب به نخاع و به مغز منتقل می کنند در مغز این سیگنال ها پردازش می شوند و خارش یا مالشی مختصر در پاسخ به آن اتفاق می افتد.

اگرچه خاراندن برای رفع خارش مفید است، اما این کار فقط تسکین موقت را ارائه می دهد و ممکن است باعث تحریک بیشتر پوست و احتمالاً جراحت آن شود که می تواند عفونت را در پی داشته باشد. علیرغم تقریباً یک قرن تحقیق در مورد خارش، هیچ درمان اختصاصی در این رابطه وجود ندارد، اما چندین ماده موضعی و خوراکی در دسترس هستند که خارش در برخی نقاط را از بین می برند. این عوامل شامل لوسیون ها و کرم ها (مانند کالامین و هیدروکورتیزون)، آنتی هیستامین ها، آنتاگونیست های مواد افیونی، آسپرین و نور درمانی ماوراء بنفش می باشد.
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics 💫

📝تهیه و تنظیم: #عطیه_احمدی دانشجوی #ارشد_بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها علمی_اجتماعی

📌لینک سایت :
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=5089

📌منبع:
https://www.scientificamerican.com/article/experts-why-we-itch-and-scratch/

💢 دوره فشرده یک روزه لینوکس

📆 ۱۸ شهریور ماه

⏰ ساعت ۹ تا ۲۱

💰 هزینه دوره ۳۹۵ هزار تومان

👨‍💻#آشنایی_با_دستورات_پرکاربرد_لینوکس

🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4

📝تهیه و تنظیم: #دانیال_خدیوی دانشجو ارشد بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

فایل #pdf کتاب "اصول عملی آنالیز داده های توالی یابی RNA"

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

💢شروع کلاس جمعه

📆 ۱۵ شهریور ماه

⏰ساعت ۱۲:۳۰ تا ۱۴:۳۰

⌛طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره ۳۴۹ هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4

✏️تشخیص کمپلکس های پروتئینی و دسته بندی کمی آن با CN-PAGE

اکثر فرایندهای سلولی بر عهده ی کمپلکس های پروتئینی است. پیش از این شناسایی کمپلکس های پروتئینی به کمک ترکیبی از روش های جداسازی بر حسب اندازه و طیف سنجی جرمی انجام شده است. با این حال، بسیاری از این روش ها فاقد اطلاعات کمی جهت درک چگونگی تاثیر تغییرات فراوانی و ترکیب کمپلکس های پروتئینی بر شارهای متابولیکی هستند.

🌿در این مقاله رویکرد مطالعه کمی کمپلکس های پروتئینی در گیاه آرابیدوپزیز(Arabidopsis) در پایان روز و در پایان شب ارائه شده است.

💡مشاهدات این مقاله نشان می دهد تقسیم اندازه کمپلکس های پروتئینی به وسیله CN-PAGE همراه با طیف سنجی جرمی می تواند جهت ایجاد پروفایل های فراوانی در طول شیب وزن مولکولی مورد استفاده قرار گیرد. علاوه بر آن با تجزیه پروفایل های فراوانی کمپلکس پروتئینی می توان به طور قابل ملاحظه ای خوشه بندی پروفایل های پروتئینی را بهبود بخشید.

این مقاله از فاصله اقلیدسی بین جفت های پروتئینی برای تشخیص میان کنش های فرضی کمپلکس های پروتئینی و در نهایت تشخیص کمپلکس های پروتئینی استفاده می کند. مقادیر آستانه ای قابل قبول که برپایه یک برش هستند به وسیله آنالیز منحنی مشخصه گیرنده- گرداننده (Receiver-Operator Characteristic) بهینه شده است.

📝رویکرد این مقاله تنوع فنی کمی را نشان می دهد و به راحتی می تواند برای مطالعه کمپلکس های پروتئینی در هر سیستم بیولوژیکی استفاده شود.

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics 💫

📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی دانشجوی #ارشد_بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها : #مقاله_هفته

📌لینک سایت :
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=5091

📌منبع:
https://www.nature.com/articles/s41598-019-47829-7

Protein Complex Identification and quantitative complexome by CN-PAGE
Protein Complex Identification and quantitative complexome by CN-PAGE

🌀 تولید دستگاه قابل‌حمل توالی‌‌یاب

✅ یک شرکت انگلیسی به نام Oxford Nanopore Technologies اولین دستگاه قابل حمل توالی‌یابی DNA 🧬 را تولید کرده‌است. این دستگاه USB با نام minION کوچک‌تر از یک تلفن معمولی است و برای توالی‌یابی رشته‌های طولانی DNA به یک لپ‌تاپ معمولی 💻 متصل می‌شود. minION قبلاً برای توالی‌یابی ژنوم انسانی مورد استفاده قرار گرفته‌است و همچنین توانسته‌است برخی از شکاف‌های شناخته شده در داده‌ها را پر کند.

✅ این دستگاه بر روی آنچه فناوری nanopore نامیده می‌شود کار می‌کند. داخل یک مولکول پروتئین منافذی وجود دارد که در یک غشای مصنوعی تعبیه شده و در یک مایع غوطه‌ور است. هنگامی که یک ولتاژ در غشاء اعمال می‌شود، یون‌ها از درون منافذ جریان می‌یابند و می‌توان جریان الکتریکی را اندازه‌گیری کرد. انسداد منافذ توسط هر مولکول دیگر مانند DNA منجر به افت جریان الکتریکی می‌شود.

مولکول DNA از چهار نوع باز مختلف تشکیل شده‌است: آدنین (A)، تیمین (T)، گوانین (G) و سیتوزین (C). هر یک از این بازها جریان را در سراسر منافذ به سطوح مختلف تغییر می‌دهند. بنابراین با اندازه گیری جریان، می‌توان چهار باز مختلف را شناسایی کرد و با تکرار این کار، minION می‌تواند توالی A ،T ،G و C را روی رشته های DNA بخواند.

📝به نقل از Bloomberg، توالی‌یاب minION بسیار سریع‌تر از سایر دستگاه‌های تعیین توالی ، مانند Illumina وسایر دستگاه‌های توالی‌یاب در بازار است. minION با رشته‌های DNA طولانی‌تر ، حدود 882،000 جفت باز کار می‌کند ، در صورتی که سایر دستگاه‌های توالی‌یاب با طول خوانش‌های کوتاه‌تر از 100-200 جفت باز کار می‌کنند. یک مزیت بارز این روش این است که اجازه می‌دهد تا برخی ویژگی‌های اپی ژنتیکی مانند متیلاسیون حفظ شود.

❌ نقطه ضعف اصلی سیستم minION این است که میزان خطای آن 1 در 100 باز است که بسیار بیشتر از سایر فناوری‌های تعیین توالی است، اگرچه با اندازه‌گیری‌های مکرر می‌توان تا حدودی این خطا را جبران کرد.

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعی‌پور
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه‌ها: #اخبار_فناوری

📌لینک سایت:
http://www.codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=5092

📌منبع:
https://thewire.in/science/handheld-device-set-to-take-over-dna-sequencing-industry

#داستان_طنز
#من_و_جلسه_دفاع

وقتی یکی از داورهای مقاله ام میگه چیزی رو که پیش بینی کردی آزمایش کن 📌 😅

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🌨🌨پژوهش‌گران یک پروتئین گیرنده را با قابلیت تشخیص فرا رسیدن زمستان شناسایی کرده‌اند.❄❄

یافته‌هایی (منتشر شده در مجله سِل در تاریخ 29 آگوست) از اولین پروتئین حساس به سرمای شدید شناخته شده پرده‌برداری می‌کنند.
شان ژو عضو هیئت علمی انستیتو علوم زیستی دانشگاه میشیگان و مؤلف ارشد این مطالعه می‌گوید: «به وضوح عصب‌های پوست سرما را احساس می‌کنند. اما هیچ فردی تا کنون نتوانسته است راهکار دقیقی برای چگونگی این احساس پیشنهاد دهد. اکنون فکر می‌کنم ما پاسخی داریم.»
زمانی که دمای محیط به درجات آزار دهنده و حتی خطرناک تقلیل می‌یابد، پروتئین‌های گیرنده درون اعصاب حسی پوست این تغییر را درک می‌کنند و این اطلاعات را به مغز می‌فرستند. این ارگانیسم در موجودات مختلف از انسان گرفته تا موجوداتی کوچکی مانند کرم‌ها وجود دارد که این گونه مطالعات در آزمایشگاه ژو تحت عنوان مدل Caenorhabditis elegans انجام می‌شود.
ژو می‌گوید: «وقتی از خانه بیرون می‌آیید و احساس سرما می‌کنید، شما تلاش می‌کنید در اولین فرصت به محیط گرم‌تر قبلی باز گردید. در مورد کرم‌ها هم همینطور است. وقتی آن‌ها احساس سرما می‌کنند نیز، رفتاری پرهیزجویانه از خود نشان می‌دهند: فرار از دمای سرد دقیقاً مانند انسان‌ها.»

طبق گفته‌ی ژو، جستجوهای پیشین برای یک گیرنده سرمایی معمولاً غیر موفق بوده، زیرا پژوهش‌گران تمرکزشان را روی گروه‌های خاصی از ژن‌های مرتبط با حس گذاشته بودند و این رویکردی سوگرایانه بود. با بهره‌گیری از سادگی الگانس ژو و همکارانش یک رویکرد غیر اریب در پیش گرفتند. آن‌ها هزاران تغییر تصادفی ژنتیکی را مورد بررسی قرار دادند تا بفهمند کدام یک در پاسخ کرم‌ها به سرما تأثیرگذارند.
پژوهش‌گران فهمیدند که کرم‌هایی که گیرنده گلوتامیت ژن glr-3 را از دست دادند، در شرایطی که دما به زیر 16 درجه سلسیوس (64 درجه فارنهایت) رسید، دیگر پاسخی به سرما ندادند. این ژن مسئول ساختن پروتئین گیرنده GLR-3 است. بدون این پروتئین، کرم‌ها به سرما بی‌حس شدند که نشان‌دهنده‌ی این است که این پروتئین برای اینکه کرم‌ها سرما را حس کنند لازم است.
علاوه بر این، ژن glr-3 در تکامل بین گونه‌های مختلف، از جمله انسان حفظ شده است. و به نظر می‌آید نسخه‌های دیگر ژن (مربوط به مهره‌داران) می‌توانند به عنوان گیرنده‌های حسی سرما عمل کنند.
وقتی پژوهشگران نسخه‌های ژن مربوط به پستانداران را به کرم‌های جهش‌یافته که glr-3 را نداشتند (و به سرما بی‌حس بودند) اضافه کردند، مشاهده کردند که حس سرمایی کرم‌ها برگشته است.


📝تهیه و تنظیم : #سیدعلی_میرمصطفی دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها: #علمی_اجتماعی


✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📌منبع:
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/08/190829150803.htm

📝تهیه و تنظیم: #م_ح

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

✏️روشی غنی برای انتخاب مجموعه پروب های بهینه متناظر با ژن

برای تفسیر ریزآرایه های (microarray) بیان ژن باید رابطه میان مجموعه پروب های ریز آرایه و ژن مدنظر مان را بررسی کنیم. این رابطه در اکثر چیپ های ریزآرایه شرکت Affemetrix یک رابطه یک به یک نیست و ممکن است ژن مورد نظر به وسیله مجموعه پروب های متعددی تشخیص داده شود. موضوع از این بایت اهمیت پیدا می کند که نتایج حاصل از این مجموعه پروب ها گاهی با یکدیگر در تناقض اند! بنابراین یافتن تخمینی از ژن مدنظر می تواند در انتخاب پروب ها و تفسیر صحیح آن راه گشا باشد. با این هدف، نویسندگان این مقاله یک روش امتیاز دهی توسعه داده اند که از مزایای آن می توان به افتراق مجموعه پروب های مشابه و کاهش آلودگی داده های حاصل اشاره کرد.

✅استفاده از این روش امتیاز دهی منجر به تناظر یک به یک میان مجموعه پروب و ژن مدنظر می شود و پیچیدگی ها و خطاهای حاصل از انتخاب پروب ها را کاهش می دهد.

💡برای تست این روش، تطابق مقادیر پروتئین و مقادیر بیان ژن و همچنین تشابه مجموعه های ژن هایی که همبستگی دارند ارزیابی شده است. نتایج حاصل از هر دو تست نشان دهنده دقت بالای این روش امتیاز دهی در تشخیص ژن هایی که با چند مجموعه پروب رابطه دارند و همچنین انتخاب بهترین مجموعه پروب است.

📝این روش، تناظر ساده و بی ابهامی میان پروب ها و ژن فراهم می کند تا ارزیابی بیان ژن ها با سهولت و دقت بالایی انجام شود.

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics 💫

📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی دانشجوی #ارشد_بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها : #مقاله_هفته

📌لینک سایت :
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=5093

📌منبع:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3266307/