Bioinformatics
2.79K subscribers
701 photos
84 videos
64 files
832 links
تنها کانال تخصصی بیوانفورماتیک ایران
🔺All in one!!🔺
💎Bioinformatics, Computational biology, Modern medicine and Biomedical informatics💎
👨‍💻Learn with experts!
🔥پزشکی نوین
‼️زیست شناسی محاسباتی
Download Telegram
[Richard_E._Neapolitan]_Probabilistic_Methods.pdf
4.6 MB
فایل #pdf کتاب "روش‌های احتمالاتی برای بیوانفورماتیک"

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
💊بررسی رویکرد ها و منابع موقعیت یابی مجدد دارو


🔴 کشف دارو یک فرآیند زمان بر، نیازمند سرمایه گذاری بالا و پرخطر است.

💡موقعیت یابی مجدد دارو در سالهای اخیر به یک استراتژی رایج استفاده مجدد از دارو برای کاربردهای دیگر تبدیل شده است. برخلاف استراتژی های تولید داروها این استراتژی کارآمد ، اقتصادی و بدون خطر است.

🔍دارو ماینوکسیدیل یکی از داروهایی است که به این صورت موقعیت یابی شده است و امروزه استفاده می شود. این دارو در ابتدا برای بیماران قلبی کشف شد. محققان جهت حل مشکل ریزش مو به بررسی این دارو پرداخته و مشخص شد دارو ماینوکسیدیل جهت ریزش مو بسیار خوب عمل میکند و عملا امروزه برای این مورد استفاده می شود.

🔹معمولاً سه نوع رویکرد باز آفرینی دارو وجود دارد: رویکردهای محاسباتی ، رویکردهای آزمایش بیولوژیکی و رویکردهای مختلط که همه آنها در موقعیت یابی مجدد دارو بسیار مورد استفاده قرار می گیرند.

🔶 در این مقاله ، رویکردهای محاسباتی مرور و ویژگی های شان برجسته شده است تا محققان به واسطه آن رویکردهای قدرتمندتری را توسعه دهند. علاوه برآن یافته های مهم به دست آمده با استفاده از این رویکردها نیز ذکر شده و 76 منبع مهم در مورد موقعیت یابی مجدد دارو را خلاصه شده است. سرانجام ، چالش ها و فرصت ها در تولید دارو از دیدگاه های مختلفی از جمله فناوری ، مدل های تجاری ، ثبت اختراعات و سرمایه گذاری مورد بحث قرار گرفته است.


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی
دانشجو ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


۲شنبه ها: #مقاله_هفته

📌منبع:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6097480/
💢 شروع کلاس جمعه

📆 ۸ شهریور ماه

ساعت ۱۳:۳۰ تا ۱۵:۳۰

طول دوره ۶ هفته

♦️هزینه دوره ۳۹۵ هزار تومان

👨‍💻#آشنایی_با_دستورات_پرکاربرد_لینوکس

🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر

👈 برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4
مدرس ها:
👨🏻‍🏫 دکتر سجاد قرقانی (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تهران و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران )
👨🏻‍🏫 دکتر مانی (عضو هیئت علمی گروه شیمی تجزیه دانشگاه تربیت مدرس )

🕰طول دوره: هشت هفته
چهارشنبه 18:00 - 20:00
📆 20 شهریور ماه

💎10 درصد تخفیف دانشجویی
😃 برگزای کلاس به صورت آنلاین💻
♦️جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool4

🌞کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞

@Iran_Bioinformatics💫
📉 کاهش نرخ سوخت و سازِ در حین راه رفتن و دویدن با استفاده از یک exosuit قابل حمل و چندکاره


🏃‍♀راه رفتن و دویدن اساسا بیومکانیک متفاوتی دارند، که توسعه دستگاه های کمک کننده به راه رفتن را چالش برانگیز می کند.


🔶 این exosuit می تواند نرخ سوخت و سازِ راه رفتن بر روی تردمیل با سرعت ۱۵ متر بر ثانیه را ۹.۳ درصد و دویدن با سرعت ۲.۵ متر بر ثانیه را ۴ ددصد کاهش دهد.

🔻این exosuit می تواند به صورت خودکار بین پروفایل های عمل کننده برای هر دو مدل راه رفتن تعویض یابد و این تعویض بر اساس تخمین انرژی پتانسیل نوساناتِ نرخ سوخت و سازِ سرعت های متفاوت دویدن و راه رفتن در سطوح شیب دار صورت می گیرد که چند کاره بودن این exosuit را نشان می دهد.



کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


۴شنبه ها: #اخبار_فناوری


📌منبع:
https://science.sciencemag.org/content/365/6454/668
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🌌 آیا می توان یک سیاه چاله را از بین برد؟

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

🎙صداگذاری و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

📝 ترجمه :#سارا_فیاض‌زاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه‌ها: #فیلم
#داستان_طنز
#رابطه_زیستی

📌وقتی زیادی درس میخونی...

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📱 آیا از طریق اطلاعات تلفن همراه می توان اقدام به خودکشی را پیش بینی نمود؟


ظهر هر چهارشنبه زنگ هشداری بر تلفن همراه حدود ۵۰ نوجوان در نیویورک و پنسیلوانیا ارسال می گردد و این سوالات را مطرح می کند:
🔹 در هفته گذشته چند بار به پایان دادن به زندگی خود فکر کرده اید؟
🔹 آیا برنامه ای برای پایان دادن به زندگی خود ریخته اید؟
🔹 آیا اقدامی جهت پایان دادن به زندگی خود انجام داده اید؟


📂 افراد ۱۳-۱۸ ساله پاسخ های خود را به سرورهای ایمن ارسال می کنند. آنها با آگاهی والدین خود، به ضبط شبانه روزی زندگی دیجیتال شان به مدت ۶ ماه توافق کرده اند، جزئیات و داده هایی که پرسشنامه های پزشکان قادر به پاسخگویی به آن نیستند، با این شیوه جمع آوری می گردد. مانند پیام های ارسالی، پست های شبکه های اجتماعی، لحن صدا در تماس های تلفنی، حالت چهره در سلفی ها، موسیقی پخش شده، میزان تحرک در طول روز و مقدار زمان در خانه ماندن.

⛔️ اکثر این نوجوانان اخیرا اقدام به خودکشی کرده بودند یا افکاری در این رابطه داشته اند و همه درگیر بیماری ذهنی چون افسردگی بوده اند.

💻 این مطالعه با نام 'ارزیابی تلفن همراه جهت پیش بینی خودکشی' (MAPS) یکی از چندین تلاش ابتدایی صورت گرفته برای محک جریان اطلاعات دستگاه تلفن همراه است و در تلاش برای پاسخگویی به این سوال است که "چطور می توان احتمال اقدام به خودکشی را پیش بینی نمود؟"


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


📌منبع:
https://science.sciencemag.org/content/365/6455/742
📚تهیه و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #کتاب_هفته

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
💢شروع کلاس جمعه

📆 ۸ شهریور ماه

ساعت ۱۹ تا ۲۱

طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره ۳۴۹ هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4
🌀تکامل رژیم غذایی در میان درخت زندگی جانوری 🌮


🔸آن چه یک جانور می خورد اساسی ترین جنبه زیستی آن موجود است، اما جای تعجب است که تکامل رژیم غذایی تاکنون در سراسر فرمانروایی جانوران مورد مطالعه قرار نگرفته است.


🎯 در این مقاله یک تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی در مقیاس بزرگ برای پاسخگویی به سه سوال حل نشده 🔒درباره تکامل رژیم های غذایی جانوران انجام شده است.


1- آیا رژیم های غذایی در سراسر درخت فیلوژنی جانوران حفاظت شده است؟
2- آیا رژیم غذایی در نرخ ازدیاد گونه ها در میان شاخه های جانوری تأثیر دارد؟
3- رژیم غذایی اجداد جانوران و کلادهای اصلی جانوری چه بوده است؟


👨‍💻 در این پژوهش، دانشمندان داده های رژیم غذایی 1087 گونه و ترجیحات رژیم غذایی آن ها را بر روی یک درخت تکاملی ساخته شده از داده های توالی DNA ترسیم کردند و روابط تکاملی آن ها را مورد تجزیه و تحلیل قرار دادند.


📊 بررسی ها نشان می دهد که در بین جانوران، 🥩 رژیم غذایی گوشتخواری رایج (حدود 63 درصد)، 🥬گیاهخواری کمتر رایج (حدود 32 درصد) و 🍔 همه چیز خواری نسبتاً نادر (حدود 3 درصد) است.


🔺علیرغم اختلاف نظرهای زیاد درباره این که آیا صفات اکولوژیکی حفاظت شده یا ناپایدار هستند، این پژوهشگران حفاظت شدگی شدیدی را در رژیم غذایی طی یک دوره زمانی بسیار طولانی پیدا کردند.


🔹همچنین آشکار گردید که رژیم غذایی با میزان تنوع گونه ها در میان شاخه جانوران ارتباطی ندارد، برخلاف مطالعات قبلی که نشان می داد گیاهخواری باعث افزایش تنوع در برخی گروه های مهم (مثل سخت پوستان 🦞، حشرات🐞 و پستانداران 🐏) می شود.


🔻سرانجام این پژوهشگران به این نتیجه رسیدند که اجداد همه جانوران به احتمال زیاد گوشتخوار بوده اند، همان طور بسیاری از شاخه های اصلی (مانند بندپایان 🐜، نرم تنان 🐌 و طناب داران 🐃).


👨‍💻 نتایج حاصل از این پژوهش به طور قابل ملاحظه ای حاکی از آن است که بسیاری از گونه های گوشتخوار امروزی ممکن است این رژیم غذایی را از اجداد گوشتخوار در بازه زمانی بیش از 800 میلیون سال حفظ کرده باشند.



📝 تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=4087


📌لینک مقاله:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/evl3.127
📝تهیه و تنظیم : #ساره_عامری_فر دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


سه شنبه ها : #معرفی_سایت
کانال بیوانفورماتیک ایران

@Iran_bioinformatics💫
🗣 محققان موفق به ابداع گجت پوشیدنی شدند که به افراد فاقد توانایی تکلم کمک می‌کند تا صحبت کنند.

🔉🎤 این دستگاه که گلوی گرافنی مصنوعی پوشیدنی ( Wearable Artificial Graphene Throat) نام دارد، به گلو می‌چسبد و حرکات گلو را به آوا تبدیل می‌کند.

📟 دستگاه‌هایی که قابلیت اندازه‌گیری حرکات ظریف روی پوست مانند ضربان قلب و نبض را داشته باشند، پیش از این ساخته شده بودند؛ اما توانایی تبدیل این حرکات به صدا را نداشتند و یا از لحاظ سخت افزاری به گونه‌ای بودند که پوشیدن آنها برای مدت طولانی امکان پذیر نبود.

🔳 همانطور که از اسم این گجت پیداست، از گرافن تهیه شده که به کمک لیزر روی ورقه‌ای بسیار نازک از پلی‌وینیل‌الکل قرارگرفته است که به راحتی به گلوی فرد می‌چسبد، انعطاف‌پذیر است و اندازه‌ی کوچکی دارد. این قسمت به کمک الکترودهایی به یک بازوبند متصل می‌شود، که خود شامل یک مدار، میکروکامپیوتر، تقویت کننده و رمزگشاست.

💡 با بهره‌گیری از خواص و عملکرد مکانیکی-الکتریکی فوق‌العاده‌ی گرافن و مدار ساخته شده توسط تیم تحقیقاتی با قابلیت دوگانه‌ی تشخیص و انتشار صوت، این دستگاه می‌تواند حرکات قوی یا ضعیف را در ناحیه گلو تشخیص دهد و آنها را تبدیل به آواهایی مثل «بله» و «خیر» کند.

👩🏻‍💻👨🏻‍🔧 این تیم تحقیقاتی بر این باور است که در آینده نزدیک، می‌توان به افراد فاقد توانایی تکلم آموزش داد تا سیگنال‌هایی را با گلوی خود تولید کنند که به کمک این دستگاه بتوان آن را به یک گفتار روان تبدیل کرد.

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

📝تهیه و تنظیم : #سارا_فیاض_زاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری



📌منبع:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/m/pubmed/31268667/

📌لینک سایت:
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=4089
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#داستان_طنز
#من_و_استاد_راهنمام

📌وقتی استاد راهنمات از محوطه دانشگاه برت میداره میاره آزمایشگاه سر پایان نامه‌ات 😅

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
چرا و چگونه قسمت های بدن دچار خارش می شوند؟ چرا خاراندن احساس خوبی دارد؟
خارش، یک احساس عمومی ناشی از تحریک سلول های پوستی یا سلول های عصبی مرتبط با پوست است. در حالی که خارش می تواند یک مزاحمت باشد، به عنوان یک مکانیسم مهم حسی و حفاظتی، مانند سایر احساسات پوستی چون لمس ، درد ، لرزش ، سرما و گرما نیز عمل می کند.

خارش علامت غالب بسیاری از بیماری های پوستی است و همچنین در برخی از بیماری ها که بر کل بدن تأثیر می گذارد نیز وجود دارد.
احساس خارش پوست به دلیل تحریک پروپیواسپتورها (انتهای عصب حساس به خارش) توسط واسطه های مکانیکی، حرارتی یا شیمیایی بوجود می آید.

به طور کلی، خارش شامل فعال شدن پروپیواسپتورهای سلولهای عصبی تخصصی به نام الیاف C می باشد که از نظر عملکردی مجزا هستند و فقط احساس خارش را منتقل می کنند. این الیاف C هنگامی که به صورت سطحی بر روی پوست تحریک می شوند، سیگنال هایی را در امتداد عصب به نخاع و به مغز منتقل می کنند در مغز این سیگنال ها پردازش می شوند و خارش یا مالشی مختصر در پاسخ به آن اتفاق می افتد.

اگرچه خاراندن برای رفع خارش مفید است، اما این کار فقط تسکین موقت را ارائه می دهد و ممکن است باعث تحریک بیشتر پوست و احتمالاً جراحت آن شود که می تواند عفونت را در پی داشته باشد. علیرغم تقریباً یک قرن تحقیق در مورد خارش، هیچ درمان اختصاصی در این رابطه وجود ندارد، اما چندین ماده موضعی و خوراکی در دسترس هستند که خارش در برخی نقاط را از بین می برند. این عوامل شامل لوسیون ها و کرم ها (مانند کالامین و هیدروکورتیزون)، آنتی هیستامین ها، آنتاگونیست های مواد افیونی، آسپرین و نور درمانی ماوراء بنفش می باشد.
کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics 💫

📝تهیه و تنظیم: #عطیه_احمدی دانشجوی #ارشد_بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها علمی_اجتماعی

📌لینک سایت :
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=5089

📌منبع:
https://www.scientificamerican.com/article/experts-why-we-itch-and-scratch/
💢 دوره فشرده یک روزه لینوکس

📆 ۱۸ شهریور ماه

ساعت ۹ تا ۲۱

💰 هزینه دوره ۳۹۵ هزار تومان

👨‍💻#آشنایی_با_دستورات_پرکاربرد_لینوکس

🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4
📝تهیه و تنظیم: #دانیال_خدیوی دانشجو ارشد بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
RNA-seq data analysis a practical approach (Persian).pdf
15.5 MB
فایل #pdf کتاب "اصول عملی آنالیز داده های توالی یابی RNA"

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
💢شروع کلاس جمعه

📆 ۱۵ شهریور ماه

ساعت ۱۲:۳۰ تا ۱۴:۳۰

طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره ۳۴۹ هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4
✏️تشخیص کمپلکس های پروتئینی و دسته بندی کمی آن با CN-PAGE

اکثر فرایندهای سلولی بر عهده ی کمپلکس های پروتئینی است. پیش از این شناسایی کمپلکس های پروتئینی به کمک ترکیبی از روش های جداسازی بر حسب اندازه و طیف سنجی جرمی انجام شده است. با این حال، بسیاری از این روش ها فاقد اطلاعات کمی جهت درک چگونگی تاثیر تغییرات فراوانی و ترکیب کمپلکس های پروتئینی بر شارهای متابولیکی هستند.

🌿در این مقاله رویکرد مطالعه کمی کمپلکس های پروتئینی در گیاه آرابیدوپزیز(Arabidopsis) در پایان روز و در پایان شب ارائه شده است.

💡مشاهدات این مقاله نشان می دهد تقسیم اندازه کمپلکس های پروتئینی به وسیله CN-PAGE همراه با طیف سنجی جرمی می تواند جهت ایجاد پروفایل های فراوانی در طول شیب وزن مولکولی مورد استفاده قرار گیرد. علاوه بر آن با تجزیه پروفایل های فراوانی کمپلکس پروتئینی می توان به طور قابل ملاحظه ای خوشه بندی پروفایل های پروتئینی را بهبود بخشید.

این مقاله از فاصله اقلیدسی بین جفت های پروتئینی برای تشخیص میان کنش های فرضی کمپلکس های پروتئینی و در نهایت تشخیص کمپلکس های پروتئینی استفاده می کند. مقادیر آستانه ای قابل قبول که برپایه یک برش هستند به وسیله آنالیز منحنی مشخصه گیرنده- گرداننده (Receiver-Operator Characteristic) بهینه شده است.

📝رویکرد این مقاله تنوع فنی کمی را نشان می دهد و به راحتی می تواند برای مطالعه کمپلکس های پروتئینی در هر سیستم بیولوژیکی استفاده شود.

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics 💫

📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی دانشجوی #ارشد_بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها : #مقاله_هفته

📌لینک سایت :
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=5091

📌منبع:
https://www.nature.com/articles/s41598-019-47829-7

Protein Complex Identification and quantitative complexome by CN-PAGE
Protein Complex Identification and quantitative complexome by CN-PAGE