Bioinformatics
2.79K subscribers
701 photos
84 videos
64 files
832 links
تنها کانال تخصصی بیوانفورماتیک ایران
🔺All in one!!🔺
💎Bioinformatics, Computational biology, Modern medicine and Biomedical informatics💎
👨‍💻Learn with experts!
🔥پزشکی نوین
‼️زیست شناسی محاسباتی
Download Telegram
🔆اطلس سلول های کبدی انسانی🔆



🔹کبد انسان اندامی چند کاره و ضروری برای بدن محسوب می گردد. با وجود رشد بیماری های کبدی، گزینه های درمانی محدودی برای آنها وجود دارد و ترکیب سلولی این اندام به خوبی شناخته نشده است.


🔬 در این مقاله، با روش توالی یابی تک سلولی RNA حدود ۱۰،۰۰۰ سلول طبیعی از بافت کبدی ۹ فرد اهداکننده بررسی و اطلس سلولی کبد انسان ساخته شد.


📊 آنالیزهای این مطالعه منجر به شناسایی زیر نوع های سلولی اندوتلیال (که قبلا ناشناخته بودند)، سلول های Kupffer و هپاتوسیت ها همراه با ترنسکریپتوم برخی از این جمعیت ها گردید.


✳️ از این اطلس جهت بررسی تغییرات فنوتیپی رخ داده در کارسینوما سلول های کبدی، هپاتوسیت های انسانی و سلول های اندوتلیال کبدی پیوندزده شده به کبد موش استفاده شد.


👈اطلس سلول کبد انسانی امکان کشف سلول های کبدی طبیعی و بیمار ناشناخته را فراهم می کند.


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫




📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس



۲شنبه ها: #مقاله_هفته

📌منبع:

https://www.nature.com/articles/s41586-019-1373-2
تشخیص ترس با تکنولوژی Amazon Rekognition

تکنولوژی بازشناخت چهره شرکت آمازون احساس ترس را از روی چهره تشخیص میدهد.
به نقل از سایت آمازون ویژگی تشخیص احساس این نرم افزار که شامل احساس خوشحالی، ناراحتی، عصبانیت، شگفت زده شدن، انزجار، آرامش و گیجی می شود را بهبود داده اند و همچنین تشخیص احساس ترس را نیز بر آن افزوده اند.

این شرکت همچنین ادعا میکند که قدرت تشخیص سن افراد را نیز بهبود داده و این نرم افزار با دقت بیشتر و در بازه های سنی کمتری سن افراد را حدس میزند.

هنوز هم بحث هایی در رابطه با قوانین و حریم شخصی برای استفاده از اینگونه تکنولوژی ها و جلوگیری از سواستفاده دولت ها از آنها وجود دارد که در سالهای گذشته این شرکت را نیز درگیر خود کرده است.

برای مطالعه بیشتر به لینک زیر مراجعه کنید:
https://aws.amazon.com/about-aws/whats-new/2019/08/amazon-rekognition-improves-face-analysis/

📝تهیه و تنظیم : #نیلوفر_سید_مجیدی
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
💢شروع کلاس جمعه

📆 ۸ شهریور ماه

ساعت ۱۹ تا ۲۱

طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره ۳۴۹ هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🎮 بازی Genome Jumper 🎮
یه بازی موبایله در ژانر بازی های جدی که توسط غول بیوانفورماتیک، موسسه SIB، منتشر شده. با انجام این بازی، میتونید به سیاحت در محتوای ژنتیکی انسان بپردازید و درکی نسبی از تفاوت های ژنتیکی میان افراد مختلف پیدا کنید... از رنگ پوست گرفته تا ترجیحات غذایی یا ریسک ابتلا به بیماری هایی از جمله سرطان پستان.
از طریق این بازی که هم نسخه اندروید و هم ios اون موجوده، میتونید خیلی خیلی ساده متوجه بشید که تفاوت های اندک ژنتیکی چجوری باعث تفاوت های ظاهری چشمگیر میشه.
همچنین میتونید با پشت سر گذاشتن هر مرحله، به مطالعه مقالات مرتبط با واریانت های همون قسمت بپردازید. همین الآن از Google Play یا App Store دانلود کنید، چون مهمتر از ازرشمند بودنش، مجانی بودنشه!😂



📝 گردآوری: #محمد_افشاری
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه ها: #فیلم


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#داستان_طنز
#من_و_همکلاسی

📌وقتی میری سر جلسه امتحان و زیر پوستی به رفیقت میگی برسون و اِلّا 😡

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
مدرس: 👨🏻‍🏫 دکتر جواد ظهیری (عضو هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس )

🕰طول دوره: هشت هفته
شنبه ها 10:00 - 12:00
📆2 شهریور ماه

👈هزینه دوره :560 هزارتومان

💎10 درصد تخفیف دانشجویی
😃 برگزای کلاس به صورت آنلاین💻
♦️جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool4

🌞کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞
👇👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫
🌀ورود کریسپر به نخستین آزمایش های بالینی انسان



🔸فناوری کریسپر در حال ورود به اولین آزمایش های بالینی انسانی خود است و در این مرحله ویرایشگر ژن به بررسی اختلالات خونی، نابینایی و سرطان می پردازد.

🔹در این آزمایش ها، دانشمندان از CRISPR / Cas9 برای مقابله با سرطان و اختلالات خونی در افراد استفاده می کنند. در این آزمایش ها، محققان برخی از سلول های یک فرد را برداشته، DNA 🧬 را ویرایش کرده و سلول ها را دوباره به داخل بدن تزریق می کنند و به این طریق سلول ها برای مبارزه با بیماری مسلح می شوند.

🔻محققان همچنین می دانند كه چگونه CRISPR / Cas9 در بدن انسان عمل می كند. در یک آزمایش دیگر که در آینده نزدیک انجام می شود، این قیچی مولکولی✂️ به چشم افراد دارای نابینایی ارثی تزریق می شود.


اعتبار کریسپر سال گذشته هنگامی که یک دانشمند چینی ویرایش یک ژن را در جنین های دو نوزاد دختر 👶🏻 انجام داد و با این کار مقررات علمی و اخلاق دستکاری ژن را زیر سوال برد، خدشه دار شد.

🔹آزمایش های جدید با چالش‌های اخلاقی قبلی روبرو نیستند. آلن رگنبرگ 👨‍🔬، پژوهشگر زیست شناس در مؤسسه اخلاقیات زیستی جانز هاپکینز برمن می گوید این فناوری نه بر روی جنین بلکه بر روی کودکان و بزرگسالان مورد آزمایش قرار می گیرد و منجر به ایجاد تغییرات ارثی DNA نمی شود.


🎯 اولین بار در سال 2012 ، ویرایشگر ژن کریسپر نوید درمان بیش از 6000 بیماری ژنتیکی شناخته شده را داد اما هنوز سؤالات زیادی در مورد این که آیا کریسپر می تواند به وعده نخستین خود در سال 2012 عمل کند، باقی مانده است.



📝تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها: #علمی_اجتماعی


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📌 منبع:
https://www.sciencenews.org/article/crispr-gene-editor-first-human-clinical-trials?tgt=nr
📝تهیه و تنظیم: #دانیال_خدیوی دانشجو ارشد بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
[Richard_E._Neapolitan]_Probabilistic_Methods.pdf
4.6 MB
فایل #pdf کتاب "روش‌های احتمالاتی برای بیوانفورماتیک"

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
💊بررسی رویکرد ها و منابع موقعیت یابی مجدد دارو


🔴 کشف دارو یک فرآیند زمان بر، نیازمند سرمایه گذاری بالا و پرخطر است.

💡موقعیت یابی مجدد دارو در سالهای اخیر به یک استراتژی رایج استفاده مجدد از دارو برای کاربردهای دیگر تبدیل شده است. برخلاف استراتژی های تولید داروها این استراتژی کارآمد ، اقتصادی و بدون خطر است.

🔍دارو ماینوکسیدیل یکی از داروهایی است که به این صورت موقعیت یابی شده است و امروزه استفاده می شود. این دارو در ابتدا برای بیماران قلبی کشف شد. محققان جهت حل مشکل ریزش مو به بررسی این دارو پرداخته و مشخص شد دارو ماینوکسیدیل جهت ریزش مو بسیار خوب عمل میکند و عملا امروزه برای این مورد استفاده می شود.

🔹معمولاً سه نوع رویکرد باز آفرینی دارو وجود دارد: رویکردهای محاسباتی ، رویکردهای آزمایش بیولوژیکی و رویکردهای مختلط که همه آنها در موقعیت یابی مجدد دارو بسیار مورد استفاده قرار می گیرند.

🔶 در این مقاله ، رویکردهای محاسباتی مرور و ویژگی های شان برجسته شده است تا محققان به واسطه آن رویکردهای قدرتمندتری را توسعه دهند. علاوه برآن یافته های مهم به دست آمده با استفاده از این رویکردها نیز ذکر شده و 76 منبع مهم در مورد موقعیت یابی مجدد دارو را خلاصه شده است. سرانجام ، چالش ها و فرصت ها در تولید دارو از دیدگاه های مختلفی از جمله فناوری ، مدل های تجاری ، ثبت اختراعات و سرمایه گذاری مورد بحث قرار گرفته است.


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی
دانشجو ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


۲شنبه ها: #مقاله_هفته

📌منبع:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6097480/
💢 شروع کلاس جمعه

📆 ۸ شهریور ماه

ساعت ۱۳:۳۰ تا ۱۵:۳۰

طول دوره ۶ هفته

♦️هزینه دوره ۳۹۵ هزار تومان

👨‍💻#آشنایی_با_دستورات_پرکاربرد_لینوکس

🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر

👈 برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4
مدرس ها:
👨🏻‍🏫 دکتر سجاد قرقانی (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تهران و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران )
👨🏻‍🏫 دکتر مانی (عضو هیئت علمی گروه شیمی تجزیه دانشگاه تربیت مدرس )

🕰طول دوره: هشت هفته
چهارشنبه 18:00 - 20:00
📆 20 شهریور ماه

💎10 درصد تخفیف دانشجویی
😃 برگزای کلاس به صورت آنلاین💻
♦️جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool4

🌞کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞

@Iran_Bioinformatics💫
📉 کاهش نرخ سوخت و سازِ در حین راه رفتن و دویدن با استفاده از یک exosuit قابل حمل و چندکاره


🏃‍♀راه رفتن و دویدن اساسا بیومکانیک متفاوتی دارند، که توسعه دستگاه های کمک کننده به راه رفتن را چالش برانگیز می کند.


🔶 این exosuit می تواند نرخ سوخت و سازِ راه رفتن بر روی تردمیل با سرعت ۱۵ متر بر ثانیه را ۹.۳ درصد و دویدن با سرعت ۲.۵ متر بر ثانیه را ۴ ددصد کاهش دهد.

🔻این exosuit می تواند به صورت خودکار بین پروفایل های عمل کننده برای هر دو مدل راه رفتن تعویض یابد و این تعویض بر اساس تخمین انرژی پتانسیل نوساناتِ نرخ سوخت و سازِ سرعت های متفاوت دویدن و راه رفتن در سطوح شیب دار صورت می گیرد که چند کاره بودن این exosuit را نشان می دهد.



کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


۴شنبه ها: #اخبار_فناوری


📌منبع:
https://science.sciencemag.org/content/365/6454/668
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🌌 آیا می توان یک سیاه چاله را از بین برد؟

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

🎙صداگذاری و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

📝 ترجمه :#سارا_فیاض‌زاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه‌ها: #فیلم
#داستان_طنز
#رابطه_زیستی

📌وقتی زیادی درس میخونی...

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📱 آیا از طریق اطلاعات تلفن همراه می توان اقدام به خودکشی را پیش بینی نمود؟


ظهر هر چهارشنبه زنگ هشداری بر تلفن همراه حدود ۵۰ نوجوان در نیویورک و پنسیلوانیا ارسال می گردد و این سوالات را مطرح می کند:
🔹 در هفته گذشته چند بار به پایان دادن به زندگی خود فکر کرده اید؟
🔹 آیا برنامه ای برای پایان دادن به زندگی خود ریخته اید؟
🔹 آیا اقدامی جهت پایان دادن به زندگی خود انجام داده اید؟


📂 افراد ۱۳-۱۸ ساله پاسخ های خود را به سرورهای ایمن ارسال می کنند. آنها با آگاهی والدین خود، به ضبط شبانه روزی زندگی دیجیتال شان به مدت ۶ ماه توافق کرده اند، جزئیات و داده هایی که پرسشنامه های پزشکان قادر به پاسخگویی به آن نیستند، با این شیوه جمع آوری می گردد. مانند پیام های ارسالی، پست های شبکه های اجتماعی، لحن صدا در تماس های تلفنی، حالت چهره در سلفی ها، موسیقی پخش شده، میزان تحرک در طول روز و مقدار زمان در خانه ماندن.

⛔️ اکثر این نوجوانان اخیرا اقدام به خودکشی کرده بودند یا افکاری در این رابطه داشته اند و همه درگیر بیماری ذهنی چون افسردگی بوده اند.

💻 این مطالعه با نام 'ارزیابی تلفن همراه جهت پیش بینی خودکشی' (MAPS) یکی از چندین تلاش ابتدایی صورت گرفته برای محک جریان اطلاعات دستگاه تلفن همراه است و در تلاش برای پاسخگویی به این سوال است که "چطور می توان احتمال اقدام به خودکشی را پیش بینی نمود؟"


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


📌منبع:
https://science.sciencemag.org/content/365/6455/742
📚تهیه و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #کتاب_هفته

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
💢شروع کلاس جمعه

📆 ۸ شهریور ماه

ساعت ۱۹ تا ۲۱

طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره ۳۴۹ هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool4
🌀تکامل رژیم غذایی در میان درخت زندگی جانوری 🌮


🔸آن چه یک جانور می خورد اساسی ترین جنبه زیستی آن موجود است، اما جای تعجب است که تکامل رژیم غذایی تاکنون در سراسر فرمانروایی جانوران مورد مطالعه قرار نگرفته است.


🎯 در این مقاله یک تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی در مقیاس بزرگ برای پاسخگویی به سه سوال حل نشده 🔒درباره تکامل رژیم های غذایی جانوران انجام شده است.


1- آیا رژیم های غذایی در سراسر درخت فیلوژنی جانوران حفاظت شده است؟
2- آیا رژیم غذایی در نرخ ازدیاد گونه ها در میان شاخه های جانوری تأثیر دارد؟
3- رژیم غذایی اجداد جانوران و کلادهای اصلی جانوری چه بوده است؟


👨‍💻 در این پژوهش، دانشمندان داده های رژیم غذایی 1087 گونه و ترجیحات رژیم غذایی آن ها را بر روی یک درخت تکاملی ساخته شده از داده های توالی DNA ترسیم کردند و روابط تکاملی آن ها را مورد تجزیه و تحلیل قرار دادند.


📊 بررسی ها نشان می دهد که در بین جانوران، 🥩 رژیم غذایی گوشتخواری رایج (حدود 63 درصد)، 🥬گیاهخواری کمتر رایج (حدود 32 درصد) و 🍔 همه چیز خواری نسبتاً نادر (حدود 3 درصد) است.


🔺علیرغم اختلاف نظرهای زیاد درباره این که آیا صفات اکولوژیکی حفاظت شده یا ناپایدار هستند، این پژوهشگران حفاظت شدگی شدیدی را در رژیم غذایی طی یک دوره زمانی بسیار طولانی پیدا کردند.


🔹همچنین آشکار گردید که رژیم غذایی با میزان تنوع گونه ها در میان شاخه جانوران ارتباطی ندارد، برخلاف مطالعات قبلی که نشان می داد گیاهخواری باعث افزایش تنوع در برخی گروه های مهم (مثل سخت پوستان 🦞، حشرات🐞 و پستانداران 🐏) می شود.


🔻سرانجام این پژوهشگران به این نتیجه رسیدند که اجداد همه جانوران به احتمال زیاد گوشتخوار بوده اند، همان طور بسیاری از شاخه های اصلی (مانند بندپایان 🐜، نرم تنان 🐌 و طناب داران 🐃).


👨‍💻 نتایج حاصل از این پژوهش به طور قابل ملاحظه ای حاکی از آن است که بسیاری از گونه های گوشتخوار امروزی ممکن است این رژیم غذایی را از اجداد گوشتخوار در بازه زمانی بیش از 800 میلیون سال حفظ کرده باشند.



📝 تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📌توضیحات تکمیلی این پژوهش را می توانید از طریق لینک زیر دنبال کنید.
http://codecool.ir/journal%20detail.aspx?file=4087


📌لینک مقاله:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/evl3.127
📝تهیه و تنظیم : #ساره_عامری_فر دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


سه شنبه ها : #معرفی_سایت
کانال بیوانفورماتیک ایران

@Iran_bioinformatics💫