Bioinformatics
2.79K subscribers
701 photos
84 videos
64 files
832 links
تنها کانال تخصصی بیوانفورماتیک ایران
🔺All in one!!🔺
💎Bioinformatics, Computational biology, Modern medicine and Biomedical informatics💎
👨‍💻Learn with experts!
🔥پزشکی نوین
‼️زیست شناسی محاسباتی
Download Telegram
💡استفاده از یادگیری عمیق برای آنالیز تصاویر شبکیه چشم

📋دیابت بیماری رو به گسترش در سراسر جهان است. از عوارض شایع این بیماری می‌توان به رتینوپاتی (retinopathy) و ورم ماکولا (macular edema) اشاره کرد.

📚در حال حاضر تشخیص این عوارض بر اساس تصاویر fundus یا شبکیه چشم توسط کارشناسان پزشکی انجام می‌شود. با توجه به این که تعداد بیماران مبتلا به دیابت به سرعت در حال افزایش است، تعداد تصاویر تولید شده برای تشخیص و غربالگری هم افزایش یافته‌است که باعث افزایش حجم کارِ کارکنان پزشکی و هزینه‌های خدمات بهداشتی می‌شود.

استفاده از یک سیستم خودکار به عنوان ابزاری برای تشخیص کامل و یا کمک کننده به کارشناسان پزشکی می‌تواند باعث کاهش هزینه‌ها بشود.

📝در این مقاله محققان با استفاده از یک سیستم یادگیری عمیق و با استفاده از کسر کوچکی از تصاویر، رتینوپاتی را بهتر از مطالعات قبلی تشخیص داده‌اند.

✔️از نتایج جدید این مطالعه می‌توان به ارائه پنج سیستم غربالگری مختلف برای رتینوپاتی و ورم ماکولا اشاره کرد که باعث طبقه‌بندی دقیق‌تر تصاویر شده‌است.



کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعی‌پور
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک_آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس



دوشنبه ها: #مقاله_هفته


📌منبع:
https://www.nature.com/articles/s41598-019-47181-w
📝 تهیه و تنظیم: #یاسمین_کیانیان دانشجوی دکتری #شیمی_آلی_محاسباتی دانشگاه تربیت مدرس

سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_پسادکتری


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫


📌منبع:
Www.nature.com/naturecareers/job/post-doc-in-bioinformatics-max-delbruck-center-for-molecular-mdc-696371
👨🏻‍🏫 مدرس: دکتر سیدشهریار عرب (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران )

🕰طول دوره: هشت هفته
سه شنبه 18:30 - 20:30
📆 15 مرداد ماه

👈هزینه دوره :580 هزارتومان

💎10 درصد تخفیف دانشجویی

♦️جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool4

🌞کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞
👇👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫
📜دانشمندان با تصویرسازی تشدید مغناطیسی(MRI) از مغز برای بیش از 100 ساعت به تصویری سه بعدی دست یافتند که گفته میشود دقیق ترین اسکن گرفته شده از آناتومی مغز انسان است و داده هایشان را در اختیار عموم قرار داده اند.
با اینکه مقاله آقای Brian L. Edlow و همکارانش از بیمارستان عمومی ماساچوست هنوز در نشریه ای چاپ نشده است ولی به اشتراک گذاری داده هایشان با افراد دیگر توجه زیادی را به خود جلب کرده است.
برای مشاهده ویدیویی از این MRI به لینک زیر مراجعه کنید:

https://youtu.be/_p-mcUbEZpA

و برای مطالعه بیشتر در این رابطه میتوانید به لینک های زیر مراجعه کنید:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/649822v1

https://www.sciencenews.org/article/mri-scan-most-detailed-look-yet-whole-human-brain

📝تهیه و تنظیم : #نیلوفر_سید_مجیدی
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
مدرس ها:
👨🏻‍🏫 دکتر سجاد قرقانی (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تهران و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران )
👨🏻‍🏫 دکتر مانی (عضو هیئت علمی گروه شیمی تجزیه دانشگاه تربیت مدرس )

🕰طول دوره: هشت هفته
چهارشنبه 18:00 - 20:00
📆 16 مرداد ماه

👈هزینه دوره :570 هزارتومان

💎10 درصد تخفیف دانشجویی
😃 برگزای کلاس به صورت آنلاین💻
♦️جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool4

🌞کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞
👇👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🎞 تکامل چشم انسان

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

📝 ترجمه و زیرنویس: #دانیال_خدیوی
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه ها: #فیلم

📌منبع:
https://www.ted.com/talks/joshua_harvey_the_evolution_of_the_human_eye
💢شروع کلاس جمعه

🗓 18 مرداد ماه

ساعت 19:00 تا 21:00

⌛️طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره 349 هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool4

🌞 کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞

@Iran_Bioinformatics💫
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#داستان_طنز
#من_و_پایان_نامه

📌وقتی بعد از دو ماه پروژه result کارت رو میبینی😭

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


۱شنبه ها: #معرفی_کتاب


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
Computational_Biology_of_Non_Coding.pdf
11.1 MB
🔹فایل #pdf کتاب "زیست شناسی محاسباتی RNAهای غیر رمزگذار"

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
💻 نرم افزار PhysiCell یک شبیه ساز سلولی مبتنی بر علم فیزیک و متن باز جهت شبیه سازی سیستم های چند سلولی:


🔴 بسیاری از سوالات مطرح شده در رابطه با سیستم های چند سلولی؛ تنها با مطالعه چگونگی حرکت سلول ها‍‍، رشد و تقسیمشان، برهمکنش ها و مرگ سلول ها پاسخ داده خواهند شد. پویایی سیستم ها در مقیاس یک بافت حاصل برهمکنش بین سلول ها، سلول ها با محیط اطرافشان و پاسخی که می دهند می باشد. یک آزمایشگاه مجازی ایده آل، آزمایشگاهی است که بتواند محیط بیوشیمیایی و بسیاری از برهم کنش های مکانیکی و بیوشیمیایی میان سلول ها را شبیه سازی کند.

🔹نرم افزار PhysiCell (شبیه ساز سیستم های چند سلولی بر مبنای علوم فیزیکی) یک شبیه ساز عامل محور به صورت متن باز است که برای مطالعه بسیاری از برهمکنش های سلولی در محیط های زیستی پویا می باشد. این شبیه ساز بر اساس انتقالات زیستی چند سوبسترایی است که فنوتیپ سلول ها را به انتشار سوبستراها و فاکتورهای انتقال پیام مرتبط می سازد. این شبیه ساز مدل های جزئی تری مانند چرخه سلولی، آپوپتوز، نکروز، تغییرات حجمی مواد و ... را شامل می شود.

🔶 نرم افزار PhysiCell با زبان c++ نوشته شده است که ملزومات نرم افزاری اندکی نیاز دارد و موجب می شود که برنامه روی بستر (پلت فورم) های مختلف قابل اجرا باشد. این برنامه باOpenMP قابلیت موازی سازی دارد و با کامپیوترهای ۴ هسته ای معمولی می توان سیستم هایی با تعداد ۱۰۶ -۱۰۵ سلول را شبیه سازی کرد، اما مجموعه هایی با تعداد سلول های بالاتر را می توان روی HPC (کامپیوترهایی با سرعت پردازش بالا) شبیه سازی نمود.



کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📝تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی
دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


۲شنبه ها: #مقاله_هفته

📌منبع:

https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1005991
💢شروع کلاس سه شنبه

📆 ۲۲ مرداد ماه

ساعت ۱۷ تا ۱۹

طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره ۳۴۹ هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_R_مقدماتی

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر برای هر دوره

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس بگیرید.

🆔 @codecool4
ذخیره سازی اطلاعات بر روی مولکول‌های کوچک پیشبرنده‌ی متابولیسم❗️

🧬 دی‌اِن‌اِی دیگر تنها مولکولی نیست که می‌توان برای ذخیره سازی اطلاعات دیجیتالی از آن استفاده کرد.

👩🏻‍🔬👨🏻‍🔬یک گروه تحقیقاتی در دانشگاه Brown، ایسلند، موفق شدند تصاویر ساده‌ای مثل تصویر یک گربه‌ی مصری🐱 را با استفاده از آرایه‌ای از مولکول‌های کوچک ذخیره و بازیابی کنند. آن‌ها معتقدند که این روش ذخیره سازی در برابر هک شدن آسیب پذیری کمتری دارد و عملکرد خود را در شرایط نامساعد محیطی بهتر حفظ می‌کند.

✴️ این گروه با الهام از تحقیقات اخیر مبنی بر ذخیره سازی اطلاعات روی DNA، در تلاش بود تا امکان کدگذاری اطلاعات مختصر را توسط مولکول‌های کوچکتر و ساده‌تر بررسی کند.

🧪 به این منظور، آن‌ها مخلوطی از متابولیت‌های معمول یعنی قندها، اسیدهای آمینه و سایر مولکول‌های کوچک که در متابولیسم انسان و سایر ارگانیزم‌های زنده حیاتی و ضروری هستند، تهیه کردند. حضور یا عدم حضور یک متابولیت خاص در این محلول به منزله‌ی دو دویی 1 و 0 بود که می‌توانست به صورت اطلاعات دیجیتالی کدگذاری شود.

💬 به گفته‌ی این تیم تحقیقاتی پس از نوشته شدن اطلاعات روی این متابولیت‌ها که بسیار کوچکتر از DNA و پروتئین هستند و می‌توانند تنوع زیادی داشته باشند، این مولکول‌ها به انرژی دیگری احتیاج ندارند و بسته به نوع مولکول و شرایط محیطی این داده‌ها می‌توانند ماه‌ها و سال‌ها نگه‌داری شود.
در واقع، حافظه‌های مولکولی (بسته به خواص مولکولیشان) می‌توانند نسبت به حافظه‌های الکترونیکی در شرایط نامساعد مثل دما و فشار و تنش‌های مکانیکی پایداری بیشتری از خود نشان دهند و جایگزین مناسبی برای هارد درایوهای امروزی باشند.

🗃 این نوع ذخیره سازی امکان نگه‌داری مقدار زیادی داده به صورت offline (بجای استفاده از فضای ابری) را فراهم می‌کند؛ که به نوعی باعث حفاظت از آن‌ها در برابر هک شدن هم می‌گردد.

🐌 هر چند در حال حاضر این تکنولوژی در مقایسه با کامپیوترها سرعت کمتری دارد اما نسبت به حافظه‌ی DNA از مزایای بیشتری برخور دار است.

📌 لازم به ذکر است، هر چند محققان این گروه ادعا می‌کنند که این تکنولوژی برای استفاده در تحقیقات آزمایشگاهی آماده است، اذعان دارند که پیش از استفاده از این تکنولوژی در مقیاس بزرگتر و برای مصارف خارج از آزمایشگاه، لازم است بر سرعت آن افزوده و از اندازه سخت‌افزار آن کاسته شود.

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

📝تهیه و تنظیم : #سارا_فیاض‌زاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری

📌منبع :
https://www.newscientist.com/article/2208439-data-can-now-be-stored-inside-the-molecules-that-power-our-metabolism/
مدرس ها:
👨🏻‍🏫 دکتر سجاد قرقانی (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تهران و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران )
👨🏻‍🏫 دکتر مانی (عضو هیئت علمی گروه شیمی تجزیه دانشگاه تربیت مدرس )

🕰طول دوره: هشت هفته
چهارشنبه 18:00 - 20:00
📆 30 مرداد ماه

👈هزینه دوره :570 هزارتومان

💎10 درصد تخفیف دانشجویی
😃 برگزای کلاس به صورت آنلاین💻
♦️جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool4

🌞کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞
👇👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#داستان
#طنز
#من_و_پایان_نامه!

👈وقتی میخوام یکی از دانشجوهای دکتری گروه تو قسمتی از پایان نامه‌م بهم کمک کنه 😐😂

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics
مدرس: 👨🏻‍🏫 دکتر جواد ظهیری (عضو هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس )

🕰طول دوره: 5 هفته
یکشنبه ها 14:00 - 16:00
📆 3 شهریور ماه

👈هزینه دوره :395 هزارتومان

💎10 درصد تخفیف دانشجویی
😃 برگزای کلاس به صورت آنلاین💻
♦️جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool4

🌞کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞
👇👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫
🔭🔭تلسكوپا روز به روز بزرگتر و گرون تر مى شن، ولى آيا راه بهترى ( براى ساخت تلسكوپ ) وجود ندارد؟🤩


يك فضانورد يك راه حل جانبى پيش نهاد داده است:🧠

تبديل كل زمين 🌎 به يك لنز تلسكوپ با استفاده از اتمسفر زمين براى خم كردن و متمركز كردن نور.

📡وقتى نور ستارگان به اتمسفر زمين برخورد مى كند، نور خم مى شود يا بازتاب مى كند. اين تمركز تشعشعات باعث مى شود نور در يك ناحيه در طرف مقابل زمين جمع شوند.🌠

🛰به گفته ديويد كيپينگ از دانشگاه كلمبيا با قرار دادن يك سفينه در نقطه مناسب ( حدود يك و نيم میليون كيلومتر از زمين ) مى توانيم پرتوهاى متمركز شده را جمع كنيم.
ابزار موجود در سفينه در مقايسه با تلسكوپ هاى موجود بر روى زمين ممكن است بتوانند نور بهترى از اجسام تار جمع كنند.

كيپينگ اين ايده را در مطالعه اى كه در نشريات جامعه فضانوردان اقيانوس آرام به چاپ رسيده، مطرح كرده است.

" واضحاً بايد خيلى كار انجام بشه تا بفهميم كار مى كنه يا نه " به گفتن مارتين الويس از موسسه اخترفيزيك هاروارد سميثزونين.
" حتى اگر اين ايده قابليت اجرايى نداشته باشد، اين روش تفكر خلاقانه اى است كه براى خروج نجوم از اين وضعيت خطى و روند درخواست نسخه هاى بزرگتر و بزرگتر از آنچه هم اكنون داريم، به آن نياز داريم."



کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics💫




📝 تهیه و تنظیم : #سیدعلی_میرمصطفی دانشجوی #ارشد_بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


شنبه ها: #علمی_اجتماعی

📌منبع:
https://www.sciencenews.org/article/proposed-space-telescope-would-use-earth-atmosphere-lens
📝تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان
دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
Brain Evolution by Design.pdf
13.3 MB
فایل #pdf کتاب "تکامل مغز توسط طراحی"


کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
💢 دوره فشرده دو روزه

📆 شنبه و یکشنبه ۲۶ و ۲۷ مرداد ماه

ساعت ۱۰ تا ۱۶

💰هزینه دوره ۳۹۵ هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_R_پیشرفته

🔰 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر به زبان انگلیسی

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس بگیرید.

🆔 @codecool4