👨🏻‍🎓 دوره آموزشی: پکیج جامع طراحی پروتئین

👨🏻‍🏫مدرس: دکتر سیدشهریار عرب (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتی ایران )

📜 با ارائه گواهی معتبر

🔷اطلاعات بیشتر و مشاوره:
🆒 @codecool4

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعی‌پور
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک_آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

🌸خوشبختی و موفقیت: ژن ، خانواده و اثرات محیط.

🍄اگرچه شواهد زیادی دال بر تاثیر ثروت، ازدواج و روابط دوستانه بر میزان احساس خوشبختی و شادمانی وجود دارد اما جای تاثیر ژن و محیط در این مقوله خالی است.

🌟شواهد ارایه شده دراین مقاله به خوبی بیان میکند که نه تنها خانواده، ژن و محیط پیرامون بر میزان شادی ما موثرند بلکه در ایجاد انواع احساسات نیز بی تاثیر نیستند.

👭👬بررسی های گسترده توسط سازمان midlife در ایالات متحده صورت گرفته که در آن برای بررسی اثر ثروت و خانواده
در میزان شادی از دوقلوهایی استفاده شده که در شرایط مختلف زندگی میکردند.
درواقع تمام شرایط را جز نوع رفاه در خانواده و محیط پیرامون ، یکسان در نظر گرفتند.

🧶نتایج این تحقیق حاکی از آن بود که ژن ها به تنهایی نمیتوانند موثر باشند، بلکه محیط در بروز یک‌ ژن میتواند اثر داشته باشد و مهم تر از آن باید دانست که خوشبختی جنبه های مختلفی دارد و در هر جنبه ی آن عوامل مختلفی میتواند اثرگذار باشد و این بخش از زندگی که جز مهمترین قسمت ها نیز هست نیاز به تحقیقات گسترده تر دارد.



@Iran_bioinformatics 💫
✅کانال بیوانفورماتیک ایران



📝تهیه و تنظیم: #عطیه_احمدی دانشجوی ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها : #مقاله_هفته


📌منبع:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19569406

📝تهیه و تنظیم: #ح_ن

سه شنبه ها: #معرفی_ابزار_بیوانفورماتیک


✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

❄️🔥یه تابستون خنک
💯مدرسه تابستانی
#جامع #بیوانفورماتیک ایران

📌بیش از 20 دوره آموزشی بیوانفورماتیک (آنالیز بیان ژن - NGS - طراحی دارو - طراحی پروتئین و ... )

🔷یادگیری ماشین با رویکرد بیوانفورماتیکی 😍

✍️کسب اطلاعات بیشتر و ثبت نام:
🆔 @codecool4

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

فرصت ناب تابستان و تقویت رزومه☝️

#داستان_طنز
#من_و_دفاع

👈 وقتی بعد از هفت خوان پایان نامه می فهمی حالا باید از خوان جلسه دفاع رد شی 😱

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🔅روشن شدن بخش های تاریک تر میراث ژنتیکی ما🧬


🌀ترانسپوزون ها که برخی اوقات به عنوان بخش تاریک ژنوم ما شناخته می شوند، متشکل از توالی های DNA قابل انتقال است که با ورود خود به درون یک ژن می تواند باعث تغییر ژنتیکی شوند.

🔹این ترانسپوزون ها اغلب در طول رشد جنین، بویژه از طریق متیلاسیون DNA خاموش می شوند اما فعال شدن آن ها از طریق دِمتیلاسیون می تواند منجر به بیماری های جدی شود.


👨‍🔬پژوهشگران در یک بررسی مشاهده نمودند که "اگر متیلاسیون DNA در سلول های بنیادی عصبی خاموش شود، آن ها زنده مانده و مجموعه خاصی از ترانسپوزون ها فعال می شود که بر روی بسیاری از ژن های مهم در نمو سلول های عصبی، تأثیر می گذارند.


🎯 این نتایج می تواند راه را برای درک کاملاً جدید این که چگونه از بین رفتن متیلاسیون DNA بر روی ژنوم ما در بیماری های مختلف تاثیر می گذارد، باز کند.



📝تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها: #علمی_اجتماعی


✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📌 منبع:
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/07/190719102142.htm

📝تهیه و تنظیم: #دانیال_خدیوی دانشجو ارشد بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

فایل #pdf کتاب "راهنمای زیست شناسی سلولی برای دانشمندان کامپیوتر"

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

❄️🔥یه تابستون خنک
💯مدرسه تابستانی
#جامع #بیوانفورماتیک ایران

مدرس: دکتر سیدشهریار عرب (عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتی ایران )

✍️کسب اطلاعات بیشتر و ثبت نام:
🆔 @codecool4

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🌸ابزار SWISS MODEL: مدل سازی همسانی ساختار پروتئینی و کمپلکس آنها

🗝🗝مدل سازی همسانی به یک روش مهم در زیست شناسی ساختاری تبدیل شده است که به طور قابل توجهی موجب کاهش فاصله میان ساختار اول پروتئین(توالی پروتئین شناخته شده) و ساختار سوم پروتئین شده است.


💡گردش کار و سرورهای کاملا اتوماتیک موجب ساده سازی فرایند مدل سازی شده است، همچنین کاربران بدون تخصص خاص محاسباتی قادر اند مدل های پروتئینی قابل اطمینان تولید کنند و به راحتی به نتایج مدل سازی، تجسم و تفسیر آنها دسترسی داشته باشند.

🔖در این مقاله سعی شده به روز رسانی های سرور SWISS MODEL که 25 سال پیش در زمینه مدل سازی خودکار شروع به کار و پیوسته توسعه یافته توضیح داده شود.


🌟به تازگی، قابلیت مدل سازی کمپلکس های دارایی چند زیر واحد مشابه یا غیر مشابه نیز به این ابزار افزوده شده است. با شروع از توالی اسید آمینه پروتئین های میان کنش کننده، هم استوکیومتری و هم ساختار کلی مجموعه میان کنش کننده با استفاده از مدل سازی همولوگ مطرح می شوند.

🔦علاوه بر آن سایر پیشرفت های عمده این ابزار شامل اجرای یک موتور مدل سازی ( ProMod3) و معرفی یک روش ارزیابی کیفی جدید ( QMEANDisCo) است. SWISS-MODEL به صورت رایگان در دسترس همگان می باشد.




@Iran_bioinformatics 💫
✅کانال بیوانفورماتیک ایران



📝تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


دوشنبه ها : #مقاله_هفته


📌منبع:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6030848/

💢شروع کلاس جمعه

📆 ۴ مرداد ماه

⏰ساعت ۱۵:۳۰ تا ۱۷:۳۰

⌛️طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره ۳۹۵ هزار تومان

👨‍💻#آشنایی_با_دستورات_پرکاربرد_لینوکس

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

📜 با ارائه مدرک معتبر

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.

🆔 @codecool3

متاژنومیکس چیست؟

📝تهیه و تنظیم: #مژگان_مظفری_لقا دانشجوی دکتری #بیوانفورماتیک دانشگاه #تهران

سه شنبه ها: #اینفوگرافیک

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌منبع:
https://www.sciencedirect.com/topics/biochemistry-genetics-and-molecular-biology/metagenomics

❇️ جهش پروتئین مغزی در کودکان مبتلا به اوتیسم باعث بروز رفتاری مشابه مبتلایان اوتیسم در موش ها می گردد.


🔴 نوعی جهش جدید که در پروتئین مغزی کودکان مبتلا به اوتیسم رخ می دهد را در مغز موش های مورد آزمایش ایجاد کردند. موش ها تغییرات رفتاری شدیدی از خود نشان دادند که به اختلالات بیماران اوتیسم انسانی بسیار نزدیک است.

🔬 این پژوهش توسط اورلیو گالی و مارک والاس (دکترای زیست شناسی عصبی و رییس دانشگاه وندربیلت) انجام شده است. پروتئین مورد مطالعه ناقل دوپامین یا DAT است.نورون های خاصی در مغز انتقال دهنده عصبی دوپامین را از پایانه عصبی شان آزاد می کنند. دوپامین از محل سیناپس عبور کرده و در نورون دریافت کننده پاسخ ایجاد می کند. DAT در غشاء نورون انتقال دهنده وظیفه اش این است که دوپامین را از محل سیناپس به داخل سلول آزاد کننده اش پمپ کرده و به فرآیند پاسخ در نورون گیرنده خاتمه دهد.

🔵 فعالیت مغز شامل سیستم دوپامین در ناحیه ایی از مغز به نام استریاتوم می شود که تنظیم کننده اصلی عملکرد حرکتی انگیزشی فرآیندهای پاداشی می باشد. بنابر این تعجبی ندارد اگر اختلال در این سیستم مغزی باعث اختلالات مغز و اعصاب مشابه پارکینسون، مصرف کوکائین،نیکوتین و سایر مواد مخدر و اختلالات دوقطبی ADHD و ASD ایجاد کند.


🐀 موش های هموزیگوت با جهش T356M در DAT تغییرات رفتاری بسیار شدیدی نشان می دهند که مشابه رفتار افراد مبتلا به ASDو ADHD است و تغییرات قابل توجهی در فیزیولوژی مغز آن ها دیده می شود.

❎ بیماری ADHD اختلال بیش فعالی و عدم تمرکز و ASD اختلال اوتیسم است که معمولا همزمان بروز پیدا می کنند.
در موش هایی که تنها یک نسخه از ژن جهش یافته (T356M) DAT را داشتند در مقایسه با موش های سالم هیچ تفاوتی مشاهده نشد. موش ها با این جهش در برقراری ارتباطات اجتماعی دچار مشکل می شوند، درونگرا شده و دچار بیش فعالی می گردند که در صورت تیمار شدن با دارو های مهار کننده DAT از شدت بیش فعالی شان کاسته شد.


👨‍⚕گالی و والاس معتقدند که جهش در ناقل دوپامین که مرتبط با اوتیسم است انتقال دوپامین استریاتوم را تغییر داده و رفتارهای وابسته به دوپامین را تحت تأثیر قرار می دهد.



✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫


📝تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


۴شنبه ها: #اخبار_فناوری


📌منبع: 
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/07/190723182249.htm

⚡️🤯 سرگذشت مردی که سرش در شتاب دهنده‌ی ذرات قرار گرفت!


📝ترجمه : #سارا_فیاض‌زاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک
آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


🎙صداگذاری : #محمد_افشاری
دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوانفورماتیک
آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه ها: #فیلم

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

#داستان_طنز
#دنیا_بدون_بیوانفورماتیک

📌وقتی با دوستات کل ترم سر کلاس آنالیز داده بیان ژن نرفتین و پروژه مپینگ دارین

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

💢شروع کلاس جمعه

🗓 18 مرداد ماه

⏰ساعت 19:00 تا 21:00

⌛️طول دوره ۶ هفته

💰هزینه دوره 349 هزار تومان

👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون_مقدماتی

🔰۱۰ درصد تخفیف دانشجویی

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید.
🆔 @codecool4

🌞 کانال بیوانفورماتیک ایران 🌞

@Iran_Bioinformatics💫

دست بندهای Get چگونه دست بندهایی هستند ؟🤔

استفاده از تکنولوژی رسانایی استخوان باعث می شود، صدا از طریق استخوان های مچ دست به نوک انگشت اشاره منتقل شود ; در این هنگام صدا از طریق جمجمه به طور
مستقیم به حلزونی گوش می رسد.

این اختراع جدید به نظر یک ردیاب تناسب اندام زیباست و مانند ساعت هوشمند عمل می کند، اما هیچ دکمه و صفحه ای ندارد.

همچنین هنگامی که انگشت خود را به گوش نزدیک کنید ، صدا را پخش می کند و کاملا از طریق حرکات و دستورات صوتی کنترل می شود. این دستبند را Get می نامند و سازندگان آن فکر می کنند که می توانند راه ارتباط ما با یکدیگر را تغییر دهند.

در حال حاضر، یکی از نکات جدیدی که باعث می شود Get یک دستگاه مناسب و قانع کننده باشد، توانایی گوش دادن به تماس های تلفنی، پیام ها و دیگر صوت ها ( در کل حفظ حریم خصوصی بدون بلندگو و یا هدفون) می باشد. بجای بلندگو یا هدفون، Get از تکنولوژِی رسانایی استخوانی استفاده می کند.
برای گوش دادن، تمام کاری که باید انجام دهید این است که انگشتتان را روی گوش خود مانند یک جاسوس ، قرار دهید😉.

صدا از طریق دستبند Get، به صورت لرزش هایی به استخوان مچ دست شما و سپس به انگشت اشاره شما منتقل می شود که در اخر با لمس گوش ، صدا از طریق جمجمه به حلزونی گوش می رسد.

سازندگان این دستگاه امیدوارند طریقه ی شنیدار توسط دستگاه های اطراف از جمله تلفن های همراه که در آن حفظ حریم خصوصی برای ما اهمیت زیادی دارد را تغییر دهند.
البته صدای منتقل شده توسط این روش هنوز به کیفیت بلندگو یا هدفون ها نمی باشد اما باید این نکته را مد نظر داشت که هیچ تکنولوژی در ابتدا کاملا نبوده است.



✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_bioinformatics💫



📝تهیه و تنظیم: #عطیه_احمدی دانشجوی #ارشد_بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


شنبه ها: #علمی_اجتماعی

📌منبع:

https://newatlas.com/get-bone-conducting-smart-bracelet/60587/https://newatlas.com/get-bone-conducting-smart-bracelet/60587/

💡استفاده از یادگیری عمیق برای آنالیز تصاویر شبکیه چشم

📋دیابت بیماری رو به گسترش در سراسر جهان است. از عوارض شایع این بیماری می‌توان به رتینوپاتی (retinopathy) و ورم ماکولا (macular edema) اشاره کرد.

📚در حال حاضر تشخیص این عوارض بر اساس تصاویر fundus یا شبکیه چشم توسط کارشناسان پزشکی انجام می‌شود. با توجه به این که تعداد بیماران مبتلا به دیابت به سرعت در حال افزایش است، تعداد تصاویر تولید شده برای تشخیص و غربالگری هم افزایش یافته‌است که باعث افزایش حجم کارِ کارکنان پزشکی و هزینه‌های خدمات بهداشتی می‌شود.

استفاده از یک سیستم خودکار به عنوان ابزاری برای تشخیص کامل و یا کمک کننده به کارشناسان پزشکی می‌تواند باعث کاهش هزینه‌ها بشود.

📝در این مقاله محققان با استفاده از یک سیستم یادگیری عمیق و با استفاده از کسر کوچکی از تصاویر، رتینوپاتی را بهتر از مطالعات قبلی تشخیص داده‌اند.

✔️از نتایج جدید این مطالعه می‌توان به ارائه پنج سیستم غربالگری مختلف برای رتینوپاتی و ورم ماکولا اشاره کرد که باعث طبقه‌بندی دقیق‌تر تصاویر شده‌است.



✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫



📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعی‌پور
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک_آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس



دوشنبه ها: #مقاله_هفته


📌منبع:
https://www.nature.com/articles/s41598-019-47181-w