📍#شروع کلاس
✅#برنامه_نویسی_R
🗓26 بهمن ماه
💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری
✅برای کسب اطلاعات بیشتر از سایر دوره ها به کانال زیر مراجعه فرمایید:
@BioinformaticsSchools💫
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1
❄️🔥کانال بیوانفورماتیک ایران 🔥❄️
@Iran_Bioinformatics💫
✅#برنامه_نویسی_R
🗓26 بهمن ماه
💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری
✅برای کسب اطلاعات بیشتر از سایر دوره ها به کانال زیر مراجعه فرمایید:
@BioinformaticsSchools💫
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1
❄️🔥کانال بیوانفورماتیک ایران 🔥❄️
@Iran_Bioinformatics💫
♒️ 11 فوریه، روز "بین المللی زنان و دختران در علم" گرامی باد.
👩🏻⚕️پرفسور باربارا مک کلین تاک برنده جایزه نوبل پزشکی:
"اگر می دانید که در مسیر درست قرار دارید، اگر این دانش درونی را دارید، پس هیچ کس نمی تواند شما را متوقف کند ... مهم نیست که دیگران چه می گویند. "
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌 منبع:
https://www.monash.edu/science/home/womensinscience
👩🏻⚕️پرفسور باربارا مک کلین تاک برنده جایزه نوبل پزشکی:
"اگر می دانید که در مسیر درست قرار دارید، اگر این دانش درونی را دارید، پس هیچ کس نمی تواند شما را متوقف کند ... مهم نیست که دیگران چه می گویند. "
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌 منبع:
https://www.monash.edu/science/home/womensinscience
💻 ساخت شبکه های PPI برای گونه ی لیشمانیا از طریق اطلاعات ساختاری پروتئین
💊 تجزیه و تحلیل سیستماتیک انگل ها کلیدی برای درک بهتر فرآیندهای زیستی است. چراکه باعث می شود مکانیسم بیماری ها روشن شده و عملکرد پروتئین ها روشن شود و هدف دارو به درستی انتخاب شود.
🔬 درحال حاضر،چندین روش برای پیش بینی واکنش های متقابل بین پروتئین ها برای گونه های غیر مدل، وجود دارد اما فقط شامل بخش کوچکی از کل پروتئوم و واکنش های موجود می شود.
📚براساس این تحقیق،روش های زیست شناسی محاسباتی، پیش بینی شبکه پروتئینی و آنالیز مقایسه ای برای مطالعه ی
Leishmania braziliensis
و
Leishmania infantum
بکارگرفته شده است.
🤒 این انگل ها عامل لیشمانیوزیز هستند، بیماری که درسطح جهانی اپیدمیک می باشد و داروهای موجود برای درمانش کافی نیستند.
🚺 تهیه و تنظیم : #عطیه_احمدی دانشجوی ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🔊منبع:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5840830/
💊 تجزیه و تحلیل سیستماتیک انگل ها کلیدی برای درک بهتر فرآیندهای زیستی است. چراکه باعث می شود مکانیسم بیماری ها روشن شده و عملکرد پروتئین ها روشن شود و هدف دارو به درستی انتخاب شود.
🔬 درحال حاضر،چندین روش برای پیش بینی واکنش های متقابل بین پروتئین ها برای گونه های غیر مدل، وجود دارد اما فقط شامل بخش کوچکی از کل پروتئوم و واکنش های موجود می شود.
📚براساس این تحقیق،روش های زیست شناسی محاسباتی، پیش بینی شبکه پروتئینی و آنالیز مقایسه ای برای مطالعه ی
Leishmania braziliensis
و
Leishmania infantum
بکارگرفته شده است.
🤒 این انگل ها عامل لیشمانیوزیز هستند، بیماری که درسطح جهانی اپیدمیک می باشد و داروهای موجود برای درمانش کافی نیستند.
🚺 تهیه و تنظیم : #عطیه_احمدی دانشجوی ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🔊منبع:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5840830/
PubMed Central (PMC)
Building protein-protein interaction networks for Leishmania species through protein structural information
Systematic analysis of a parasite interactome is a key approach to understand different biological processes. It makes possible to elucidate disease mechanisms, to predict protein functions and to select promising targets for drug development. Currently,…
📍#شروع کلاس
✅#بسته_جامع_طراحی_دارو
🗓30 بهمن ماه
💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری
✅برای کسب اطلاعات بیشتر از سایر دوره ها به کانال زیر مراجعه فرمایید:
@BioinformaticsSchools💫
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1
❄️🔥کانال بیوانفورماتیک ایران 🔥❄️
@Iran_Bioinformatics💫
✅#بسته_جامع_طراحی_دارو
🗓30 بهمن ماه
💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری
✅برای کسب اطلاعات بیشتر از سایر دوره ها به کانال زیر مراجعه فرمایید:
@BioinformaticsSchools💫
👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1
❄️🔥کانال بیوانفورماتیک ایران 🔥❄️
@Iran_Bioinformatics💫
✨روز داروین مبارک✨
✴️ اگر امروز با جزئیات می دانیم که ما گونه انسان و میلیونها گونه جاندار دیگر چگونه بر روی کره زمین تا به این نقطه از حیات رسیدهایم را مدیون شروع چارلز داروین هستیم. امروز تولد این دانشمند بزرگ است.
چارلز داروین:
"این نیرومند ترین گونه ما نیست که زنده می ماند هوشمندترین هم نیست، کسی زنده می ماند که بیش از همه شایستگی سازگاری با دگرگونی را دارد."
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
✴️ اگر امروز با جزئیات می دانیم که ما گونه انسان و میلیونها گونه جاندار دیگر چگونه بر روی کره زمین تا به این نقطه از حیات رسیدهایم را مدیون شروع چارلز داروین هستیم. امروز تولد این دانشمند بزرگ است.
چارلز داروین:
"این نیرومند ترین گونه ما نیست که زنده می ماند هوشمندترین هم نیست، کسی زنده می ماند که بیش از همه شایستگی سازگاری با دگرگونی را دارد."
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #معرفی_بیوانفورماتیک
📌منبع:
http://www.synergielyoncancer.com/glossary/bioinformatics
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26764471
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #معرفی_بیوانفورماتیک
📌منبع:
http://www.synergielyoncancer.com/glossary/bioinformatics
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26764471
قبلنا فقط داروساز ها میتونستن دارو بسازن ولی الان مدرسه زمستونی ما به زیست شناسا و برنامه نویس ها هم یاد میده چطوری دارو بسازن👨🔬👩🏻🔬
اگه میخوای دارو طراحی کنی دوره طراحی دارو مدرسمونو از دست نده
👇👇👇👇
https://t.me/Iran_Bioinformatics💫
اگه میخوای دارو طراحی کنی دوره طراحی دارو مدرسمونو از دست نده
👇👇👇👇
https://t.me/Iran_Bioinformatics💫
👨🏻💻امواج الکترومغناطیس با دو منشأ طبیعی و انسانی، نقش مهمی در زندگی امروزهی ما بازی میکنند.
📵از این امواج برای ارتباطات رادیویی، تلویزیونی، شبکههای مخابراتی و تمامی ارتباطات بیسیم استفاده میکنند.
🥵 تأثیرات ترموژنیکی (تولید گرما در بدن) این میدانها با شدت میدان که با شاخصی به اسم SAR یا نرخ جذب ویژه اندازهگیری میشود رابطهای مستقیم دارد. نرخ جذب ویژه با واحد وات بر کیلوگرم، نشان میدهد که چقدر از انرژی موجود درمیدان الکترومغناطیس جذب بدن میشود.
⚠️ اثرات گرمایی این میدانها بر فرآیند تخریب سلولی تأثیرگذار خواهد بود.در این بین میزان تأثیرگذاری میدانهای الکترومغناطیس بر برخی افراد بسیار بالا است و منجر به سندرومی به نام Electrohypersensitivy یا EHS میشود.
📝تهیه و تنظیم : #سینا_صامتی
دانش آموخته کارشناسی ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📌منبع :
https://www.statista.com/chart/12797/the-phones-emitting-the-most-radiation/
📵از این امواج برای ارتباطات رادیویی، تلویزیونی، شبکههای مخابراتی و تمامی ارتباطات بیسیم استفاده میکنند.
🥵 تأثیرات ترموژنیکی (تولید گرما در بدن) این میدانها با شدت میدان که با شاخصی به اسم SAR یا نرخ جذب ویژه اندازهگیری میشود رابطهای مستقیم دارد. نرخ جذب ویژه با واحد وات بر کیلوگرم، نشان میدهد که چقدر از انرژی موجود درمیدان الکترومغناطیس جذب بدن میشود.
⚠️ اثرات گرمایی این میدانها بر فرآیند تخریب سلولی تأثیرگذار خواهد بود.در این بین میزان تأثیرگذاری میدانهای الکترومغناطیس بر برخی افراد بسیار بالا است و منجر به سندرومی به نام Electrohypersensitivy یا EHS میشود.
📝تهیه و تنظیم : #سینا_صامتی
دانش آموخته کارشناسی ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫
📌منبع :
https://www.statista.com/chart/12797/the-phones-emitting-the-most-radiation/
📌📌چرا زیست شناسا باید زبان آر را یادبگیرن⁉️
✅یادگیری یه زبان برنامه نویسی جدید ، تصمیم مهمیه چون زبانی که یاد میگیرین باید قابلیت کاربرد تخصصی و حرفه ای در زمینه کاری شما را داشته باشه 💯💯
✨®️قدرتمندترین زبان برنامه نویسی کاربردی تو ژنتیک 🧬 و سایر رشته زیست شناسی🔬
🔊 اگر فکر میکنی 🤔بلدی پیشرفته اش رو برو‼️ و گرنه مقدماتی❗️
👇👇👇
🎥 https://t.me/Iran_Bioinformatics💫
✅یادگیری یه زبان برنامه نویسی جدید ، تصمیم مهمیه چون زبانی که یاد میگیرین باید قابلیت کاربرد تخصصی و حرفه ای در زمینه کاری شما را داشته باشه 💯💯
✨®️قدرتمندترین زبان برنامه نویسی کاربردی تو ژنتیک 🧬 و سایر رشته زیست شناسی🔬
🔊 اگر فکر میکنی 🤔بلدی پیشرفته اش رو برو‼️ و گرنه مقدماتی❗️
👇👇👇
🎥 https://t.me/Iran_Bioinformatics💫
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#Oxford_nanopore
📝 ترجمه: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
🎙صداگذاری: #محمد_افشاری دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
پنج شنبه ها: #فیلم
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📝 ترجمه: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
🎙صداگذاری: #محمد_افشاری دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
پنج شنبه ها: #فیلم
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
زیست شناسی که نتونه آنالیر بیان ژن انجام بده مثل زنبوریه که نتونه عسل درست کنه🐝
🧬اگه میخوای صفر تا صد آنالیز بیان ژنو تحت نظر اساتید بهترین دانشگاه های کشور یاد بگیری یه سر به کانال ما بزن
👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫
@Iran_Bioinformatics💫
👆👆👆👆👆👆👆👆👆👆👆
🧬اگه میخوای صفر تا صد آنالیز بیان ژنو تحت نظر اساتید بهترین دانشگاه های کشور یاد بگیری یه سر به کانال ما بزن
👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫
@Iran_Bioinformatics💫
👆👆👆👆👆👆👆👆👆👆👆
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#داستان_طنز
#من_و_استاد_راهنمام!
👈 عکس العمل استاد راهنمام وقتی یک کار اشتباهی انجام می دم 😂
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
#من_و_استاد_راهنمام!
👈 عکس العمل استاد راهنمام وقتی یک کار اشتباهی انجام می دم 😂
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🌌 آیا ما در هر دقیقه در میلیون ها جهان دیگر حضور داریم؟! 🤔
یکی از مباحث جذاب دنیای امروز این است که آیا جهان به همان شیوه ای است که ما درحال تجربه اش هستیم یا تنها این جهان نسخه ای از وقایع خارج از آن می باشد؟🚪
شاید جهان دیگری باشد، شاید حتی از خود ما نیز نسخه های دیگری وجود داشته باشد که هرکدام درحال تجربه ی متفاوت از زندگی باشند.🎒
از دید فیزیک و تلسکوپ ها جهان را با واژه ای جز وسعت و عظمت نمی شود توصیف کرد که شامل میلیون ها فوتون و نوترون و ذرات مختلف دیگر می شود.
هر کهکشان شامل تریلیون ها ستاره می شود و احتمال اینکه جهان های دیگری وجود داشته باشد و نسخه های دیگری از ما،بسیار زیاداست. اما آنچه مسلم است این است که حتی اگر این گفته درست باشد هرکدام از نسخه های ما در هر جهان منحصر به فرد است.🎇
🔔🔔نتیجه آن است
حال که از نسخه ی فعلی ما فقط در همین جهان موجود است، انتخاب هایی را انجام دهید که بعدها بخاطر عدم انجام آن حسرت نخورید،رؤیایتان را دنبال کنید،برای خودتان ایستادگی کنید از دل مشکلات گذر کنید و هر روز از زندگی خود فراتر روید .
زنده باد زندگی 😊
📝تهیه و تنظیم : #عطیه_احمدی دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
شنبه ها: #علمی_اجتماعی
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌منبع:
http://www.space.com/32728-parallel-universes.html
یکی از مباحث جذاب دنیای امروز این است که آیا جهان به همان شیوه ای است که ما درحال تجربه اش هستیم یا تنها این جهان نسخه ای از وقایع خارج از آن می باشد؟🚪
شاید جهان دیگری باشد، شاید حتی از خود ما نیز نسخه های دیگری وجود داشته باشد که هرکدام درحال تجربه ی متفاوت از زندگی باشند.🎒
از دید فیزیک و تلسکوپ ها جهان را با واژه ای جز وسعت و عظمت نمی شود توصیف کرد که شامل میلیون ها فوتون و نوترون و ذرات مختلف دیگر می شود.
هر کهکشان شامل تریلیون ها ستاره می شود و احتمال اینکه جهان های دیگری وجود داشته باشد و نسخه های دیگری از ما،بسیار زیاداست. اما آنچه مسلم است این است که حتی اگر این گفته درست باشد هرکدام از نسخه های ما در هر جهان منحصر به فرد است.🎇
🔔🔔نتیجه آن است
حال که از نسخه ی فعلی ما فقط در همین جهان موجود است، انتخاب هایی را انجام دهید که بعدها بخاطر عدم انجام آن حسرت نخورید،رؤیایتان را دنبال کنید،برای خودتان ایستادگی کنید از دل مشکلات گذر کنید و هر روز از زندگی خود فراتر روید .
زنده باد زندگی 😊
📝تهیه و تنظیم : #عطیه_احمدی دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
شنبه ها: #علمی_اجتماعی
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
📌منبع:
http://www.space.com/32728-parallel-universes.html
Space
Do parallel universes exist? We might live in a multiverse.
Sci-fi loves parallel universes. But could we really be in one?
🌀هشتمين همايش بيو انفورماتيك ايران 🌀
🗒تاريخ برگزاري ٢٩ بهمن الي ١ اسفندماه ١٣٩٧
✴️ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🗒تاريخ برگزاري ٢٩ بهمن الي ١ اسفندماه ١٣٩٧
✴️ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🔮💯سرمایهگذاری مطمئن روی یک زبان درست‼️
شما هم جزء آن دسته از برنامهنویسا 👨🏻💻و زیست شناسهایی 👩🔬هستین که تصمیم گرفتین در سال نو یک زبان برنامهنوسی جدیدی رو یاد بگیرن ‼️ اگر مصمم شدین تا پایتون رو یاد بگیرن اما مطمئن نیستین 🤔 که چطوری باید اینکار رو شروع کنید، یه سر به ✨☃️ مدرسه زمستونی بیوانفورماتیک بزنید اونجا با بهترین 👨🏫 مدرسا این زبان رو یاد میگیری👌👌
👇👇👇
🔸🔸 @Iran_Bioinformatics❄️💫
🔸🔸 @Iran_Bioinformatics❄️💫
شما هم جزء آن دسته از برنامهنویسا 👨🏻💻و زیست شناسهایی 👩🔬هستین که تصمیم گرفتین در سال نو یک زبان برنامهنوسی جدیدی رو یاد بگیرن ‼️ اگر مصمم شدین تا پایتون رو یاد بگیرن اما مطمئن نیستین 🤔 که چطوری باید اینکار رو شروع کنید، یه سر به ✨☃️ مدرسه زمستونی بیوانفورماتیک بزنید اونجا با بهترین 👨🏫 مدرسا این زبان رو یاد میگیری👌👌
👇👇👇
🔸🔸 @Iran_Bioinformatics❄️💫
🔸🔸 @Iran_Bioinformatics❄️💫
📝تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
یکشنبه ها: #معرفی_کتاب
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
یکشنبه ها: #معرفی_کتاب
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
🐧🧬🐧 بایو لینوکس🤔⁉️
آموزش لینوکس به همراه معرفی پکیج های و نرم افزارهای زیستی در🏠 مدرسه جامع بیوانفورماتیک ایران💫
🚥🚥🚥🚥پیش نیاز برای دوره آنالیز بیان ژن 👉👉👉👉👉
👇👇👇
🌀🌀 👉@Iran_Bioinformatics💯💯♨️
🌀🌀👉@Iran_Bioinformatics💯💯♨️
آموزش لینوکس به همراه معرفی پکیج های و نرم افزارهای زیستی در🏠 مدرسه جامع بیوانفورماتیک ایران💫
🚥🚥🚥🚥پیش نیاز برای دوره آنالیز بیان ژن 👉👉👉👉👉
👇👇👇
🌀🌀 👉@Iran_Bioinformatics💯💯♨️
🌀🌀👉@Iran_Bioinformatics💯💯♨️
🧬حاشیه نویسی ژنومیک به وسیله ابزار GTF پایتون
با وجود محبوبیت بسیار زیاد پایتون در بیوانفورماتیک، کتابخانه های محدودی جهت دستکاری سریع مختصات ژن در فرمت GTF موجود است.
💻 در این مطالعه یک پکیج پایتون از ابزار GTF (Pygtftk) با هدف دستکاری آسان و قدرتمند مختصات ژنی در فرمت GTF توسعه پیدا کرد. برای عملکرد بهینه، موتور اصلی این پکیج یک کتابخانه پویای C می باشد ( libgtftk)، در صورتی که پایتون API قابلیت استفاده و خواندن جهت گسترش اسکریپت ها را داراست.
💻 بر اساس این پکیج پایتون، خط فرمان gtftk گسترش پیدا کرد که برای سهولت بکارگیری فایل های GTF شامل ۵۷ زیر فرمان بود. این فرمان ها برای موارد زیر استفاده می گردند:
۱. اجرای وظایف بنیادی ( مانند انتخاب، الحاق، به روز رسانی یا حذف کلیدها/ خصوصیات)
۲. انتخاب ژن ها و ترنسکریپت ها براساس معیارهای مختلف ( مانند اندازه، تعداد اگزون، موقعیت TSS و طول اینترون)
۳. انجام عملیات های پیشرفته ای چون تجزیه و تحلیل coverage خصوصیات ژنتیکی با استفاده از فایل های bigwig جهت ایجاد دیاگرام های read-coverage.
پکیج pygtftk حاشیه نویسی فایل های GTF با اطلاعات خارجی را تسهیل می کند و ابزار های پیشرفته ای برای تجزیه و تحلیل ژن ها فراهم می کند.
📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics
📌 منبع:
https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article-abstract/doi/10.1093/bioinformatics/btz116/5320559?redirectedFrom=fulltext
با وجود محبوبیت بسیار زیاد پایتون در بیوانفورماتیک، کتابخانه های محدودی جهت دستکاری سریع مختصات ژن در فرمت GTF موجود است.
💻 در این مطالعه یک پکیج پایتون از ابزار GTF (Pygtftk) با هدف دستکاری آسان و قدرتمند مختصات ژنی در فرمت GTF توسعه پیدا کرد. برای عملکرد بهینه، موتور اصلی این پکیج یک کتابخانه پویای C می باشد ( libgtftk)، در صورتی که پایتون API قابلیت استفاده و خواندن جهت گسترش اسکریپت ها را داراست.
💻 بر اساس این پکیج پایتون، خط فرمان gtftk گسترش پیدا کرد که برای سهولت بکارگیری فایل های GTF شامل ۵۷ زیر فرمان بود. این فرمان ها برای موارد زیر استفاده می گردند:
۱. اجرای وظایف بنیادی ( مانند انتخاب، الحاق، به روز رسانی یا حذف کلیدها/ خصوصیات)
۲. انتخاب ژن ها و ترنسکریپت ها براساس معیارهای مختلف ( مانند اندازه، تعداد اگزون، موقعیت TSS و طول اینترون)
۳. انجام عملیات های پیشرفته ای چون تجزیه و تحلیل coverage خصوصیات ژنتیکی با استفاده از فایل های bigwig جهت ایجاد دیاگرام های read-coverage.
پکیج pygtftk حاشیه نویسی فایل های GTF با اطلاعات خارجی را تسهیل می کند و ابزار های پیشرفته ای برای تجزیه و تحلیل ژن ها فراهم می کند.
📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
دوشنبه ها: #مقاله_هفته
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics
📌 منبع:
https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article-abstract/doi/10.1093/bioinformatics/btz116/5320559?redirectedFrom=fulltext
OUP Academic
Explore, edit and leverage genomic annotations using Python GTF toolkit
AbstractMotivation. While Python has become very popular in bioinformatics, a limited number of libraries exist for fast manipulation of gene coordinates in En
💢💢🕸🕸🕸درک شبکه های زیستی باعث دید بهتر زیستی میشه ⚡️⚡️🕸🕸🕸
🛠🛠تحلیل داده های زیاد و پیچیده ای که امروزه زیست شناسا 👨🔬باهاش سر کار دارن با یادگیری شبکه های زیستی 🕸🕸آسون و راحت میشه💪💪
💠💠💠💠 @Iran_Bioinformatics👈👀✨✨✨✨✨✨✨✨✨
💠💠💠💠@Iran_Bioinformatics👈👀✨✨✨✨✨✨✨✨✨
🛠🛠تحلیل داده های زیاد و پیچیده ای که امروزه زیست شناسا 👨🔬باهاش سر کار دارن با یادگیری شبکه های زیستی 🕸🕸آسون و راحت میشه💪💪
💠💠💠💠 @Iran_Bioinformatics👈👀✨✨✨✨✨✨✨✨✨
💠💠💠💠@Iran_Bioinformatics👈👀✨✨✨✨✨✨✨✨✨
📝 تهیه و تنظیم: #نیلوفر_سید_مجیدی دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس
سه شنبه ها: معرفی #موقعیت_تحصیلی
📌لینک:
https://www.nature.com/naturecareers/job?id=674413
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫
سه شنبه ها: معرفی #موقعیت_تحصیلی
📌لینک:
https://www.nature.com/naturecareers/job?id=674413
✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫