📍#شروع کلاس
✅#برنامه_نویسی_پایتون

👨‍🏫مدرسین:دکتر جواد ظهیری(عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس)
بابک خرسند(دانشجوی مقطع دکتری هوش مصنوعی)


🗓نیمه دوم بهمن ماه

💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1

#طنز
#من_و_استاد_راهنمام!

👈وقتی شیش ماهه که به استادت گفتی پایان نامه آماده اس اما می گه تا ظهر بیارش بخونم😂

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📍#شروع کلاس
✅#برنامه_نویسی_R

👨‍🏫مدرسین:دکتر جواد ظهیری(عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس)
بابک خرسند(دانشجوی مقطع دکتری هوش مصنوعی)


🗓نیمه دوم بهمن ماه

💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1

🦏🦏 بازگرداندنِ گونه های منقرض شده


🏹 شکارچیان با تقاضای شکار فیل ها، کرگدن ها، شیرها و سایر حیوانات در معرض خطر همچنان در صدر اخبار باقی مانده اند.

🌏 تغییرات آب و هوایی تلفات سنگینی بر بسیاری از گونه های حیوانی، گیاهی و حشرات سراسر زمین بر جای گذاشته است.

🚂 و تاثیرات انسان بر زیستگاه های طبیعی چون اقیانوس ها، جنگل های استوایی و صحراها در حال بدتر شدن است.

📰 با شنیدن چنین اخباری ممکن است تصور کنید که انقراض حیوانات ناشی از فعالیت های انسانی پدیده ای منحصرا جدید است، اما تاریخ به ما خلاف این موضوع را نشان داده است و مثال های بسیاری از انقراض حیوانات به دست انسان در حدود ۱۰۰ سال اخیر وجود دارد.

🧬 تلفات حیوانات اینچنینی بحث هایی را پیرامونِ نجات سایر حیوانات در معرض خطر انقراض به هر قیمتی در پی داشته است و الهام بخش پژوهشگران در جهت توسعه فناوری هایی که امکانِ بازگرداندن گونه های منقرض شده را فراهم می کند، بوده است.

📖 برای آشنایی بیشتر با این موضوع به لینک زیر مراجعه کنید.

📌 https://cbs.asu.edu/news/bringing-back-extinct-species-if-we-can-should-we


📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها: #علمی_اجتماعی

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران

@Iran_Bioinformatics💫

📍#شروع کلاس
✅#آنالیز_داده_هایـبیانـژن

👨‍🏫مدرسین:دکتر جواد ظهیری(عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس)

🗓نیمه دوم بهمن ماه

💻برگزاری دوره به صورت انلاین

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1

💻 نرم افزار Membuilder II

📝تهیه و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #معرفی_نرم_افزار

📌 لینک دسترسی به ابزار
http://bioinf.modares.ac.ir/software/mb2/

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

👩🏻 مقالات زنان بیشتر از مردان خوانده می شود.

💬 درکشورهای آمریکا و انگلستان و اسپانیا، مقالات علمی زنان برای دانشجویان دوره لیسانس ،۲ تا۶ درصد جذاب تر از مردان است.

💻 با استفاده از نرم افزار mendeley که به نوعی سازمان دهنده ی تحقیقات و مقالات است، آقای Mike Thelwall محقق دانشگاه Wolverhampton داده های معنی داری را برای این موضوع جمع آوری کرده است.

📰 تحقیقات نشان داد که برای دوره ی ارشد موضوع متفاوت است، و دانشجویان دوره ارشد ترجیح می دهند مقالات مردان را جهت پژوهش های خود استفاده کنند.

⚠️ در هند درتمام مقاطع دانشجویان مقالات مردان را ترجیح می دهند!

🔦 این محقق پیشنهاد می دهد که زنان محقق تازه کار باید بدانند که ارجاع دادن به مقالات تنها معیار خوب بودن یک مقاله نیست و با انگیزه به تحقیق ادامه دهند تا اثر خود را بر علم بگذارند.

♦️تهیه و تنظیم: #عطیه_احمدی دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

⏪منبع:
https://www.nature.com/articles/d41586-018-07605-5

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

📍#شروع کلاس
✅#یادگیری_ماشین

👨‍🏫مدرسین:دکتر جواد ظهیری(عضو هیئت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس)

🗓نیمه دوم بهمن ماه

💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1

📝 تهیه و تنظیم: #یاسمین_کیانیان دانشجوی دکتری شیمی آلی محاسباتی دانشگاه #تربیت_مدرس

سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_پسادکتری

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

📌 منبع:
https://www.nature.com/naturecareers/job?id=673091

📝تهیه و تنظیم: #شهاب_الدین_رحیمی دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

سه شنبه ها: #معرفی_بیوانفورماتیک

📌 منبع:
کتاب Bioinformatics: The Machine Learning Approach
نوشته ی Pierri baldi و Soren brunak

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📍#شروع کلاس
✅#طراحی_پروتئین

👨‍🏫مدرس:دکتر سید شهریار عرب(عضو هئیت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس)

🗓نیمه دوم بهمن ماه

💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1

✨ پزشکی فردمحور- Precision Medicine

📝تهیه و تنظیم: #مژگان_مظفری_لقا دانشجوی دکتری #بیوانفورماتیک دانشگاه #تهران

چهار شنبه ها: #اینفوگرافیک

📌 منبع:
http://fawndesigns.com/index.php/project/precision-cancer-medicine-infographiccampaign

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📍#شروع کلاس
✅#مدلسازی_پروتئین

👨‍🏫مدرس:دکتر سید شهریار عرب(عضو هئیت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس)

🗓نیمه دوم بهمن ماه

💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1

#Metabolic_network

📝 تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

🎙صداگذاری: #سینا_صامتی دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنج شنبه ها: #فیلم

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📍#شروع کلاس
✅#دوره_جامع_رگرسیون

👨‍🏫مدرس:دکتر جواد ظهیری(عضو هئیت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس)

🗓نیمه دوم بهمن ماه

💻برگزاری دوره به صورت انلاین و حضوری

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1

#داستان_طنز
#من_و_استاد_راهنمام!

👈 کابوس های من وقتی به پایان نامه م فکر‌ می کنم 😂

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🏆جایزه ”ایگ نوبل” جایزه ای به پژوهش های مضحک ولی جدید💰


🎭 (ایگ نوبل) جایزه ای است که بسیار مورد توجه قرار گرفته; از آن حیث که به خنده دارترین و گاه مضحک ترین پژوهش سال تعلق می گیرد.

💸 این جایزه مانند جایزه ی نوبل به بخش های مختلف ادبیات و شیمی و فیزیک و... تعلق می گیرد منتها شرط خنده دار بودن باید در همه ی آن ها رعایت شود.

⏳درسال ۲۰۱۵ در قسمت ادبیات جایزه به تحقیقی با موضوع ” آیا کلمه ((ها؟!)) در تمام زبان ها کاربرد دارد یا خیر” تعلق گرفت .

👂🏼جایزه ایگ نوبل آناتومی درسال ۲۰۱۷ به موضوع ”چرا پیرمردها گوش های بزرگی دارند” تعلق گرفت.

🚗 درسال ۲۰۱۸ جایزه ایگ نوبل صلح به موضوع ”تاثیر فریاد و فحش در کیفیت رانندگی” تعلق گرفت.

🕹 اولین فایده ی این گونه جوایز جرأت دادن به محققین برای دنبال کردن افکاری است که از نظر آنان احمقانه به نظرمی آید.


📇 تهیه وتنظیم : #عطیه_احمدی دانشجوی ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


شنبه ها:#علمی_اجتماعی

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
https://www.improbable.com/ig/

🔴 نرم افزار InTAD : آنالیز هدایت شده ساختارهای کرموزومی در ژن های مورد هدف تشدیدکننده ها


🧬 فناوری های با ظرفیت بالا جهت آنالیز ساختارهای کروموزومی در مقیاس ژن آشکار کرده اند که کروماتین در دُمین های مرتبط از لحاظ توپولوژیکی سازمان یافته است که به آن TAD گفته می شود. TADها در همه انواع سلولی نسبتا پایدار هستند، در حالی که فعالیت های intra-TAD اختصاصی نوع سلول می باشد. پروفایل های اپی ژنتیک بافت ها و سلول های مختلف منجر به شناسایی عناصر تنظیمی غیرکدکننده متععدی تحت عنوان 'تشدیدکننده' شده است که با نواحی کدکننده فاصله زیادی دارند.


📈 تقریب خطی، معیار انتخابی رایجی برای بررسی وابستگی تشدیدکننده با ژن های هدف بالقوه شان می باشد. تشدیدکننده ها غالبا نزدیک ترین ژن را تنظیم می کنند، اما شناسایی بدون ابهام ژن های تنظیم شده توسط تشدیدکننده ها در غیاب نمونه داده های ساختارهای کروموزومی تطبیق یافته همچنان چالش برانگیز است.


🖥 در این پروژه، برای وابستگی تشدیدکننده ها و ژن های هدفشان روشی به کار گرفته شده است که همبستگی قابل توجه میان تشدیدکننده و بیان ژن در طول یک گروه از نمونه ها را آزمایش می کند. جهت کاهشِ تعداد آزمایش ها، این آنالیز به جفت های ژن-تشدید کننده قرار گرفته در TADهای مشابه محدود شده است و اطلاعات مربوط به این مرزهای TAD از داده های ساختارهای کروموزومی (Hi-c) که در دسترس عموم قرار دارند، برداشته شده است. این روش به صورت یک پکیج بیوکنداکتور R به نام InTAD پیاده سازی و با آنالیز داده های بیان ژن و تشدیدکننده حاصل از تومور مغزی ependymma ارزیابی شده است.


📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


دوشنبه ها: #مقاله_هفته


✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫


📌 منبع:
https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-019-2655-2

📱اپلیکیشن #OligoCOOL

🔍 علاقه مندان جهت بدست آوردن اطلاعات بیشتر در خصوص نحوه کار با OligoCOOL می توانند از طریق لینک زیر مقاله اپلیکیشن را مطالعه کنند:
📰 https://rdcu.be/bikmG


📌لینک دسترسی جهت دانلود OligoCOOL
🌐 http://bioinf.modares.ac.ir/software/OligoCOOL/

📝تهیه و تنظیم: #مژگان_مظفری_لقا دانشجوی دکتری #بیوانفورماتیک دانشگاه #تهران

دوشنبه ها: #معرفی_ابزار_بیوانفورماتیکی

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫