💢شروع کلاس فردا چهارشنبه
📆هفتم آذر‌ماه
💊#طراحی_دارو
✅برای کسب اطلاعات بیشتر از سایر دوره ها به کانال زیر مراجعه فرمایید:
@BioinformaticsSchools💫

شبکه های ژنی انسانی که براساس روش های متعدد مبنی بر شبکه بازسازی شده اند،برای نشان دادن ارتباط فرضیه ی دارو-بیماری-ژن ،استفاده شده و میتواند درجنبه های مختلف بیماری کاربردی باشند.
توانایی پیش بینی و سامان دادن ژن های مربوط به یک بیماری خاص بسیار حائز اهمیت است.
ما human net که شبکه ژنی انسانی است را توسعه دادیم.
بدین صورتکه داده های امیکس گونه های مختلف را ادغام و از چهارچوب آماری bayesian استفاده میکنیم.
📰دراین مقاله ما human net را ارائه کردیم:

🔰http://www.inetbio.org/humannet

دیتابیسی از شبکه های ژنی انسانی که با داده های جدید و بهبود الگوریتم استنتاجی شبکه به روز میشوند.
واز سلسله مراتب شبکه های
ژنی انسانی تشکیل شده که جهت گیری خاصی نسبت به داده های قبلی ندارد
باید دانست که یکپارچه سازی ارگانیسم های مدل پیش بینی ژن های بیماری زا را به طور کامل تعیین نمیکند،و پیشنهاد میشود که ارتباط ژن های بیماریزا از پایگاه داده های انسانی مشتق شوند.
همراه با آنالیز شبکه ی برهمکنش بیماری،ما انتظار داریم humannetمنبع خوبی برای شبکه پزشکی باشد.

📝تهیه و تنظیم:
#عطیه_احمدی دانشجوی ارشد #بیوفیزیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #مقاله

📌منبع:
https://www.nature.com/articles/d41586-018-07271-7

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

#Video
#‌Bioinformatics
#بیوانفورماتیک

✴️اهمیت رشته بیوانفورماتیک را در این ویدیو مشاهده کنید.

پنج شنبه ها: #فیلم

📝 #ترجمه : #اسماعیل_روح_پرور دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس

🎙 #صدا_گذاری: #سحر_برهانی دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

💢شروع کلاس فردا جمعه
📆نهم آذر‌ماه
💊#برنامه_نویسی_R
✅برای کسب اطلاعات بیشتر از سایر دوره ها به کانال زیر مراجعه فرمایید:
@BioinformaticsSchools💫

❄️🔥یه زمستون داغ
💯مدرسه زمستانی
#جامع #بیوانفورماتیک ایران

✅برای کسب اطلاعات بیشتر از دوره ها با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1
و یا به کانال زیر مراجعه فرمایید:
@BioinformaticsSchools💫

#داستان
#من_و_استاد_راهنمام!

👈استاد راهنمام وقتی میخواد ازم گزارش کار بگیره😂

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

#انرژی_مثبت
#شروع_هفته
#پیروزی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

🔷🤵این دانشمند آمریکایی در زمینه علم رایانه در تاریخ ۷ مارس، ۲۰۰۷ (میلادی) در گذشت.

🔶 رهبری گروهی را به عهده داشت که اولین زبان برنامه‌نویسی سطح بالا (فورترن) را اختراع نمودند.

🔷 مخترع فرم باکوس نائور (یا به اختصار BNF) نیز بود که تقریباً پراستفاده‌ترین نمادگری برای تعریف نحو (Syntax) زبان‌های صوری است.

🔶در سال ۱۹۷۷ (میلادی) برای «مشارکت‌های ژرف، تأثیرگذار، و ماندگارش برای طراحی سامانه‌های برنامه‌نویسی کاربردی سطح بالا، و خصوصاً بخاطر کار بر روی فورترن» و انتشار اولین مقالات در مورد شیوه‌های صوری برای توصیف زبان‌های برنامه‌نویسی، جایزه تورینگ را دریافت کرد.

🔷یکی از جملات معروف او:
«من از پزشکی بیزار بودم. در دانشکده پزشکی دوست ندارند فکر کنی. فقط می‌خواهند مطالب زیادی را حفظ کنی و این تمام چیزی است که از آدم می‌خواهند. در دانشکدهٔ پزشکی نباید فکر کرد!»

📝تهیه و تنظیم: #شهاب_الدین_رحیمی دانشجوی ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس

شنبه ها : #تقویم_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🔷📘 این کتاب مجموعه‌ای از نه داستان کوتاه علمی تخیلی است.

🔶👨‍💼ایزاک آسیموف نویسندهٔ آمریکایی روسی‌تبارِ نویسنده داستان های علمی–تخیلی است.
🔷وی، بیش از ۵۰۰ عنوان کتاب در تمام دسته‌های اصلی رده‌بندی دوی (به جز فلسفه) دارد و سیارک آسیموف ۵۰۲۰ به افتخار وی، نامگذاری شده‌است.

🔶شهرت اصلی او، بیشتر، به دلیل سری_بنیاد است.

🔷قوانین سه‌گانهٔ رباتیک وی از شهرت جهانی برخوردار است و دانشنامه بریتانیکا وی را واضعِ واژهٔ رباتیک در زبان انگلیسی می‌شناسد.

📝تهیه و تنظیم: #شهاب_الدین_رحیمی دانشجوی ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس

شنبه ها : #تقویم_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

✴️یکشنبه گذشته دانشمندی چینی ادعایی مبنی بر ایجاد اولین نوزادان دستکاری ژنتیکی شده جهان مطرح کرد که حواشی زیادی را به دنبال داشت. از جمله نامه بیش از 120 دانشمند چینی که این آزمایش را ضربه بزرگی به اعتبار علمی چین دانسته‌اند:

🔰https://www.washingtonpost.com/science/2018/11/26/scientists-claim-gene-edited-babies-creates-uproar/?utm_term=.f9871b4d4683


یکی از واکنش ها به این مساله توسط دکتر Jenifer Dounda استاد دانشگاه UC برکلی و یکی از مخترعان تکنولوژی دستکاری ژنتیکی CRISPR-Cas9 که در پاسخ به این ادعا بیانیه ای منتشر کرده است.
او می گوید که عموم باید به نکات زیر توجه داشته باشند:


🔴 گزارش پزشکی در ادبیات علمی برای بررسی های دقیق منتشر نشده است.


🔴 به این دلیل که داده ها تحت بررسی دقیق قرار نگرفته اند، درستی فرآیند دستکاری ژنتیکی قابل ارزیابی نیست.

🔴 کارهایی که تاکنون توصیف شده اند، بر این تاکید دارند که استفاده از دستکاری ژنتیکی در جنین انسان به شرایطی که روش درمانی جایگزینی وجود ندارد، محدود می شود.


📝تهیه و تنظیم:
#سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک
دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه ها: #علمی_اجتماعی

📌منبع:
https://bigthink.com/surprising-science/crispr-coinventor-responds-to-claim-of-edited-babies

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

#Conference_alert

#feb_2019

📝تهیه و تنظیم :
#شهین_رمضی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک دانشگاه #تربيت_مدرس

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🐜🐜🐜تراکم زیاد جمعیت و نیز تماس‌های مکرر و نزدیک بین افراد موجب شیوع سریع بیماری‌ها می‌شود.
یکی از ساز و کارهای دفاعی مورچه‌ها برای دفاع از کلونی دربرابر بیماری‌ها، تطابق با سازمان اجتماعی خودتوسعه‌یافته است.
مورچه‌ها تماس تصادفی با دیگر اعضای کلونی ندارند؛ بلکه به‌صورت زیرگروه‌هایی براساس سن و وظیفه‌شان تقسیم شده‌اند. درحالی‌که مورچه‌های کارگر جوان که «مورچه‌های پرستار» خوانده می‌شوند، از نوزادان حساس در مرکز کلونی مراقبت می‌کنند، کارگرهای مسن تبدیل به چراگرانی می‌شوند که در خارج از آشیانه به‌دنبال غذا می‌گردند.
🐜مورچه‌های چراگر درمعرض عوامل بیماری‌زای بیشتری قرار می‌گیرند.
👩‍🔬پژوهشگران از سیستم بارکد برای بررسی تعاملات بین مورچه‌ها و به‌خصوص مطالعه‌ی رفتار آن‌ها در هنگام شیوع بیماری‌ استفاده کردند. در آزمایش نخست، آن‌ها نشانگرهای دیجیتالی را روی ۲۲۶۶ مورچه‌ی باغی قرار دادند.
📸دوربین‌های مادون‌قرمز در هر نیم‌ثانیه تصویری از کلونی‌ها ثبت می‌کرد؛ بنابراین پژوهشگران می‌توانستند حرکت و موقعیت هر مورچه و تعاملات آن‌ها را دنبال کنند. پژوهشگران نشان دادند که تقسیم مورچه‌ها به زیرگروه‌های خاص عملی پیشگیرانه است و خطر شیوع بیماری را کاهش می‌دهد. سپس، ۱۰ درصد از مورچه‌های کارگر (تمام چراگرها) درمعرض اسپورهای قارچ قرار داده شدند که به‌آسانی ازطریق تماس منتشر می‌شوند. مقایسه‌ی کلونی‌ها قبل و بعد از مواجهه با عامل بیماری‌زا نشان می‌داد.
مورچه‌ها سریعا حضور اسپورهای قارچی را احساس می‌کنند و رفتار خود را به‌منظور تقویت روش‌های دفاع‌ موجود تغییر می‌دهند. این واکنش پاسخی است که کل کلونی بروز می‌دهد؛ حتی جانورانی که خودشان درمعرض اسپورها قرار نگرفته بودند، رفتارشان را تغییر می‌دادند.

📝تهیه و تنظیم:
#سینا_صامتی دانشجوی ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس

سه شنبه ها: #خبر

📌منبع:
https://www.sciencedaily.com/images/2018/11/181123135020_1_900x600.jpg

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

💢شروع کلاس جمعه
📆 شانزده آذر‌ ماه
👨‍💻#برنامه_نویسی_پایتون
✅برای کسب اطلاعات بیشتر از سایر دوره ها به کانال زیر مراجعه فرمایید:
@BioinformaticsSchools💫

👈برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool1

💻 نرم افزار FlePS زیر نظر
👨‍💻دکتر #سید_شهریار_عرب
👨‍💻 دکتر #جواد_ظهیری

توسط

👩‍💻 #مژگان_مظفری_لقا
در گروه بیوانفورماتیک

🏢 دانشگاه تربیت مدرس، توسعه یافته است و از طریق لینک زیر در دسترس عموم قرار دارد:
🔰http://bioinf.modares.ac.ir/software/fleps/

📝تهیه و تنظیم: #مژگان_مظفری_لقا دانشجوی دکتری #بیوانفورماتیک دانشگاه #تهران

🗓چهارشنبه ها : #معرفی_نرم_افزار

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

#Video
#‌Bioinformatics
#بیوانفورماتیک

✴️مدلسازی رفتار تومور .

پنج شنبه ها: #فیلم

📝 #ترجمه : #نیلوفر_سید_مجیدی دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس

🎙 #صدا_گذاری: #محمد_افشاری دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

👈احوال پرسی استادها سر جلسه دفاع 😂

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

#شروع_هفته
#انرژی_مثبت

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫

📝تهیه و تنظیم: #رایحه_وفایی دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس

شنبه ها : #تقویم_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک
آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یک شنبه ها: #معرفی_کتاب

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

✨ تأیید نخستین داروی #مبتنی_بر_siRNA برای درمان نوعی بیماری عصبی✨

🔹 این خبر که توسط "جامعه ژن و سلول درمانی آمریکا"منتشر شده است، حاکی از تأیید نخستین دارو از نسل جدید روش درمان بیماری های #آمیلوئیدوزیس توسط اداره غذا و داروی آمریکا (FDA) است که مبتنی بر RNA سرکوبگر (RNAi) عمل می نماید.

🔸 داروی #Patisiran برای درمان نوعی بیماری عصبی محیطی تحت عنوان #پلی_نوروپاتی بکار می رود که در دسته بیماری های آمیلوئیدوزیس قرار داشته و ناشی از تجمع فیبرهای آمیلوئیدی پروتئین ترانسترین است و به آن آمیلوئیدوز #hATTR نیز می گویند.
☠️ این بیماری ژنتیکی نادر که ناتوان کننده و اغلب مرگبار است حدود 50،000 نفر در سراسر جهان را تحت تأثیر قرار داده و با ایجاد پروتئین آمیلوئید غیر طبیعی در اعصاب محیطی، قلب و سایر اندام ها مشخص می شود.

🔹این دارو با هدف قرار دادن علت اصلی آن، ما را قادر به توقف یا معکوس کردن بیماری به جای کند کردن روند پیشرفت یا کاهش علائم آن می سازد که از علائم مهم آن تحلیل رفتن عصب و در نهایت درد، ضعف و از دست دادن تحرک است.
🔍بررسی فاز سوم این دارو در یک جمعیت تصادفی از این بیماران که حدود 18 ماه طول کشید، بهبود در کیفیت زندگی، فعالیت های روزانه، کم کاری و تغذیه را نشان می دهد.

🔸روش های درمان مبتنی بر RNA سرکوبگر با خاموش کردن ژن های مختص به بیماری عمل کرده و برای مهار یک فرایند سلولی طبیعی و معرفی شکل جدیدی از درمان بیماری ها طراحی شده اند.
💊داروی Patisiran نیز به عنوان بخشی از یک زیر مجموعه از این درمان ها که مبتنی بر (siRNA) است طراحی گردیده و مانع از بیان پروتئین های ایجاد کننده بیماری در بیماران مبتلا به پلی نوروپاتی می شود.

🔹به طور کلی درمان های RNAi یک فناوری جدید و هیجان انگیز در جهت توسعه داروهای خاموش کننده ژن برای درمان سایر بیماری های ژنتیکی هستند. تأیید این دارو از جهات بسیاری قابل توجه بوده و اکنون جامعه آمیلوئیدوز hATTR، از مبتلایان به این بیماری گرفته تا متخصصان مراقبت های بهداشتی دارای یک گزینه درمان هستند که امید تازه ای را برای درمان این بیماری ارائه می دهد.

#Polyneuropathy
#Amyloidosis
#Patisiran

📌منبع:
https://www.asgct.org/research/news/august-2018/fda-approves-patisiran-rna-interference-rnai

📝تهیه و تنظیم : #سمیه_آزادیان دانشجوی ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس

یک شنبه ها: #علمی_اجتماعی

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫