📍#شروع کلاس
✅#بسته_جامع_مهندسی_پروتئین
چهارشنبه
🗓هفته اول آذر ماه

‼️ ظرفیت باقیمانده 👈#پنج نفر

جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool1

#یک_کانال✅ به جای #چندیدن_کانال💪
🍁کانال بیوانفورماتیک ایران 🍁
👇👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫

🔺All in one💯🔺
#InfoGraphic
#Fact
#حقارت_انسان

🌏 اگر #عمر_کره_زمین را یک فیلم ۲۴ #ساعته در نظر بیگریم که دقیقا از نیمه شب شروع به دیدن آن میکنیم:

🚶🏽انسان امروزی در چهار #ثانیه آخر در فیلم ظاهر می‌گردد ‼‼
تا ساعت ۱۰ صبح تقریبا هیچ اکسیژنی وجود ندارد.
🐠بعد ازساعت ۸ شب ماهی ها ظاهر می شوند.
🌱بعد از ساعت ۹ شب اولین گیاهان پدیدار می‌گردند.
🐂حدود یک ساعت مانده به آخر فیلم پستاندارن را میتوان دید.
🦕ساعت۱۱:۴۰ شب دایناسورها منقرض می شوند.

منبع عکس:
https://i.pinimg.com/originals/63/70/19/63701947eefbd93dae8e943b5c466df1.jpg

✅#یک_کانال به جای #چندیدن_کانال💪
👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫

🔺All in one💯For bioinformaticians, computational biologists and biomedical informatics scientists🔺

#Video
#‌Bioinformatics
#بیوانفورماتیک

🔰 ویدئویی تماشایی از کارکرد بیوانفورماتیک که توسط بزرگترین شبکه ملی بیوانفورماتیک در اروپا به نام SIB تدوین گردیده و اهمیت این رشته را در توسعه دانش فردا به زیبایی بازگو می کند.

📝 #ترجمه : #ساره_عامری
🎙 #صدا_گذاری: #محمد_افشاری

👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫

📌با توجه به درخواست اعضای محترم

✅#اطلاعات_دقیق و #سرفصل های دروس مدرسه #جامع پاییزی در کانال زیر در دسترس می باشد.
👇👇👇👇

https://t.me/BioinformaticsSchools

🔺All in one!! 💯🔺

#on_this_week
"جین امدال"

🔶متولد 16 نوامبر 1922 و یکی از دانشمندان برجسته علوم رایانه بود.

🔵شهرت او حاصل تلاش‌هایش در توسعه #مین_فریم_ها یا بزرگ‌رایانه های شرکت #IBM و #قانون_امدال بود.

🗓مهمترین رویداد های هفته، شنبه ها

✅#یک_کانال به جای #چندیدن_کانال💪

👇👇👇
@Iran_Bioinformatics

🔺All in one!! 💯🔺

#on_this_week
"ادوارد دویسی"

🔶وفات یافته 23 اکتبر 1986 و یکی از دانشمندان برجسته علوم زیستی بود.

🔵وی به‌همراه هنریک کارل پیتر دام، جایزه #نوبل فیزیولوژی و پزشکی را به‌خاطر کشف #ویتامین_K و ساختار شیمیایی‌اش، دریافت کرد.

🗓مهمترین رویداد های هفته، شنبه ها

✅#یک_کانال به جای #چندیدن_کانال💪

👇👇👇
@Iran_Bioinformatics

🔺All in one!! 💯🔺

#on_this_week
"دنیل ناتانس"

🔶متولد 30 اکتبر 1928 و از دانشمندان برجسته #میکروبیولوژی بود.

🔵وی برنده جایزه #نوبل فیزیولوژی و پزشکی نیز می باشد.

🗓مهمترین رویداد های هفته، شنبه ها

🔷شهرت او حاصل کشف آنزیم های محدود کننده است.

✅#یک_کانال به جای #چندیدن_کانال💪

👇👇👇
@Iran_Bioinformatics

🔔🔔🔔🔔🔔🔔🔔🔔🔔
⚡️شروع #دوره #آموزش #R #آذر ماه
💥#کد_جدید
‼️ #ظرفیت باقیمانده 👈#دو نفر
جهت کسب اطلاعات بیشتر میتوانید با شناسه زیر تماس برقرار کنید:
@codecool1

#R
#learning
👇👇👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫

🔺All in one💯🔺

🔹ارتباط #کودک_آزاری با تغییرات #اپی_ژنتیکی🔸

📌مطالعات بیشماری که تا کنون در زمینه کودک آزاری از جنبه های مختلف آن انجام شده است، نشان می دهد اشخاصی که در دوران کودکی مورد آزار و اذیت و سوء رفتار والدین و اطرافیان قرار گرفته اند به احتمال زیاد همین رفتارها را در بزرگسالی در رابطه با فرزندانشان و اشخاص دیگر می توانند بروز دهند.
علاوه بر این کودک آزاری نه تنها بر روح و روان کودک اثرات عمدتاً جبران ناپذیری می گذارد بلکه نشانه های آسیب یا جراحت جسمی در DNA آنها نیز باقی می ماند.
پژوهش¬هایی که تا کنون در این مورد صورت گرفته است، ردپای "تغییرات اپی ژنتیک" را در افزایش ریسک ابتلا به بیماری های عصبی و قلبی – عروقی کودکانی که مورد آزار جسمی و روحی قرار گرفته اند، نشان می دهد.

⚜️ در یک پژوهش که به تازگی با هدف بررسی نقش این تغییرات توسط محققان دانشگاه بریتیش کلمبیا انجام گرفته است، سلول های اسپرم افرادی مورد بررسی قرار گرفت که در دوران کودکی خود دچار آسیب شده بودند. نتایج حاصل از این بررسی‌ها بیانگر این است که سوء رفتارهای احساسی، جسمی و جنسی تجربه‌شده توسط کودکان، می تواند بر روی متیلاسیون DNA و تغییر بیان ژن این افراد تأثیر گذار باشد. در واقع تغییرات در متیلاسیون DNA (متیله و دِمتیله شدن) همانند کلیدی است که باعث خاموش و روشن شدن ژن ها، تغییر الگوی بیان ژن و در نهایت تغییر عملکرد سلول می گردد.

💢 با این اوصاف کاهش یا افزایش متیلاسیون و به عبارتی دیگر #اختلالات #متیلاسیون (Methylation disorders) می تواند در زمینه جرم شناسی برای سنجش و راست آزمایی اتهامات مربوط به کودک آزاری مورد استفاده قرار بگیرد.

#Childhood #abuse
#Epigenetics

📝تهیه و تنظیم : #سمیه_آزادیان
#علمی #اجتماعی

✅کانال بیوانفورماتیک ايران
@Iran_Bioinformatics💫

https://www.nature.com/articles/s41398-018-0252-1
http://science.sciencemag.org/content/347/6229/1480

💻نرم افزار NCC-Finder:
🛠ابزار بیوانفورماتیکی برای تجزیه و تحلیل تاثیر محیط پیرامونی آمینواسیدها با هدف طراحی و مهندسی پروتئین و افزایش پایداری آن است. در ادامه درباره هر یک از این ماژول ها به اختصار توضیح داده شده است.
1.پیدا کننده همسایه: آمینواسیدهای همسایه آمینواسید مورد نظر را پیدا کرده که میتواند به آنالیز ساختاری با هدف دست کاری پروتئین کمک کند.
2. پیدا کننده ارتباط: آمینواسیدهای بین دو subunit را مشخص میکند که میتواند سرنخ های ارزشمندی با هدف کنترل میانکنش پروتئین ها بدهد.
3. پیدا کننده آمینواسیدهای حیاتی: آمینواسیدهای مهم در پایداری پروتئین را شناسایی و در اختیار کاربر قرار می دهد.

📌این نرم افزار زیر نظر
👨‍💻آقای دکتر سیدشهریار عرب و در
گروه بیوانفورماتیک
🏢 دانشگاه تربیت مدرس،
👩‍💻توسط خانم دکتر نیلوفر شیروانی زاده(ماژول اول و دوم) و
👩‍💻خانم سارا نعمتی(ماژول سوم) توسعه یافته است و از طریق لینک زیر در دسترس عموم قرار دارد:
http://bioinf.modares.ac.ir/software/nccfinder/

📝تهیه و تنظیم : #نیلوفر_سید_مجیدی


🗓دوشنبه ها #معرفی_نرم_افزار
#tool
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🏣شرکت آمازون از اجرای برنامه ای برای آموزش
👨‍💻برنامه نویسی به ۱۰ میلیون دانش آموز با تاکید بر آموزش اقلیت ها و دختران خبر داده است.

برنامه یادشده در یک بازه زمانی یک ساله اجرا می شود و هدف از این کار آشنا ساختن دانش آموزان از سنین پایین با روش های کدنویسی و برنامه نویسی است.
👩‍💻کمبود نیروی متخصص در حوزه علوم رایانه و برنامه نویسی در آمریکا نیز از جمله دلایل علاقه آمازون به اجرای چنین طرحی است.
این شرکت می گوید با همکاری تعدادی موسسه دیگر و پرداخت هزینه راه اندازی اقامتگاه های تابستانی، آموزش معلمان و اجرای برخی ابتکارعمل های دیگر برنامه مذکور را به پیش خواهد برد. در قالب این طرح تلاش می شود افراد با استعداد اما فقیر از خانواده های کم درآمد شناسایی شوند تا استعدادهای آنها در زمینه برنامه نویسی شکوفا شود.
آمازون مدعی است برای اجرای این برنامه به اقلیت های نژادی و قومی مانند سیاه پوستان، اسپانیایی تبارها و همین طور دانش آموزان دختر توجه ویژه ای خواهد کرد. برنامه مذکور مهندسان آینده نام دارد و برنامه ریزی برای اجرای آن از سال گذشته آغاز شده است.
📌منبع :‌ واشنگتن پست


📝تهیه و تنظیم : #سینا_صامتی


🗓سه شنبه ها #خبر
#news
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

بسته جامع #طراحی_محاسباتی_دارو
👈ظرفیت باقیمانده 2 نفر
✅کانال بیوانفورماتیک
@Iran_Bioinformatics💫

اطلاعات دقیق تمام دروس مدرسه جامع پاییزی بیوانفورماتیک ایران در کانال زیر در دسترس می باشد.
https://t.me/BioinformaticsSchools

🛠ابزار های محاسباتی جدید، به درمان بهینه بیماری آلزایمر می تواند کمک کند:
رویکردی نوین در مدل سازی ، راهکاری برای تحریک اختصاصی مغز هر بیمار پیشنهاد می دهد.
تحریکات الکتریکی بخش های مختلف مغز، میتواند موجب بهبود فعالیت مدارهای عصبی آسیب دیده از آلزایمر گردد.
در حال حاضر تمامی بیماران، پروتوکل درمانی مشخصی را دریافت میکنند اما اثر درمانی برای هر بیمار، برحسب تفاوت های فردی سیگنال های مغزی، متفاوت است.
👨‍👦‍👦سانچز-رودریگز و همکارانش، برای بررسی امکان شخصی سازی تحریکات مغزی، از یک روش تئوری استفاده نمودند و ابزار محاسباتی را توسعه دادند که اطلاعات اسکن MRI و اندازه گیری سیگنال های مغزی بیماران را دریافت نموده و بر اساس آن، سیگنال های بهینه تحریک مغز را با هدف ارسال دقیق به محل مورد نظر و درمان فردی موثر تعیین نمایند.
این روش جدید بر مبنای محاسباتی با عنوان SDRE طراحی شده تا سیگنال های درونی مغز که دینامیک و سیستم های غیر خطی مغز انسان را کنترل میکند، بهینه سازند.
این روش موجب می شود تا نواحی خاصی از مغز که برای تحریک مناسب نیستند، مشخص شوند. محققان با این روش نواحی چون دستگاه لیمبیک و عقده های قاعده ایی را تعیین کردند که به طرز ویژه ایی هدف مناسبی برای تحریک مغز بیماران آلزایمری می باشد.
👨‍⚕️سانچز-رودریگز بیان داشت: " من فکر میکنم به زودی استفاده از ابزار های مشابه برای مطالعه و درمان سایر بیماری هایی که از طریق عملکرد مغز تحت تاثیر قرار میگیرد؛ مثل صرع و پارکینسون، به شدت مورد توجه قرار خواهد گرفت." در ادامه محققان در تلاش هستند تا ابزار خود را بر مبنای تفاوت عملکرد مغز هر بیمار، بهبود بخشند. این دستاورد در ادامه نیازمند آزمایشات حیوانی و بالینی می باشد.

📌منبع:

Lazaro M. Sanchez-Rodriguez, Yasser Iturria-Medina, Erica A. Baines, Sabela C. Mallo, Mehdy Dousty, Roberto C. Sotero. Design of optimal nonlinear network controllers for Alzheimer's disease. PLOS Computational Biology, 2018; 14 (5): e1006136 DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006136

📝تهیه و تنظیم : #رایحه_وفایی
دانشجوی دکتری بیوفیزیک و آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

🗓 #علمی_اجتماعی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

🛑ظرفیت باقیمانده برخی از دوره های
#مدرسه_جامع_پاییزی_بیوانفورماتیک_ایران

🔰اطلاعات دقیق و سرفصل های دروس در کانال زیر در دسترس می باشد.

@BioinformaticsSchools

✅همچنین می‌توانید با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید:
@codecool1

🔺All in one💯🔺
#انرژی_مثبت
#شروع_هفته
#پیروزی

✅#یک_کانال به جای #چندیدن_کانال💪
👇👇👇
@Iran_Bioinformatics💫

🔺All in one!! 💯🔺

#on_this_week
"فردریک سنگر"

🔶متولد 13 اوت 1918 و از دانشمندان برجسته #زیست_شناسی بود.

🔵وی روش‌هایی را برای مشخص کردن ترتیب #آمینواسیدها در ملکول‌های پیچیدهٔ #پروتئین ابداع کرد و نخستین کسی بود که مولکول کامل DNA را توالی‌یابی کرد.

🔷وی تنها کسی است که دو بار برندهٔ جایزه نوبل شیمی در سال‌های ۱۹۵۸ و ۱۹۸۰ شده است.

🔶مهمترین رویداد های هفته، شنبه ها

✅#یک_کانال به جای #چندیدن_کانال💪

👇👇👇
@Iran_Bioinformatics

🔺All in one!! 💯🔺

#on_this_week
"لین مارگولیس"

🔶متولد 5 مارس 1938 و از دانشمندان برجسته #زیست_شناسی بود.

🔵 نظریه‌پرداز #فرگشتی، نویسنده علمی، مربی و مروج و اولین طرفدار مدرن اهمیت #درون‌هم‌زیستی در فرگشت اهل آمریکا بود

🔷جان ساپ تاریخ‌دان گفته‌است: «نام لین مارگولیس مترادف درون‌همزیستی است، همان‌طور که نام داروین مترادف فرگشت است.»

🔶مهمترین رویداد های هفته، شنبه ها

✅#یک_کانال به جای #چندیدن_کانال💪

👇👇👇
@Iran_Bioinformatics

🛑#بیوانفورماتیک را به #مادربزرگ خود توضیح دهید.

🤦‍♀️دقیقا چی میخونی تو دانشگاه! ؟

♦️مطمئنا چندین بار تا حال این سوال را از شما پرسیده اند. چه در مهمانی های دوستانه و خانوادگی یا در گفتگو با همسایه یا وقتی با خانواده خود دور هم هستید.

🔸برقراری ارتباط و صحبت در مورد موضوعات مختلف علمی با مخاطبانی که در آن حوزه غیر متخصص هستند به طوری که جذابیت موضوع به خوبی منتقل شود کار دشواری است.

✅اگر چه این موضوع معمولا آموزش داده نمیشود، اما توانایی توضیح دادن کار خود به دیگران، مهارت ضروری در علم است.

👇مقاله زیر که در مجله Plos Computational Biology چاپ‌شده به همین موضوع اختصاص دارد.

منبع:https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1003305


📝تهیه و تنظیم : #اسماعیل_روح_پرور
دانشجوی ارشد بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

🗓 #مقاله

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

#معرفی_کتاب

🔷این کتاب مروری کلی و قابل دسترس در زمینه یادگیری آماری را فراهم می نماید که ابزاری ضروری جهت شناخت مجموعه های داده ای حجیم و پیچیده می باشد. این نوع داده ها در بیست سال گذشته در زمینه هایی از زیست شناسی تا سرمایه گذاری و بازاریابی یا حتی اخترفیزیک پدید آمده است.
♦این کتاب برخی از مهمترین تکنیک های مدل سازی و پیش بینی را همراه با برنامه های کاربردی مربوطه ارائه می دهد.

🔶مباحث اصلی کتاب:
رگرسیون، طبقه بندی، روش resampling، رویکردهای انقباض، روش های درختی، ماشین های بردار پشتیبانی، خوشه بندی و غیره است.

🔷از آنجا که هدف از این کتاب درسی این است که استفاده از این تکنیک های یادگیری آماری توسط علاقه مندان را تسهیل کند، هر فصل شامل آموزش جامعی در مورد نحوه اجرای تجزیه و تحلیل ها و روش های ارائه شده در R می باشد.

🔶نظر دکتر جواد ظهیری عضو هیات علمی گروه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس درباره کتاب : "یکی از ۱۰ کتابی که در ۱۰ سال اخیر دیده ام و تمام صفحاتش ارزش مطالعه دارد".

🔷یک کتاب کاملا ضروری برای تمام دانشجویان و محققان بیوانفورماتیک است.

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics💫

سال‌ها تحقیقات 👨‍✈️کارآگاهان جنایی و پلیس اف‌بی‌آی برای دستگیری قاتل سریالی که در رسانه‌ها به «قاتل ایالت طلایی» معروف شده بود، به 🚔دستگیری افسر سابق پلیس کالیفرنیا منجر شد.این مرد به ارتکاب 12قتل، 45تجاوز و 120سرقت متهم شده است. در دهه‌های 1970و 1980ده‌ها قتل و تجاوز در نقاط مختلف کالیفرنیا رخ داد که پلیس اعتقاد داشت همه آنها توسط یک نفر صورت گرفته اما هرگز عامل این جنایت شناسایی نشد. موج این جنایات چنان ترس و وحشتی بین مردم ایجاد کرده بود که نام «قاتل ایالت طلایی» سر زبان‌ها افتاد.اینجا بود که بهره گیری از کامپیوترها و علم #بیوانفورماتیک به کمک دانشمندان بررسی صحنه جرم آمد تا پس از سالها منجر به شناسایی قاتل ایالت طلایی شود.پایگاه ‌داده ‌های استفاده ‌شده توسط اف بی آی و سایر نهادهای مجری قانون به عنوان سیستم شاخص DNA ترکیبی (CODIS) شناخته می‌شوند.
📌منبع :‌Science Daily
ادامه مطلب:
https://www.sciencedaily.com/releases/2018/10/181011143
📝تهیه و تنظیم : #سینا_صامتی
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک #تربیت_مدرس
🗓سه شنبه ها #خبر
✅کانال بیوانفورماتیک ایران
@Iran_Bioinformatics 💫