یک پایگاه داده جدید (کسنرسیوم DoGA) که بیش از ۱۰۰ نوع بافت مختلف سگ را پوشش میدهد، میتواند به طور قابل توجهی درک ما از بیماریهای ارثی را بهبود بخشد و اطلاعات ارزشمندی برای تحقیقات بهداشتی در زمینه سگها و انسانها فراهم کند. این دیتابیس حاوی اطلاعات ارزشمندی از چگونگی بیان ژن ها و عملکرد پروموتر ها در بافت های خاصی از سگسانان است که می تواند افق های جدیدی را در مطالعات بالینی باز نماید.
https://www.doggenomeannotation.org/
https://dcc.doggenomeannotation.org/doga
https://www.doggenomeannotation.org/
https://dcc.doggenomeannotation.org/doga
👍4😁1
#خبر-علمی
پژوهشگران انستیتو Hubrecht دریافتهاند که نحوه بستهبندی DNA در سلولها میتواند مستقیماً بر سرعت تکثیر DNA در حین تقسیم سلولی تأثیر بگذارد. آنها گزارش کردهاند که بستهبندی DNA از طریق یک مسیر غیرمعمول سیگنالهایی ارسال میکند که بر توانایی سلول برای تقسیم و رشد اثر میگذارد. این کشف راههای جدیدی را برای بررسی ارتباط بین تکثیر DNA و بستهبندی آن باز میکند. این یافتهها ممکن است در آینده به دانشمندان کمک کنند تا درمانها و داروهایی برای بیماریهایی مانند سرطان پیدا کنند.
پژوهشگران انستیتو Hubrecht دریافتهاند که نحوه بستهبندی DNA در سلولها میتواند مستقیماً بر سرعت تکثیر DNA در حین تقسیم سلولی تأثیر بگذارد. آنها گزارش کردهاند که بستهبندی DNA از طریق یک مسیر غیرمعمول سیگنالهایی ارسال میکند که بر توانایی سلول برای تقسیم و رشد اثر میگذارد. این کشف راههای جدیدی را برای بررسی ارتباط بین تکثیر DNA و بستهبندی آن باز میکند. این یافتهها ممکن است در آینده به دانشمندان کمک کنند تا درمانها و داروهایی برای بیماریهایی مانند سرطان پیدا کنند.
👍4🔥2
#دانستنیها
مسیرهای سیگنالینگ وابسته به G پروتئین ها از مهمترین مسیرهای زیستی در سلول های گیاهی هستند. اگرچه سلولهای گیاهی بیشتر عناصر اصلی موجود در سیگنالدهی G پروتئین های حیوانی را دارند، تفاوتهای موجود در معماری شبکه و ویژگیهای ذاتی عناصر پروتئین G در گیاهان، سیگنالدهی G را در سلولهای گیاهی از مدل حیوانی متمایز میسازد. بر خلاف پروتئینهای G حیوانی، پروتئینهای G گیاهی بهطور خودکار فعال میشوند و به همین دلیل، تنظیم فعالسازی G در گیاهان در مرحله غیرفعالسازی رخ میدهد. خاصیت خودفعالشوندگی همچنین به این معناست که پروتئینهای G گیاهی نیازی به گیرندههای معمولی پروتئین G در حیوانات ندارند و بنابراین فاقد آنها هستند. اهداف پروتئینهای G فعالشده در گیاهان، که به عنوان افکتورها نیز شناخته میشوند، متفاوت از افکتورها در سلولهای حیوانی هستند. مجموعه سادهتری از عناصر سیگنالدهی G در آرابیدوپسیس باعث میشود که سیگنالدهی G در یک بستر چندسلولی راحتتر قابل دستکاری باشد...... مطالعه بیشتر...
مسیرهای سیگنالینگ وابسته به G پروتئین ها از مهمترین مسیرهای زیستی در سلول های گیاهی هستند. اگرچه سلولهای گیاهی بیشتر عناصر اصلی موجود در سیگنالدهی G پروتئین های حیوانی را دارند، تفاوتهای موجود در معماری شبکه و ویژگیهای ذاتی عناصر پروتئین G در گیاهان، سیگنالدهی G را در سلولهای گیاهی از مدل حیوانی متمایز میسازد. بر خلاف پروتئینهای G حیوانی، پروتئینهای G گیاهی بهطور خودکار فعال میشوند و به همین دلیل، تنظیم فعالسازی G در گیاهان در مرحله غیرفعالسازی رخ میدهد. خاصیت خودفعالشوندگی همچنین به این معناست که پروتئینهای G گیاهی نیازی به گیرندههای معمولی پروتئین G در حیوانات ندارند و بنابراین فاقد آنها هستند. اهداف پروتئینهای G فعالشده در گیاهان، که به عنوان افکتورها نیز شناخته میشوند، متفاوت از افکتورها در سلولهای حیوانی هستند. مجموعه سادهتری از عناصر سیگنالدهی G در آرابیدوپسیس باعث میشود که سیگنالدهی G در یک بستر چندسلولی راحتتر قابل دستکاری باشد...... مطالعه بیشتر...
🤔3👍2❤1
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
#خبر تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران در شرایط خاص، اصلاح هدفمند بخشهای معیوب در ژنوم میتواند منجر به بروز نقصهای ژنتیکی جدید شود. این مسئله توسط یک تیم از دانشگاه زوریخ (UZH) در مورد بیماری ارثی نادر به نام گرانولوماتوز…
همراهان عزیز پیرامون اثر جانبی #کریسپر که توسط محققان دانشگاه زوریخ سویس برای اولین بار در بازارایی کروموزومی در بیماری گرانولوماتوز گزارش شده است اطلاعات بیشتری درخواست نمودند و اکنون دوستان می توانند با مطالعه دو لینک زیر به جزییات خبر و مطالعه منتشر شده در این زمینه دست پیدا نمایند. مقاله هدف که این یافته را گزارش نموده است بر ترمیم توالی ژن NCF1 با استفاده از تکنولوژی ویرایش ژن پرداخته است که منجر به مشاهده چنین موردی در رابطه با کریسپر شده است.
لینک خبر بر روی سایت دانشگاه زوریخ سویس
لینک مقاله
@irbioinformatics
لینک خبر بر روی سایت دانشگاه زوریخ سویس
لینک مقاله
@irbioinformatics
🤔3👍2
s42003-024-06959-z.pdf
2 MB
Gene editing of NCF1 loci is associated with homologous recombination and chromosomal rearrangements
🔬👇
"....In conclusion, we have shown that targeted editing of the NCF1 gene and pseudogenes on the same chromosome can correct the NCF1 ΔGT mutation but is inherently associated with the introduction of chromosomal aberrations in a fraction of the edited cells. Importantly, our presented data provided valuable insights on genome editing involving multiple on-targets on the same chromosome, such as the HBB/HBD and CCR2/CCR5 loci58,59, in which DSB-independent editing systems may be advantageous in terms of safety for future clinical application of pseudogene-associated disorders."
@irbioinformatics
🔬👇
"....In conclusion, we have shown that targeted editing of the NCF1 gene and pseudogenes on the same chromosome can correct the NCF1 ΔGT mutation but is inherently associated with the introduction of chromosomal aberrations in a fraction of the edited cells. Importantly, our presented data provided valuable insights on genome editing involving multiple on-targets on the same chromosome, such as the HBB/HBD and CCR2/CCR5 loci58,59, in which DSB-independent editing systems may be advantageous in terms of safety for future clinical application of pseudogene-associated disorders."
@irbioinformatics
👍4😁1
Air pollution can increase the risk of diabetes
طبق مطالعهای که توسط محققان بیمارستان دانشگاه زوریخ و دانشگاه بازل انجام شده است، ذرات دیزل باعث ایجاد واکنشی در روده موشها میشوند که به توسعه دیابت کمک میکند.
@irbioinformatics
براساس این یافته جدید قرارگیری دهانی یا Oral exposure در معرض ذرات آلودگی هوا باعث ایجاد نشانه های اینترفرون و التهاب در ماکروفاژهای روده بزرگ به همراه کاهش ماکروفاژهای CCR2- ضدالتهابی و مقیم می شود. حذف ماکروفاژها، NLRP3 یا IL-1β موشها را در برابر عدم تحمل گلوکز ناشی از آلودگی هوا محافظت می کند. در مقابل، موشهای Rag2-/- که فاقد سلولهای ایمنی تطبیقی هستند، پس از قرارگیری دهانی در معرض ذرات دیزل یا Diesel Exhaust Particle (DEP) دچار التهاب شدید روده و عدم تحمل گلوکز می شوند.
طبق مطالعهای که توسط محققان بیمارستان دانشگاه زوریخ و دانشگاه بازل انجام شده است، ذرات دیزل باعث ایجاد واکنشی در روده موشها میشوند که به توسعه دیابت کمک میکند.
@irbioinformatics
براساس این یافته جدید قرارگیری دهانی یا Oral exposure در معرض ذرات آلودگی هوا باعث ایجاد نشانه های اینترفرون و التهاب در ماکروفاژهای روده بزرگ به همراه کاهش ماکروفاژهای CCR2- ضدالتهابی و مقیم می شود. حذف ماکروفاژها، NLRP3 یا IL-1β موشها را در برابر عدم تحمل گلوکز ناشی از آلودگی هوا محافظت می کند. در مقابل، موشهای Rag2-/- که فاقد سلولهای ایمنی تطبیقی هستند، پس از قرارگیری دهانی در معرض ذرات دیزل یا Diesel Exhaust Particle (DEP) دچار التهاب شدید روده و عدم تحمل گلوکز می شوند.
👏3👍2😍2
اندامک ولت یا vault
علاوه بر اندامک های روتینی که در سلول های یوکاریوتی می شناسید یک اندامک دیگر هم در سلول های یوکاریوتی وجود دارد که در منابع و رفرنس های تکست کنونی در مورد ان بحثی نشده است و فقط در مقالات به صورت محدود بحث گردیده است.
ولت یا ریبونوکلئونوپروتئین سیتوپلاسمی ولت یک اندامک یوکاریوتی است که عملکرد آن هنوز به طور کامل درک نشده است. ولتها در سال ۱۹۸۶ توسط نانسی کدرشا و لئونارد روم کشف و ایزوله شدند. ولتها اندامکهای سیتوپلاسمی هستند که وقتی با رنگآمیزی منفی شده و زیر میکروسکوپ الکترونی مشاهده میشوند، به طاقهای سقف یک کلیسای کاتدرال شباهت دارند و تقارن ۳۹ برابری (یا D39d) دارند. این اندامکها در بسیاری از انواع سلولهای یوکاریوتی وجود دارند و به نظر میرسد که بین یوکاریوتها بسیار محافظتشده باشند.
علاوه بر اندامک های روتینی که در سلول های یوکاریوتی می شناسید یک اندامک دیگر هم در سلول های یوکاریوتی وجود دارد که در منابع و رفرنس های تکست کنونی در مورد ان بحثی نشده است و فقط در مقالات به صورت محدود بحث گردیده است.
ولت یا ریبونوکلئونوپروتئین سیتوپلاسمی ولت یک اندامک یوکاریوتی است که عملکرد آن هنوز به طور کامل درک نشده است. ولتها در سال ۱۹۸۶ توسط نانسی کدرشا و لئونارد روم کشف و ایزوله شدند. ولتها اندامکهای سیتوپلاسمی هستند که وقتی با رنگآمیزی منفی شده و زیر میکروسکوپ الکترونی مشاهده میشوند، به طاقهای سقف یک کلیسای کاتدرال شباهت دارند و تقارن ۳۹ برابری (یا D39d) دارند. این اندامکها در بسیاری از انواع سلولهای یوکاریوتی وجود دارند و به نظر میرسد که بین یوکاریوتها بسیار محافظتشده باشند.
👍9
📃 Protein Structure Prediction: Challenges, Advances, and the Shift of Research Paradigm
📕 Journal: Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB) (I.F.=11.5)
🗓Publish year: 2023
🧑💻Authors: Bin Huang, Lupeng Kong, Chao Wang, ...
🏢Universities: University of Chinese Academy of Sciences, Microsoft Research AI4Science, Huawei Noah’s Ark Lab, China
📎 Study the paper
📲Channel: @irBioinformatics
#review #protein
📕 Journal: Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB) (I.F.=11.5)
🗓Publish year: 2023
🧑💻Authors: Bin Huang, Lupeng Kong, Chao Wang, ...
🏢Universities: University of Chinese Academy of Sciences, Microsoft Research AI4Science, Huawei Noah’s Ark Lab, China
📎 Study the paper
📲Channel: @irBioinformatics
#review #protein
👍5
👩🏫 Machine Learning and AI in Bioinformatics
💥Texas A&M University
👩💻 Course link
📲Channel: @irBioinformatics
#course #machine_learning #ai
💥Texas A&M University
👩💻 Course link
📲Channel: @irBioinformatics
#course #machine_learning #ai
❤5👍1
ساز و آواز دلشده_همایون شجریان
@HomayoonShajarian2
خوشا دردی که درمانش تو باشی
خوشا راهی که پایانش تو باشی
خوشا چشمی که رخسار تو بیند
خوشا ملکی که سلطانش تو باشی
خوشا آن دل که دلدارش تو گردی
خوشا جانی که جانانش تو باشی
چه خوش باشد دلِ امیدواری
که امّید دل و جانش تو باشی
گل و گلزار خوش آید کسی را
که گلزار و گلستانش تو باشی
مپرس از کفر و ایمان بیدلی را
که هم کفر و هم ایمانش تو باشی
خوشا راهی که پایانش تو باشی
خوشا چشمی که رخسار تو بیند
خوشا ملکی که سلطانش تو باشی
خوشا آن دل که دلدارش تو گردی
خوشا جانی که جانانش تو باشی
چه خوش باشد دلِ امیدواری
که امّید دل و جانش تو باشی
گل و گلزار خوش آید کسی را
که گلزار و گلستانش تو باشی
مپرس از کفر و ایمان بیدلی را
که هم کفر و هم ایمانش تو باشی
❤5👍1
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
👍4❤1
📌یه لیست از ابزارهای هوش مصنوعی رایگان برای کارهای مرتبط با مقاله و ریسرچ. استفاده ازشون یه هوشمندی و مراقبتی میخواد. هرچی از این ابزارها میبینید رو با چشم باز استفاده کنید.
1️⃣ سایت typeset.io
✔️ پاسخ به سوالات بر اساس مقالات
✔️ دستیار مطالعه مقاله
✔️ بازنویسی متن
2️⃣ سایت researchrabbit.ai
✔️ دستهبندی مقالات
✔️ پیدا کردن و اتصال مقالات مشابه
3️⃣ سایت glasp.co (اکستنشن)
✔️ یادداشتبرداری از مقالات
4️⃣ سایت semanticscholar.org
✔️ جستوجوی مقاله
✔️ پیدا کردن مقالات مشابه
5️⃣ سایت consensus.app
✔️ پاسخ به سوال بر اساس مقاله
6️⃣ سایت elicit.com
✔️ پاسخ به سوال بر اساس فایل مقاله
✔️ استخراج لیست مفاهیم برای مقاله
✔️ استخراج اطلاعات از مقالات
7️⃣ سایت scite.ai
✔️ رفرنسدهی و نوشتن مرور ادبیات
8️⃣ سایت connectedpapers.com
✔️ پیدا کردن مقالات مشابه
8️⃣ سایت scholarcy.com
✔️ خلاصه سازی مقاله
🔟 سایت paperpal.com
✔️ کمک در نگارش مقاله
1️⃣ سایت typeset.io
✔️ پاسخ به سوالات بر اساس مقالات
✔️ دستیار مطالعه مقاله
✔️ بازنویسی متن
2️⃣ سایت researchrabbit.ai
✔️ دستهبندی مقالات
✔️ پیدا کردن و اتصال مقالات مشابه
3️⃣ سایت glasp.co (اکستنشن)
✔️ یادداشتبرداری از مقالات
4️⃣ سایت semanticscholar.org
✔️ جستوجوی مقاله
✔️ پیدا کردن مقالات مشابه
5️⃣ سایت consensus.app
✔️ پاسخ به سوال بر اساس مقاله
6️⃣ سایت elicit.com
✔️ پاسخ به سوال بر اساس فایل مقاله
✔️ استخراج لیست مفاهیم برای مقاله
✔️ استخراج اطلاعات از مقالات
7️⃣ سایت scite.ai
✔️ رفرنسدهی و نوشتن مرور ادبیات
8️⃣ سایت connectedpapers.com
✔️ پیدا کردن مقالات مشابه
8️⃣ سایت scholarcy.com
✔️ خلاصه سازی مقاله
🔟 سایت paperpal.com
✔️ کمک در نگارش مقاله
👍10❤1
اگه دنبال یک کتاب تکست خوب و جامع در حوزه سلولی مولکولی می گردین این کتاب فوق العاده عالی رو مطالعه کنین. معرکس این کتاب هایی که بروس البرتس می نویسه. ویرایش ششم این کتاب هم الان جدیدترین ویرایشش هستش که می تونین فایلش دانلود و استفاده کنین. در مورد مولفش میخواین اطلاعات بیشتری کسب کنین از اینجا وارد شوید
🥰4
اکه دنبال ی نرم افزار خیلی خوب برای طراحی ساختارهای شیمیایی میگردین که فری باشه می تونین این ابزارKetcher رو استفاده کنین هم انلاینه و هم اینکه خیلی راحته کار باهاش و خروجی های با کیفیتی رو ایجاد می کنه
https://lifescience.opensource.epam.com/KetcherDemo/index.html?api_path=/v2
https://lifescience.opensource.epam.com/KetcherDemo/index.html?api_path=/v2
👍5
این مقاله اخیرا چاپ شده اخر مقدمش نگاه کنین ببینین نویسنده هاش چی نوشتن :) ظاهرا داور ازشون خواسته به زور به مقالاتش سایت بدن اینام نه اوردن نه بردن اخر مقدمه نوشتن به این مقالات بی ربطم ارجاع میدیم در حالی که ربطی به کار ما ندارن :) یعنی اکادمیا دیونه خونس قشنگ :) می تونین از لینک زیر برین این جمله رو دقیقا تو متن مقاله ببینین عجیب بود برای من واقعیتش :)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0360319924043957
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0360319924043957
😁7