آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.6K subscribers
1.57K photos
46 videos
423 files
727 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://t.me/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
آلودگی های پلاستیکی تأثیرات تمام مرزهای سیاره‌ای را بدتر می‌کند.
تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
👍2
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
آلودگی های پلاستیکی تأثیرات تمام مرزهای سیاره‌ای را بدتر می‌کند. تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
یک مقاله جدید نشان می‌دهد که آلودگی پلاستیکی به صورت چشمگیری اثرات مخرب بر روی تمام مرزهای سیاره‌ای، از جمله تغییرات اقلیمی، اسیدی شدن اقیانوس‌ها و از دست رفتن تنوع زیستی را تشدید می‌کند. پیش از مذاکرات نهایی پیمان بین‌المللی پلاستیک، محققان از تصمیم‌گیران می‌خواهند که به آلودگی پلاستیکی فقط به‌عنوان یک مشکل مدیریت پسماند نگاه نکنند.

پاتریشیا ویاروبیا-گومز، نویسنده اصلی مقاله از مرکز تاب‌آوری استکهلم، می‌گوید: "ضروری است که به کل چرخه حیات پلاستیک‌ها توجه کنیم، از استخراج سوخت فسیلی گرفته تا تولید اولیه پلیمرهای پلاستیکی." پلاستیک‌ها به آن اندازه که قبلاً تصور می‌شد ایمن و خنثی نیستند. مقاله پژوهشی جدید که توسط یک تیم بین‌المللی از محققان نوشته شده، از چارچوب مرزهای سیاره‌ای برای ساختاربندی شواهد فزاینده اثرات پلاستیک بر محیط زیست، سلامت و رفاه انسانی استفاده می‌کند. سالانه ۵۰۰ میلیون تن پلاستیک تولید می‌شود، اما تنها ۹ درصد از آن‌ها در سطح جهانی بازیافت می‌شود. پلاستیک‌ها همه جا هستند: از قله کوه اورست تا عمیق‌ترین نقطه گودال ماریانا.
تیم تحقیقاتی از طریق بررسی تحلیلی مطالعات علمی درباره تأثیرات پلاستیک‌ها در محیط طبیعی نشان می‌دهد که آلودگی پلاستیکی فرآیندهای کل سیستم زمین را تغییر می‌دهد و بر همه مشکلات مهم زیست‌محیطی جهانی، از جمله تغییرات اقلیمی، از دست رفتن تنوع زیستی، اسیدی شدن اقیانوس‌ها، و استفاده از آب شیرین و زمین تأثیر می‌گذارد.

این مقاله با عنوان "Plastics pollution exacerbates the impacts of all planetary boundaries
" بر ضرورت درک پیچیدگی پلاستیک‌ها تأکید دارد. به‌عنوان موادی مبتنی بر پلیمرهای مصنوعی که با هزاران ماده شیمیایی دیگر همراه هستند، تأثیرات پلاستیک‌ها در تمام چرخه حیات این محصولات و مواد رخ می‌دهد
پاتریشیا ویاروبیا-گومز، دانشجوی دکتری در مرکز تاب‌آوری استکهلم در دانشگاه استکهلم، می‌گوید: "پلاستیک‌ها به‌عنوان محصولاتی بی‌اثر دیده می‌شوند که از محصولات محبوب ما محافظت می‌کنند یا زندگی ما را آسان‌تر می‌کنند و به‌راحتی قابل پاک‌سازی هستند هنگامی که به زباله تبدیل شوند. اما این دیدگاه بسیار دور از واقعیت است. پلاستیک‌ها از ترکیب هزاران ماده شیمیایی ساخته شده‌اند. بسیاری از این مواد، مانند مختل‌کننده‌های غدد درون‌ریز و مواد شیمیایی ماندگار، دارای سمیّت و زیان برای اکوسیستم‌ها و سلامت انسان هستند. ما باید پلاستیک‌ها را به‌عنوان ترکیبی از این مواد شیمیایی ببینیم که روزانه با آن‌ها تعامل داریم."
👍3
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
دزدا دنبال این پسر ۲۸ساله کردن یارو رفت تو خونه با ار‌پی‌جی برگشت 😂 آرپیجی داشت تو خونه ش 😂🤏🔫
😁6🤣1
آیا می دانید فرایند دیالیز چگونه کار می کند؟ در این مقاله مروری که در ژورنال جاما چاپ شده است چگونگی این فرایند تشریح شده است.
🔥4👏1
#خبر
تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
در شرایط خاص، اصلاح هدفمند بخش‌های معیوب در ژنوم می‌تواند منجر به بروز نقص‌های ژنتیکی جدید شود. این مسئله توسط یک تیم از دانشگاه زوریخ (UZH) در مورد بیماری ارثی نادر به نام گرانولوماتوز مزمن گزارش شده است.
موضوع از این قراره که اخیرا محققان سویسی با استفاده از تکنولوژی کریسپر توانستند یک ایراد ژنتیکی را برطرف کنند، اما به ناگاه متوجه شدند درست شدن ایراد ژنتیکی همانا یه بخش قضیه هستش و وقوع یک ایراد جدیدتر بخش دیگر قضیه. این گزارش به عنوان اولین اثر جانبی تکنولوژی کریسپر در مطالعات بالینی در هفته های گذشته منتشر شده است.
👍31👏1
یک پایگاه داده جدید (کسنرسیوم DoGA) که بیش از ۱۰۰ نوع بافت مختلف سگ را پوشش می‌دهد، می‌تواند به طور قابل توجهی درک ما از بیماری‌های ارثی را بهبود بخشد و اطلاعات ارزشمندی برای تحقیقات بهداشتی در زمینه سگ‌ها و انسان‌ها فراهم کند. این دیتابیس حاوی اطلاعات ارزشمندی از چگونگی بیان ژن ها و عملکرد پروموتر ها در بافت های خاصی از سگسانان است که می تواند افق های جدیدی را در مطالعات بالینی باز نماید.
https://www.doggenomeannotation.org/
https://dcc.doggenomeannotation.org/doga
👍4😁1
#خبر-علمی
پژوهشگران انستیتو Hubrecht دریافته‌اند که نحوه بسته‌بندی DNA در سلول‌ها می‌تواند مستقیماً بر سرعت تکثیر DNA در حین تقسیم سلولی تأثیر بگذارد. آن‌ها گزارش کرده‌اند که بسته‌بندی DNA از طریق یک مسیر غیرمعمول سیگنال‌هایی ارسال می‌کند که بر توانایی سلول برای تقسیم و رشد اثر می‌گذارد. این کشف راه‌های جدیدی را برای بررسی ارتباط بین تکثیر DNA و بسته‌بندی آن باز می‌کند. این یافته‌ها ممکن است در آینده به دانشمندان کمک کنند تا درمان‌ها و داروهایی برای بیماری‌هایی مانند سرطان پیدا کنند.
👍4🔥2
#دانستنی‌ها
مسیرهای سیگنالینگ وابسته به G پروتئین ها از مهمترین مسیرهای زیستی در سلول های گیاهی هستند. اگرچه سلول‌های گیاهی بیشتر عناصر اصلی موجود در سیگنال‌دهی G پروتئین های حیوانی را دارند، تفاوت‌های موجود در معماری شبکه و ویژگی‌های ذاتی عناصر پروتئین G در گیاهان، سیگنال‌دهی G را در سلول‌های گیاهی از مدل حیوانی متمایز می‌سازد. بر خلاف پروتئین‌های G حیوانی، پروتئین‌های G گیاهی به‌طور خودکار فعال می‌شوند و به همین دلیل، تنظیم فعال‌سازی G در گیاهان در مرحله غیرفعال‌سازی رخ می‌دهد. خاصیت خودفعال‌شوندگی همچنین به این معناست که پروتئین‌های G گیاهی نیازی به گیرنده‌های معمولی پروتئین G در حیوانات ندارند و بنابراین فاقد آن‌ها هستند. اهداف پروتئین‌های G فعال‌شده در گیاهان، که به عنوان افکتورها نیز شناخته می‌شوند، متفاوت از افکتورها در سلول‌های حیوانی هستند. مجموعه ساده‌تری از عناصر سیگنال‌دهی G در آرابیدوپسیس باعث می‌شود که سیگنال‌دهی G در یک بستر چندسلولی راحت‌تر قابل دستکاری باشد...... مطالعه بیشتر...
🤔3👍21
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
#خبر تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران در شرایط خاص، اصلاح هدفمند بخش‌های معیوب در ژنوم می‌تواند منجر به بروز نقص‌های ژنتیکی جدید شود. این مسئله توسط یک تیم از دانشگاه زوریخ (UZH) در مورد بیماری ارثی نادر به نام گرانولوماتوز…
همراهان عزیز پیرامون اثر جانبی #کریسپر که توسط محققان دانشگاه زوریخ سویس برای اولین بار در بازارایی کروموزومی در بیماری گرانولوماتوز گزارش شده است اطلاعات بیشتری درخواست نمودند و اکنون دوستان می توانند با مطالعه دو لینک زیر به جزییات خبر و مطالعه منتشر شده در این زمینه دست پیدا نمایند. مقاله هدف که این یافته را گزارش نموده است بر ترمیم توالی ژن NCF1 با استفاده از تکنولوژی ویرایش ژن پرداخته است که منجر به مشاهده چنین موردی در رابطه با کریسپر شده است.

لینک خبر بر روی سایت دانشگاه زوریخ سویس

لینک مقاله

@irbioinformatics
🤔3👍2
s42003-024-06959-z.pdf
2 MB
Gene editing of NCF1 loci is associated with homologous recombination and chromosomal rearrangements
🔬👇
"....In conclusion, we have shown that targeted editing of the NCF1 gene and pseudogenes on the same chromosome can correct the NCF1 ΔGT mutation but is inherently associated with the introduction of chromosomal aberrations in a fraction of the edited cells. Importantly, our presented data provided valuable insights on genome editing involving multiple on-targets on the same chromosome, such as the HBB/HBD and CCR2/CCR5 loci58,59, in which DSB-independent editing systems may be advantageous in terms of safety for future clinical application of pseudogene-associated disorders."

@irbioinformatics
👍4😁1
Air pollution can increase the risk of diabetes
طبق مطالعه‌ای که توسط محققان بیمارستان دانشگاه زوریخ و دانشگاه بازل انجام شده است، ذرات دیزل باعث ایجاد واکنشی در روده موش‌ها می‌شوند که به توسعه دیابت کمک می‌کند.
@irbioinformatics
براساس این یافته جدید قرارگیری دهانی یا Oral exposure در معرض ذرات آلودگی هوا باعث ایجاد نشانه های اینترفرون و التهاب در ماکروفاژهای روده بزرگ به همراه کاهش ماکروفاژهای CCR2- ضدالتهابی و مقیم می شود. حذف ماکروفاژها، NLRP3 یا IL-1β موش‌ها را در برابر عدم تحمل گلوکز ناشی از آلودگی هوا محافظت می کند. در مقابل، موش‌های Rag2-/- که فاقد سلول‌های ایمنی تطبیقی هستند، پس از قرارگیری دهانی در معرض ذرات دیزل یا Diesel Exhaust Particle (DEP) دچار التهاب شدید روده و عدم تحمل گلوکز می شوند.
👏3👍2😍2
اندامک ولت یا vault
علاوه بر اندامک های روتینی که در سلول های یوکاریوتی می شناسید یک اندامک دیگر هم در سلول های یوکاریوتی وجود دارد که در منابع و رفرنس های تکست کنونی در مورد ان بحثی نشده است و فقط در مقالات به صورت محدود بحث گردیده است.
ولت یا ریبونوکلئونوپروتئین سیتوپلاسمی ولت یک اندامک یوکاریوتی است که عملکرد آن هنوز به طور کامل درک نشده است. ولت‌ها در سال ۱۹۸۶ توسط نانسی کدرشا و لئونارد روم کشف و ایزوله شدند. ولت‌ها اندامک‌های سیتوپلاسمی هستند که وقتی با رنگ‌آمیزی منفی شده و زیر میکروسکوپ الکترونی مشاهده می‌شوند، به طاق‌های سقف یک کلیسای کاتدرال شباهت دارند و تقارن ۳۹ برابری (یا D39d) دارند. این اندامک‌ها در بسیاری از انواع سلول‌های یوکاریوتی وجود دارند و به نظر می‌رسد که بین یوکاریوت‌ها بسیار محافظت‌شده باشند.
👍9
📃 Protein Structure Prediction: Challenges, Advances, and the Shift of Research Paradigm

📕 Journal: Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB) (I.F.=11.5)
🗓Publish year: 2023

🧑‍💻Authors: Bin Huang, Lupeng Kong, Chao Wang, ...
🏢Universities: University of Chinese Academy of Sciences, Microsoft Research AI4Science, Huawei Noah’s Ark Lab, China

📎 Study the paper

📲Channel: @irBioinformatics
#review #protein
👍5
👩‍🏫 Machine Learning and AI in Bioinformatics
💥Texas A&M University

👩‍💻 Course link

📲Channel: @irBioinformatics
#course #machine_learning #ai
5👍1
ساز و آواز دلشده_همایون شجریان
@HomayoonShajarian2
خوشا دردی که درمانش تو باشی
خوشا راهی که پایانش تو باشی
خوشا چشمی که رخسار تو بیند
خوشا ملکی که سلطانش تو باشی
خوشا آن دل که دلدارش تو گردی
خوشا جانی که جانانش تو باشی
چه خوش باشد دلِ امیدواری
که امّید دل و جانش تو باشی
گل و گلزار خوش آید کسی را
که گلزار و گلستانش تو باشی
مپرس از کفر و ایمان بیدلی را
که هم کفر و هم ایمانش تو باشی
5👍1
IMG_3535.MOV
77.1 MB
کنسرت امستردام همایون شجریان
جای دوستان خالی
🥰6👍2
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
👍41