Genomics UA
875 subscribers
97 photos
2 files
161 links
Громадська організація "Геноміка ЮА". Ваш дім біоінформатики та омік в Україні.

Чат: https://t.me/BioinformaticsUA
Вебсайт: genomics.org.ua
YouTube: https://www.youtube.com/@genomicsUA
Download Telegram
Відео нашого останнього вебінару зі статистичного моделювання диференціації клітин вже доступне за посиланням.
Хай гайз, ми знову на зв’язку✌️

🧑‍🎓Для тих, хто хоче опанувати навички успішного проходження співбесід та побудови кар'єрної стратегії, Геноміка ЮА відкриває реєстрацію на Менторську школу!

🧫Це експрес курс, де ми розкажемо про ключові аспекти вступу на навчальні програми та прийом на роботу в біомедичній сфері.

💡На наших зустрічах ви дізнаєтесь:
Як спланувати процес вступу/працевлаштування;
Що описати в резюме та мотиваційному листі;
Які питання краще задавати потенційному керівнику;
З чого найкраще почати роботу на новому місці.

📘У школі передбачаються:
❇️Щотижневі лекції;
❇️Обговорення практичних кейсів в невеликих групах (надіславши нам своє резюме і мотиваційний лист ви отримаєте зворотній зв'язок);
❇️Презентації від учасників (є можливість презентувати себе і попрактикуватись у проходженні співбесіди).

📍Локація: онлайн
🔗Посилання на реєстрацію: https://forms.gle/uYrLGoEG7JEMpkYs8
Дедлайн реєстрації 15.01.22
📅Орієнтовані дати: 18.02.22-18.03.22 щотижнево по пятницям о 19.00 по Києву.
Друзі, встигніть зареєструватись на нашу менторську школу! Дедлайн 15.01.

Запрошуємо і менторів, і учасників 🧬👩‍🔬🧑‍💻

Посилання на реєстрацію: https://forms.gle/uYrLGoEG7JEMpkYs8
Вже в цю п'ятницю ми проведемо нашу першу зустріч в рамках менторської школи! Будь ласка, напишіть @mkorshe, якщо ви подавали заявку і не отримали запрошення 😊
Привіт, спільното.

Хтось вже прочитав новини про початок повномасштабного вторгнення, а хтось вже чув сирени. Це означає одне: сьогодні розпочався завершальний етап російської війни проти нас. Етап, який стане кінцем для російської держави та їхніх терористичних дій, націлених на Україну.
Ми з командою "Геноміки" приводимо декілька пунктів, які вважаємо доцільними.
1. Подбайте про власну безпеку і не припускайте паніки - це те, чого бажає наш ворог. Українська армія наразі задає важких втрат окупантам і їм потрібна ваша підтримка.
2. Ігноруйте будь-які новини, які надходять з неофіційних джерел, або з посиланнями на них.
3. Якщо ще не володієте цією інформацію, дізнайтеся, де знаходиться найближче бомбосховище, контакти представників територіальної оборони, та подбайте про безпеку своїх родичів та тих, хто не може зробити це сам.

Все буде добре, бо ми разом. Зараз не 2014-й рік. Українська армія готова до будь-якої атаки. Забезпечмо їй надійний тил. 🇺🇦💙💛

Підтримати Україну тут: https://linktr.ee/RazomForUkraine
Спільнота для спілкування "Геноміки" переходить на закритий режим - виключно за запрошеннями та рекомендацією учасників та/або підтвердженням особистості адміністраторам.

Також повідомляємо, що ми запрошуємо нових учасників з бекграундами в IT, біоінформатиці, STEM, медицині тощо і готові підтримати у проєктах, де така експертиза зможе піти на користь України та не на користь окупантам.
Друзі та колеги з наукового фронту 🔬🧬💊🧪,
наша колега та соратниця Ніка, яка працює в University of Utah Health, поділилася ініціативою з допомоги вченим, які знаходяться в Україні. Далі наведений текст пропозиції, будемо дуже вдячні за розповсюдження!

"Для Науковців, які залишилися в Україні, та зацікавлені у віддалених позиціях. Багато хто працює над тим, щоб такі позиції створити. Будь ласка, заповніть анкету
http://bit.ly/requestRemoteResearchUA

Увага, для тих, хто виїхав чи збирається виїзжати, є інші ресурси. Не заповнюйте цю анкету і пишіть в коментарі, якщо вам ті ресурси невідомі.

І звісно підписуйте петицію https://www.change.org/p/universities-open-remote-positions-for-ukrainian-refugee-scholars

Дякую! Тримайтесь! 💙💛

Будь ласка, поширюйте."
Наші колеги діляться новинами, що 23-24 вересня у Варшаві планується NGSymposium in Computational Biology.

Якщо ви зацікавлені, будь ласка, дайте знати тут: https://t.co/wXAFJ3oFKE. Це допоможе вирішити, який формат є найбільш зручним (особисто, гібридний, або онлайн).
Друзі,
пропонуємо приєднатись до нашого теплого голосового чату цієї суботи о 19.00 по Києву (18.00 СЕТ).

Будемо говорити, як працюють та що роблять наші вчені під час війни. А ще про те, які можливості зараз пропонує світова академічна спільнота, щоб підтримати українців.
Live stream scheduled for
Привіт! 🗣

Це автоматичне нагадування: наш голосовий чат почнеться вже за годину. Зустрічаємося тут :)
Live stream started
Live stream finished (1 hour)
👋 Привіт, Геноміко!

🧬 Наш новий учасник спільноти, Сергій Науменко (PhD, Research Associate з Harvard T.H. Chan School of Public Health), запропонував зустрітися та оговорити дві статті:
1. Про нову збірку геному людини;
2. Та про те, як вона впливає на аналіз мінливостей.

✍️ Попри те, що геном людини був прочитаний ще у 2001 році й ця послідовність вдосконалювалась та використовувалась у всіх популяційних та генетико-медичних проєктах, він був фрагментований (майже 1000 контігів), та на 8% не закінчений (невідомі послідовності у subtelomeric and pericentromeric regions, недавні сегментні дуплікації, rDNA та ін.). Лише останніми роками технології ultralong sequencing reads (Oxford Nanopore and PacBio HIFI) дозволили прочитати довгі послідовності та "перестрибнути" через повтори та складні ділянки. Ще одною складовою успіху стало вдосконалення алгоритмів збірки геному основаних на string graphs (граф стрічок).

Коли: завтра, 16.04.22, о 18:00 за Київським часом (або 11:00 за EDT часом)
📍 Де: Zoom
Якщо ви не змогли приєднатися до нашого Біомедичного журнального клубу у квітні, ми приготували запис зустрічі:

https://youtu.be/p5Nf3FKKybU

Підписуйтесь на ютуб-канал, де зберігаються записи наших минулих заходів, і приєднуйтеся до наступних! :)
Привіт, друзі. На цю суботу ми запланували вебінар з оглядом біоінформатики малих геномних варіантів.
На зустрічі розглянемо процеси визначення, анотації, та пріоритизації геномних варіантів.
У якості типів даних будуть геноми, екзоми, панелі глибокого покриття, амплікони, секвенування із UMI та подвійні UMI.
А ще поговоримо про безліч інструментів:
- пайплайни: GATK, Dragen, bcbio,Terra;
- анотація: snpEff, VEP, OpenCravat, vcfanno;
- пріоритизація: gemini, R/tidyverse, excel, oncoprints, SolveBio, cBioPortal;

Лектор: Сергій Науменко
Де: онлайн (посилання на Zoom)
Коли: 14 травня 2022, 17:00 (Київ) / 10:00 (Бостон)
Публікуємо запис вчорашнього вебінару. Екзоми, геноми, біоінформатичні пайплайни - дякуємо Сергію за класний матеріал!

https://youtu.be/2x5XLqU_U-A

Не забувайте підписуватися на наші YouTube та Телеграм канали і ділитися матеріалами з колегами. Цим ви нам дуже допоможете в плануванні наступних заходів! ❤️🧬
Привіт, друзі Геноміки!

Розповідаємо вам про два цікаві заходи, де наближається кінцевий термін реєстрації:

1. NGSymposium in Computational Biology (Варшава або онлайн, 23-24 вересня 2022). Дедлайн подачі тез: 23 травня. Ось тут можна подивитися програму минулого симпозіуму.

2. NGSchool2022 (Яблонна, 15-23 вересня 2022). Дедлайн реєстрації: 30 травня. Сама реєстрація містить декілька задачок з основ кодінгу, статистики та інтерпретації досліджень.

Також на сайті можна почитати про допомогу щодо реєстраційних внесків для тих, кому це необхідно.

Цікаво, що у спільноті Геноміки є учасники, які або брали участь у минулих заходах, або мають відношення до організації цих. Тому скористаємося цією можливістю і порекомендуємо додаватися до нашого чату (інформація в описі каналу) :)