Хочемо запросити вас на семінар від наших друзів з Bioinformatics for Ukraine. Наступного четверга вони проводять зустріч, присвячену експресії генів. На ній буде про те, що таке транскриптоміка, в яких дослідженнях її застосовують, та чому вміння аналізувати транскриптомні дані відкриває багато кар'єрних можливостей

Розповідати про це буде Олександр Петренко, науковий співробітник Медичного університету Відня, співзасновник Геноміки ЮА та один з інструкторів курсу з аналізу даних РНК-секвенування.

Коли: 21-го березня, 7 вечора за Києвом.
Реєстрація: Google Spreadsheet. Зв'язок з організаторами: лінк.

- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 Youtube-канал | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn сторінка

За тиждень спільнота Геноміки ЮА поповнила банку на 20% від мети збору - дякуємо за це!

Нагадуємо, що ми долучилися до великого збору на авто та FPV-дрони для 72 ОМБР імені Чорних Запорожців, НГУ "Буревій" та 44 ОАБР. Наша мета - зібрати 50 000 грн для волонтерів, які усе закуплять, привезуть та передадуть прямо в руки бійцям.

Будемо вдячні за будь-які донати, адже сотні навіть самих маленьких пожертв приводять до того, що наше військо матиме усі необхідні інструменти для ефективних бойових дій.

Ми обіцяли, що за досягнення мети ми викладемо у відкритий доступ наш практичний курс з секвенування РНК, який провели інструктори з досвідом в індустрії та академії. Перший тиждень курсу вже на нашому ютуб-каналі! Подальші розблокування:
40% - тиждень про диференційну експресію
60% - тиждень про візуалізацію даних
80% - тиждень про функціональний аналіз
100% - тиждень про біоінформатичні звіти та презентації проєктів.

Наша банка тут: https://send.monobank.ua/jar/3FGSbU8mWy. Також будемо вдячні за репост.

- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 Youtube-канал | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn сторінка

Літо наближається - біоінформатики збираються!

🚨🎉 Наші друзі організовують школу з біоінформатики та обчислювального аналізу сучасних типів даних у біології!

😎Безумовно рекомендуємо скористатися можливістю зустрітися із біоінформатиками з різних куточків світу, однодумцями з України та опанувати омріяні навички!

UBDS^3:
🙊двомовна школа Українська & English
🕔триває 2 тижні (7-20 липня 2024)
🎓включає лекції+практичні заняття (перший тиждень)+міні-дослідницькі проекти (другий тиждень)
🗞для бакалаврів та магістрів, громадян або резидентів України
💻з досвідом програмування і без (але з великою мотивацією!)
✊участь безкоштовна

Програма включає багато-багато всього!

🟡Аналіз оміксних даних, обчислювальну нейробіологію, кількісну/статистичну/функціональну/еволюційну генетику, обчислювальну екологію та популяційну біологію, філогенетику/філогеноміку, а також багато інших більш спеціалізованих тем.
🔵Студенти матимуть можливість попрактикуватися в та/або навчитись програмувати на R та Python, аналізувати зображення, аналізувати та візуалізувати дані, використовувати загальновживані та спеціалізовані біоінформатичні програми, а також опанувати основи машинного навчання.

Дедлайн: заявки приймаються за посиланням до 22 квітня 2024. Ви також можете знайти більше деталей про Школу на веб-сайті організаторів: https://www.bds3.org/.

- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 Youtube-канал | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn сторінка

🧬 Пошук фахівців у галузі біоінформатики для роботи над high risk/high reward проєктом "Targeting 8-oxo-G Epigenetic Signature in Response to Chemotherapy for the Treatment of Lung Cancer"

▶️ З нами зв'язалася Надія Липова (Assistant Professor, Dept. of Medicine, University of Louisville, USA). Вона шукає мотивованих фахівців з біоінформатики для роботи над проєктом, сфокусованим на ролі окисненого гуаніну (8-oxo-G) як епігенетичної мітки у регуляції метаболічного фенотипу раку легень у відповідь на хіміотерапію.

▶️ Проєкт передбачає проведення низки дослідів на 3D культурі клітин раку легень та мапування мітки 8-oxo-G на геномі із застосуванням методів RNA-Seq, OxiDiP-Seq та ChiP-Seq.

▶️ Вимоги:
• володіння всіма необхідними методами для дизайну експериментів та аналізу даних секвенування
• володіння англійською мовою
• афіліація з академічною установою
• доступна фінансова компенсація (~2-5% effort) для co-investigator (незалежний дослідник). Для технічної позиції можлива компенсація зарплати.

▶️ Наразі проєкт перебуває на стадії подачі пропозиції до грантової агенції (США, дедлайн - 1 квітня, 2024 року).
Ми очікуємо, що в разі фінансування, проєкт триватиме 2 роки (старт 01/2025).

Будь ласка, надсилайте свої запитання чи своє резюме на адресу: Надія Липова, nadiia.lypova@louisville.edu

- - -
Від себе додамо, що це - чудова можливість для українських дослідників залучитися до проєкту з цікавими методами в актуальному напрямку у разі успіху грантової заявки.
- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 Youtube-канал | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn сторінка

🧬 В Україні набирає популярності формат журнальних клубів: отримали запрошення від друзів з Інституту високих технологій КНУ, ділимося з вами!

Цієї суботи буде зустріч їх журнального клубу за темою генетичних ножиць CRISPR/Cas9. Катерина Жишкевич, студентка ІВТ, розповість про їхню історію, механізм роботи та потенціал у лікуванні ВІЛ.

➡️ Коли: 30 березня (субота) о 14:00.
➡️ Де: Глушкова 4Д, Читалка факультету комп'ютерних наук та кібернетики КНУ
➡️ Реєстрація: до 29-го березня у формі
➡️ Зв'язок з організаторами: журнальний клуб та Читалка

- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 Youtube-канал | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn сторінка

▶️ До нас звернувся учасник спільноти, який шукає фахівця для співпраці з приводу наукової роботи.

▶️ В нього є дані зимової орнітофауни на території міських агломерацій, декілька тисяч спостережень за чотири роки на території чотирьох міст. Для завершення роботи він потребує фахівця зі статистичної обробки та аналізу даних (наприклад, в середовищі R).

▶️ Умови співпраці: співавторство в публікації або оплата послуг.

▶️ Зв'язок та запитання: t.me/cas_tielll_d6 або Castielllua@gmail.com. Будемо також вдячні за поширення.

- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn

▶️ Сьогодні вийшла публікація "The resilience of Ukrainian scientists" в Cell Systems, серед співавторів якої є багато учасників нашої спільноти.

▶️ Це - важлива композиція коментарів про те, як війна впливає на українську науку і науковців. Вона містить ті думки та послання, які особливо важливо побачити нашим закордонним колегам та друзям: від Валерія, який поставив кар'єру на паузу та мобілізувався одразу після вторгнення; від дослідників в українських інститутах, які продовжують працювати попри все; та від українських дослідників в закордонних інститутах.

▶️ Дуже важливо поділитися публікацією з вашими закордонними колегами, особливо якщо ви користуєтеся 🔗 LinkedIn та 👥 Twitter або аналогічними платформами - тож будемо вам вдячні за це. Доступ: https://www.cell.com/cell-systems/fulltext/S2405-4712(24)00091-7#%20

- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn

Перед голосуванням за пакет допомоги США для України трампісти у конгресі знов згадали про українські біолабораторії. Як бачимо, докази очевидні: анонімний учасник спільноти Геноміки ЮА допоміг зі збором для артилеристів від колективу Розвідка Ноєм, і снаряд M107 скоро полетить / вже полетів розносити бурятовіруси.

Make Ukrainian Biolabs Great Again, так би мовити. Сподіваємося, конгресвумен Марджорі Тейлор Грін пишатиметься нами.

- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn

Ми щойно розіслали листи щодо нашого курсу РНК-секвенування: аналіз даних в R, профінансованого DAAD. Якщо ви реєструвалися на курс - перевіряйте вхідні повідомлення. Всередині:

* інформація для доступу до вашого акаунту та пошти на genomics.org.ua.
* інформація про платформу, де, власне, буде проходити курс та спілкування по ньому, а також де знайти посилання на зустрічі.
* відповіді на (як ми думаємо) типові запитання.

Якщо ви реєструвалися на курс, але не отримали листа - щось пішло не так, або ваша пошта була написана з помилкою при реєстрації. В такому випадку напишіть на opetrenko@genomics.org.ua.

Побачимося 1-го серпня на першому зайнятті!
- - -
📩 Чат спільноти Геноміки ЮА | 📹 YouTube | 🌐 Вебсайт | ☁️ genomicsua.bsky.social | 🔗 LinkedIn