В 1960 г. Богоявленский собор и Спасскую церковь хотели снести. После того как профессор пединститута Виктор Тюкавкин и директор художественного музея Алексей Фатьянов отправили в Москву телеграмму, протестуя против решения о готовящемся сносе двух Иркутских храмов, для разрешения спорной ситуации (а фактически для подписания бумаг, обосновывающих снос храмов) из Москвы приехала архитектор Оранская Галина Геннадьевна. Но вместо того, чтобы дать приказ о сносе, она взялась за реконструкцию культовых сооружений. Реставрационные работы с восстановлением шатрового завершения колокольни были выполнены в 1967-1985 гг. по проекту архитектора Г.Г. Оранской.
Иркутяне разных профессий участвовали в восстановлении из руин замечательного памятника архитектуры. Среди них особенно хочется выделить каменщика О.П. Кикаса, через чьи руки прошли тысячи специально приготовленных кирпичей, каждый из которых был положен мастером в предназначенное место и помог воссоздать архитектуру здания, а
также преподавателя Иркутского училища искусств А.Н. Штанько, который своим подвижническим трудом восстановил сложную технологию изготовления поливных изразцов, которые почти все были утеряны за то время, когда в храме располагался хлебозавод, и изготовил их для
украшения Богоявленского собора.
Во время 18-летней реставрации многое удалось воссоздать, но полностью прежний облик храму возвращен не был.
В 1985 г. здание Богоявленского собора было передано Иркутскому областному художественному музею.
В 1994 г. в соборе начались богослужения, и памятник старины вновь стал храмом.

На праздник светлой Пасхи 1995 г. епископом Вадимом собор Богоявления был освящен, таким образом после семидесятилетнего забвения духовный светильник Иркутской области был возрожден.
С 2013 г. Богоявленский собор — главный кафедральный собор Иркутской области и митрополии.
Собор Богоявления — с 1994 г. традиционное место открытия ежегодного всероссийского фестиваля «Дни русской духовности и культуры «Сияние России» в Иркутске.
https://vk.com/id777643568?z=video777643568_456239031%2Fvideos777643568%2Fpl_777643568_-2