Determining the isoelectric point of a polypeptide

#Polypeptide
#Isoelecric
#Biochemistry

@Essential_Biochemistry

☑️خاصیت آمفوتری امینواسید ها :

ﻋﺎﻣﻞ ﻗﺎﺑﻞ ﻳﻮﻧﻴﺰه ﺷﺪن ﻣﻲ ﺑﺎﺷﻨﺪ ﻋﺎﻣﻞ ﻛﺮﺑﻮﻛﺴﻴﻞ ﻛﻪ ﺑﻪ اﺳﻴﺪ آﻣﻴﻨﻪ ﺧﺎﺻﻴﺖ اﺳﻴﺪي و ﻋﺎﻣﻞ آﻣﻴﻨﻲ ﻛﻪ ﺑﻪ آن ﺧﺎﺻﻴﺖ ﻗﻠﻴﺎﺋﻲ ﻣﻲ دﻫﺪ . ﺑﺪﻟﻴﻞ وﺟﻮد اﻳﻦ دو ﻋﺎﻣﻞ اﺳﻴﺪي و آﻣﻴﻨﻲ اﺳﻴﺪ آﻣﻴﻨﻪ ﺧﺎﺻﻴﺖ آﻣﻔﻮﺗﺮي دارد . ﺑـﺎر اﻟﻜﺘﺮﻳﻜـﻲ اﺳـﻴﺪ آﻣﻴﻨـﻪ در ﻣﺤﻴﻂ ﻫﺎي ﻣﺨﺘﻠﻒ ﻣﺘﻔﺎوت اﺳﺖ.
🔅در محیط اسیدی : PH<3 به صورت مثبت
🔅در محیط قلیایی : PH>9 به ورت منفی وجود دارند و در ادامه مباحث مربوط به نقطه ایزوالکتریک که در پست های قبل به ان پرداخته شده است .
#aminoacide
#Amphoteric_properties

@Essential_Biochemistry

☑️خاصیت نوری امینواسید ها :
تمامی اسید های امینه بر مسیر نور پلاریزه تاثیرگذارند .( 🔅 توجه : البته به جز گلایسین که فاقد کربن کایرال یا نامتقارن است )
همانطور که میدانید امینو اسید ها به دو فرم D ( Dextrogree ) و L (Levogyre) بر حسب قرارگیر گروه امین وجود دارند . و امینواسید های به کار رفته در پروتئین ها الفا L امینواسید هستند.

☑️امینواسید ها به همین علت باعث انحراف نورپلاریزه میشوند .
اگر به سمت راست نور را منحرف کند ان را راستگردان گویند و با علامت (+) و اگر چپ گردان باشد با علامت (-) نشان داده میشوند

#aminoacide

@Essential_Biochemistry

☑️ایندکس هیدروپاتی ( Hydropathy Index) :
مقیاسی مرکب از میزان ابگریزی و ابدوستی زنجیره کربنی R . این میزان انرژی ازاد (دلتا G)انتقال زنجیره جانبی از یک محیط ابگریز به محیط ابی .
برای قطبی ها دلتا G کوچکتر از صفر و مساعد
برای ناقطبی ها این مقدار بزرگتر از صفر و نامساعد است . 🔅 البته این مورد یک استثنا دارد سیستئین با وجود دلتا G بزرگتر از صفر قطبی در نظر گرفته شده است .
🔅دلیل : توانایی گروه سولفیدریل به عنوان اسید ضعیف و توانایی ایجاد پیوند هیدروژنی ضعیف با اکسیژن و یا نیتروژن .

#Index_hydropathy
#aminoacide

@Essential_Biochemistry

The chart of Hydropathy index

#Index_hydropathy
#aminoacide

@Essential_Biochemistry

🛑‼️نکاتی در مورد پیوند پپتیدی :

☑️ پیوند پپتیدی یا امگا (ω) :

به دلیل رزونانس پیوند بین Nو Cخاصیت پیوند دوگانه پیدا می کند .
این پیوند مسطح است قابلیت چرخش ندارد .
چرخش حول محورپیوند c-c ساختار های متفاوت با پایداری متفاوت ایجاد میکند .در پروتئین ها چرخش حول محور پیوند پپتیدی به صورت خود به خود وجو ندارد .
#Peptide_bond
#aminoacide

@Essential_Biochemistry

☑️منحنی راماچاندران(Ramachandran ) :
این منحنی زوایای مجاز و غیر مجاز فی و سای را نشان میدهند .

🔅گردش در جهت عقربه ساعت با علامت (+) و گردش بر خلاف عقربه ساعت (-) نشان داده میشود .
🔅قسمت های ابی رنگ مجاز اند و در طبیعت موجودند و قسمت های پررنگ تر فراوانی بیشتری دارند .
🔅در حالت Ψ= -90 و Ф=90 و قسمت های بی رنگ این حالت ها غیرمجاز هستند چون گروه جانبی با اتم اکسیژن تداخل خواهد داشت پس ناموجود اند .

#aminoacide
#Ramachandran

@Essential_Biochemistry

Understanding PHI and PSI Angles, Ramachandran Plots, & Newman Projections

#Angle_fi(Φ)
#Angle_sai(Ψ)
#Ramachandran
#aminoacide

@Essential_Biochemistry

در کدام اسیدامینه (Hydropathy Index) بیشتر است ؟ (کنکور 98 دکتری )
public poll

Ala – 14
👍👍👍👍👍👍👍 70%
@rezayari1400, @biolojistt, @m_behzadmand, Soudabeh Niknia, Mhrn, Motahare, @aaammmm2332, @Katrineebrahimi, @SRDdbddadvar, a.e.k, سید رضا, .., Sara, ‌ⓚ

Arg – 4
👍👍 20%
@Niloofarkhairkhah, @Ahmadi19980, @Ajf1999, soheila

Asn – 1
👍 5%
علیرضا

Tyr – 1
👍 5%
@biophysicspnu

👥 20 people voted so far.

کدام اسید امینه زید فاقد چرخش فی (Ф) می باشد ؟ (ارشد بیوشیمی بالینی 88)
public poll

پر.لین – 36
👍👍👍👍👍👍👍 82%

گلایسین – 5
👍 11%

اورنیتین – 2
▫️ 5%

تریپتوفان – 1
▫️ 2%

👥 44 people voted so far.

☑️ICSI Footage


***intracytoplasmic sperm injection, a technique for in vitro fertilization in which an individual sperm cell is introduced into an egg cell.


@cytology
@medterms
@IranBiologists
@essential_biochemistry

پاسخ : پرولین
@Essential_Biochemistry

پاسخ :آلانین
@Essential_Biochemistry

☑️سطوح ساختاری پروتئین ها :
برای هر پروتئین 4 سطح ساختاری درنظر گرفته شده است .همه پروتئین ها سطوح 1تا 3 را دارا هستند .

☑️سطح 1 : توال خطی امینو اسید ها در پروتئین
🔅 حاصل پیوند پپتیدی
☑️سطح 2 : الگوهای ساختمانی 3 بعدی منظم که بعد از ترجمه در بخشی از پروتئین ایجاد شوند شامل صفحات مارپیچی آلفاهلیکس و رشته های بتا strand و loop ها
🔅حاصل پیوند های هیدروژنی
☑️سطح 3: تاخوردن (folding ) 3 بعدی پروتئین
🔅حاصل مجموع پیوند های ضعیف هیدروژنی و یونی و ابگریز و همچنین حاصل پیوند های قوی کووالانسی (دی سولفیدی )
☑️سطح 4 :اتصال زیرواحد ها (protein subunits )
🔅حاصل مجموع پیوند های ضعیف هیدروژنی و یونی و ابگریز و همچنین حاصل پیوند های قوی کووالانسی (دی سولفیدی )

#Proteins
#structural_levels

@Essential_Biochemistry