Минутка генетики
2.72K subscribers
275 photos
22 videos
3 files
207 links
Денис Черневский и краткие заметки о генетике

Консультации: https://taplink.cc/dchernevskiy
Связь: @dchernevskiy
Download Telegram
🚩 Сегодня в Казани прошла педиатрическая конференция, на которой коснулись и генетических заболеваний, в частности печени
Их очень много разных; сверху прикрепляю слайд с данными из моей диссертации.

✏️Хочу подсветить 3 важных особенности генетических заболеваний на этих примерах:
1️⃣Большинство из этих заболеваний аутосомно-рецессивные, то есть они возникают только при повреждении обеих копий гена. Носители 1 мутации не имеют симптомов, хотя есть и исключения, например, курильщики с мутацией гена SERPINA1 или женщины-носительницы мутации гена ABCB4 могут столкнуться с холестазом во время беременности (а уже их дети в группе риска по развитию тяжелого семейного прогрессирующего внутрипеченочного холестаза, он обозначен красным на слайде)
2️⃣Мой научный руководитель, д.м.н. Алла Евгеньевна Лаврова рассказала про подводные камни дифференциальной диагностики разных типов (их как минимум 13) прогрессирующего внутрипеченочного холестаза. Это яркая иллюстрация генетической гетерогенности: ОДНА болезнь может обусловлена мутациями НЕСКОЛЬКИХ генов
3️⃣Д.м.н. Аэлита Асхатовна Камалова, профессор кафедры педиатрии Казанского ГМУ рассказала про серию клинических случаев, демонстрирующих другую особенность - клинический полиморфизм: мутации в ОДНОМ гене могут стать причиной развития НЕСКОЛЬКИХ заболеваний
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
5👍34🔥14👏3🤓3
Криминальная генетика 🕵‍♂
лёгкий контент 😁 на выходные по запросам читателей, как и обещал

📖 Впервые осудили человека на основании анализа ДНК в 1987 году. Он был признан виновным в убийстве двух малолетних девочек (в 1983 и 1986 годах). Первоначального подозреваемого путем сравнения его ДНК и образцов спермы из жертв удалось оправдать. Для поиска преступника полиция с участиеи генетика Алека Джеффриса собрала образцы ДНК 5000 мужчин... но ключевым стало признание одного из них в том, что он сдал кровь вместо Колина Питчфорка - настоящий насильник был пойман.

🦟 Но лично меня больше всего впечатлила история 2008 года: в Финляндии нашли угнанную ранее машину и при ее осмотре полицейские заметили ...комара, насытившегося кровью. Анализ ДНК крови из комара указал на преступника, уже известного полиции. Ведь и за рубежом, и в России некоторые категории граждан подлежат обязательной геномной регистрации

🤫 Сейчас, спустя почти 40 лет после первой ДНК-дактилоскопии, все одновременно и лучше, и хуже:
❗️Один преступник (13 убийств, 45 изнасилований) был неуловим 50 лет, пока кто-то из его дальних родственников не сделал генетический генеалогический тест (один из мега популярных). ФБР связались с родственником, объяснили ситуацию и при составлении семейного дерева значительно сузили круг подозреваемых. В итоге генетика выявила 72-летнего пенсионера - "убийцу из золотого штата"
А в 2023 году компания 23andMe, которая выполняет "генетическую паспортизацию", сообщила об утечке персональных (имена, адреса и генетических) данных половины своих клиентов - 7 миллионов человек.

🌐 Резюме: все под колпаком генетики. Ведём себя прилично (и наши родственники, и дети, и ещё не рождённые внуки 😉)
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍40🔥24😁174
1️⃣ Не буду пока закрывать опрос выше, но тенденция уже очевидна - лидирует "сарафанное радио", в том числе с использованием интернета. Думаю, это логично, и признаюсь, что сам проголосовал только за первые 3 пункта (другие для меня не лишние, но не определяющие выбор).

2️⃣ Интересно, что второе место делят по сути бренд клиники или личный бренд врача.

3️⃣ И получается, коллеги, что за должностью и регалиями не надо гнаться, выдохнем 😮‍💨

*️⃣ Мое личное мнение про диссертации - это нужно не для пациента, а для самого себя, для пересиливания себя.
А в идеале может получится что-то полезное для других людей (это не Нобелевка, но хоть чуть-чуть).
▶️ Мы этого попытались достичь в моей работе, завтра расскажу, как именно 😀
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
1🔥47👏117👍1
Самое главное в лечении любого заболевания – понимание его причины

Кратко о нашем исследовании: 179 детям с неясной причиной хронического гепатита (исключались вирусные и аутоиммунные) выполнялись генетические тесты, которые выявили у 101 (56,4%) пациента генетическую причину. Генетические анализы - эффективный метод раннего выявления наследственных заболеваний печени, но все еще их стоимость и сроки выполнения ограничивают массовое применение. В мире существуют алгоритмы поиска причины только для взрослых (где мал вклад генетики в отличии от образа жизни) и в очень узкой группе детей - новорожденных с холестазом. В российских клинических рекомендациях пока такие алгоритмы отсутствуют, нет критериев назначения генетических анализов у детей с подозрением на наследственные заболевания печени.

Что сделали мы

Пошаговый алгоритм дифференциальной диагностики неясных гепатитов у детей (на фото):
Шаг 1️⃣ искать наиболее частые генетические заболевания печени (59,4%) - болезнь Вильсона, дефицит А1АТ и синдром Алажилля. Их можно заподозрить по характерным маркерам, а подтвердить относительно дешевыми и быстрыми методами (поиск частых мутаций/секвенирование 1 гена)
Шаг 2️⃣ поиск более редких (они редкие по отдельности, но их суммарная частота составляет почти половину) наследственных патологий печени. Мы разработали математическую модель – калькулятор риска, которым врачи могут воспользоваться бесплатно через ТГ-бот https://t.me/GenLivDisBot . Он состоит из 5 простых вопросов (скрининг) и призван помогать педиатрам и другим клиницистам определить показания к консультации генетика и расширенному генетическому исследованию. При значении риска ≥36,8% его чувствительность - 69,8%, а специфичность - 79,2%
Шаг 3️⃣ при отрицательных результатах генетических анализов и сохранении подозрений на наследственно обусловленное заболевание печени мы предлагаем проведение междисциплинарного консилиума с целью выбора дальнейшей тактики обследования ребенка

⚠️ Важно: все дети, у которых был установлен генетический диагноз, получили пользу от проведенного исследования (прогнозирование заболевания, скрининг сопутствующих патологий, назначение патогенетической или более эффективной симптоматической терапии, определение рисков повторения заболевания в семье)
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👏40👍20🔥16👌4
Болезни печени и генная терапия
🖥 10 дней назад вышла научная статья про лечение ранее неизлечимого заболевания с помощью редактирования генов новой разновидностью CRISPR-Cas9

🚨 Через 48 часов после рождения у мальчика возникли вялость и затруднённое дыхание. Анализ крови показал превышение уровня аммиака в 30 раз. Быстрый генетический анализ (в статье не указано, как быстро, но это реально даже за пару часов) выявил две мутации гена CPS1, что подтвердило диагноз - дефицит карбамоилфосфатсинтетазы 1-го типа, при котором чем раньше заболевание проявилось, тем хуже прогноз.
⬆️ На картинке показано, что это дефект фермента, который токсичный аммиак превращает в мочевину. Накопление аммиака – это высокий риск необратимых неврологических нарушений и смерти (50% таких детей погибают до года).
🟢 Сначала ребенка лечили стандартной схемой: препараты, связывающие азот, + цитруллин + диета с ограничением белка, что дало положительный эффект
🔴 Но в 3 месяца уровень аммиака снова стал расти. Обсуждался следующий этап – трансплантация печени.

🤫 В это время исследователи разработали альтернативу - индивидуальную терапию с использованием липидных наночастиц для генетического редактирования. Это заняло 6 месяцев (диагностика, эксперименты на моделях животных, на человеческой клеточной линии, юридическое одобрение FDA).
Ребенку провели два введения, в 7 и 8 месяцев. 📉 Уровень аммиака в крови снизился, что подтвердило эффективность лечения. Серьезных побочных эффектов не наблюдалось.
Цитата исследователей:
Технология редактирования генов на основе CRISPR-Cas9 становится методом лечения таких заболеваний, как серповидноклеточная анемия, β-талассемия и др. Но новый подход потенциально может устранять более 90% патогенных вариантов генетических заболеваний, которые, хотя и встречаются редко по отдельности, в совокупности поражают сотни миллионов людей по всему миру.

Мы живем в удивительное время.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥33👏1411💯8
Ровно 1 неделя до защиты диссертации

... и до спама фото/видео по дороге из Нижнего Новгорода в Саратов 🚗
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
2🔥99👍2519👏65🤩3💯2🎉1👌1
🧬Новый ИИ Difface создает 3D изображения лиц по генетической информации

Разработанный Китайской академией наук, Difface — это комплекс программ, который анализирует геномные данные для создания 3D изображений лиц.

🟢ИИ тренировали на 9,674 образцах 3D изображений и геномных данных представителей народности хань*. Выявлено 7,842 значимых варианта, связанных с лицами, которые стали входными SNP для Difface.

🟢В контрольной группе из 2,000 участников Difface смог безошибочно узнать человека по ДНК в 3.3% случаев. Добавление информации о возрасте, поле и ИМТ улучшило точность: средняя ошибка снизилась до 2.93 мм.

Однако технология вызывает вопросы о геномной конфиденциальности и имеет серьезные этические и юридические последствия. Разработчики планируют повысить точность и адаптировать ИИ для различных этнических групп.
*Хань (ханьцы, также китайцы в узком этническом смысле) — этническая группа сино-тибетской языковой семьи.
Источник
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥26🤔13👏10😁7
Сегодня день защиты детей

Ссылки на свои размышления в 2024 и 2023 годах прикрепляю

А сегодня хочу сказать, что для меня это ещё и день педиатрии

🚸 Моя первая специальность - педиатрия
🚸 Моя супруга - Наталья - педиатр, преподаватель кафедры педиатрии, и главный врач для детей всех наших близких
🎂 У нее завтра день рождения

Если есть желание, можете написать поздравление здесь 😉
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
1🔥110👍22🎉13🤩12👏4
⚠️ Не верится, но уже завтра с 11:00 по МСК начнется заседание, на котором я представлю к защите кандидатскую диссертацию на тему "Клинические и молекулярно-генетические характеристики наследственных болезней с поражением печени у детей". Будем надеяться, что до 13:00 решение будет принято 💭

Результат сообщу здесь, не переключайтесь 😁

🙂 Ну сегодня ситуация выглядит вот так:
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
2🔥92😁47👏23👍74🤓2
кандидат медицинских наук
15🔥392👏7624🏆1816👍5🎉4🤩3🤣3🙏2
Написав эти слова и перечитав их, хочу подчеркнуть, что это не какой-то официальный обмен любезностями, а мое честное мнение 

Отходя от предзащитного стресса, я хочу написать 2 вещи:

1️⃣На мой личный взгляд, диссертация и три буквы "к.м.н" перед ФИО не так уж и важны. Гораздо важнее путь, который пройден человеком - это настоящее достижение.

2️⃣Лично для меня это достижение было бы АБСОЛЮТНО НЕВОЗМОЖНО без огромного числа людей, которые непосредственно или косвенно участвовали в формировании меня как личности. Уверен, что я не смогу перечислить всех поименно, поэтому заранее прошу прощения.
При этом важно понимать, что вклад каждого человека в моей жизни разный, но КАЖДЫЙ был необходим - поэтому я буду перечислять не в порядке значимости, а в обратном хронологическом. 

Я благодарю:
• Диссертационный совет Саратовского медицинского университета, председателя Черненкова ЮВ за оперативное рассмотрение моей работы, а учёного секретаря Липатову ТЕ за человечность и огромную помощь на всех этапах! Отдельно благодарю Спиваковского ЮМ, чьи интеллигентность и лекции стали для меня образцом за наши недолгие встречи.
• Своего научного руководителя Лаврову АЕ за направление, организацию, всестороннюю помощь, поддержку, искреннюю вовлечённость, за возможность развития, а изначально за погружение в мир гепатологии
• Своих официальных оппонентов, Строкову ТВ и Захарову ЕЮ. Я вообще не понимаю, почему исторически закрепилось слово оппоненты, так эти уважаемые и крайне компетентные в сфере наследственных заболеваний печени (и не только) доктора наук только помогали нам!
• Тех, кто смог разделить радость праздничного дня со мной лично! Спасибо, моя команда (мои люди со мной ❤️😁)
• Всех сотрудников Института педиатрии ПИМУ, особенно отделения педиатрии №2, которые непосредственно вели и лечили пациентов (Лаврова АЕ, Борисова ЕЮ, Ерзутова МВ, Жиганшина ТВ, Полканова ИВ, Махалова АС). Отдельно я хочу выразить огромную благодарность Коноваловой ЕЮ не только за ведение пациентов, но и за методическую и, главное, моральную поддержку!
• Заведующую кафедрой педиатрии Новопольцеву ЕГ за то, что я вообще решился на аспирантуру, за возможность начать преподавать, за большущие доброту и заботу
• Большинство своих преподавателей ВУЗе (поименно всех перечислить не хватит лимита текста)
• Врачей, которые спасают меня самого (ОД, ИА, КС, ДС, ЕА, МВ, ВС и многие другие)
• Своих коллег-врачей, которые понимают, помогают и подерживаю. Отдельно я благодарю Макарову МВ, которая для меня стала великолепным наставником по генетике и работе в целом 
• Тех, с кем я встретился за 11 лет учебы в НижГМА/ПИМУ. Несмотря на сложную учёбу, это был один из лучших периодов жизни, в основном благодаря "группе высшей степени приятности" и моим настоящим друзьям, которые до сих пор поддерживают во всем (как физически, так и мемчикам 😉)
• Своих друзей со школы, в особенности NADJ
• Своих учителей из моей родной гимназии №53. А особенно благодарю Лисину ВА, которой, увы, сейчас с нами нет - Учителя истории, своего первого научного руководителя, которая успела в моем 6 классе привить мне любовь к научному поиску
• Всю-всю-всю свою большую семью за просто невообразимую помощь и поддержку!
• Свою жену Натали и сына Льва. Просто знайте, что они - моя главная мотивация ко всему
• И безусловно своих родителей. Вы мои самые главные наставники в жизни

Всех благодарю, обнимаю и делю с вами радость маленькой победы 🤗
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
1🔥159🏆44👏28👍27
Я с новостями 📣

📌 Вчера отмечался день медицинского работника (коллеги, с праздником!).
В этом году премии «Призвание» удостоены сотрудники МГНЦ за разработку расширенного неонатального скрининга, позволяющего в кратчайшие сроки выявить наследственные заболевания у новорожденных и сразу начать лечение.

📌 А десять дней назад, 6 июня, состоялся первый Всемирный День Осведомлённости о заболевании, которое называется Миопатия Ульриха-Бетлема (COL-6). Это один из видов врожденных мышечных дистрофий, связанный с мутациями в генах, кодирующих коллаген 6-го типа: COL6A1, COL6A2, COL6A3, COL12A1. Примерно 1 из 100 000 человек в мире имеет это заболевание. В российском реестре сейчас более 180 пациентов с миопатией Ульриха-Бетлема. Большую работу для этих детей проводят не только врачи - сами пациенты и их семьи огранизовывются в сообщества, которые с заботой и пониманием эффективно помогают друг другу. Российское пациентское сообщество по миопатии Ульриха-Бетлема можно найти здесь 
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥56👍23👏147🙏6