Зимой записывали подкаст с сообществом помощи детям с особенностями развития

Я писал ранее, что поддерживаю объединения родителей таких детей, их общение и самообразование

⭐️ В этот раз очень душевно и просто (я надеюсь 😁) поговорили про генетику

https://vkvideo.ru/video-226329792_456239071

ВРОЖДЁННЫЕ ≠ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ

Эти два термина похожи и зачастую (даже в учебниках) представляются синонимами
‼️ Но это не так

Иногда цель врач-генетика заключается как раз в том, чтобы разграничить эти понятия и определить реально ли необходимо искать генетическую причину заболевания пациента 🤔


🧬 Генетические аномалии - это изменения ДНК человека, которые часто наследуются, часто проявляются симптомами со стороны разных органов и могут возникнуть в любом возрасте

⚛️ Врождённые аномалии - это нарушения развития конкретного органа (чаще всего только одного), которое выявляется сразу при рождении или даже внутриутробно. В большинстве случаев их конкретную причину не удается найти (кроме случаев подтвержденных подтвержденных внутриутробных инфекций, приема некоторых лекарств, алкоголя, воздействия ионизирующего излучения и др)

👀 Как раз про последний пункт недавно написал мой талантливый друг, детский хирург и эндоскопист Вадим Олегович Теплов. С удовольствием делюсь его экспертным ТГ-каналом

PS в будущем он обещал добавить больше "лёгкого" контента, подписывайтесь и следите 😁

"Минутка кина"
о генетике, конечно

🖥 Недавно коллеги порекомендовали мне интересный фильм 2009 года с Кэмерон Диаз и другими убедительными актерами - "Мой ангел-хранитель"

Завязка сюжета
У маленькой девочки выявляют злокачественное заболевание крови - лейкоз. Для лечения необходима трансплантация костного мозга (вернее кровяных стволовых клеток в нем). Родители и брат не могут стать донорами из-за несовместимости. Доктора предлагают прибегнуть к ЭКО с генетическим тестированием эмбрионов, которое поможет родить "идеального" донора. Последствия такого решения становятся причиной серьезных и неоднозначных морально-этико-философских проблем в семье, спойлерить не стану.

Фильм не основан на реальных событиях и кажется, что такие технологии - просто выдумка ... но такая процедура действительно возможна ⚡️

🔍 В 2000 году родился Адам Нэш - первый ребенок, рождённый для спасения своей старшей сестры путем донорства пуповинной крови (тоже богатой стволовыми клетками) в первые сутки своей жизни.
У девочки было выявлено тяжёлое генетическое заболевание - анемия Фанкони.
Ее родители прибегнули к ЭКО с ПГТ для:
➕ исключения у будущего ребенка мутаций этой болезни
➕ для поиска наиболее схожего с сестрой по системе HLA

🛡 HLA - это генетически обусловленные маркеры нашей иммунной системы. Чтобы трансплантировать орган от человека к человеку, необходимо, чтобы эти маркеры двух людей были максимально идентичны, иначе будет отторжение.
Иногда HLA-типирование предлагают для обследования супружеских пар при планировании беременности, но мы уже обсуждали здесь, что так делать не надо

🎙 В общем, это одна из тем, которая сложнее с этической стороны, чем с технической.
А вы как думаете, можно ли создавать ребенка для спасения другого?

Генетический паспорт

На фоне прошлой новости ко мне резко увеличилось количество вопросов про «а надо ли делать себе генетический паспорт?»

Год назад я писал на эту тему, и мое мнение не изменилось - все зависит от цели ✅

Но давайте еще раз и подробнее
▶️Генетический паспорт – маркетинговое название. Каждая лаборатория включает в этот анализ разное содержание. По меркам генетики это дешевый анализ, который дает небольшой объем информации о человеке.
▶️Эта информация (по крайней мере бОльшая ее часть) не лженаучна – исследуются те генетические точки (мутации), для которых в научных исследованиях описана связь с той или иной характеристикой здоровья и способностей.
▶️Эти научные исследования проводятся утрировано так: изучают ДНК 100 гроссмейстеров и 100 людей, не умеющих играть в шахматы. То, что будет отличать генетически гроссмейстеров, может рассматриваться как важные для шахмат «гены шахматиста». Вот только помните, что 1) в формировании наших достижений более важным является влияние внешней среды, обучение и опыт; 2) большинство таких научных публикаций базируются на маленьких генетических анализах, на маленькой группе людей – большинство современных полногеномных исследований большой случайной выборки людей опровергают такие ассоциации
▶️Чтобы нагляднее показать, какую часть ДНК анализируют генпаспорта, я нарисовал картинку 📤. Оранжевое – весь геном; красное – его наиболее важная часть, называемая экзом; маленькие зеленые кружочки – точки (мутации), исследуемые паспортом. Их сумма в 1000 раз меньше, чем маленький прямоугольник экзом.
▶️Я делал себе и своим родственникам такой генпаспорт известной российской компании ради интереса и любопытной информации о происхождении и способности к бегу на короткие дистанции. И с полным пониманием, что это не медицинский анализ, необходимый для планирования беременности или определения причины заболевания - своим пациентам я его НЕ рекомендую.

PS мой генпаспорт выявил высокие шансы иметь IQ > 170 🤓 и паранойю 🤨 ну и в чем они ошиблись? 😅😅😅

Короткое видео про то, все ли определяется генетикой 👀
Почти в продолжение прошлой темы)

Генетические данные человека постоянны, поэтому большинство генетических тестов (например, секвенирование) нужно выполнять всего 1️⃣раз в жизни.

🕯 Но вот их интерпретация может меняться с развитием науки. Поэтому в случаях неясных заболеваний и отрицательных результатов применяется повторный биоинформатический анализ - он позволяет снова пересмотреть "сырые" данные последовательности ДНК и выловить то, что было неизвестно ранее. Например, бывают ситуации, когда в 2019 году секвенирование генома не выявило мутаций, а спустя 5 лет биоинформатический анализ, потому ранее не было данных о связи такой мутации с заболеванием.
Его стоимость значительно ниже первичного обследования (не требуется повторный забор крови и сложные дорогостоящие лабораторные этапы).

Научные исследования показывают, что у 7–12% пациентов без установленного диагноза после первичного секвенирования экзома обнаруживаются генетические заболевания при повторном анализе. В 2023 году опубликован результат повторного анализа данных 114 пациентов с патологиями почек и печени неясного генеза, который показал увеличение на 7% выявления причин заболеваний.

☄️ А совсем недавно международная группа ученых, в которую вошли мои уважаемые коллеги из НИИ нейронаук Университета Лобачевского, описала новый синдром - SPOUT1-ассоциированное нарушение нейропсихического развития.
Это означает, что ранее это нарушение могло быть пропущено просто в связи с неизвестностью... А ведь каждый год до сих пор появляется информация о ранее неописанных в международных базах данных мутациях и заболеваниях

❓ Мне задали вопрос:
"Гастроэнтеролог заподозрила у моего ребенка синдром Жильбера и сказала сдать генетический анализ. Надо ли?"

Сегодня, кстати, всемирный день здоровья. Всем всегда хочется знать о своем здоровье больше. И картинка сверху тому подтверждение 🙂

Подобные вопросы поступают очень часто, поэтому хочу ответить здесь для всех

Но! Отвечу только через 48 часов 😁
А пока мне интересно узнать мнения моих коллег, поэтому предлагаю опрос:

У меня синдром Жильбера

🟡Моя супруга поставила мне этот диагноз, будучи ещё на II курсе медицинского (она тогда ещё не знала, что мы поженимся 😁). На старших курсах это констатировала преподаватель, только начав занятие по болезням печени у моей группы. И мой научный руководитель тоже сразу обратила на это внимание.
Просто по лёгкой желтизне склер моих глаз, даже без измерения уровня билирубина (мои значения почти всегда 20-30 мкмоль/л)
🧬Только потом, изучая результаты секвенирования своего генома, я подтвердил это генетически.

❓ Опрос выше оказался очень интересным: врачи разделились ровно на 2 лагеря во мнениях. Так где же истина?

Как в моем личном примере, так и в мировой практике показано, что синдром Жильбера можно выявить без генетического теста. Он не нужен для диагностики, а его масштабного применения лучше избегать, чтобы не порождать лишнее беспокойство у пациентов

❗️В редких случаях анализ может быть полезен: как часть диагностики более агрессивной гипербилирубинемии - синдрома Криглера-Найяра; а также при назначении лекарств, которые хуже метаболизирутся при повреждении гена UGT1A1 (их относительно немного!)
‼️ Лично по моему мнению (принимаю критику) в большинстве случаев генетический анализ на синдром Жильбера опасен: он может дать ложное представление о доброкачественности повышения билирубина, что позволит упустить действительно тяжелое заболевание печени.

🔜Подробно про синдром Жильбера, его проявления и лечение (спойлер: оно не требуется) я писал раньше https://t.me/DenProGen/99
🔜И делюсь очень подробной статьей про это состояние - https://www.journal-of-hepatology.eu/article/S0168-8278(23)00421-X/fulltext

Стратегии секвенирования: как врачи выбирают метод


NGS – это не одна конкретная методика, а целый спектр стратегий секвенирования, которые различаются по объему анализируемой информации, показаниям и стоимости. В этом посте – короткий разбор стратегий высокопроизводительного секвенирования, которые применяются в медицинской генетике.

Генетические панели
⚫️Количество генов: от 2 до ~2000 генов
⚫️Когда применяется: клиническая картина позволяет заподозрить конкретную группу заболеваний (например, кардиомиопатии, эпилепсии, иммунодефицит и т.д.)
⚫️Особенности: высокая чувствительность, но ограниченность – в генах, не входящих в панель, варианты не найти
⚫️Цена: от ~30 000 руб (зависит от типа панели и количества входящих в нее генов)

Секвенирование клинического экзома (clinical exome sequencing, CES)
⚫️Количество генов: ~4000-5000 генов, связанных с заболеваниями согласно OMIM и другим базам фенотип-генотипических ассоциаций
⚫️Когда применяется: при подозрении на большой спектр заболеваний
⚫️Особенности: охватывает только клинически значимые гены, поэтому варианты в недавно описанных генах не найти
⚫️Цена: ~40 000 руб

Полноэкзомное секвенирование (whole-exome sequencing, WES)
⚫️Количество генов: ~20000 экзонов белок-кодирующих генов
⚫️Когда применяется: при подозрении на большой спектр заболеваний
⚫️Особенности: покрывает все известные и потенциально значимых гены (включает только ~1.5-3% от последовательности всего генома, однако с помощью обнаруживается до ~85% всех причин наследственных заболеваний!)
⚫️Цена: ~45 000 руб

Полногеномное секвенирование (whole-genome sequencing, WGS)
⚫️Количество генов: весь геном, это все гены, некодирующие последовательности, регуляторные регионы, митохондриальная ДНК
⚫️Когда применяется: при подозрении на большой спектр заболеваний и особенно сложных случаях, когда другие методы не дали результата, для поиска вариантов в некодирующих областях
⚫️Особенности: самый полный охват, возможность анализа структурных перестроек, регуляторных регионов, однако высокая стоимость
⚫️Цена: ~95 000 руб

Секвенирование митохондриальной ДНК
⚫️Количество генов: вся последовательность митохондриальной ДНК
⚫️Когда применяется: при подозрении на митохондриальные заболевания (например, мышечная слабость, офтальмоплегия, лактат-ацидоз и др.)
⚫️Особенности: специфичный метод для выявления митохондриальных патологий, но не выявляет варианты в ядерных генах, кодирующих митохондриальные белки
⚫️Цена: ~35 000 руб

Выбор метода зависит от специфичности симптомов и уровня генетической гетерогенности предполагаемого заболевания.
Специфичность — это степень, с которой симптомы указывают на конкретное заболевание. Например, повышение уровня хлорида натрия в секрете потовых желез — специфичный признак муковисцидоза. А вот судороги — симптом неспецифичный, поскольку может встречаться при множестве разных состояний.
Генетическая гетерогенность — это количество разных генов, мутации в которых могут вызывать одно и то же заболевание. Например, муковисцидоз связан только с одним геном. А вот детская фокальная эпилепсия может быть вызвана мутациями во множестве различных генов, поэтому это генетически гетерогенное заболевание.
В вопросе выбора оптимальной стратегии секвенирования очень важно тесное взаимодействие врача-генетика и лаборатории.