Случайные находки в генетических анализах

Вчера я получил результат секвенирования генома своего маленького пациента с неврологическими нарушениями.
 
Анализ выявил наиболее вероятную причину симптомов (ещё потребуется дообследование родителей), а также мутацию, которая совсем никак не связана с болезнями нервной системы - мутацию в гене BRCA1.

⚠️Человек, у которого выявлена мутация в гене BRCA1, имеет повышенный риск развития некоторых онкологических заболеваний: 
       - рак молочной железы (как женщины, так и мужчины!)
       - рак яичника (женщины)
       - рак предстательной железы (мужчины)
       - рак поджелудочной железы (оба пола)
       - и в меньшей степени некоторых других 

Результат был неожиданным, это так называемая случайная находка. Есть список 97 генов (он обновляется ежегодно), мутации в которых добросовестные лаборатории обязаны всегда сообщать пациентам, так как для связанных с ними заболеваниями есть эффективные профилактика и/или лечение.

➡️ Для самого ребенка этот результат сейчас ни на что не повлияет (как минимум до 25-35 лет), но теперь у его родителей (и других родственников) можно найти эту мутацию и начать своевременную профилактику.

О супружеской совместимости
Замершие беременности и выкидыши могут возникнуть в любой семье. Чаще всего следующая беременность заканчивается рождением здорового ребенка. Но ≈ 5% пар сталкиваются с ≥2 выкидышами подряд - это повод пройти дополнительное обследование.

❓Какое?
Недавно ко мне обратилась пара, которая столкнулась с 3 подряд выкидышами на раннем сроке беременности. Некий врач рекомендовал недешевый "анализ на совместимость партнёров - тестирование шести HLA-антигенов первого класса". Звучит круто, но читайте дальше.
В результате было выявлено, что 3⃣ из 6⃣ антигенов HLA у мужа и жены одинаковые ➡️ врач сказал им, что это и есть причина, что теперь надо либо суррогатную мать, либо проводить супер-пупер (нет) ЛИМФОЦИТОИММУНОТЕРАПИЮ, чтобы выносить ребенка.

Для справки: в прошлом веке (буквально) ряд небольших статей показал будто такой анализ полезен. Однако позже крупные исследования доказали, что никакой связи с количеством совпадений HLA у супругов с невынашиванием беременности нет. Наши и зарубежные свежие клинические рекомендации говорят однозначно, что этот анализ никому назначать не стоит!

Я рекомендовал супругам начать с исследования кариотипа (который вообще по ОМС можно сделать) - оказалось, у супруга есть сбалансированная транслокация, о которых я рассказывал здесь. Это истинная причина их проблем, но главное, эта семья может зачать своих детей - с помощью ЭКО с ПГТ-А.

☝️При этом, все же бывают случаи, когда причина кроется в одинаковых мутациях супругов, однако это совсем другие гены, расскажу в следующий раз...

О супружеской совместимости (часть 2)

❓Так могут ли быть несовместимые пары❓

В некотором смысле да, но термин этот не корректен. Давайте разбираться:

Почти у каждого нашего гена есть 2 копии (одна от мамы, другая - от папы), и у многих людей одна копия бывает повреждена (имеется 1 мутация). В большинстве случаев этого достаточно для нормальной жизни, человек остаётся совершенно здоровым и не знает о носительстве мутации.

Но если встречаются ♂️ и ♀️, у которых повреждена копия одинаковых генов, то у них может родиться ребенок с генетическим заболеванием, если унаследует обе мутации.

К таким болезням относятся спинальная мышечная атрофия, муковисцидоз, наследственная тугоухость, болезнь Вильсона и многие другие...

Что важно знать:
1️⃣ Проверить наличие бессимптомных мутаций у себя и партнёра можно (и нужно) ДО беременности
2️⃣ Если у обоих супругов выявляются мутации в одном и том же гене, мы можем на это повлиять - провести ЭКО с предварительным обследованием эмбрионов (ПГТ-М) или выполнить анализ во время беременности
3️⃣ Кажется, что генетические болезни встречаются очень редко, а генетические анализы очень дороги - однако следует помнить, что эти анализы проводятся 1 раз в жизни, а бремя этих заболеваний несопоставимо тяжелее
4️⃣ Почти каждый человек несёт в своей ДНК как минимум 1 мутацию, само по себе такое носительство не представляет угрозы...

...но есть исключения, о которых в следующий раз

Генетика может быть полезной не только в медицине ☝️

😔 Вот так пытаешься рассказывать о генетической науке в своем канале, о доказательной медицине, пишешь настоящую диссертацию, .... но интервью для жителей твоего города берут у врача интегративной медицины, который умеет легко переписывать ДНК с помощью гормонов...эх 😒
Но не расстраиваемся, работаем дальше! 😎

Кому нельзя курить?
Конечно, никому 🤓 но есть люди, для лёгких которых курение может быть особенно опасным...

Помните, я писал, что у большинства людей есть та или иная мутация, которая в одиночку ни к чему не приводит, но есть исключения?

Есть генетическое заболевание, которое называется сложно - дефицит альфа-1-антитрипсина. Оно может проявляться патологией печени (чаще у младенцев) и ХОБЛ - хронической обструктивной болезнью легких (эмфиземой и/или бронхоэктазами), обычно у людей старше 30 лет. Развивается оно при наличии двух мутаций гена SERPINA1.

От 1% до 5% людей в мире имеет одну такую мутацию и помимо риска рождения ребенка с заболеванием, такое носительство значимо повышает риск ХОБЛ при активном/пассивном курении, загрязнении воздуха, воздействии промышленной пыли и химикатов.
Разумеется, у курильщиков без такой мутации тоже неприятности могут развиться, но не так быстро 🚭

🧬 Важно интерпретировать результаты генетических анализов со всех сторон, чтобы понимать и прямые, и косвенные последствия как для самого человека, так и для его родственников

Не могу пройти мимо этой новости 😄

"У меня более 💯 биологических детей. Моя донорская (спермы) деятельность помогла более чем ста парам в 12 странах завести детей. Теперь я планирую открыть исходный код своей ДНК, чтобы мои биологические дети могли легче находить друг друга" - сообщил предприниматель Павел Дуров в Telegram

Есть несколько мыслей:
1️⃣ Донорство спермы - это действительно необходимая некоторым парам мера помощи. Но, на мой взгляд, для выбора донора недостаточно видеть фото человека и его достижения, важно ещё и обследовать на бессимптомное носительство генетических заболеваний (люди не знают об этом!), что сейчас проводится в абсолютно недостаточном объеме
2️⃣ Наличие сотен-тысяч детей от одного человека может быть потенциально опасно повышением вероятности случайных близкородственных браков
3️⃣ Раскрытие своей ДНК (не до конца понятно, что именно он подразумевает) - на самом деле, при желании его дети и так найдут друг друга без проблем - это обычный гентест на происхождение. Если Павел секвенирует свой геном, выявит у себя носительство заболеваний или, например, онкологические риски и сообщит об этом - вот тут будет польза!
4️⃣ Очень много потенциальных юридических и этических проблем у этой новости (особенно в аспекте раскрытия персональной информации), но их я не могу и не буду профессионально комментировать 😀

Снова о мужском и женском

"Алжирская боксерша с мужскими хромосомами победила итальянскую боксершу на Олимпиаде, нанеся сокрушительный удар в коротком 46-секундном бою"

В этом скандале больше всего меня расстраивает, что ряд известных людей (и, как следствие, СМИ), не разбирающихся в генетике и не знающих точных фактов, пытаются делать громкие заявления...

❓Что известно?
1️⃣ Иман Хелиф из Алжира заявляет, что родилась женщиной и всю жизнь живёт женщиной, никогда свой пол не меняла.
2️⃣ По данным Международной ассоциации бокса на Олимпиаде есть несколько спортсменок, не прошедших тест на соответствие полу (вероятнее всего за счёт наличия мужской хромосомы Y, либо повышенного уровня тестостерона).

❓Может ли быть такое?
Да, и генетика может это объяснить! Обычно мужчины имеют хромосомы XY, а женщины — хромосомы XX, но человек, родившийся с мутацией, приводящей к нарушению формирования пола, иногда может иметь как мужские, так и женские половые признаки.
О самых частых я рассказывал здесь, но вообще есть очень много видов. В моем любимом Медико-генетическом научном центре есть целая лаборатория генетики нарушений репродукции, которую возглавляет потрясающий учёный Вячеслав Борисович Черных - он часто выступает на конференциях (здесь можно посмотреть одну из его лекций) и каждый раз шокирует меня тем, насколько сложна генетика формирования пола, и какие редкие случаи встречаются...

🏅В спорте это тоже не первый (и не последний) прецедент: в 2019 год у южноафриканской бегуньи Кастер Семеня после ошеломительных побед тоже заподозрили особенности полового развития - аутосомно-рецессивное заболевание, называемое дефицит 5α-редуктазы. У таких людей хромосомы XY, внутренние мужские половые органы (неопущенные яички, вырабатывающие много тестостерона), но наружные половые органы соответствуют женским. Ей даже предписали принимать препараты для снижения уровня тестостерона, если она хочет продолжать участвовать в международных соревнованиях по бегу, ведь тестостерон действительно может давать спортивное преимущество (поэтому мужчины, как правило, быстрее и сильнее женщин).

Наверное, спор о справедливости участия таких спортсменов решить трудно. В конце концов, Олимпиада - это игра, у нее должны быть правила, которые должны решать такие казуистические вопросы.

А вы как думаете?

О бесплатных генетических анализах
в эндокриногенетике

В прошлый раз рассказывал про генетически обусловленные нарушения формирования пола. Обычно их выявляют в детском или подростковом возрасте, лечением занимаются детские эндокринологи.

Но для постановки диагноза часто нужны генетики и генетические анализы.
И сейчас есть возможность бесплатной диагностики!

Кому могут оказать помощь?
- Дети до 18 лет
- Старше 18 лет - на усмотрение координаторов

Какие заболевания выявляют?
1. Врожденная дисфункция коры надпочечников, надпочечниковая недостаточность, электролитные нарушения
2. Врожденный гиперинсулинизм, сахарный диабет
3. Врожденный гипотиреоз
4. Гипогонадотропный гипогонадизм
5. Гипопитуитаризм
6. Нарушения формирования пола
7. Рахитоподобные заболевания
8. Нарушения фосфорно-кальциевого обмена
9. Эндокринные опухоли

Для коллег более подробная информация по ссылке и в прикрепленном протоколе ⬆️

Стоило пожаловаться, что интервью берут не у меня, как поступило предложение от портала НН.РУ с интересными вопросами из разряда "можно ли родить гения и красавца по заказу?" 😁

Итог можете почитать здесь
Спойлер: нельзя. По крайне мере пока 😁

Актер Колин Фаррелл рассказал о сыне с генетическим заболеванием

Давно известно, что его 20-летний сын Джеймс имеет синдром Ангельмана. На прошлой неделе актер заявил, что открывает фонд помощи людям с этой патологией и другими расстройствами интеллектуального развития.
В видео (оно длится 15 минут, посмотрите) он показал сына и рассказал подробности постановки диагноза:

К году наш сын не научился ползать и сидеть, в связи с чем ему поставили диагноз ДЦП - детский церебральный паралич. Но через год невролог обратил внимание на беспричинный смех сына и заподозрил синдром Ангельмана. Генетический анализ подтвердил диагноз.

Во многих странах относительно неплохо организована помощь детям с генетическими особенностями, но когда они вырастают, переходят из педиатрической во "взрослую" медицинскую сеть, они сталкиваются с большими проблемами. Их решение будет основной целью фонда Колина Фаррелла.
__

Синдром Ангельмана возникает обычно случайно у 1 из 15 тысяч детей, характеризуется тяжелой задержкой развития, нарушениями речи, атаксией, а также уникальным поведением: частая улыбка, беспричинный смех. Часто у таких детей наблюдаются РАС и судороги.

Впервые я сам столкнулся с этим синдромом, работая медицинским братом в студенчестве. Никогда не забуду, как девочка боялась шприц (я брал у нее кровь), но единственной ее реакцией были добрая улыбка и громкий смех...