Минутка генетики
2.72K subscribers
275 photos
22 videos
3 files
207 links
Денис Черневский и краткие заметки о генетике

Консультации: https://taplink.cc/dchernevskiy
Связь: @dchernevskiy
Download Telegram
Всех с зимними праздниками! 🎅

Не подводил итогов - очевидно, что главный для этого блога, - это его появление и более 200 любознательных подписчиков 🤓

В профессиональной сфере удалось многое: сотни пациентов, десятки выступлений на конференциях, несколько научных публикаций. Надо завести привычку рассказывать вам сразу, чтобы новости не копились :)

Но сегодня поделюсь наиболее значимой историей: удалось выявить причину болезни у девочки 7 лет с выраженной слабостью мышц - миопатию Дюшенна. Таких случаев в мире единицы.

Задача была сложной по нескольким причинам:
1) До меня ей назначили мощный и дорогой анализ - секвенирование экзома (прочитывание 20 тысяч генов). Он выявил мутацию, связанную с другой неизлечимой миопатией. В такой ситуации было легче всего сослаться на эту "причину" и отпустить девочку домой, но я не повелся 😎 эта мутация имела признаки доброкачественности ☝️

Запомните! Не все мутации в заключении являются причиной болезни! Важно проверять их значимость в каждом конкретном случае, для этого и нужен генетик.

2) Симптомы кричали именно о миопатии Дюшенна, смущало только то, что она практически не встречается у девочек. Почему? Виновный ген DMD расположен в половой Х хромосоме: у мальчиков она только одна, а у девочек - две (при "поломке" одной есть "запасная"). А мутации в нем такие особенные, что их нельзя увидеть при секвенировании экзома (ох уж эта генетика)

Мы выполнили простейший и бесплатный анализ: была выявлена потеря участка гена DMD на одной из Х хромосом. Затем другим методом удалось доказать, что вторая ("здоровая") Х хромосома у этой девочки оказалась абсолютно не активна да, и такое бывает... 

Самое главное в этой истории не то, что это случай на миллион. Важнее всего то, что для миопатии Дюшенна есть специальное лечение! И девочка сейчас в процессе его получения.
🔥47👍13🤯4👏3
Секвенирование экзома

Поступил вопрос по прошлому посту: почему первый анализ не увидел мутацию?

Не существует одного идеального теста, у всех есть свои и

Экзом человека - это около 2% всего генома, но это наиболее информативная часть ядерной ДНК. Больше 80% известных на сегодня генетических заболеваний можно выявить с помощью прочтения (секвенирования) экзома.

Поэтому анализ экзома весьма популярен:
🔸Когда симптомы стёртые, не кричат о конкретном заболевании
🔸Когда предполагаемое заболевание связано с мутациями в нескольких разных генах
🔸Когда человек хочет получить больше информации о бессимптомном носительстве генетических болезней

Но есть и оставшиеся 20%, причем они не так редки. Секвенирование экзома НЕ может выявить или исключить наличие:

1⃣ Структурные перестройки хромосом (синдром Ди Джорджи)
2⃣ Внутригенные делеции/дупликации (СМА, миодистрофия Дюшенна)
3⃣ Мутации митохондриальной ДНК (синдром Ли)
4⃣ Мутации интронной части ДНК (98% генома)
5⃣ Болезни экспансий (хорея Гентингтона)
6⃣ Эпигенетические заболевания (синдром Ангельмана)
7⃣ Численные или сбалансированные хромосомные аномалии (синдром Дауна, транслокации)
8⃣ Соматические мутации

И ещё несколько слов "на генетическом" 😄

В общем, чтобы не делать ненужные обследования и сэкономить время, нервы и все другие ресурсы, желательно обратиться к генетику не только после анализа, но и до его выполнения.
🔥18👍7👏2
🧬 24 января - Международный день повышения осведомлённости о синдроме Алажилля (артериопеченочная дисплазия)

➡️Это редкое генетическое заболевание, которое характеризуется хроническим внутрипеченочным холестазом вследствие аномалии развития желчных потоков, а также поражением сердца, характерными чертами лица, аномалиями глаз, позвонков, почек и сосудов.

➡️Заболевание носит имя доктора Даниэля Алажилля, который в 1975 году описал синдром и установил специфические диагностические критерии.

➡️Среди основных симптомов синдрома Алажилля можно выделить желтуху, зуд, врожденные пороки сердца, аномалии костей, увеличение печени, офтальмологические нарушения и ряд других.

➡️Распространенность заболевания составляет 1:70 000 новорожденных в мире.

➡️Лечение синдрома Алажилля включает в себя специализированные продукты лечебного питания и диету, лекарственные препараты для снижения производных желчных кислот и уменьшения зуда, трансплантацию печени для пациентов с тяжелым течением заболевания.

➡️В Медико-генетическом научном центре имени академика Н.П. Бочкова проводится бесплатная диагностика синдрома Алажилля в рамках научно-диагностических программ. Основная цель проекта - способствовать повышению качества и доступности комплексной медицинской помощи детям с наследственными заболеваниями, раннему выявлению синдрома Алажилля.

"Сейчас методы, которые применяются в этой программе, позволяют устанавливать это заболевание быстрее и точнее и даже не прибегать к биопсии печени. А появление новых методов терапии синдрома Алажилля делает такую диагностику еще более важной и необходимой",

- рассказала заведующая отделом педиатрии ФГБУ "НМИЦ акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова", педиатр, неонатолог, профессор, д.м.н. Анна Дегтярева.

Дорогостоящим препаратом Мараликсибат детей с синдромом Алажилля обеспечивает созданный Президентом России Фонд помощи детям с тяжёлыми и редкими заболеваниями "Круг добра".
На сегодняшний день у Фонда 39 подопечных с синдромом Алажилля.
🔥16👍7
Диагноз по фото

Пусть звучит эзотерически, но это правда возможно

Давно рассказываю своим студентам про бесплатное приложение Face2gene - его можно скачать на любой смартфон, загрузить фотографию пациента (с его добровольного согласия, разумеется), и нейросеть составит список наиболее вероятных диагнозов. Дело в том, что многие наследственные заболевания имеют характерные лицевые признаки; яркий пример - синдром Дауна.

Сегодня наткнулся на свежую статью: учёные опробовали это приложение на 145 пациентах с подтвержденными генетическими диагнозами: синдром Корнелии де Ланге (45), синдром Кабуки (26), синдром Вильямса (21), синдром Вольфа-Хиршхорна (10), синдром Ангельмана (6) и другие.
По данным учёных в 90% случаев Face2Gene предположил верный диагноз!

"Такой инструмент может быть полезен как экспертам в области генетики, так и «непрофессионалам»" - отметили авторы статьи.

Лично я неоднократно пробовал использовать в практике это приложение, но пока что вау результата не наблюдал 🤔 Только студенты очень вдохновлялись, фоткали друг друга и себя, обнаруживая синдром Марфана и иже с ним 😄

Скачать можно тут и тут. Делитесь своими результатами
🔥15👍5🤯4😁3
Коротко о том, как можно демонизировать работу генетика и генетические обследования

Встретилась новость - "В Башкортостане предложили заключать браки только по справке о генетической совместимости"

Как обычно, вектор идеи благородный, но в СМИ все выглядит жутковато 😱.

🔸Во-первых, нежелательно употреблять термин "генетическая совместимость", все его трактуют по-разному. Здесь речь идёт о выявлении бессимптомного носительства аутосомно-рецессивных генетических заболеваний, которые не проявляются у человека, но могут возникнуть у его детей.

Предлагать проводить такой анализ супружеским парам, которые планируют беременность, - это хорошо. Я об этом давно писал.
Но нельзя запрещать браки, если оба родителя являются носителями одного и того же заболевания - сейчас есть возможности рождения здорового ребенка в таких семьях.

🔸Во-вторых, надо совершенно точно понимать, что такой анализ до беременности не может дать прогноз по ВСЕМ генетическим нарушениям (например, синдром Дауна, ахондроплазия и другие споннтано возникающие мутации), и тем более по таким состояниям, как расстройство аутистического спектра (о котором упомянули в публикации).

Я бы предлагал такие новшества вводить не с кнутом, а с пряником: проводить ликбезы о природе генетических болезней, предлагать бесплатные обследование и консультацию генетика брачующимся, и, конечно, обеспеченное государством сопровождение семей, в которых есть повышенные риски. А у вас какие идеи?

*безусловно все это пока ещё требует проведения научных, этических и экономических исследований*
👍22😱3👏1
«Синдром вялого ребенка»
Этим термином обозначают снижение мышечного тонуса у детей первого года жизни.

Чаще всего тревогу начинают бить детские неврологи и педиатры при плановом осмотре новорожденного, но родители и сами могут заподозрить проблему - такие дети имеют характерный внешний вид (см. картинку от Morton SU и коллег):
🔻«Поза лягушки»
🔻Провисание головы и ног в положении на животе
🔻Провисание головы при тракции за ручки

Примерно в трети случаев проблему могут увидеть опытные врачи УЗИ во время обычного скрининга беременных, есть классная статья на эту тему, из нее верхняя картинка (СЛАБОНЕРВНЫМ НЕ СМОТРЕТЬ!).

Трудно сказать, насколько это частая проблема, но в статье 2017 года дается оценка в 1 случай из 100.

Причин может быть множество: инфекции, осложнения во время беременности и в родах, прием лекарств матерью и генетические заболевания. Исследование 2022 года показало, что секвенирование экзома/генома выявило генетическую причину у 56% таких детей.
Наиболее частые генетические заболевания в этой группе: врожденные миопатии, миодистрофии, миастении, миотонии, спинальные атрофии, болезни обмена веществ (Помпе, Краббе) и наследственные синдромы (Дауна, Прадера-Вилли).

⚠️Только важно помнить, что у любого метода и даже полногеномного секвенирования есть как возможности, так и ограничения, поэтому надо учитывать все особенности конкретного ребенка для того, чтобы выбрать оптимальный алгоритм обследования. ⚠️ Например, спинальную мышечную атрофию невозможно «увидеть» при таком секвенировании. Зато это одно из тех заболеваний на которое возможна эффективная проверка еще на этапе планирования беременности, а также при рождении ребенка (с 2023 год всех новорожденных проверяют на это заболевание бесплатно, но около 5% детей может быть «пропущено»)
🔥12👍5👏2😱1
Тут есть 3 секунды, где я пытаюсь простыми словами рассказать о неправильной инактивации Х хромосомы:
😁5
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
Редкое генетическое заболевание выявили у 7-летней Лизы из Дзержинска. Обычно Миопатия Дюшенна проявляется у мальчиков.
В Нижегородской области это - первый случай заболевания у девочки.


С ребенком познакомилась Татьяна Колпакова.

Подписаться I Прислать новость
🔥18👍6👌3
А ещё объявляется КОНКУРС на самую оригинальную подпись! Автор самого залайканного комментария получит приз ❗️
😁18👍9
Инактивация хромосомы Х

Одна из наших хромосом называется Х (Икс, а не Хэ, если что 😁). У женщин их две, а мужчин одна. И чтобы женщинам не стало плохо от этого избытка природа придумала способ заглушить одну из них - инактивировать.
Подробнее визуализировать я попробовал с помощью игрушек сына (какие-то волшебные липучки 😅) - смотрите картинки ⬆️

Нет, правда сначала посмотрите картинки (я очень старался доступно объяснить), а потом читайте дальше!

Казалось бы, какая разница, чья хромосома Х активно работает, мамина или папина.
Но во многих исследованиях было показано, что сдвиг инактивации хромосомы Х может быть причиной преждевременной недостаточности яичников, привычного невынашивания беременности и ряда других патологий. 

А если у женщины есть и сдвиг инактивации, и какая-либо мутация хромосомы Х, то есть риск развития Х-сцепленного рецессивного (те, которые обычно только у мальчиков, например, миодистрофия Дюшенна/Беккера, гемофилия А и другие). Симптомы заболевания обычно менее выражены, чем у заболевших мальчиков, но все зависит от процента сдвига инактивации.

PS у кошек цвет шерсти определяется геном хромосомы Х. Поэтому из-за инактивации часть клеток может быть одного цвета, другая другого, а третья их смесью - черепаший трехцветный окрас. И мальчиков котов с таким окрасом не бывает, только кошки ⬇️
🔥25👍7🤯6
🤩10👍6🔥4
Редкая дата - редкое заболевание
Сегодня международный день осведомленности о генетических заболеваниях.

На сегодняшний день известно более 8000 таких заболеваниях. Большинство из них вы никогда не узнаете и не встретите, потому что они действительно очень редко встречаются: 1 случай на десятки и сотни тысяч людей.

Но их СУММАРНАЯ частота - 1%

Кажется мало?

В масштабах России это можно сравнить с населением Нижнего Новгорода - почти полтора миллиона человек.

Да, ни один генетик не увидит все 8000 патологий, но совершенно точно врач ЛЮБОЙ специальности в своей практике встретит как минимум 1-го пациента с генетическим заболеванием. Поэтому важно говорить об этом.
👍23🔥8💯6🤔5👏3
Мне сегодня 28

Чкаловская восьмерка отлично вписалась к моей двойке)

И сегодня вас стало больше 280, спасибо за интерес!
_

Я
вам частенько рассказываю про разные генетические анализы. В частности про самый расширенный на сегодняшний день - секвенирование (прочитывание) всего генома.
Чтобы не быть сапожником без сапог, пришлось и самому пройти исследование 🧬

Теперь смогу рассказать вам о собственных генетических особенностях.
Интересно?)
🎉41🔥21😁5👍3
Прекрасные обладательницы двух Х хромосом!
Поздравляю всех вас с международным женским днём!


🤓 Праздничный интересный факт 🤓
Думаете все дело в Y-хромосоме? Она та граница между 23 февраля и 8 марта?
А вот и нет!

Представьте себе, иногда бывают:
♀️женщины с кариотипом XY (синдром Свайера)
♂️мужчины с кариотипом XX (синдром де ля Шапеля)

Нет, нас не обманывали в школе 😄 Просто в жизни все сложнее, чем в учебниках, и иногда организм ошибается.

☝️Всему виной ген SRY (англ. Sex-determining Region Y - участок в Y-хромосоме, определяющий пол). В норме он присутствует в Y-хромосомах самцов всех млекопитающих, включая мужчин. Этот ген является дирижёром, который руководит развитием по мужскому типу, начиная с 7 недели беременности 🤰🏻
До этого момента абсолютно все мы независимо от половых хромосом развиваемся одинаково, как будущие женщины.

☝️При делении клеток могут случаться ошибки - мутации: женщине достаточно получить всего лишь один ген SRY, чтобы развиться по мужскому типу, а мужчине лишиться его, чтобы мужчиной не стать.
Так что именно SRY можно назвать главным мужским геном 🤷‍♂

Текст позаимствован и адаптирован из https://dzen.ru/a/XwyruFl0u14ciI-o
а картинку нарисовал ИИ 😁

PS в комментариях снова изображения нормального набора хромосом
🔥42👍9🎉8
"Генетический паспорт"

Обещал поделиться результатами анализа всего моего генома (но исчез из-за усилившихся попыток написать диссертацию 🫠)

Сейчас есть много рекламы от ген лабораторий про анализ с названием а-ля "генетический паспорт", и меня часто спрашивают, стоит ли оно. (спойлер: все зависит от цели). Тут 3 момента:
1⃣ нет единого определения этого термина => везде будет разный состав таких "паспортов".
2⃣ основное их отличие - метод анализа, от него зависит количество и надежность получаемой информации. Чаще всего используются методы, ищущие конкретные буквы в ДНК. Анализ может включать 20, 200 или даже 200 тысяч букв. Звучит внушительно, но все это капля в море в сравнении с 3 млрд буквами - все можно прочесть только полногеномным секвенированием (и то есть ограничения).
3⃣ "генетический паспорт" обычно состоит из двух блоков: медицинского и информационно-развлекательного. И если ваша цель получить достоверную медицинскую информацию, то обязательно обговорите с врачом, какой анализ лучше выполнить. К второму блоку требования менее серьезные 😁

Разумеется, я хотел максимум количества и достоверности информации + я знаю изнутри качество работы лаборатории Эвоген => выбор не стоял, и теперь я счастливый обладатель своего полностью расшифрованного генома весом ≈ 100 Гб.

Что касается медицинской части: у меня не выявлено генетических заболеваний, высокого риска тяжелых заболеваний, в том числе наследственных опухолевых синдромов, однако есть бессимптомное носительство мутации в гене DHCR7, который связан с очень тяжелым синдромом (подробнее в комментариях). Напомню, у всех есть две копии этого гена; у меня повреждена одна, но, к счастью, есть резервная, поэтому меня болезнь миновала. Однако, если у супруги тоже есть мутация в гене DHCR7, то высок риск рождения ребенка с патологией.

Все это мега важная информация, особенно для планирования семьи.
А про развлекательный контент я расскажу в следующий раз 😄
👍41👏4😱4🔥1
Сегодня выступал на Конгрессе "5П Детская медицина" и занял 🥉 место в конкурсе молодых учёных 😎
Разумеется, все благодаря поддержке главного зрителя 😄

интересно, любовь к генетике передается генетически или нет? 🤔
Ваши идеи?)
🔥48🎉12😁8👍2🤩1